BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-164A13
Chromosome14 (Build37)14 (Build37)
Map Location 23,739,920 - 23,740,75323,245,393 - 23,245,668
singlet/doubletsingletsinglet
Overlap gene1700112E06Rik
Upstream geneZfp503, EG665075, EG435392, LOC665068
Downstream geneKcnma1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-164A13.bB6Ng01-164A13.g
ACCDH956469DH956470
length834276
definitionDH956469|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-164A13, 5' end.DH956470|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-164A13, 3' end.
singlet/doubletsingletsinglet
BLAST hituniqueunique
Map location.(23,739,920 - 23,740,753)(23,245,393 - 23,245,668)
sequence
gaattccttgaacacttgccttaggaataaagattataattactatgaat
tgattaccttatataatcataagacctccttgggttgacccattggtaac
tgaattttacaaacaaggacaaaaaatccccaaacaaacaaacaaaaaac
aaaaccaaaacaaacaaacaaacaaacaaaaaaacaaagacaaagagata
ccccagcctccagatacatggctacaagcaggttcaagtccactctgggc
agaatggtccaagaccagggacacagtcactgattctatttaagtgccca
ttactcatctctggcatatcccaggaatgtgaacttggaaatggttttca
agtctgagccccatgaagaaggtgccatctctcaatccatggtgttgttg
catctacacacttttcaaacaggatgactgagcatcaatgcttctcttta
tttaaggtatcattaatatttatgaacttcagagaaagacttccagggtc
tgttaggaattacaaagcagcaaagcaaaacaaaatcatagaaagtgcaa
agcagcaaaccacaactcatgaaggtctgggtcccactccaagaaacttg
catctttgcctcctctctagcattaaatagttgcttcagttctgccaagt
gctcagcataggccagaagaaagatgaaaagaaacctgtctgttatggga
gagcagatgagtatctgctgaagttcagaactctctggcaatgggattag
agagacttcacagaggacatcctcaaggagtatgctaaagacctcagaat
ttcaggaaggatgcctatgggggaggggggaggg
ttaggcagtcatttgaagccttttgctatatatatatatatgtggtgggt
gatatttaagaggcacacaaaacattaaaaattaccttgagaatagtgtg
ccctcccttgaataatgaagaagtaatgtggggaaatagggtggtgttgg
ggtgccatcattccccacttgacagatgatgagcagctcagggcttgcta
accatgctggtgataggatgatccaatggcagcatgttttgaacagtgaa
gggggtcatgtggggggtaggggtca
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_23739920_23740753
seq2: B6Ng01-164A13.b_46_879

seq1  GAATTCCTTGAACACTTGCCTTAGGAATAAAGATTATAATTACTATGAAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTTGAACACTTGCCTTAGGAATAAAGATTATAATTACTATGAAT  50

seq1  TGATTACCTTATATAATCATAAGACCTCCTTGGGTTGACCCATTGGTAAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATTACCTTATATAATCATAAGACCTCCTTGGGTTGACCCATTGGTAAC  100

seq1  TGAATTTTACAAACAAGGACAAAAAATCCCCAAACAAACAAACAAAAAAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAATTTTACAAACAAGGACAAAAAATCCCCAAACAAACAAACAAAAAAC  150

seq1  AAAACCAAAACAAACAAACAAACAAACAAAAAAACAAAGACAAAGAGATA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAACCAAAACAAACAAACAAACAAACAAAAAAACAAAGACAAAGAGATA  200

seq1  CCCCAGCCTCCAGATACATGGCTACAAGCAGGTTCAAGTCCACTCTGGGC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCAGCCTCCAGATACATGGCTACAAGCAGGTTCAAGTCCACTCTGGGC  250

seq1  AGAATGGTCCAAGACCAGGGACACAGTCACTGATTCTATTTAAGTGCCCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAATGGTCCAAGACCAGGGACACAGTCACTGATTCTATTTAAGTGCCCA  300

seq1  TTACTCATCTCTGGCATATCCCAGGAATGTGAACTTGGAAATGGTTTTCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACTCATCTCTGGCATATCCCAGGAATGTGAACTTGGAAATGGTTTTCA  350

seq1  AGTCTGAGCCCCATGAAGAAGGTGCCATCTCTCAATCCATGGTGTTGTTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCTGAGCCCCATGAAGAAGGTGCCATCTCTCAATCCATGGTGTTGTTG  400

seq1  CATCTACACACTTTTCAAACAGGATGACTGAGCATCAATGCTTCTCTTTA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTACACACTTTTCAAACAGGATGACTGAGCATCAATGCTTCTCTTTA  450

seq1  TTTAAGGTATCATTAATATTTATGAACTTCAGAGAAAGACTTCCAGGGTC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAAGGTATCATTAATATTTATGAACTTCAGAGAAAGACTTCCAGGGTC  500

seq1  TGTTAGGAATTACAAAGCAGCAAAGCAAAACAAAATCATAGAAAGTGCAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTAGGAATTACAAAGCAGCAAAGCAAAACAAAATCATAGAAAGTGCAA  550

seq1  AGCAGCAAACCACAACTCATGAAGGTCTGGGTCCCACTCCAAGAAACTTG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAGCAAACCACAACTCATGAAGGTCTGGGTCCCACTCCAAGAAACTTG  600

seq1  CATCTTTGCCTCCTCTCTAGCATTAAATAGTTGCTTCAGTTCTGCCAAGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTTTGCCTCCTCTCTAGCATTAAATAGTTGCTTCAGTTCTGCCAAGT  650

seq1  GCTCAGCATAGGCCAGAAGAAAGATGAAAAGAAACCTGTCTGTTATGGGA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCAGCATAGGCCAGAAGAAAGATGAAAAGAAACCTGTCTGTTATGGGA  700

seq1  GAGCAGATGAGTATCTGCTGAAGTTCAGAACTCTCTGGCAATGGGATTAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCAGATGAGTATCTGCTGAAGTTCAGAACTCTCTGGCAATGGGATTAG  750

seq1  AGAGACTTCACAGAGGACATCCTCAAGGAGTATGCTAAAGACCTCAGAAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGACTTCACAGAGGACATCCTCAAGGAGTATGCTAAAGACCTCAGAAT  800

seq1  TTCAGGAAGGATGCCTATGGGGGAGGGGGGAGGG  834
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAGGAAGGATGCCTATGGGGGAGGGGGGAGGG  834

seq1: chr14_23245393_23245668
seq2: B6Ng01-164A13.g_74_349

seq1  TTAGGCAGTCATTTGAAGCCTTTTGCTATATATATATATATGTGGTGGGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGGCAGTCATTTGAAGCCTTTTGCTATATATATATATATGTGGTGGGT  50

seq1  GATATTTAAGAGGCACACAAAACATTAAAAATTACCTTGAGAATAGTGTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATATTTAAGAGGCACACAAAACATTAAAAATTACCTTGAGAATAGTGTG  100

seq1  CCCTCCCTTGAATAATGAAGAAGTAATGTGGGGAAATAGGGTGGTGTTGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTCCCTTGAATAATGAAGAAGTAATGTGGGGAAATAGGGTGGTGTTGG  150

seq1  GGTGCCATCATTCCCCACTTGACAGATGATGAGCAGCTCAGGGCTTGCTA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGCCATCATTCCCCACTTGACAGATGATGAGCAGCTCAGGGCTTGCTA  200

seq1  ACCATGCTGGTGATAGGATGATCCAATGGCAGCATGTTTTGAACAGTGAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCATGCTGGTGATAGGATGATCCAATGGCAGCATGTTTTGAACAGTGAA  250

seq1  GGGGGTCATGTGGGGGGTAGGGGTCA  276
      ||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGGTCATGTGGGGGGTAGGGGTCA  276