BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-135A16
Chromosome14 (Build37)
Map Location 26,329,492 - 26,496,615
singlet/doubletdoublet
Overlap geneZmiz1, 4931406H21Rik
Upstream geneLOC669315, LOC100039411, I920194n01, LOC100039007
Downstream genePpif, 2310047A01Rik, Anxa11, Plac9, D14Ertd449e, Cphx, 1110051B16Rik, LOC100039468, LOC100039484, LOC100039175, LOC100039192, LOC100039213, LOC100039227, LOC100039503, LOC100039246, LOC100039257, LOC100039280, LOC100039293, LOC100039527, LOC100039538, 4933413J09Rik, Slmap, LOC100039353, LOC665279, A630054L15Rik, Arf4, E430028B21Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-135A16.bB6Ng01-135A16.g
ACCDH935188DH935189
length1,2391,112
definitionDH935188|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-135A16, 5' end.DH935189|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-135A16, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(26,495,357 - 26,496,615)(26,329,492 - 26,330,614)
sequence
gaattcagcgtgtgatgtggaaagggggaagaaggtaaagcccaactgag
cactgtcttacccttcaaagatctgtggctctcaggactgaaccaagggc
atcttgacacaaagagctgtataaaaagacactgagtgatgttggaggcc
agagagctggacagatgctaaggtcctataggaaaggtcatgaccgatga
catccacttgggactttcccgaggactgtgccccagagatgcacacctca
ctcgtgtaggcgcgtagagacaactgagatctgagcgcctcctgccccac
cttgccctgccccagaggcctcatgcgcttcccacttctctcccaggact
ctgggtctgcgttggcttctgggacagcaggtggggaacagggccagctg
tcactcccctgccacagcctagctctaggataccatgggtgagatacaga
tcccaagtggctccattcacaggctctaggtatcccaactatcacttagc
ccgtgttggttctcccagcaggaggcacatctgggaaaccccgaggccta
cctctgatgatgtcatggaggtcacctgggctgcttttcttgtgaatcag
gttgtgtcacaggatgctgacccaggtgacaatctgtaaaacttccctgt
taaaagcacagcaagggcctggtttcctcagccatggtagtaaggggcca
gactgagggatttccataggtgtcaagagggaagatttgagtgaccctcc
accccgttctccagttgatctgagtggagcctacactgttcccaaacctt
cacagcatcctgtagtccatccttcctccactccatccccactgcccagt
ccaggctgcagccctacacattggagctgcaggaggccccttgctgtccc
cagccctagcttctcagtgcttcatggggtcacgcccttcctttatcagg
gataatttacagtcaagaaatgcaaaagcttaaaagaaaaagcttttaac
aaatgcatactcttgatcatgagtccaagcccagacagctcctgtaactg
gggaaggaaccaatgaccctcttttaagctgcatcccagcactctggaca
accctctgttgtgtgctccacaaacatccccccaaaaacaaaagcaacca
actactatccatcgaacacaacagtccactaacaacaacaaatggggctt
gagacaaatactgcacatggcaggggccctatataaatg
gaattcagtccccaaacctccctacacaaggtccttattgtacactgcat
tccagatgaggagacggaggcacagagaggccacccacagttggaaaggg
gtgacactggaagtcagaatcaagagtcagctcagattcttgagtggcca
aacagctgagcatacctcatcctgccccagggttagcacacaagttccac
atcctggggattcgactctcttttgggacaaagggtggcatgtgctcaag
gtcacatgcaaaggtcaccttccttctactttgtttgagataggctttct
tgctgtttgcttttgtggacatggacactagactggctggcctctgagtt
cctgtggattctccctttgccttccttcttgatgtcccatcatatcgagt
catctgtctctctagccctgagatttaataggaaaggcagaagggtcccc
gcccccagccccccagcccccagcagggccttcctggtacagcaatggag
tacaccattgacagaggagaagtaccagcagaggggcagagtggagcctg
aaacagctgctggcctgcgttaccagtgcccaggccaggacttctggggt
gaggagccagtactccctggggtcctgggtcatttgttaaccaatataga
ctgcagtgcatattgaggccaggtctcttatggaagaagcaggtgatatc
atctccacccacctctgcctcatccccttaccctttaatcatgtctggat
ctgtgtccctctccccatcttgctcctgccagcagccaggccttactgtg
tctctgcctctatgtcacggtctcccatccttctctgtctccccggcttc
ccatcacaaccagagaaagtccaaattataagacggcagtgatcaaggcc
atcttcctggctgggtgagtcagagagctgtttgggcctctcttagccca
cctgagcctctggccttggtgtatgggtagtgtggcactctgtgcaagct
gctttggtgctagtcgtgcctagcttcactgtggatgcatgcatgctgga
caagaacaacgaagctttactatatcctcacacccttctcagaacctacc
aagactgctgcc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_26495357_26496615
seq2: B6Ng01-135A16.b_48_1286 (reverse)

seq1  CATTTATAAAGG--CCCTG-CATGTGCAGTATGGTTGCTTCAAGGCCCCC  47
      |||||||| |||  ||||| ||||||||||||  |||  |||||  ||||
seq2  CATTTATATAGGGCCCCTGCCATGTGCAGTAT--TTGTCTCAAG--CCCC  46

seq1  ATTTTTGTTTGTTTGGTTAGTTGGTTGTTTTGTTGTTTGATTGGTTGGTT  97
      ||||    |||||  |||||| |  ||||    |||| ||| | | |  |
seq2  ATTT---GTTGTT--GTTAGTGGACTGTT---GTGTTCGATGGATAG--T  86

seq1  AGTTGGTTTTGCTTTTGTTTTTTTGGGGGGTGGTTTTGGTGGAAGCCAAC  147
      ||||||  |||||||||  |||||||||||  ||||  |||||   ||  
seq2  AGTTGG--TTGCTTTTG--TTTTTGGGGGGATGTTT--GTGGAGCACACA  130

seq1  ACAGA-GGTTGTTCAGAGTGCTGGGATGCAAGCTTAAAAGA-GGTCACTG  195
      ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | 
seq2  ACAGAGGGTTGTCCAGAGTGCTGGGATGC-AGCTTAAAAGAGGGTCA-TT  178

seq1  GGTCCCTTCCCCAGTGACAGAAGCTGTCTGGGCTTGGACTCATTGATCAG  245
      ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| 
seq2  GGTTCCTTCCCCAGTTACAGGAGCTGTCTGGGCTTGGACTCA-TGATCAA  227

seq1  GAGTATGCATTTGTTAAAAGC-TCTTCTTTTAAGCTTTTTGCATTTCTTG  294
      ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||
seq2  GAGTATGCATTTGTTAAAAGCTTTTTCTTTTAAGC-TTTTGCATTTCTTG  276

seq1  ACTGTAAATTATCCCTGAATAAAGGAAGGGCGTGACCCCATGAAAGCACT  344
      ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  ACTGTAAATTATCCCTG-ATAAAGGAAGGGCGTGACCCCATG-AAGCACT  324

seq1  GAGAAGCTAGGGCTGGGGACAGCAAGGGGCCTCCTGCAGCTCCAATGTGT  394
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAAGCTAGGGCTGGGGACAGCAAGGGGCCTCCTGCAGCTCCAATGTGT  374

seq1  AGGGCTGCAGCCTGGACTGGGCAGTGGGGATGGAGTGGAGGAAGGATGGA  444
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGCTGCAGCCTGGACTGGGCAGTGGGGATGGAGTGGAGGAAGGATGGA  424

seq1  CTACAGGATGCTGTGAAGGTTTGGGAACAGTGTAGGCTCCACTCAGATCA  494
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACAGGATGCTGTGAAGGTTTGGGAACAGTGTAGGCTCCACTCAGATCA  474

seq1  ACTGGAGAACGGGGTGGAGGGTCACTCAAATCTTCCCTCTTGACACCTAT  544
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGGAGAACGGGGTGGAGGGTCACTCAAATCTTCCCTCTTGACACCTAT  524

seq1  GGAAATCCCTCAGTCTGGCCCCTTACTACCATGGCTGAGGAAACCAGGCC  594
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAATCCCTCAGTCTGGCCCCTTACTACCATGGCTGAGGAAACCAGGCC  574

seq1  CTTGCTGTGCTTTTAACAGGGAAGTTTTACAGATTGTCACCTGGGTCAGC  644
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGCTGTGCTTTTAACAGGGAAGTTTTACAGATTGTCACCTGGGTCAGC  624

seq1  ATCCTGTGACACAACCTGATTCACAAGAAAAGCAGCCCAGGTGACCTCCA  694
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCTGTGACACAACCTGATTCACAAGAAAAGCAGCCCAGGTGACCTCCA  674

seq1  TGACATCATCAGAGGTAGGCCTCGGGGTTTCCCAGATGTGCCTCCTGCTG  744
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACATCATCAGAGGTAGGCCTCGGGGTTTCCCAGATGTGCCTCCTGCTG  724

seq1  GGAGAACCAACACGGGCTAAGTGATAGTTGGGATACCTAGAGCCTGTGAA  794
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGAACCAACACGGGCTAAGTGATAGTTGGGATACCTAGAGCCTGTGAA  774

seq1  TGGAGCCACTTGGGATCTGTATCTCACCCATGGTATCCTAGAGCTAGGCT  844
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAGCCACTTGGGATCTGTATCTCACCCATGGTATCCTAGAGCTAGGCT  824

seq1  GTGGCAGGGGAGTGACAGCTGGCCCTGTTCCCCACCTGCTGTCCCAGAAG  894
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGCAGGGGAGTGACAGCTGGCCCTGTTCCCCACCTGCTGTCCCAGAAG  874

seq1  CCAACGCAGACCCAGAGTCCTGGGAGAGAAGTGGGAAGCGCATGAGGCCT  944
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAACGCAGACCCAGAGTCCTGGGAGAGAAGTGGGAAGCGCATGAGGCCT  924

seq1  CTGGGGCAGGGCAAGGTGGGGCAGGAGGCGCTCAGATCTCAGTTGTCTCT  994
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGGGCAGGGCAAGGTGGGGCAGGAGGCGCTCAGATCTCAGTTGTCTCT  974

seq1  ACGCGCCTACACGAGTGAGGTGTGCATCTCTGGGGCACAGTCCTCGGGAA  1044
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGCGCCTACACGAGTGAGGTGTGCATCTCTGGGGCACAGTCCTCGGGAA  1024

seq1  AGTCCCAAGTGGATGTCATCGGTCATGACCTTTCCTATAGGACCTTAGCA  1094
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCCCAAGTGGATGTCATCGGTCATGACCTTTCCTATAGGACCTTAGCA  1074

seq1  TCTGTCCAGCTCTCTGGCCTCCAACATCACTCAGTGTCTTTTTATACAGC  1144
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTCCAGCTCTCTGGCCTCCAACATCACTCAGTGTCTTTTTATACAGC  1124

seq1  TCTTTGTGTCAAGATGCCCTTGGTTCAGTCCTGAGAGCCACAGATCTTTG  1194
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTGTGTCAAGATGCCCTTGGTTCAGTCCTGAGAGCCACAGATCTTTG  1174

seq1  AAGGGTAAGACAGTGCTCAGTTGGGCTTTACCTTCTTCCCCCTTTCCACA  1244
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGGTAAGACAGTGCTCAGTTGGGCTTTACCTTCTTCCCCCTTTCCACA  1224

seq1  TCACACGCTGAATTC  1259
      |||||||||||||||
seq2  TCACACGCTGAATTC  1239

seq1: chr14_26329492_26330614
seq2: B6Ng01-135A16.g_68_1179

seq1  GAATTCAGTCCCCAAACCTCCCTACACAAGGTCCTTATTGTACACTGCAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGTCCCCAAACCTCCCTACACAAGGTCCTTATTGTACACTGCAT  50

seq1  TCCAGATGAGGAGACGGAGGCACAGAGAGGCCACCCACAGTTGGAAAGGG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAGATGAGGAGACGGAGGCACAGAGAGGCCACCCACAGTTGGAAAGGG  100

seq1  GTGACACTGGAAGTCAGAATCAAGAGTCAGCTCAGATTCTTGAGTGGCCA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGACACTGGAAGTCAGAATCAAGAGTCAGCTCAGATTCTTGAGTGGCCA  150

seq1  AACAGCTGAGCATACCTCATCCTGCCCCAGGGTTAGCACACAAGTTCCAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAGCTGAGCATACCTCATCCTGCCCCAGGGTTAGCACACAAGTTCCAC  200

seq1  ATCCTGGGGATTCGACTCTCTTTTGGGACAAAGGGTGGCATGTGCTCAAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCTGGGGATTCGACTCTCTTTTGGGACAAAGGGTGGCATGTGCTCAAG  250

seq1  GTCACATGCAAAGGTCACCTTCCTTCTACTTTGTTTGAGATAGGCTTTCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCACATGCAAAGGTCACCTTCCTTCTACTTTGTTTGAGATAGGCTTTCT  300

seq1  TGCTGTTTGCTTTTGTGGACATGGACACTAGACTGGCTGGCCTCTGAGTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGTTTGCTTTTGTGGACATGGACACTAGACTGGCTGGCCTCTGAGTT  350

seq1  CCTGTGGATTCTCCCTTTGCCTTCCTTCTTGATGTCCCATCATATCGAGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGTGGATTCTCCCTTTGCCTTCCTTCTTGATGTCCCATCATATCGAGT  400

seq1  CATCTGTCTCTCTAGCCCTGAGATTTAATAGGAAAGGCAGAAGGGTCCCC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTGTCTCTCTAGCCCTGAGATTTAATAGGAAAGGCAGAAGGGTCCCC  450

seq1  GCCCCCAGCCCCCCAGCCCCCAGCAGGGCCTTCCTGGTACAGCAATGGAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCCCAGCCCCCCAGCCCCCAGCAGGGCCTTCCTGGTACAGCAATGGAG  500

seq1  TACACCATTGACAGAGGAGAAGTACCAGCAGAGGGGCAGAGTGGAGCCTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACACCATTGACAGAGGAGAAGTACCAGCAGAGGGGCAGAGTGGAGCCTG  550

seq1  AAACAGCTGCTGGCCTGCGTTACCAGTGCCCAGGCCAGGACTTCTGGGGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACAGCTGCTGGCCTGCGTTACCAGTGCCCAGGCCAGGACTTCTGGGGT  600

seq1  GAGGAGCCAGTACTCCCTGGGGTCCTGGGTCATTTGTTAACCAATATAGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGAGCCAGTACTCCCTGGGGTCCTGGGTCATTTGTTAACCAATATAGA  650

seq1  CTGCAGTGCATATTGAGGCCAGGTCTCTTATGGAAGAAGCAGGTGATATC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCAGTGCATATTGAGGCCAGGTCTCTTATGGAAGAAGCAGGTGATATC  700

seq1  ATCTCCACCCACCTCTGCCTCATCCCCTTACCCTTTAATCATGTCTGGAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTCCACCCACCTCTGCCTCATCCCCTTACCCTTTAATCATGTCTGGAT  750

seq1  CTGTGTCCCTCTCCCCATCTTGCTCCTGCCAGCAGCCAGGCCTTACTGTG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGTCCCTCTCCCCATCTTGCTCCTGCCAGCAGCCAGGCCTTACTGTG  800

seq1  TCTCTGCCTCTATGTCACGGTCTCCCATCCTTCTCTGTCTCCCCGGCTTC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTGCCTCTATGTCACGGTCTCCCATCCTTCTCTGTCTCCCCGGCTTC  850

seq1  CCATCACAACCAGAGAAAAGTCCAAATTATAAGACGGCAGTGATCAAGGC  900
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATCACAACCAGAG-AAAGTCCAAATTATAAGACGGCAGTGATCAAGGC  899

seq1  CATCTTCCTGGCTGGGTGAGGTCAGAGAGCTGTTTGGGCCTCTCTTAGCC  950
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTTCCTGGCTGGGTGA-GTCAGAGAGCTGTTTGGGCCTCTCTTAGCC  948

seq1  CACCTGAGCCTCTGGCCTTTGGTGGTATGGGTAGTGTGGCACCTCTGTGC  1000
      ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||
seq2  CACCTGAGCCTCTGGCC-TTGGT-GTATGGGTAGTGTGGCA-CTCTGTGC  995

seq1  AAGCCTGGCTTTGTGCCTAGTCCGTGCCTAGCTTCACTGTGGATGCAGTG  1050
      ||||   ||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  AAGC--TGCTTTGGTGCTAGT-CGTGCCTAGCTTCACTGTGGATGCA-TG  1041

seq1  CATGCTGGACCAGAACAACAAAGCTTTAACTATATCCTCACACCCTTCTC  1100
      |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  CATGCTGGACAAGAACAACGAAGCTTT-ACTATATCCTCACACCCTTCTC  1090

seq1  AGACACTACCTAGAACTGCTGCC  1123
      |||  ||||| || |||||||||
seq2  AGAACCTACCAAG-ACTGCTGCC  1112