BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-169C04
Chromosome14 (Build37)
Map Location 8,211,254 - 8,304,499
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC623215, LOC100042286, LOC666957, LOC100042263, LOC100042258
Upstream geneB930046C15Rik, LOC100041600, LOC100041958, LOC100041964, LOC546590, LOC666906, LOC100042024, LOC100041664, LOC100042077, LOC100041675, LOC666329, EG666833, LOC100042043, EG666918, LOC100041700, LOC100042054, LOC100042100, EG622781, LOC100041740, LOC100038847, LOC100042129, LOC100041770, LOC100042149, LOC544988, EG626456, LOC100041791, LOC100042164, LOC100042182, LOC100041808, LOC100042192, LOC100042207, EG432817, LOC100042217, LOC100041830, LOC100042235, EG545013, EG666947
Downstream geneLOC100042272, LOC100041874, LOC100042304, LOC100041881, LOC100042312, LOC100041893, ENSMUSG00000058570, EG666976, Flnb, Dnase1l3, Abhd6, Rpp14, Pxk, Pdhb, Kctd6, Acox2, BC055107, Oit1, LOC667005, 4930452B06Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-169C04.bB6Ng01-169C04.g
ACCDH960191DH960192
length1,236983
definitionDH960191|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-169C04, 5' end.DH960192|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-169C04, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(8,303,246 - 8,304,499)(8,211,254 - 8,212,237)
sequence
gaattcaacatcattaaatcacaacatgagaagacaatgttggatatgaa
taaaatgatccagtccataattggttccatgcagtactccaaggaactga
tagaagataactattcctacaggtgagtcagtgacacaaatgagaccccc
agaactaggcagggaatgcttctgtccttttaggactttgaacaaaagca
agggttctggttctatgctatctgttttttatttaggaaccctgccctga
ggcaagggtcttggatttgtacctcttggacacaggtgtcctaagtgtga
agagtgtccaagaccctccaatctttattcttccaaattcaagatcctct
acatagaaaacttttccaccacgctgggaatatccaggaaccctgaacct
ctgggtttctgaccacagattaaaagatctaggattcccaacaaaaatgt
aaagattgcacacctgtttggtcgtctcacctctctcagaggggctaagc
cctctccctgctgaaggttttatggtaccacagacctataatcaaccatg
aggaacatttcctcttctgtcatgtatatggtgtactcttggtgtcaggg
tttttagaagtttgttgagtcctgtggaatatggctggtatcttgatatg
acctgcctctgtttggtgctcctatgtaactgtggactcttctgggggct
gtctgggaatcagggcccttgcagggatcataggacttgtaggagtggca
agccaatggaatctggctgggaatcaccaatttttctttgtggatcagca
ttaaggaggaccacctcctccgtgagtgcactcaactccacgaaaacgta
aaggatattactgaatgagaacagaaagctgctggtggagcagctggcca
caagtgtcctgtggggaagaaaagaggtctctgaggagccagcaagaaca
tctgtgtcccaagtgccaaggaacaccagtagatgatttgtatcagagca
gattgcctcatgtctaaacataaacatagacaatcaatgtaatagttcaa
cacttcttcagcactcacctatgttttcctcaaaggatgttagtatcatc
tacagggctctcttggggaagtagcttgttcaagaaactgccattttggc
atgcaagtttcctgctctgctatatacacaaaggatatgtttgattagac
atctcacacccatatgcttaactttgaaggggctgt
gaattccctgcatcacatcaaacatgagctaacaatgtccttcaattctt
cttgcctgggccagctgatacatttcagagccagggagatggcagtaggg
tgtgaggcatatgtctacctatggtgcttgggaacagggacatagctgag
gagcccagcttgaagataactttcctgctctttcagggattcattagtgt
ctctagcaacacttcttcctcagatttctatttgggactaagcatggttt
ctcctggccctgtgccatcatctatgcaagtttactagtgtttatctaaa
tacaggatctactggaaggcataatcccaaccctccaccatctctaagga
ggaggagaggttgaagaggttggagaatctgacaatctccagaagatgac
aaatgggagggatgaactctggggaatcctggcccattacactaacaagg
atttgaacaacaacaggtagtcattatgcccagttctttgctatcttggg
ccctctctgttaacccaagatttcctcacatcacaggagactacaactcc
agagtgttctcatgcccaaaatcattttcctgattacatcttagatacag
aacttgaagttcagataggagtgagatggggtcacaggctcttttgattc
ccccaaaagtaaaccagagcctgtggcctgaatcacagtctgggaataag
ggtagaagtgtgtgagctctcatcctgcattttaagaagcctggacatgt
gttggcttatggaaattactaggtgctgtgtgcttatggcaaatcacttt
tgtaactgacctggaagtactttggttctaattggtcctgtcaacagctg
gagagttctggtcccacgtgctgcctctcagtgtgacaggatttctgcag
gtcactgcttttctctgatttgctcattgtactctgaattgtatttattt
ggcattctaagtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_8303246_8304499
seq2: B6Ng01-169C04.b_45_1280 (reverse)

seq1  ACAGCACCCTTCAAACTTAAGGCATATAGTGTTGTGATGTCTAATCAACC  50
      ||||| ||||||||| |||| |||||| |   || ||||||||||||| |
seq2  ACAGC-CCCTTCAAAGTTAA-GCATATGGGTGTGAGATGTCTAATCAAAC  48

seq1  TATCTCCCTTAGTGATTATAGCAGAGCAGGAACATTTGCATGCCAAATAT  100
       || | |||| |||  |||||||||||||||| | ||||||||||||   
seq2  -ATAT-CCTTTGTGTATATAGCAGAGCAGGAA-ACTTGCATGCCAAAATG  95

seq1  GCAGTTTCTTGAACCAGGCTACCTCCAC-AGAGAGCCCTGTAGATGATCA  149
      ||||||||||||| || ||||| ||| | |||||||||||||||||||  
seq2  GCAGTTTCTTGAA-CAAGCTACTTCCCCAAGAGAGCCCTGTAGATGAT--  142

seq1  CATAAACAAACA--CTTGGAGG-AAACATAGGTGAGTGCCTGGAGAAGTT  196
           || ||||  ||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||| |
seq2  -----ACTAACATCCTTTGAGGAAAACATAGGTGAGTG-CTGAAGAAG-T  185

seq1  GGTGGACTATTACATTTGATTGTCTATGTTTATGTTTAGACATGAGGGCA  246
      | || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  GTTGAACTATTACA-TTGATTGTCTATGTTTATGTTTAGACATGA-GGCA  233

seq1  ATCTGCCTCTGATACACATCATCCTACCTGGTGTTCCTTGGCACTTGGGA  296
      ||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTG-CTCTGATACAAATCAT-CTA-CTGGTGTTCCTTGGCACTTGGGA  280

seq1  CACAGATGTTCTTGCTGGCCTCCTCAGAGAACCTCTTTTCTTCCCCACAG  346
      |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  CACAGATGTTCTTGCTGG-CTCCTCAGAG-ACCTCTTTTCTTCCCCACAG  328

seq1  GACACTTGTGGCCAGCCTGCTCCACCAGCAGCCTTCTGTTCTCATTCAGT  396
      ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  GACACTTGTGGCCAG-CTGCTCCACCAGCAGCTTTCTGTTCTCATTCAGT  377

seq1  AATATCC-TTACGTTTTCGTGGAGTTGAGTGCACTCACGGAGGAGGTGGT  445
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATATCCTTTACGTTTTCGTGGAGTTGAGTGCACTCACGGAGGAGGTGGT  427

seq1  CCTCCTTAATGCTGATCCACAAAGAAAAATTGGTGATTCCCAGCCAGATT  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCCTTAATGCTGATCCACAAAGAAAAATTGGTGATTCCCAGCCAGATT  477

seq1  CCATTGGCTTGCCACTCCTACAAGTCCTATGATCCCTGCAAGGGCCCTGA  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATTGGCTTGCCACTCCTACAAGTCCTATGATCCCTGCAAGGGCCCTGA  527

seq1  TTCCCAGACAGCCCCCAGAAGAGTCCACAGTTACATAGGAGCACCAAACA  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCCAGACAGCCCCCAGAAGAGTCCACAGTTACATAGGAGCACCAAACA  577

seq1  GAGGCAGGTCATATCAAGATACCAGCCATATTCCACAGGACTCAACAAAC  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGCAGGTCATATCAAGATACCAGCCATATTCCACAGGACTCAACAAAC  627

seq1  TTCTAAAAACCCTGACACCAAGAGTACACCATATACATGACAGAAGAGGA  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTAAAAACCCTGACACCAAGAGTACACCATATACATGACAGAAGAGGA  677

seq1  AATGTTCCTCATGGTTGATTATAGGTCTGTGGTACCATAAAACCTTCAGC  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGTTCCTCATGGTTGATTATAGGTCTGTGGTACCATAAAACCTTCAGC  727

seq1  AGGGAGAGGGCTTAGCCCCTCTGAGAGAGGTGAGACGACCAAACAGGTGT  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGAGAGGGCTTAGCCCCTCTGAGAGAGGTGAGACGACCAAACAGGTGT  777

seq1  GCAATCTTTACATTTTTGTTGGGAATCCTAGATCTTTTAATCTGTGGTCA  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAATCTTTACATTTTTGTTGGGAATCCTAGATCTTTTAATCTGTGGTCA  827

seq1  GAAACCCAGAGGTTCAGGGTTCCTGGATATTCCCAGCGTGGTGGAAAAGT  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAACCCAGAGGTTCAGGGTTCCTGGATATTCCCAGCGTGGTGGAAAAGT  877

seq1  TTTCTATGTAGAGGATCTTGAATTTGGAAGAATAAAGATTGGAGGGTCTT  945
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTATGTAGAGGATCTTGAATTTGGAAGAATAAAGATTGGAGGGTCTT  927

seq1  GGACACTCTTCACACTTAGGACACCTGTGTCCAAGAGGTACAAATCCAAG  995
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACACTCTTCACACTTAGGACACCTGTGTCCAAGAGGTACAAATCCAAG  977

seq1  ACCCTTGCCTCAGGGCAGGGTTCCTAAATAAAAAACAGATAGCATAGAAC  1045
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCTTGCCTCAGGGCAGGGTTCCTAAATAAAAAACAGATAGCATAGAAC  1027

seq1  CAGAACCCTTGCTTTTGTTCAAAGTCCTAAAAGGACAGAAGCATTCCCTG  1095
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAACCCTTGCTTTTGTTCAAAGTCCTAAAAGGACAGAAGCATTCCCTG  1077

seq1  CCTAGTTCTGGGGGTCTCATTTGTGTCACTGACTCACCTGTAGGAATAGT  1145
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTAGTTCTGGGGGTCTCATTTGTGTCACTGACTCACCTGTAGGAATAGT  1127

seq1  TATCTTCTATCAGTTCCTTGGAGTACTGCATGGAACCAATTATGGACTGG  1195
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCTTCTATCAGTTCCTTGGAGTACTGCATGGAACCAATTATGGACTGG  1177

seq1  ATCATTTTATTCATATCCAACATTGTCTTCTCATGTTGTGATTTAATGAT  1245
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCATTTTATTCATATCCAACATTGTCTTCTCATGTTGTGATTTAATGAT  1227

seq1  GTTGAATTC  1254
      |||||||||
seq2  GTTGAATTC  1236

seq1: chr14_8211254_8212237
seq2: B6Ng01-169C04.g_69_1051

seq1  GAATTCCCTGCATCACATCAAACATGAGCTAACAATGTCCTTCAATTCTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCCTGCATCACATCAAACATGAGCTAACAATGTCCTTCAATTCTT  50

seq1  CTTGCCTGGGCCAGCTGATACATTTCAGAGCCAGGGAGATGGCAGTAGGG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGCCTGGGCCAGCTGATACATTTCAGAGCCAGGGAGATGGCAGTAGGG  100

seq1  TGTGAGGCATATGTCTACCTATGGTGCTTGGGAACAGGGACATAGCTGAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGAGGCATATGTCTACCTATGGTGCTTGGGAACAGGGACATAGCTGAG  150

seq1  GAGCCCAGCTTGAAGATAACTTTCCTGCTCTTTCAGGGATTCATTAGTGT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCCCAGCTTGAAGATAACTTTCCTGCTCTTTCAGGGATTCATTAGTGT  200

seq1  CTCTAGCAACACTTCTTCCTCAGATTTCTATTTGGGACTAAGCATGGTTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTAGCAACACTTCTTCCTCAGATTTCTATTTGGGACTAAGCATGGTTT  250

seq1  CTCCTGGCCCTGTGCCATCATCTATGCAAGTTTACTAGTGTTTATCTACC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  
seq2  CTCCTGGCCCTGTGCCATCATCTATGCAAGTTTACTAGTGTTTATCTAAA  300

seq1  TACAGGATCTACTGGAAGGCATCATCCCAACCCTCCACCATCTCTAAGGA  350
      |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAGGATCTACTGGAAGGCATAATCCCAACCCTCCACCATCTCTAAGGA  350

seq1  GGAGGAGAGGTTGAAGAGGTTGGAGAATCTGACATTCTCCAGAAGATGAC  400
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  GGAGGAGAGGTTGAAGAGGTTGGAGAATCTGACAATCTCCAGAAGATGAC  400

seq1  AAATGGGAGGGATGAACTCTGGGGAATCCTGGCCCATTACACTAACAAGG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGGGAGGGATGAACTCTGGGGAATCCTGGCCCATTACACTAACAAGG  450

seq1  ATTTGAACAACAACAGGTAGTCATTATGCCCAGTTCTTTGCTATCTTGGG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTGAACAACAACAGGTAGTCATTATGCCCAGTTCTTTGCTATCTTGGG  500

seq1  CCCTCTCTGTTAACCCAAGATTTCCTCACATCACAGGAGGCTACAACTCC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  CCCTCTCTGTTAACCCAAGATTTCCTCACATCACAGGAGACTACAACTCC  550

seq1  AGAGTGTTCTCATGCCCAAAATCATTTTCCTGATTACATCTTAGATACAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGTGTTCTCATGCCCAAAATCATTTTCCTGATTACATCTTAGATACAG  600

seq1  AACTTGAAGTTCAGATAGGAGTGAGATGGGGTCACAGGCTCTTTTGATTC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTTGAAGTTCAGATAGGAGTGAGATGGGGTCACAGGCTCTTTTGATTC  650

seq1  CCCCAAAAGTAAACCAGAGCCTGTGGCCTGAATCACAGTCTGGGAATAAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCAAAAGTAAACCAGAGCCTGTGGCCTGAATCACAGTCTGGGAATAAG  700

seq1  GGTAGAAGTGTGTGAGCTCTCATCCTGCATTTTAAGAAGCCTGGACATGT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTAGAAGTGTGTGAGCTCTCATCCTGCATTTTAAGAAGCCTGGACATGT  750

seq1  GTTGGCTTATGGAAATTACTAGGTGCTGTGTGCTTATGGCAAATCACTTT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGGCTTATGGAAATTACTAGGTGCTGTGTGCTTATGGCAAATCACTTT  800

seq1  TGTAACTGACCTGGAGGTACTTTGGTTCTAATTGGTCCTGTCAACAGCTG  850
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAACTGACCTGGAAGTACTTTGGTTCTAATTGGTCCTGTCAACAGCTG  850

seq1  AAGAGTTCTGGTCCCACGTGCTGCCTCTCAGTGTGACAGGATTTCTGCAG  900
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAGTTCTGGTCCCACGTGCTGCCTCTCAGTGTGACAGGATTTCTGCAG  900

seq1  GTCACTGCTTTTCTCTGATTTTGCTCATTGTACTCTGAATTGTATTTATT  950
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCACTGCTTTTCTCTGA-TTTGCTCATTGTACTCTGAATTGTATTTATT  949

seq1  TGGCATTCTAAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG  984
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCATTCTAAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG  983