BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-190H10
Chromosome14 (Build37)
Map Location 86,112,410 - 86,224,556
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC629794, LOC668603
Downstream geneLOC100043301, EG629815, LOC100043306, LOC100043778, LOC100043310, LOC100043311, Diap3
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-190H10.bB6Ng01-190H10.g
ACCGA014212GA014213
length1,151928
definitionB6Ng01-190H10.b B6Ng01-190H10.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(86,112,410 - 86,113,574)(86,223,630 - 86,224,556)
sequence
gaattctcaaggttattaagtgcatatggagtgttgccacataaatattg
tggagtttataaagggaaggtgtatctaatgataaagtattttgaagatc
ggataattgtgcctgggtgctagatgccacaggaaaaaattaggaaaact
tattttccatttatttttttctgaatagtcagaggcacttgaaatttgat
atggaagtaagggaaaatgtattattcaatttgctatgctatgagttcat
tccatggagagagtgagtaactgttttttacctggctaacatcttaacag
atagttttacagaagactaaaataacatgtattatgatatgaatctgaaa
aattttaaaaagatataatattgtttcttattttctcttttaagatgaat
ctatttaaaaataaaactgttgaatttcacagtttcttttattatgaaga
ttattaccagaggaatacgtccctttattcatttagaaacaatatgacat
gctatatttgttcgggtcagacatatttcacatggctgaggatagttatt
acatggtttcatattcaatcaataatttggtgctgcttttaggataattt
aattgactactgaaacatacaaactaaactcattttgtctttatgccaac
attgttgtaaagatttattatccccattttttggcatttcaactaagggt
cacccacatttagttcttgtagcctcacagtggtcatatggaacctgaag
aggccacctccagtggccagacaggaccctcagtgaagggatgggaacat
caacccacctacaaaacttttgacccaaagaatatagaggaagataaatg
tgccagagactgatggaatggctgaccagcccaaatttggatccatccca
ttggtggacaccaattcctgacactattactaatactatgtcatatttgt
aggcagggagcctagcattgctgtcctctgagagctctacagagcagact
gagacagatgcagagactcacagcccaccactggactcagtctgggaccc
ttattagaaaagttaggggagtatgagactgatgtgatggcaccccatac
aaaacacagtgtaagtacctctggggagcttcctagacttagctacacca
a

gaattcattgacaccacagaccttgcattgataaaggtaccaacccttca
aggtttgtgtcactaatcttccaaggaggttcaattggcaaatgcagctg
ccaatagcgagaagaggattatggaagtgctgaatctgtaatctaagtta
gacagagaagttgagggaacagaaagaaattaaagagtaaaggtgatgaa
tatgatgaaaagataacacacccattatttaacaatgtacaaatatgaca
aaaggaggtatattcgtcaactatatatacagtgaacatcttgaaataga
ctgcctatcaagaaacggaggcatactcaagtcacatgtatggaagaaag
tctaagtggtttagcacaggcttcttggctgttagttttgtgatgggaat
agataacggcacatcacccagtgagggacatgttgggaatatcagctaga
atcaggaaatattcctttgaggatatatcccccagttaccaaggatttta
tattacttttcaactcttaaagccggtttcatcttctaggagcagctgac
tgagggatggatccttcctagatgagccactgtgggctgctaagcatcca
caccatggcagagaagcagtaatgacagtgggaccgataaattaacaact
tccactgaagcatattttttttaatttatttttttaattaggcattttcc
tcatttacatttccaatgctatcccaaaagtcccccctcccccctcccac
tccccaaccccccccccaatcccacgttttggccctggcattccccagta
ctgaggcatataaagtttgcaagtccaagggcctctctttccagtgatgg
ctgactaggccaacttttgatacatatgcagttagagttaagagctccgt
gggtactggttaggtcattatgttgttc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_86112410_86113574
seq2: B6Ng01-190H10.b_43_1193

seq1  GAATTCTCAAGGTTATTAAGTGCATATGGAGTGTTGCCACATAAATATTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCAAGGTTATTAAGTGCATATGGAGTGTTGCCACATAAATATTG  50

seq1  TGGAGTTTATAAAGGGAAGGTGTATCTAATGATAAAGTATTTTGAAGATC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAGTTTATAAAGGGAAGGTGTATCTAATGATAAAGTATTTTGAAGATC  100

seq1  GGATAATTGTGCCTGGGTGCTAGATGCCACAGGAAAAAATTAGGAAAACT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATAATTGTGCCTGGGTGCTAGATGCCACAGGAAAAAATTAGGAAAACT  150

seq1  TATTTTCCATTTATTTTTTTCTGAATAGTCAGAGGCACTTGAAATTTGAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTTCCATTTATTTTTTTCTGAATAGTCAGAGGCACTTGAAATTTGAT  200

seq1  ATGGAAGTAAGGGAAAATGTATTATTCAATTTGCTATGCTATGAGTTCAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGAAGTAAGGGAAAATGTATTATTCAATTTGCTATGCTATGAGTTCAT  250

seq1  TCCATGGAGAGAGTGAGTAACTGTTTTTTACCTGGCTAACATCTTAACAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCATGGAGAGAGTGAGTAACTGTTTTTTACCTGGCTAACATCTTAACAG  300

seq1  ATAGTTTTACAGAAGACTAAAATAACATGTATTATGATATGAATCTGAAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGTTTTACAGAAGACTAAAATAACATGTATTATGATATGAATCTGAAA  350

seq1  AATTTTAAAAAGATATAATATTGTTTCTTATTTTCTCTTTTAAGATGAAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTTTAAAAAGATATAATATTGTTTCTTATTTTCTCTTTTAAGATGAAT  400

seq1  CTATTTAAAAATAAAACTGTTGAATTTCACAGTTTCTTTTATTATGAAGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATTTAAAAATAAAACTGTTGAATTTCACAGTTTCTTTTATTATGAAGA  450

seq1  TTATTACCAGAGGAATACGTCCCTTTATTCATTTAGAAACAATATGACAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTACCAGAGGAATACGTCCCTTTATTCATTTAGAAACAATATGACAT  500

seq1  GCTATATTTGTTCGGGTCAGACATATTTCACATGGCTGAGGATAGTTATT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTATATTTGTTCGGGTCAGACATATTTCACATGGCTGAGGATAGTTATT  550

seq1  ACATGGTTTCATATTCAATCAATAATTTGGTGCTGCTTTTAGGATAATTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGGTTTCATATTCAATCAATAATTTGGTGCTGCTTTTAGGATAATTT  600

seq1  AATTGACTACTGAAACATACAAACTAAACTCATTTTGTCTTTATGCCAAC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTGACTACTGAAACATACAAACTAAACTCATTTTGTCTTTATGCCAAC  650

seq1  ATTGTTGTAAAGATTTATTATCCCCATTTTTTGGCATTTCAACTAAGGGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGTTGTAAAGATTTATTATCCCCATTTTTTGGCATTTCAACTAAGGGT  700

seq1  CACCCACATTTAGTTCTTGTAGCCTCACAGTGGTCATATGGAACCTGAAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCCACATTTAGTTCTTGTAGCCTCACAGTGGTCATATGGAACCTGAAG  750

seq1  AGGCCACCTCCAGTGGCCAGACAGGACCCTCAGTGAAGGGATGGGAACAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCCACCTCCAGTGGCCAGACAGGACCCTCAGTGAAGGGATGGGAACAT  800

seq1  CAACCCACCTACAAAACTTTTGACCCAAAGAATATAGAGGAAGATAAATG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACCCACCTACAAAACTTTTGACCCAAAGAATATAGAGGAAGATAAATG  850

seq1  TGCCAGAGACTGATGGAATGGCTGACCAGCCCAAATTTGGATCCATCCCA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCAGAGACTGATGGAATGGCTGACCAGCCCAAATTTGGATCCATCCCA  900

seq1  TTGGTGGACACCAATTCCTGACACTATTACTAATACTATGTCATATTTGT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGTGGACACCAATTCCTGACACTATTACTAATACTATGTCATATTTGT  950

seq1  AGGCA-GGAGCCTAGCATTGCTGTCCTCTGAGAAGCTCTAACAGAAGCAG  999
      ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||
seq2  AGGCAGGGAGCCTAGCATTGCTGTCCTCTGAG-AGCTCT-ACAG-AGCAG  997

seq1  ACTGAGACAGATGCAGAGACTCACAGCCCACCACTGGACTCAGGTCTGGG  1049
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  ACTGAGACAGATGCAGAGACTCACAGCCCACCACTGGACTCA-GTCTGGG  1046

seq1  ACCCTTA-TAGAAAAGTTAGGGGAAGTATTGAAGGAACTGAAGGTGATGG  1098
      ||||||| ||||||||||||||| |||||    |  |||| | |||||||
seq2  ACCCTTATTAGAAAAGTTAGGGG-AGTAT----GAGACTG-ATGTGATGG  1090

seq1  CAACCCCATACAAAACAACAGTGTAAAGTAACCTCT-GGGAGCTCACATA  1147
      | |||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||  | ||
seq2  C-ACCCCATACAAAAC-ACAGTGT-AAGT-ACCTCTGGGGAGCT-TCCTA  1135

seq1  GACTAAGCTACCAACCAA  1165
      |||| ||||||  |||||
seq2  GACTTAGCTAC--ACCAA  1151


seq1: chr14_86223630_86224556
seq2: B6Ng01-190H10.g_63_990 (reverse)

seq1  GAACAACATTATGAACTAACCAGTACCC-CGGAGCTCTTAACTCTAACTG  49
      ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  GAACAACATAATGACCTAACCAGTACCCACGGAGCTCTTAACTCTAACTG  50

seq1  CATATGTATCAAAAGATGGCCTAGTCAGCCATCACTGGAAAGAGAGGCCC  99
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATATGTATCAAAAGTTGGCCTAGTCAGCCATCACTGGAAAGAGAGGCCC  100

seq1  TTGGACTTGCAAACTTTATATGCCCCAGTACTGGGGAATGCCAGGGCCAA  149
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGACTTGCAAACTTTATATGCCTCAGTACTGGGGAATGCCAGGGCCAA  150

seq1  AACGTGGGATTGGGGGGGGGGTTGGGGAGTGGGAGGGGGGAGGGGGGACT  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACGTGGGATTGGGGGGGGGGTTGGGGAGTGGGAGGGGGGAGGGGGGACT  200

seq1  TTTGGGATAGCATTGGAAATGTAAATGAGGAAAATGCCTAATTAAAAAAA  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGGGATAGCATTGGAAATGTAAATGAGGAAAATGCCTAATTAAAAAAA  250

seq1  TAAATTAAAAAAAATATGCTTCAGTGGAAGTTGTTAATTTATCGGTCCCA  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAATTAAAAAAAATATGCTTCAGTGGAAGTTGTTAATTTATCGGTCCCA  300

seq1  CTGTCATTACTGCTTCTCTGCCATGGTGTGGATGCTTAGCAGCCCACAGT  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTCATTACTGCTTCTCTGCCATGGTGTGGATGCTTAGCAGCCCACAGT  350

seq1  GGCTCATCTAGGAAGGATCCATCCCTCAGTCAGCTGCTCCTAGAAGATGA  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTCATCTAGGAAGGATCCATCCCTCAGTCAGCTGCTCCTAGAAGATGA  400

seq1  AACCGGCTTTAAGAGTTGAAAAGTAATATAAAATCCTTGGTAACTGGGGG  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCGGCTTTAAGAGTTGAAAAGTAATATAAAATCCTTGGTAACTGGGGG  450

seq1  ATATATCCTCAAAGGAATATTTCCTGATTCTAGCTGATATTCCCAACATG  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATATCCTCAAAGGAATATTTCCTGATTCTAGCTGATATTCCCAACATG  500

seq1  TCCCTCACTGGGTGATGTGCCGTTATCTATTCCCATCACAAAACTAACAG  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCTCACTGGGTGATGTGCCGTTATCTATTCCCATCACAAAACTAACAG  550

seq1  CCAAGAAGCCTGTGCTAAACCACTTAGACTTTCTTCCATACATGTGACTT  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAGAAGCCTGTGCTAAACCACTTAGACTTTCTTCCATACATGTGACTT  600

seq1  GAGTATGCCTCCGTTTCTTGATAGGCAGTCTATTTCAAGATGTTCACTGT  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTATGCCTCCGTTTCTTGATAGGCAGTCTATTTCAAGATGTTCACTGT  650

seq1  ATATATAGTTGACGAATATACCTCCTTTTGTCATATTTGTACATTGTTAA  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATATAGTTGACGAATATACCTCCTTTTGTCATATTTGTACATTGTTAA  700

seq1  ATAATGGGTGTGTTATCTTTTCATCATATTCATCACCTTTACTCTTTAAT  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAATGGGTGTGTTATCTTTTCATCATATTCATCACCTTTACTCTTTAAT  750

seq1  TTCTTTCTGTTCCCTCAACTTCTCTGTCTAACTTAGATTACAGATTCAGC  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTTCTGTTCCCTCAACTTCTCTGTCTAACTTAGATTACAGATTCAGC  800

seq1  ACTTCCATAATCCTCTTCTCGCTATTGGCAGCTGCATTTGCCAATTGAAC  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTCCATAATCCTCTTCTCGCTATTGGCAGCTGCATTTGCCAATTGAAC  850

seq1  CTCCTTGGAAGATTAGTGACACAAACCTTGAAGGGTTGGTACCTTTATCA  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCTTGGAAGATTAGTGACACAAACCTTGAAGGGTTGGTACCTTTATCA  900

seq1  ATGCAAGGTCTGTGGTGTCAATGAATTC  927
      ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCAAGGTCTGTGGTGTCAATGAATTC  928


| Home | SequenceCutter | Blast | Download |