BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-146E10
Chromosome14 (Build37)
Map Location 32,047,423 - 32,224,964
singlet/doubletdoublet
Overlap genePhf7, Bap1, Dnahc1, Capn7, Sh3bp5
Upstream geneCacna1d, LOC665399, Dcp1a, Tkt, Prkcd, EG665466, Rft1, Sfmbt1, Tmem110, Mustn1, Itih4, Itih3, Itih1, Nek4, Spcs1, Glt8d1, Gnl3, Pbrm1, EG432834, Nt5dc2, Stab1, Nisch, Tnnc1, Sema3g
Downstream geneMettl6, Eaf1, Colq, Hacl1, Btd, Ankrd28, Galntl2, Dph3, Oxnad1, Msmb, Ncoa4, Timm23, Parg, LOC665601, Ogdhl, 1700024G13Rik, Chat
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-146E10.bB6Ng01-146E10.g
ACCDH943460DH943461
length8821,093
definitionDH943460|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-146E10, 5' end.DH943461|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-146E10, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(32,047,423 - 32,048,304)(32,223,866 - 32,224,964)
sequence
gaattctgggctcggcagcaaacgtgaatgaagaatgtctaacaaagccg
gtctcggactgcaaggggtttccaatccagcagtagagacagacctaatg
ttgtaggagtgacagaggacatgggttccaagggcaccagcagagacaca
agtgagaatccagtgagaacaaagaggtggcattcaacagactgaggatg
agagtcaggggttccacgctggggacccaaagcagaaagcccatgggtga
ggtgctgtgggaggcccgctgtgcagggccctatttccaaaaaggccaca
gatgacaagcctaagcaaaagctaccacaggtaatgtggtaactggtaca
aggagagagggcgggtgaatcagtgaagtgggtctagaaaaccatgcgga
caggttcttgctgcaggtctgtggggctcaatgagcaccagcaatggcag
aagggggtggggggtgaaaaacagatgactatcacaacacaatacatata
ctcagtaaagatataagcaatacaaatgagtcaataaacgagtgggggag
gagcggtaatctgtgcagaactccactctcagagaggagggtgcttaagt
cctccataccttgccggcagcatgcacaggggcacagctgacaggcgctg
ccttcgatcctgttgacagcatggaacttcatgtgatggaacgcactttc
cctctgtggcttcagaggtcagaaccatagtctgatctgatcatgatgaa
agttataagtcccagttaggggacactaggcacaatacccaattagtact
ccacaatattggttacaggaaaagctgtcaccttccaagaggaacctaac
aataactctgtggctgggaatggtggcacctg
gaattctttcctggtgtttctggtcagatgcagcagatgtttgctgctcc
cttctaaaacctcctggtgataattcctccatcttcctcccccctccccc
caactataggatgcacgccagaagttccgatctgtcctggtcgaggcaac
ggtgaaactagacgaactggcaaagaaaatcggcaaagccgtggaggact
cgaagccctactgggaggcccggagggtggcaaggcaggtaagacagcct
gaaggtgtctgctctgcccgtgtatctcccactgaagtttagaagcacct
gccccatggctgcctacgatcagccttcttataccctgcctctatgggct
ccatccagctcatgacaccattaatagagtatcagccctgattcaggtgg
tccttgtcacatgacctgtggtgactgaagcctctgagttgaggagttgt
ggactggtgggcactgtggatgtgtccagcgcttcctttggtgtggtctt
cctctcttagaggctgcctgtgaggcacagggcagaggacccttggttag
cccttctcacctctgacctgttagagtctgtgtttacagtgagagcagct
ccacgtgcatggctttgtctagggttttacatacagaagggatcagatat
agaagggattgatgggcaaacaagcagatgacaggcctgggaagccacaa
ggtcatcctatgtcctcttccatatcccgaacttagaagtctctcccaca
tcttacctacatccctccaaagtccttcctgctcatagctgggtgagcaa
agcagtctggttggctttcattcaaatcatgctttggtgggcgggaccat
atggctgcggcacatcctgcagtgagtcttacagcttcctttttctgtac
ctccctgactcctcttggggaggaactgtggttggggacactcactgctg
gaggcagtgatgtggcatatctctttttttctcattcttctcttgaccct
aaacataataattaagatcaccaacggagtctggtggctactatccagtg
gtaggtgtgccagaccaggtcccatcagggggggtgaccggct
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_32047423_32048304
seq2: B6Ng01-146E10.b_49_930

seq1  GAATTCTGGGCTCGGCAGCAAACGTGAATGAAGAATGTCTAACAAAGCCG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTGGGCTCGGCAGCAAACGTGAATGAAGAATGTCTAACAAAGCCG  50

seq1  GTCTCGGACTGCAAGGGGTTTCCAATCCAGCAGTAGAGACAGACCTAATG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTCGGACTGCAAGGGGTTTCCAATCCAGCAGTAGAGACAGACCTAATG  100

seq1  TTGTAGGAGTGACAGAGGACATGGGTTCCAAGGGCACCAGCAGAGACACA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTAGGAGTGACAGAGGACATGGGTTCCAAGGGCACCAGCAGAGACACA  150

seq1  AGTGAGAATCCAGTGAGAACAAAGAGGTGGCATTCAACAGACTGAGGATG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGAGAATCCAGTGAGAACAAAGAGGTGGCATTCAACAGACTGAGGATG  200

seq1  AGAGTCAGGGGTTCCACGCTGGGGACCCAAAGCAGAAAGCCCATGGGTGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGTCAGGGGTTCCACGCTGGGGACCCAAAGCAGAAAGCCCATGGGTGA  250

seq1  GGTGCTGTGGGAGGCCCGCTGTGCAGGGCCCTATTTCCAAAAAGGCCACA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGCTGTGGGAGGCCCGCTGTGCAGGGCCCTATTTCCAAAAAGGCCACA  300

seq1  GATGACAAGCCTAAGCAAAAGCTACCACAGGTAATGTGGTAACTGGTACA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGACAAGCCTAAGCAAAAGCTACCACAGGTAATGTGGTAACTGGTACA  350

seq1  AGGAGAGAGGGCGGGTGAATCAGTGAAGTGGGTCTAGAAAACCATGCGGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAGAGAGGGCGGGTGAATCAGTGAAGTGGGTCTAGAAAACCATGCGGA  400

seq1  CAGGTTCTTGCTGCAGGTCTGTGGGGCTCAATGAGCACCAGCAATGGCAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGTTCTTGCTGCAGGTCTGTGGGGCTCAATGAGCACCAGCAATGGCAG  450

seq1  AAGGGGGTGGGGGGTGAAAAACAGATGACTATCACAACACAATACATATA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGGGGTGGGGGGTGAAAAACAGATGACTATCACAACACAATACATATA  500

seq1  CTCAGTAAAGATATAAGCAATACAAATGAGTCAATAAACGAGTGGGGGAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGTAAAGATATAAGCAATACAAATGAGTCAATAAACGAGTGGGGGAG  550

seq1  GAGCGGTAATCTGTGCAGAACTCCACTCTCAGAGAGGAGGGTGCTTAAGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCGGTAATCTGTGCAGAACTCCACTCTCAGAGAGGAGGGTGCTTAAGT  600

seq1  CCTCCATACCTTGCCGGCAGCATGCACAGGGGCACAGCTGACAGGCGCTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCCATACCTTGCCGGCAGCATGCACAGGGGCACAGCTGACAGGCGCTG  650

seq1  CCTTCGATCCTGTTGACAGCATGGAACTTCATGTGATGGAACGCACTTTC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTCGATCCTGTTGACAGCATGGAACTTCATGTGATGGAACGCACTTTC  700

seq1  CCTCTGTGGTCTTCAGAGGTCAGAACCATAGTCTGATCTGATCATGATGA  750
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCTGTGG-CTTCAGAGGTCAGAACCATAGTCTGATCTGATCATGATGA  749

seq1  AAGTTATAAGTCCCAGTTAGGGGACACTAGGCACAATACCCAATTAGTAC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTTATAAGTCCCAGTTAGGGGACACTAGGCACAATACCCAATTAGTAC  799

seq1  TCCACAA-AATGGTTACAGGAAAAGCTGTCACC-TCCAAGAGGAACCTAA  848
      ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  TCCACAATATTGGTTACAGGAAAAGCTGTCACCTTCCAAGAGGAACCTAA  849

seq1  CAATAACTCATGTGGCTGGGAATGGTGGCACCTG  882
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATAACTC-TGTGGCTGGGAATGGTGGCACCTG  882

seq1: chr14_32223866_32224964
seq2: B6Ng01-146E10.g_69_1161 (reverse)

seq1  AGCCGGTCA-CCCACCTGCTAGGACCTGGTCTGGCTACACCTGACAACTG  49
      ||||||||| ||| |||| | |||||||||||||| |||||| || ||||
seq2  AGCCGGTCACCCCCCCTGATGGGACCTGGTCTGGC-ACACCT-ACCACTG  48

seq1  AATAGTTGCCCAACAGACTCCG-TGGTGATCTTGATTATTATGTTTAGGG  98
       ||||| | ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||
seq2  GATAGTAG-CCACCAGACTCCGTTGGTGATCTTAATTATTATGTTTAGGG  97

seq1  TCAAGAGAAGATATGAG-AAGAAAGAGATATGCCACAATCTACTGCTTCC  147
      ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||| ||||| | |
seq2  TCAAGAGAAGA-ATGAGAAAAAAAGAGATATGCCAC-ATC-ACTGCCT-C  143

seq1  CAGCAGATGAGGTGTCCCCAA-CACAGTTCCCTCCCACAGAGGAGTCAGG  196
      |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||
seq2  CAGCAG-TGA-GTGTCCCCAACCACAGTT-CCTCCCCAAGAGGAGTCAGG  190

seq1  GAGGTACAGAAAAGGAAGGCTGTAAGACTCACTGCAGGATGTGCCGCAGC  246
      ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGTACAGAAAAAGGAAGCTGTAAGACTCACTGCAGGATGTGCCGCAGC  240

seq1  CATATGGGTCCCCGCCCACC-AAGCATGATTTGGATG-AAGCCAACCAGA  294
      |||||||   |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||
seq2  CATATGG--TCCCGCCCACCAAAGCATGATTTGAATGAAAGCCAACCAGA  288

seq1  CTGCTTTGCTCACCCAGCTATGAGCAGGAAGGACTTTGGAGGGATGTAGG  344
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTTTGCTCACCCAGCTATGAGCAGGAAGGACTTTGGAGGGATGTAGG  338

seq1  TAAGATGTGGGAGAGACTTCTAAGTTCGGGATATGGAAGAGGACATAGGA  394
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGATGTGGGAGAGACTTCTAAGTTCGGGATATGGAAGAGGACATAGGA  388

seq1  TGACCTTGTGGCTTCCCAGGCCTGTCATCTGCTTGTTTGCCCATCAATCC  444
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACCTTGTGGCTTCCCAGGCCTGTCATCTGCTTGTTTGCCCATCAATCC  438

seq1  CTTCTATATCTGATCCCTTCTGTATGTAAAACCCTAGACAAAGCCATGCA  494
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTATATCTGATCCCTTCTGTATGTAAAACCCTAGACAAAGCCATGCA  488

seq1  CGTGGAGCTGCTCTCACTGTAAACACAGACTCTAACAGGTCAGAGGTGAG  544
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTGGAGCTGCTCTCACTGTAAACACAGACTCTAACAGGTCAGAGGTGAG  538

seq1  AAGGGCTAACCAAGGGTCCTCTGCCCTGTGCCTCACAGGCAGCCTCTAAG  594
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGGCTAACCAAGGGTCCTCTGCCCTGTGCCTCACAGGCAGCCTCTAAG  588

seq1  AGAGGAAGACCACACCAAAGGAAGCGCTGGACACATCCACAGTGCCCACC  644
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGGAAGACCACACCAAAGGAAGCGCTGGACACATCCACAGTGCCCACC  638

seq1  AGTCCACAACTCCTCAACTCAGAGGCTTCAGTCACCACAGGTCATGTGAC  694
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCCACAACTCCTCAACTCAGAGGCTTCAGTCACCACAGGTCATGTGAC  688

seq1  AAGGACCACCTGAATCAGGGCTGATACTCTATTAATGGTGTCATGAGCTG  744
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGACCACCTGAATCAGGGCTGATACTCTATTAATGGTGTCATGAGCTG  738

seq1  GATGGAGCCCATAGAGGCAGGGTATAAGAAGGCTGATCGTAGGCAGCCAT  794
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGGAGCCCATAGAGGCAGGGTATAAGAAGGCTGATCGTAGGCAGCCAT  788

seq1  GGGGCAGGTGCTTCTAAACTTCAGTGGGAGATACACGGGCAGAGCAGACA  844
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGCAGGTGCTTCTAAACTTCAGTGGGAGATACACGGGCAGAGCAGACA  838

seq1  CCTTCAGGCTGTCTTACCTGCCTTGCCACCCTCCGGGCCTCCCAGTAGGG  894
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTCAGGCTGTCTTACCTGCCTTGCCACCCTCCGGGCCTCCCAGTAGGG  888

seq1  CTTCGAGTCCTCCACGGCTTTGCCGATTTTCTTTGCCAGTTCGTCTAGTT  944
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCGAGTCCTCCACGGCTTTGCCGATTTTCTTTGCCAGTTCGTCTAGTT  938

seq1  TCACCGTTGCCTCGACCAGGACAGATCGGAACTTCTGGCGTGCATCCTAT  994
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACCGTTGCCTCGACCAGGACAGATCGGAACTTCTGGCGTGCATCCTAT  988

seq1  AGTTGGGGGGAGGGGGGAGGAAGATGGAGGAATTATCACCAGGAGGTTTT  1044
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTGGGGGGAGGGGGGAGGAAGATGGAGGAATTATCACCAGGAGGTTTT  1038

seq1  AGAAGGGAGCAGCAAACATCTGCTGCATCTGACCAGAAACACCAGGAAAG  1094
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAGGGAGCAGCAAACATCTGCTGCATCTGACCAGAAACACCAGGAAAG  1088

seq1  AATTC  1099
      |||||
seq2  AATTC  1093