BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-154L19
Chromosome14 (Build37)
Map Location 73,131,756 - 73,225,383
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC668477, LOC668482, LOC675957, Fndc3a
Downstream geneLOC100043721, LOC100043723, LOC668487, LOC668489, Cysltr2, LOC100043149, Rcbtb2, Rb1, P2ry5, Itm2b, LOC100043152, Med4, Nudt15, Sucla2, LOC100043734
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-154L19.bB6Ng01-154L19.g
ACCDH949701DH949702
length1,1581,045
definitionDH949701|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-154L19, 5' end.DH949702|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-154L19, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(73,224,221 - 73,225,383)(73,131,756 - 73,132,803)
sequence
gaattctaagtgagaagccttgaacaagtaagtgactgggcttgttaagt
ttcagtgtctcccactacacagcaataataccagtgtctgcctcagactc
tccgagttcaaattctgtctctagatgaccaccaagtctcctttttggtt
actccatctctatacgagaaaggttttcctgaagggaaagggcttcatga
agtttgagtgtttagaatgttgtctggcatagaatgtaagtgctcaaagg
ctggagcttggaatatggctaagtggatataagacctatcatataagcag
gaggacctgagctcagatccccagcacacttgtaaaagtctagtggagta
ccatacatctaaaactctgctgctgaaggaagggagacagggatctctgg
agcgtattggccagctagtcttggcagtcaaggttcatgagatcttctgt
ttccaacaagtatattaagctatcaaggaagacctctggcctcctcatgc
agacaaacacacacatgtacccatattcataaatacatataatcatgtgc
acaagccacccacccaaaacacacacacacacacacacaccctcaaagct
aggtgtgggtggtacacactgtaatcccaagacctgagacactaagacag
aaagatcatgagttagagatcagctgggctacataacaggtcttacaata
caaaaacaaacaacaagaatgtacatgttcaataaatattgactgttacg
attttatttttaaaaacgctggttcttatgaacagtggttgacttgccca
aagcaacagtcattctgtccatctcaagtcctatttaactctgtgttttt
tcgagcataaggctgagagttactgtggaaattgtttatctgtttgtctg
gattgctcctgaagacacaaaggatgccagggatatccattaataaaggc
ggatgggtaatgtttatggagtttacctctgcttttcaagtttttaaaaa
tattctccaaaatcctaaagtacaaacttcagaagaagacttcatagatg
tatgctgacctttctatctttcagaatcttatatgacagtatttcaacgg
accctagatctaaatgtggccagatgggaatatgtggtagccttgataaa
atgattta
gaattccaatgtcatccagcctgaagctggccaaagagctcatgatttga
tataattggcatactgaggggtacaaattgaatttccaaacgattttaag
aatttgcaaataacaacttcgaatatctttcatgatgattgaaaaaggag
tgtgtctacacagattagagactcgacttagatcatcatcaatttagact
ggataattagaggatataatttttggcccagtgggatgtgttttgaattc
aacaccagttatttttagtagaaggtaaggtctgaatatttcagatgaaa
ttgtactatgttaacttaattgtaaagccaggggcctcgttctttttctg
tcatttgcctactagaagtatggtgtaataattaaaagttggactgtagt
aaattaaaaataggaaatctcatctttaataacttgaagaattaaaagtt
tgtaaacccatggcaagtcagagtgatgttttgtctttatgtacataaat
atgttgattttataaagaccaaacttcttgctttattacaaggatagagt
tacaaatcaacatgcactgtattctcaatgcatgaggtttaaaaaaaagt
gtaaatttaaattacaagcctgtattcatcgtaggtgagtcttctgcagt
tttgacagaagcttcaaatcaagtgttctctgtgtcccccagaaaggatg
attcagaacttgatgagatcatttgggccatctaagaaagattgttacac
catgctgtcacctaagtgccctatttgcaatgattaggacaaccattttg
agtcatcaaacttagtttattgattacacactagaaatccagactatgta
gaagggaacaacactaacagcctctgtggtgatgtgagaagtctattctt
aaactcagagtttagacaaggtaatgcaaatagacacaccctcattttgc
cttcagacactggctttctccagaaatctctgaagaatgacacctcatcc
ccaactgctggccacattgactgatgtctgcttatactgtttctg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_73224221_73225383
seq2: B6Ng01-154L19.b_48_1205 (reverse)

seq1  TAAATCATATTTTATCAA-GCTACCAACATATCCCCATTCTGGCCCAACA  49
      ||||||  |||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||  |||
seq2  TAAATC--ATTTTATCAAGGCTACC-ACATATTCCCA-TCTGGCC--ACA  44

seq1  TTTTAGATCTTAGTGTCCGTTGAAATACTGTCATATAGAATTCTGAAAGA  99
       |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||
seq2  -TTTAGATC-TAGGGTCCGTTGAAATACTGTCATATAAGATTCTGAAAGA  92

seq1  TAGAAAGGTCAGCATACATCTATGAAGTC-TCTTCTTGAAGTTTGTAACT  148
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||   
seq2  TAGAAAGGTCAGCATACATCTATGAAGTCTTCTTC-TGAAGTTTGTA--C  139

seq1  TTTAGGATTTTGGAG-ATA-TTTTAAAAACTTGAAAAGCAGA-GTAAACT  195
      ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  TTTAGGATTTTGGAGAATATTTTTAAAAACTTGAAAAGCAGAGGTAAACT  189

seq1  CCATTAAACATTA-CCAT-CGCCTTTATTAATGGATAT-CCTGGCATCCT  242
      ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  CCA-TAAACATTACCCATCCGCCTTTATTAATGGATATCCCTGGCATCCT  238

seq1  TTGTGTCTTCAGGAAGCAATCCAGACAAACAGATAAACAATTTCCACAGT  292
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTGTCTTCAGG-AGCAATCCAGACAAACAGATAAACAATTTCCACAGT  287

seq1  AACTCTCAGCCTTATGCTCGAAAAAACACAGAGTTAAATAGGACTTGAGA  342
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTCTCAGCCTTATGCTCGAAAAAACACAGAGTTAAATAGGACTTGAGA  337

seq1  TGGACAGAATGACTGTTGCTTTGGGCAAGTCAACCACTGTTCATAAGAAC  392
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGACAGAATGACTGTTGCTTTGGGCAAGTCAACCACTGTTCATAAGAAC  387

seq1  CAGCGTTTTTAAAAATAAAATCGTAACAGTCAATATTTATTGAACATGTA  442
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCGTTTTTAAAAATAAAATCGTAACAGTCAATATTTATTGAACATGTA  437

seq1  CATTCTTGTTGTTTGTTTTTGTATTGTAAGACCTGTTATGTAGCCCAGCT  492
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTCTTGTTGTTTGTTTTTGTATTGTAAGACCTGTTATGTAGCCCAGCT  487

seq1  GATCTCTAACTCATGATCTTTCTGTCTTAGTGTCTCAGGTCTTGGGATTA  542
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCTCTAACTCATGATCTTTCTGTCTTAGTGTCTCAGGTCTTGGGATTA  537

seq1  CAGTGTGTACCACCCACACCTAGCTTTGAGGGTGTGTGTGTGTGTGTGTG  592
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGTGTACCACCCACACCTAGCTTTGAGGGTGTGTGTGTGTGTGTGTG  587

seq1  TGTTTTGGGTGGGTGGCTTGTGCACATGATTATATGTATTTATGAATATG  642
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTTGGGTGGGTGGCTTGTGCACATGATTATATGTATTTATGAATATG  637

seq1  GGTACATGTGTGTGTTTGTCTGCATGAGGAGGCCAGAGGTCTTCCTTGAT  692
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTACATGTGTGTGTTTGTCTGCATGAGGAGGCCAGAGGTCTTCCTTGAT  687

seq1  AGCTTAATATACTTGTTGGAAACAGAAGATCTCATGAACCTTGACTGCCA  742
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTTAATATACTTGTTGGAAACAGAAGATCTCATGAACCTTGACTGCCA  737

seq1  AGACTAGCTGGCCAATACGCTCCAGAGATCCCTGTCTCCCTTCCTTCAGC  792
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACTAGCTGGCCAATACGCTCCAGAGATCCCTGTCTCCCTTCCTTCAGC  787

seq1  AGCAGAGTTTTAGATGTATGGTACTCCACTAGACTTTTACAAGTGTGCTG  842
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAGAGTTTTAGATGTATGGTACTCCACTAGACTTTTACAAGTGTGCTG  837

seq1  GGGATCTGAGCTCAGGTCCTCCTGCTTATATGATAGGTCTTATATCCACT  892
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGATCTGAGCTCAGGTCCTCCTGCTTATATGATAGGTCTTATATCCACT  887

seq1  TAGCCATATTCCAAGCTCCAGCCTTTGAGCACTTACATTCTATGCCAGAC  942
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCCATATTCCAAGCTCCAGCCTTTGAGCACTTACATTCTATGCCAGAC  937

seq1  AACATTCTAAACACTCAAACTTCATGAAGCCCTTTCCCTTCAGGAAAACC  992
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACATTCTAAACACTCAAACTTCATGAAGCCCTTTCCCTTCAGGAAAACC  987

seq1  TTTCTCGTATAGAGATGGAGTAACCAAAAAGGAGACTTGGTGGTCATCTA  1042
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTCGTATAGAGATGGAGTAACCAAAAAGGAGACTTGGTGGTCATCTA  1037

seq1  GAGACAGAATTTGAACTCGGAGAGTCTGAGGCAGACACTGGTATTATTGC  1092
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGACAGAATTTGAACTCGGAGAGTCTGAGGCAGACACTGGTATTATTGC  1087

seq1  TGTGTAGTGGGAGACACTGAAACTTAACAAGCCCAGTCACTTACTTGTTC  1142
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTAGTGGGAGACACTGAAACTTAACAAGCCCAGTCACTTACTTGTTC  1137

seq1  AAGGCTTCTCACTTAGAATTC  1163
      |||||||||||||||||||||
seq2  AAGGCTTCTCACTTAGAATTC  1158

seq1: chr14_73131756_73132803
seq2: B6Ng01-154L19.g_67_1111

seq1  GAATTCCAATGTCATCCAGCCTGAAGCTGGCCAAAGAGCTCATGATTTGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAATGTCATCCAGCCTGAAGCTGGCCAAAGAGCTCATGATTTGA  50

seq1  TATAATTGGCATACTGAGGGGTACAAATTGAATTTCCAAACGATTTTAAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAATTGGCATACTGAGGGGTACAAATTGAATTTCCAAACGATTTTAAG  100

seq1  AATTTGCAAATAACAACTTCGAATATCTTTCATGATGATTGAAAAAGGAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTTGCAAATAACAACTTCGAATATCTTTCATGATGATTGAAAAAGGAG  150

seq1  TGTGTCTACACAGATTAGAGACTCGACTTAGATCATCATCAATTTAGACT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTCTACACAGATTAGAGACTCGACTTAGATCATCATCAATTTAGACT  200

seq1  GGATAATTAGAGGATATAATTTTTGGCCCAGTGGGATGTGTTTTGAATTC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATAATTAGAGGATATAATTTTTGGCCCAGTGGGATGTGTTTTGAATTC  250

seq1  AACACCAGTTATTTTTAGTAGAAGGTAAGGTCTGAATATTTCAGATGAAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACACCAGTTATTTTTAGTAGAAGGTAAGGTCTGAATATTTCAGATGAAA  300

seq1  TTGTACTATGTTAACTTAATTGTAAAGCCAGGGGCCTCGTTCTTTTTCTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTACTATGTTAACTTAATTGTAAAGCCAGGGGCCTCGTTCTTTTTCTG  350

seq1  TCATTTGCCTACTAGAAGTATGGTGTAATAATTAAAAGTTGGACTGTAGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATTTGCCTACTAGAAGTATGGTGTAATAATTAAAAGTTGGACTGTAGT  400

seq1  AAATTAAAAATAGGAAATCTCATCTTTAATAACTTGAAGAATTAAAAGTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATTAAAAATAGGAAATCTCATCTTTAATAACTTGAAGAATTAAAAGTT  450

seq1  TGTAAACCCATGGCAAGTCAGAGTGATGTTTTGTCTTTATGTACATAAAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAAACCCATGGCAAGTCAGAGTGATGTTTTGTCTTTATGTACATAAAT  500

seq1  ATGTTGATTTTATAAAGACCAAACTTCTTGCTTTATTACAAGGATAGAGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTTGATTTTATAAAGACCAAACTTCTTGCTTTATTACAAGGATAGAGT  550

seq1  TACAAATCAACATGCACTGTATTCTCAATGCATGAGGTTTAAAAAAAAGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAAATCAACATGCACTGTATTCTCAATGCATGAGGTTTAAAAAAAAGT  600

seq1  GTAAATTTAAATTACAAGCCTGTATTCATCGTAGGTGAGTCTTCTGCAGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAATTTAAATTACAAGCCTGTATTCATCGTAGGTGAGTCTTCTGCAGT  650

seq1  TTTGACAGAAGCTTCAAATCAAGTGTTCTCTGTGTCCCCCAGAAAGGATG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGACAGAAGCTTCAAATCAAGTGTTCTCTGTGTCCCCCAGAAAGGATG  700

seq1  ATTCAGAACTTGATGAGATCATTTGGGCCATCTAAGAAAGATTGTTACAC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCAGAACTTGATGAGATCATTTGGGCCATCTAAGAAAGATTGTTACAC  750

seq1  CATGCTGTCACCTAAGTGCCCTATTTGCAATGATTAGGACAACCATTTTG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGCTGTCACCTAAGTGCCCTATTTGCAATGATTAGGACAACCATTTTG  800

seq1  AGTCATCAAACTTAGTTTATTGATTACACACTAGAAATCCAGACTATGTA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCATCAAACTTAGTTTATTGATTACACACTAGAAATCCAGACTATGTA  850

seq1  GAAGGGAACAACACTAACAGCCTCTGTGGTGATGTGAGAAGTCTATTCTT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGGGAACAACACTAACAGCCTCTGTGGTGATGTGAGAAGTCTATTCTT  900

seq1  AAACTCAGGAGTTTAGACAAGGTAATGCAAATAGACACACCCTCATTTTG  950
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACTCA-GAGTTTAGACAAGGTAATGCAAATAGACACACCCTCATTTTG  949

seq1  CCTTCAGACACTGGCTTTCTCCAGAAATCTCTGAAGAATGACACCTCCAT  1000
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  CCTTCAGACACTGGCTTTCTCCAGAAATCTCTGAAGAATGACACCT-CAT  998

seq1  CCCCCAACTGCTGGCCACATTGACTGATGTCTGCTTATACTGTTTCTG  1048
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  -CCCCAACTGCTGGCCACATTGACTGATGTCTGCTTATACTGTTTCTG  1045