BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-155J21
Chromosome14 (Build37)
Map Location 33,815,134 - 33,959,849
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLrrc18
Upstream geneGalntl2, Dph3, Oxnad1, Msmb, Ncoa4, Timm23, Parg, LOC665601, Ogdhl, 1700024G13Rik, Chat, Slc18a3, LOC100040834, EG665618, Ercc6, 9430077A04Rik, Prrxl1, 3425401B19Rik, 1810011H11Rik, 4922501K12Rik, E130203B14Rik, EG665658
Downstream geneEG622657, Arhgap22, Mapk8, LOC100040079, LOC665681, Frmpd2, LOC100040093, Ptpn20, Gdf10, Gdf2, Rbp3, Zfp488, EG665754, EG432838, Antxrl, Anxa8, LOC100041131, LOC665768, Ppyr1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-155J21.bB6Ng01-155J21.g
ACCDH950350DH950351
length9531,089
definitionDH950350|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-155J21, 5' end.DH950351|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-155J21, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(33,815,134 - 33,816,088)(33,958,757 - 33,959,849)
sequence
gaattcagcacatctcacctagtcagtgacggtgcatgactgacaactgg
cagcattttcacagtaaacttcaggaaaccctcagatcaagtccctgtaa
gatctattcacactgtccacatctgtcctaagtagagggaattaatagaa
agagtagagcacttcctagttatagcccacagcagtccctggcccagaac
ggatgctgggtgaacagtagttctttcctcctgtgcagagactgcctacg
tcagaaagcagggctgatgtgggggagatctgtgaggagttccagaatca
tcatctccatacaagggactcagtggcctccatgtccctacaacctaagt
aactaactcgggtcctaggagtgaatagacctgtttgggggaagggactg
aggacacaggaagtggagccagcttgttctctgcccagtaaacgagatgg
gataaagaacaaacagtatccgaggatgctcaacctgtgatgatcaggcc
tgaatttatcgactttcaagtgtgataaaagtaacacatacacagcgttg
tacttgaagtttgaatctgtgtagttttcccagtctaacaacgtgacata
tgatgatcccccctctcctctctagcaacagcattgtacaggtgctatgt
ggctaagctgggatgtttggggtattggatagaatcaatgcattgttctc
ttacaagtgaggagggtttgttggggtatataacattatgcctcgttgat
aaacatttgtgcttttgggattaagggatttctcaggggagttcttgtta
ccacctaagagacagcccacaagcctagggtatttctcatccatgtgaaa
caatttcctccaaatggtaacatttggtgggtccagttcattatgtgtct
atgctacatctatgcatcagccaaagactgaagtaattactatgttacat
gtt
gaattccacccctgtctaggggtgacttagcctgtaccatctgcttgtgt
aatagaaacagatgagcctgactcagccacctaggctcagagtcagtgga
ttttcttcctaggatgctgaacatgaactgagaataccagtgggcacact
gatgctttctgagcagcaggtgctctgccccctactgggtgctaatgtga
actactagtgtcagctctaaaatccttcctcagagactgtcacacatata
tcaaaccacaggctgcttgactggcacatgccttgcctcgagtgggtctg
tcaggaaaccctgcacagacatcctgctgagggaatttttaaaggctaag
tgtgagtcgtctaggttgaaaggagagggaagagtttaaaggcacaaagt
accaagtggggaagaaacagtggtctgagacagctgggtggatctcgaga
tgctagctagggtaggaagttaggagctgtgggaagaggcaggagctgta
acgctgcaagcaccagctagagaagagtgttaggcagaatctagacaaag
aggatcagagatggctggcagcagagagcctcaaagttttagcaaatcca
aggcagaaatacatacaggcaggagctttgaaccaggtattctggggtga
gagacaataagggtagaagagaaagccggagtgggcaatgaaggtgcatc
cttttcgctgtctagatggaaatctgacttagaacagccatctacagcat
cacttgattctagttgataaaccccaaatctcctggtccagctttgttct
gtggaaatatacgtggaccaatcatctatctcgattttagcaagaagaaa
ctggttggattatttctgataacatatgtttatctacctcaatagacccc
aatcctcaaggaatgcttaaggtgtagccacaaacagagcagttagtgag
actcttgcttccttctttccccgtgctgcccttgaaatctgtgtggcctc
ctgctctcacgagcacgcctttggtcagagtagtcatgactgtgaacgct
tagcagttgccatctttggaaatgcagatgcagctcttt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_33815134_33816088
seq2: B6Ng01-155J21.b_50_1002

seq1  GAATTCAGCACATCTCACCTAGTCAGTGACGGTGCATGACTGACAACTGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGCACATCTCACCTAGTCAGTGACGGTGCATGACTGACAACTGG  50

seq1  CAGCATTTTCACAGTAAACTTCAGGAAACCCTCAGATCAAGTCCCTGTAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCATTTTCACAGTAAACTTCAGGAAACCCTCAGATCAAGTCCCTGTAA  100

seq1  GATCTATTCACACTGTCCACATCTGTCCTAAGTAGAGGGAATTAATAGAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCTATTCACACTGTCCACATCTGTCCTAAGTAGAGGGAATTAATAGAA  150

seq1  AGAGTAGAGCACTTCCTAGTTATAGCCCACAGCAGTCCCTGGCCCAGAAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGTAGAGCACTTCCTAGTTATAGCCCACAGCAGTCCCTGGCCCAGAAC  200

seq1  GGATGCTGGGTGAACAGTAGTTCTTTCCTCCTGTGCAGAGACTGCCTACG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATGCTGGGTGAACAGTAGTTCTTTCCTCCTGTGCAGAGACTGCCTACG  250

seq1  TCAGAAAGCAGGGCTGATGTGGGGGAGATCTGTGAGGAGTTCCAGAATCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGAAAGCAGGGCTGATGTGGGGGAGATCTGTGAGGAGTTCCAGAATCA  300

seq1  TCATCTCCATACAAGGGACTCAGTGGCCTCCATGTCCCTACAACCTAAGT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATCTCCATACAAGGGACTCAGTGGCCTCCATGTCCCTACAACCTAAGT  350

seq1  AACTAACTCGGGTCCTAGGAGTGAATAGACCTGTTTGGGGGAAGGGACTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTAACTCGGGTCCTAGGAGTGAATAGACCTGTTTGGGGGAAGGGACTG  400

seq1  AGGACACAGGAAGTGGAGCCAGCTTGTTCTCTGCCCAGTAAACGAGATGG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGACACAGGAAGTGGAGCCAGCTTGTTCTCTGCCCAGTAAACGAGATGG  450

seq1  GATAAAGAACAAACAGTATCCGAGGATGCTCAACCTGTGATGATCAGGCC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAAAGAACAAACAGTATCCGAGGATGCTCAACCTGTGATGATCAGGCC  500

seq1  TGAATTTATCGACTTTCAAGTGTGATAAAAGTAACACATACACAGCGTTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAATTTATCGACTTTCAAGTGTGATAAAAGTAACACATACACAGCGTTG  550

seq1  TACTTGAAGTTTGAATCTGTGTAGTTTTCCCAGTCTAACAACGTGACATA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTTGAAGTTTGAATCTGTGTAGTTTTCCCAGTCTAACAACGTGACATA  600

seq1  TGATGATCCCCCCTCTCCTCTCTAGCAACAGCATTGTACAGGTGCTATGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATGATCCCCCCTCTCCTCTCTAGCAACAGCATTGTACAGGTGCTATGT  650

seq1  GGCTAAGCTGGGATGTTTGGGGTATTGGATAGAATCAATGCATTGTTCTC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTAAGCTGGGATGTTTGGGGTATTGGATAGAATCAATGCATTGTTCTC  700

seq1  TTACAAGTGAGGAGGGTTTGTTGGGGTATATAACATTATGCCTCGTTGAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACAAGTGAGGAGGGTTTGTTGGGGTATATAACATTATGCCTCGTTGAT  750

seq1  AAACATTTGTGC-TTTGGGATTAAGGGATTTCTCAGGGAAGTTCTTGTTA  799
      |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  AAACATTTGTGCTTTTGGGATTAAGGGATTTCTCAGGGGAGTTCTTGTTA  800

seq1  CCACCTAAGAGACAGCCCACAAGCCTAGGGTATTTCTCATCCATGTGAAA  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACCTAAGAGACAGCCCACAAGCCTAGGGTATTTCTCATCCATGTGAAA  850

seq1  CAATTTCCTCCAAATGGTAACATTTGGTGGGTCCAGTTCAATTATGTGTC  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  CAATTTCCTCCAAATGGTAACATTTGGTGGGTCCAGTTC-ATTATGTGTC  899

seq1  TATGCTACATCTAATGCATCAGCCAAAGACTGAAGTAATTACTATGTTAC  949
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGCTACATCT-ATGCATCAGCCAAAGACTGAAGTAATTACTATGTTAC  948

seq1  TATGTT  955
       |||||
seq2  -ATGTT  953

seq1: chr14_33958757_33959849
seq2: B6Ng01-155J21.g_69_1157 (reverse)

seq1  AAAGGGCTGCATCTGCA-TTCCAAAGATTGGCAACTGACTAAGCGTTC-C  48
      |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |
seq2  AAAGAGCTGCATCTGCATTTCCAAAGA-TGGCAACTG-CTAAGCGTTCAC  48

seq1  AGTCATGACTACTCTGAACCAAAGCGTGCTCGTGAGGGCAGGA-GCCACA  97
      ||||||||||||||||| | || ||||||||||||| |||||| ||||||
seq2  AGTCATGACTACTCTGACCAAAGGCGTGCTCGTGAGAGCAGGAGGCCACA  98

seq1  CAGGATTTCCAAGGGGCAGCACGGGGAAAGAAGGAAGCAAGAGTCTCACT  147
      || ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CA-GATTTC--AAGGGCAGCACGGGGAAAGAAGGAAGCAAGAGTCTCACT  145

seq1  AACTGCTCTGTTTGTGGCTACACCTTAAGCATTCCTTGAGGATTTGGGGT  197
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  AACTGCTCTGTTTGTGGCTACACCTTAAGCATTCCTTGAGGA-TTGGGGT  194

seq1  CTATTGAGGTAGATAAACATATGTTATCAGAAATAATCCAACCAGTTTCT  247
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATTGAGGTAGATAAACATATGTTATCAGAAATAATCCAACCAGTTTCT  244

seq1  TCTTGCTAAAATCGAGATAGATGATTGGTCCACCTTATATTTCCACAGAA  297
      |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||
seq2  TCTTGCTAAAATCGAGATAGATGATTGGTCCA-CGTATATTTCCACAGAA  293

seq1  CAAAGCTGGACCAGGAGATTTGGGGTTTATCAACTAGAATCAAGTGATGC  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGCTGGACCAGGAGATTTGGGGTTTATCAACTAGAATCAAGTGATGC  343

seq1  TGTAGATGGCTGTTCTAAGTCAGATTTCCATCTAGACAGCGGAAAGGATG  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  TGTAGATGGCTGTTCTAAGTCAGATTTCCATCTAGACAGCGAAAAGGATG  393

seq1  CACCTTCATTGCCCACTCCGGCTTTCTCTTCTACCCTTATTGTCTCTCAC  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCTTCATTGCCCACTCCGGCTTTCTCTTCTACCCTTATTGTCTCTCAC  443

seq1  CCCAGAATACCTGGTTCAAAGCTCCTGCCTGTATGTATTTCTGCCTTGGA  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAGAATACCTGGTTCAAAGCTCCTGCCTGTATGTATTTCTGCCTTGGA  493

seq1  TTTGCTAAAACTTTGAGGCTCTCTGCTGCCAGCCATCTCTGATCCTCTTT  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGCTAAAACTTTGAGGCTCTCTGCTGCCAGCCATCTCTGATCCTCTTT  543

seq1  GTCTAGATTCTGCCTAACACTCTTCTCTAGCTGGTGCTTGCAGCGTTACA  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTAGATTCTGCCTAACACTCTTCTCTAGCTGGTGCTTGCAGCGTTACA  593

seq1  GCTCCTGCCTCTTCCCACAGCTCCTAACTTCCTACCCTAGCTAGCATCTC  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCCTGCCTCTTCCCACAGCTCCTAACTTCCTACCCTAGCTAGCATCTC  643

seq1  GAGATCCACCCAGCTGTCTCAGACCACTGTTTCTTCCCCACTTGGTACTT  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGATCCACCCAGCTGTCTCAGACCACTGTTTCTTCCCCACTTGGTACTT  693

seq1  TGTGCCTTTAAACTCTTCCCTCTCCTTTCAACCTAGACGACTCACACTTA  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGCCTTTAAACTCTTCCCTCTCCTTTCAACCTAGACGACTCACACTTA  743

seq1  GCCTTTAAAAATTCCCTCAGCAGGATGTCTGTGCAGGGTTTCCTGACAGA  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTTTAAAAATTCCCTCAGCAGGATGTCTGTGCAGGGTTTCCTGACAGA  793

seq1  CCCACTCGAGGCAAGGCATGTGCCAGTCAAGCAGCCTGTGGTTTGATATA  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCACTCGAGGCAAGGCATGTGCCAGTCAAGCAGCCTGTGGTTTGATATA  843

seq1  TGTGTGACAGTCTCTGAGGAAGGATTTTAGAGCTGACACTAGTAGTTCAC  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTGACAGTCTCTGAGGAAGGATTTTAGAGCTGACACTAGTAGTTCAC  893

seq1  ATTAGCACCCAGTAGGGGGCAGAGCACCTGCTGCTCAGAAAGCATCAGTG  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAGCACCCAGTAGGGGGCAGAGCACCTGCTGCTCAGAAAGCATCAGTG  943

seq1  TGCCCACTGGTATTCTCAGTTCATGTTCAGCATCCTAGGAAGAAAATCCA  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCCACTGGTATTCTCAGTTCATGTTCAGCATCCTAGGAAGAAAATCCA  993

seq1  CTGACTCTGAGCCTAGGTGGCTGAGTCAGGCTCATCTGTTTCTATTACAC  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGACTCTGAGCCTAGGTGGCTGAGTCAGGCTCATCTGTTTCTATTACAC  1043

seq1  AAGCAGATGGTACAGGCTAAGTCACCCCTAGACAGGGGTGGAATTC  1093
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCAGATGGTACAGGCTAAGTCACCCCTAGACAGGGGTGGAATTC  1089