BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-184G24
Chromosome14 (Build37)
Map Location 35,796,422 - 35,938,332
singlet/doubletdoublet
Overlap geneGrid1
Upstream geneEG665754, EG432838, Antxrl, Anxa8, LOC100041131, LOC665768, Ppyr1, LOC100041163, Gprin2, Syt15, 3110001K24Rik, LOC623142, Glud1, LOC100041231, 2200001I15Rik, Sncg, Mmrn2, Bmpr1a, 9230112D13Rik, LOC665834, Ldb3, Opn4, 5830448L01Rik, Wapal, LOC100041341
Downstream gene4930596D02Rik, LOC100040277, LOC665933, 4930474N05Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-184G24.bB6Ng01-184G24.g
ACCGA009817GA009818
length306886
definitionB6Ng01-184G24.b B6Ng01-184G24.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(35,938,027 - 35,938,332)(35,796,422 - 35,797,301)
sequence
actgacaaaacatctttgagaaatagcgttattcaaatttacaacttcag
aatcataaatgagcttatggtaagtaaacttacccttcagagtgatcaaa
tagaaatcccaaggctctgaaatgctgttaatatttaattctttaaatga
ggtacttataggtgtgctagaacagctaatggcatcctagaagcagctat
ccttagatgttacccaggaaaacagaaaaccttaatgctgctttaagagt
tttggattctgtatatgcgataagtatgtgaatgtaggtgtgtgtgtgtg
tgtgtg
gaattcatgtcggtacgagtaaccaagcatttggagcgctcttcctttat
aactactgtttccttggaactaattgggtcttgagggaactacatttatc
tttcaggtatgactatcccatgccttaactgtcttctactgtgtgaaatc
tttcacttctgaatattgttacagtggacactacacttctaacttgtggg
cctttgggggtcacattcaaagcacagagacagatatttaataatgcaaa
tgtatgtttgaatatatgagcatgtctcagtgttgtaagcaaagtgggtg
tgtgtacatgcatgtttatgtgtgtgtgcgcgagcgcatgtgcctatata
tgtgagtgcatgtatatgtgtgcttttccaattgcctttcatggtggtgc
tctctgacagactcagacctgaagcaccagaggaaggatagcttcacaga
gcatggtggatgcttggctcagaatccttccacaccatgcagagggattt
tactcctgattaaccccagattcaccatcaactgtagtacccaggacagt
tggaatggccatttatttttacaagatggcgcaggggcttgtgggagatc
cctgagctctggagtgagggagtcttctctgagtgacattttagctttca
ggtattttcccctctgggttggggaatgccacccctcctttaccttcctg
cagtgtccaagatcccttggtttagtagaagggagagtctgtgggaatac
ccatagatttcccccgcataaaggctggagagttctgagtccttgatgta
tgagatgctaaaactgggggcctgttccaggattgcttctgggtagtgag
aggtactagataaagagccagcagtctgcttctgct
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_35938027_35938332
seq2: B6Ng01-184G24.b_49_354 (reverse)

seq1  CACACACACACACACACACCTACATTCACATACTTATCGCATATACAGAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACACACACACACACACCTACATTCACATACTTATCGCATATACAGAA  50

seq1  TCCAAAACTCTTAAAGCAGCATTAAGGTTTTCTGTTTTCCTGGGTAACAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAAAACTCTTAAAGCAGCATTAAGGTTTTCTGTTTTCCTGGGTAACAT  100

seq1  CTAAGGATAGCTGCTTCTAGGATGCCATTAGCTGTTCTAGCACACCTATA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAGGATAGCTGCTTCTAGGATGCCATTAGCTGTTCTAGCACACCTATA  150

seq1  AGTACCTCATTTAAAGAATTAAATATTAACAGCATTTCAGAGCCTTGGGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTACCTCATTTAAAGAATTAAATATTAACAGCATTTCAGAGCCTTGGGA  200

seq1  TTTCTATTTGATCACTCTGAAGGGTAAGTTTACTTACCATAAGCTCATTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTATTTGATCACTCTGAAGGGTAAGTTTACTTACCATAAGCTCATTT  250

seq1  ATGATTCTGAAGTTGTAAATTTGAATAACGCTATTTCTCAAAGATGTTTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGATTCTGAAGTTGTAAATTTGAATAACGCTATTTCTCAAAGATGTTTT  300

seq1  GTCAGT  306
      ||||||
seq2  GTCAGT  306

seq1: chr14_35796422_35797301
seq2: B6Ng01-184G24.g_67_952

seq1  GAATTCATGTCGGTACGAGTAACCAAGCATTTGGAGCGCTCTTCCTTTAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATGTCGGTACGAGTAACCAAGCATTTGGAGCGCTCTTCCTTTAT  50

seq1  AACTACTGTTTCCTTGGAACTAATTGGGTCTTGAGGGAACTACATTTATC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTACTGTTTCCTTGGAACTAATTGGGTCTTGAGGGAACTACATTTATC  100

seq1  TTTCAGGTATGACTATCCCATGCCTTAACTGTCTTCTACTGTGTGAAATC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCAGGTATGACTATCCCATGCCTTAACTGTCTTCTACTGTGTGAAATC  150

seq1  TTTCACTTCTGAATATTGTTACAGTGGACACTACACTTCTAACTTGTGGG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCACTTCTGAATATTGTTACAGTGGACACTACACTTCTAACTTGTGGG  200

seq1  CCTTTGGGGGTCACATTCAAAGCACAGAGACAGATATTTAATAATGCAAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTTGGGGGTCACATTCAAAGCACAGAGACAGATATTTAATAATGCAAA  250

seq1  TGTATGTTTGAATATATGAGCATGTCTCAGTGTTGTAAGCAAAGTGGGTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTATGTTTGAATATATGAGCATGTCTCAGTGTTGTAAGCAAAGTGGGTG  300

seq1  TGTGTACATGCATGTTTATGTGTGTGTGCGCGAGCGCATGTGCCTATATA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTACATGCATGTTTATGTGTGTGTGCGCGAGCGCATGTGCCTATATA  350

seq1  TGTGAGTGCATGTATATGTGTGCTTTTCCAATTGCCTTTCATGGTGGTGC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGAGTGCATGTATATGTGTGCTTTTCCAATTGCCTTTCATGGTGGTGC  400

seq1  TCTCTGACAGACTCAGACCTGAAGCACCAGAGGAAGGATAGCTTCACAGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTGACAGACTCAGACCTGAAGCACCAGAGGAAGGATAGCTTCACAGA  450

seq1  GCATGGTGGATGCTTGGCTCAGAATCCTTCCACACCATGCAGAGGGATTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATGGTGGATGCTTGGCTCAGAATCCTTCCACACCATGCAGAGGGATTT  500

seq1  TACTCCTGATTAACCCCAGATTCACCATCAACTGTAGTACCCAGGACAGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTCCTGATTAACCCCAGATTCACCATCAACTGTAGTACCCAGGACAGT  550

seq1  TGGAATGGCCATTTATTTTTACAAGATGGCGCAGGGGCTTGTGGGAGATC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAATGGCCATTTATTTTTACAAGATGGCGCAGGGGCTTGTGGGAGATC  600

seq1  CCTGAGCTCTGGAGTGAGGGAGTCTTCTCTGAGTGACATTTTAGCTTTCA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGAGCTCTGGAGTGAGGGAGTCTTCTCTGAGTGACATTTTAGCTTTCA  650

seq1  GGTATTTTCCCCTCTGGGTTGGGGAATGCCACCCCTCCTTTACCTTCCTG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTATTTTCCCCTCTGGGTTGGGGAATGCCACCCCTCCTTTACCTTCCTG  700

seq1  CAGTGTCCAAGATCCCTTGGTTTAGTAGAAGGGAGAGTCTGTGGGAATAC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGTCCAAGATCCCTTGGTTTAGTAGAAGGGAGAGTCTGTGGGAATAC  750

seq1  CCATAGATTT-CCCCGCATAAAGGCTGGAGAGTTCTGAGTC--TGATGTA  797
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||
seq2  CCATAGATTTCCCCCGCATAAAGGCTGGAGAGTTCTGAGTCCTTGATGTA  800

seq1  TGAGATGCTAAAACT-GGGGCCTGGTCCAGGATTGCTTCTGGGTAGTGAG  846
      ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGATGCTAAAACTGGGGGCCTGTTCCAGGATTGCTTCTGGGTAGTGAG  850

seq1  AGGTACTAGATAAAGAG-CAGCAGTCTGC-TCTGCT  880
      ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||
seq2  AGGTACTAGATAAAGAGCCAGCAGTCTGCTTCTGCT  886