BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-192P01
Chromosome14 (Build37)
Map Location 10,884,452 - 11,004,124
singlet/doubletdoublet
Overlap geneFhit
Upstream geneLOC100041948, LOC100042415
Downstream geneLOC100041974
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-192P01.bB6Ng01-192P01.g
ACCGA016048GA016049
length1,1291,175
definitionB6Ng01-192P01.b B6Ng01-192P01.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(11,002,993 - 11,004,124)(10,884,452 - 10,885,624)
sequence
gaattctgtggtgccacatgaggtagaattcaccttctcaactaatgtgt
ttgtttgtttgtttgtttgtttgttttttaaacttaggtttgctgtccat
gatgatagatcccatccacagtgggatttaattcatgcaaaacatggcca
gcatgaccagaaagctcaggatctgaacttgtaagcacacttgagaccct
tctcttaaacgctcctgattctttcatctcagttagttctttcctgtgag
cacagtcaatttcccctaaattctggaagggcaacagaatgggaattaca
ctttctcggattgaattttatggctttaaacaagggactacttcttttcc
aactgtatctttcaggtatgtttcagactcttcagctctgccttgttgtg
aagaaagcatacagttaagtgaccttcagtctacccctgacctctcttcc
attaatgcttattatgcagtgtctggtcagaagaggtccctgaaatagat
gttttcctcccatcacagggacagtgactttgcagctatatctggaattg
ccttattgtgatctttcagttggggttttgcaaagtagacataagcactc
cattaatataagcagagaaatcttagtgatcagaatttggaaattcatga
cattttagaatgccaggtttctctcacacacacccacagaaatgttatat
gaggaaaataatgactataaacataggtatgtaatgtactgtatttgttt
actatctgtaaattacttgtttttagaggtgattttatgctttgaatgca
tcatgggttttaatctactatatgtatttgcatccaaggaaccaaaaaaa
gtctcggtataactttaggtttgctgtggaaaatgttttaatgttttaat
ttcaatagtttatgatatatttacacacactgatgcatacagcagatctc
tggtttggtatatgtatcttaattgactatctagatttataatttgacat
atgaaaaaaaccataaaaacacccattcttgtttcatttaggactattgt
aagtcctatcacaaagcattctacatttcatgacttagtagtctattcac
aaaacattcctaattttttcttcacagga
gaattccacatacgtttggtgggaggataaaatttttctcagtctttaaa
tttacaaccatgagtagttgaacaaccaaaatatacaaaaaaggaaaaaa
caaaacaaaacactgatgatgtgttaaatcctttaaaggaaatacaataa
ccttgtctatacctatatatatagtagtgagaagaggaaagtcagtaacc
acctgagaaaacaccaaacatagccctggcagagcccaatgctatatagc
ataactgttcaaaatagcctagacccaatgtccttgcaaagaatgcccca
gacatatagcattttgaatagaggaaggacagagtctccatattattttt
ttctaaatgaaaatgaaattaaaatacaaacattatcaagttggttaaag
agcttccaaatatcaatccaagataggtttcagagaattttagaaaatat
acagccttcaagcacatgagcagagacaaggcaggaaaaaggagtcatgc
tcaaccctacactaggcttgatcttcacaaaccaccacatagaacacata
caatgtaggacacaatcttttagataatcactcacaaagtcagatactta
gggtgactgaccacagcatgtctatgagaatgtaagatgctggccctgta
acagtcatgggaatgcagactctcatagacctgattgctgtcctgtacac
tacctgtagtctccatacggggttggcaaaacaatactgtgcataaccca
gaggggagagccctcagccaagtggttcaggaaaaatgcacttagttttt
gtgtcagagaacatgtgttttctaatagctggaagtggtcgcttttgaat
cacctggtcattcaggctgcatatatatagtaacttggtaaagcaatcat
ttaccacagatctagtgattcaaaataacaaaactttatcttgtagtttt
aaaggatagaagtcccaaggtctcactgcactaaactcaacatgagagac
agtagtagagctggagtcctcagagctactagaagaacatttcattactg
ctttatcttagcttctgaggtgcccaccacctcttggcccttgctctatc
acaaaagccagtagggcaatgcctagccatctaactcactcgactctctg
ccatcatacgagggtcttccgtaga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_11002993_11004124
seq2: B6Ng01-192P01.b_42_1170 (reverse)

seq1  TCCTGTGAAGAAAAAAAATGTAGGATGTTTTTGTG-ATAGGAATTACCTA  49
      ||||||||||||||||    |||||   ||||||| ||||  | |||  |
seq2  TCCTGTGAAGAAAAAA---TTAGGAATGTTTTGTGAATAG--ACTACTAA  45

seq1  GTCATGAAATGTAGGATGCTTTTGTGATAGGACTTAC-ATAGTCCTAAAA  98
      |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||
seq2  GTCATGAAATGTAGAATGC-TTTGTGATAGGACTTACAATAGTCCT-AAA  93

seq1  TGAAAC-AGAATGGGTGTTTTTATTGGTTTTTTTCATATGTCAATTATTA  147
      |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||
seq2  TGAAACAAGAATGGGTGTTTTTA-TGGTTTTTTTCATATGTCAAATTATA  142

seq1  AATCTAGATAGTCAATTAAGATACATATACCAAACCAGAGATCTGCTGTA  197
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCTAGATAGTCAATTAAGATACATATACCAAACCAGAGATCTGCTGTA  192

seq1  TGCATCAGTGTGTGTAAATATATCATAAACTATTG-AATTAAAACATTAA  246
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  TGCATCAGTGTGTGTAAATATATCATAAACTATTGAAATTAAAACATTAA  242

seq1  AACATTTTCCACAGC-AACCTAAAGTTATACCGAGACTTTTTTTGGTTCC  295
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACATTTTCCACAGCAAACCTAAAGTTATACCGAGACTTTTTTTGGTTCC  292

seq1  TTGGATGCAAATACATATAGTAGATTAAAACCCATGATGCATTCAAAGCA  345
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGATGCAAATACATATAGTAGATTAAAACCCATGATGCATTCAAAGCA  342

seq1  TAAAATCACCTCTAAAAACAAGTAATTTACAGATAGTAAACAAATACAGT  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAATCACCTCTAAAAACAAGTAATTTACAGATAGTAAACAAATACAGT  392

seq1  ACATTACATACCTATGTTTATAGTCATTATTTTCCTCATATAACATTTCT  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATTACATACCTATGTTTATAGTCATTATTTTCCTCATATAACATTTCT  442

seq1  GTGGGTGTGTGTGAGAGAAACCTGGCATTCTAAAATGTCATGAATTTCCA  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGGTGTGTGTGAGAGAAACCTGGCATTCTAAAATGTCATGAATTTCCA  492

seq1  AATTCTGATCACTAAGATTTCTCTGCTTATATTAATGGAGTGCTTATGTC  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTCTGATCACTAAGATTTCTCTGCTTATATTAATGGAGTGCTTATGTC  542

seq1  TACTTTGCAAAACCCCAACTGAAAGATCACAATAAGGCAATTCCAGATAT  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTTTGCAAAACCCCAACTGAAAGATCACAATAAGGCAATTCCAGATAT  592

seq1  AGCTGCAAAGTCACTGTCCCTGTGATGGGAGGAAAACATCTATTTCAGGG  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTGCAAAGTCACTGTCCCTGTGATGGGAGGAAAACATCTATTTCAGGG  642

seq1  ACCTCTTCTGACCAGACACTGCATAATAAGCATTAATGGAAGAGAGGTCA  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTCTTCTGACCAGACACTGCATAATAAGCATTAATGGAAGAGAGGTCA  692

seq1  GGGGTAGACTGAAGGTCACTTAACTGTATGCTTTCTTCACAACAAGGCAG  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGTAGACTGAAGGTCACTTAACTGTATGCTTTCTTCACAACAAGGCAG  742

seq1  AGCTGAAGAGTCTGAAACATACCTGAAAGATACAGTTGGAAAAGAAGTAG  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTGAAGAGTCTGAAACATACCTGAAAGATACAGTTGGAAAAGAAGTAG  792

seq1  TCCCTTGTTTAAAGCCATAAAATTCAATCCGAGAAAGTGTAATTCCCATT  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCTTGTTTAAAGCCATAAAATTCAATCCGAGAAAGTGTAATTCCCATT  842

seq1  CTGTTGCCCTTCCAGAATTTAGGGGAAATTGACTGTGCTCACAGGAAAGA  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTTGCCCTTCCAGAATTTAGGGGAAATTGACTGTGCTCACAGGAAAGA  892

seq1  ACTAACTGAGATGAAAGAATCAGGAGCGTTTAAGAGAAGGGTCTCAAGTG  945
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTAACTGAGATGAAAGAATCAGGAGCGTTTAAGAGAAGGGTCTCAAGTG  942

seq1  TGCTTACAAGTTCAGATCCTGAGCTTTCTGGTCATGCTGGCCATGTTTTG  995
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTACAAGTTCAGATCCTGAGCTTTCTGGTCATGCTGGCCATGTTTTG  992

seq1  CATGAATTAAATCCCACTGTGGATGGGATCTATCATCATGGACAGCAAAC  1045
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGAATTAAATCCCACTGTGGATGGGATCTATCATCATGGACAGCAAAC  1042

seq1  CTAAGTTTAAAAAACAAACAAACAAACAAACAAACAAACACATTAGTTGA  1095
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAGTTTAAAAAACAAACAAACAAACAAACAAACAAACACATTAGTTGA  1092

seq1  GAAGGTGAATTCTACCTCATGTGGCACCACAGAATTC  1132
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGGTGAATTCTACCTCATGTGGCACCACAGAATTC  1129

seq1: chr14_10884452_10885624
seq2: B6Ng01-192P01.g_62_1236

seq1  GAATTCCACATACGTTTGGTGGGAGGATAAAATTTTTCTCAGTCTTTAAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCACATACGTTTGGTGGGAGGATAAAATTTTTCTCAGTCTTTAAA  50

seq1  TTTACAACCATGAGTAGTTGAACAACCAAAATATACAAAAAAGGAAAAAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTACAACCATGAGTAGTTGAACAACCAAAATATACAAAAAAGGAAAAAA  100

seq1  CAAAACAAAACACTGATGATGTGTTAAATCCTTTAAAGGAAATACAATAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAACAAAACACTGATGATGTGTTAAATCCTTTAAAGGAAATACAATAA  150

seq1  CCTTGTCTATACCTATATATATAGTAGTGAGAAGAGGAAAGTCAGTAACC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTGTCTATACCTATATATATAGTAGTGAGAAGAGGAAAGTCAGTAACC  200

seq1  ACCTGAGAAAACACCAAACATAGCCCTGGCAGAGCCCAATGCTATATAGC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTGAGAAAACACCAAACATAGCCCTGGCAGAGCCCAATGCTATATAGC  250

seq1  ATAACTGTTCAAAATAGCCTAGACCCAATGTCCTTGCAAAGAATGCCCCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAACTGTTCAAAATAGCCTAGACCCAATGTCCTTGCAAAGAATGCCCCA  300

seq1  GACATATAGCATTTTGAATAGAGGAAGGACAGAGTCTCCATATTATTTTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACATATAGCATTTTGAATAGAGGAAGGACAGAGTCTCCATATTATTTTT  350

seq1  TTCTAAATGAAAATGAAATTAAAATACAAACATTATCAAGTTGGTTAAAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTAAATGAAAATGAAATTAAAATACAAACATTATCAAGTTGGTTAAAG  400

seq1  AGCTTCCAAATATCAATCCAAGATAGGTTTCAGAGAATTTTAGAAAATAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTTCCAAATATCAATCCAAGATAGGTTTCAGAGAATTTTAGAAAATAT  450

seq1  ACAGCCTTCAAGCACATGAGCAGAGACAAGGCAGGAAAAAGGAGTCATGC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGCCTTCAAGCACATGAGCAGAGACAAGGCAGGAAAAAGGAGTCATGC  500

seq1  TCAACCCTACACTAGGCTTGATCTTCACAAACCACCACATAGAACACATA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAACCCTACACTAGGCTTGATCTTCACAAACCACCACATAGAACACATA  550

seq1  CAATGTAGGACACAATCTTTTAGATAATCACTCACAAAGTCAGATACTTA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATGTAGGACACAATCTTTTAGATAATCACTCACAAAGTCAGATACTTA  600

seq1  GGGTGACTGACCACAGCATGTCTATGAGAATGTAAGATGCTGGCCCTGTA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTGACTGACCACAGCATGTCTATGAGAATGTAAGATGCTGGCCCTGTA  650

seq1  ACAGTCATGGGAATGCAGACTCTCATAGACCTGATTGCTGTCCTGTACAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGTCATGGGAATGCAGACTCTCATAGACCTGATTGCTGTCCTGTACAC  700

seq1  TACCTGTAGTCTCCATACGGGGTTGGCAAAACAATACTGTGCATAACCCA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCTGTAGTCTCCATACGGGGTTGGCAAAACAATACTGTGCATAACCCA  750

seq1  GAGGGGAGAGCCCTCAGCCAAGTGGTTCAGGGAAAAATGCACTTAGTTTT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  GAGGGGAGAGCCCTCAGCCAAGTGGTTCA-GGAAAAATGCACTTAGTTTT  799

seq1  TGTGTCAGAGAACATGTGTTTTCTAATAGCTGGAAGTGGTCGCTTTTGAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTCAGAGAACATGTGTTTTCTAATAGCTGGAAGTGGTCGCTTTTGAA  849

seq1  TCACCTGGTCATTCAGGCTGCATATATATAGTAACTTGGTAAAGCAATCA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACCTGGTCATTCAGGCTGCATATATATAGTAACTTGGTAAAGCAATCA  899

seq1  TTTACCACAGATCTAGTGATTCAAAATAACAAAACTTTATCTTGTAGTTT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTACCACAGATCTAGTGATTCAAAATAACAAAACTTTATCTTGTAGTTT  949

seq1  TAAAGGATAGAAGTCCCAAGTTCTCACTGCACTAAACTCAACATGAGAGA  1000
      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAGGATAGAAGTCCCAAGGTCTCACTGCACTAAACTCAACATGAGAGA  999

seq1  CAGTAGTAGAGCTGGAGTCCTCAGAGCTACTAGA--GACATTCCATTTAC  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| || ||||
seq2  CAGTAGTAGAGCTGGAGTCCTCAGAGCTACTAGAAGAACATTTCA-TTAC  1048

seq1  TTGCTTTATC-TAGCTTCTGAAGGTTGCCCACACTCTTTGGCCCCTTGCT  1097
       ||||||||| ||||||||||  | |||||||   || | | ||||||||
seq2  -TGCTTTATCTTAGCTTCTGA--GGTGCCCACCACCTCTTGGCCCTTGCT  1095

seq1  CTATCACAAAA-CCAGTAAGGC-ATGCTTAGCCTTCTTACTTCACTCGGC  1145
      ||||||||||| |||||| ||| |||| ||||| ||| || ||||||| |
seq2  CTATCACAAAAGCCAGTAGGGCAATGCCTAGCCATCTAAC-TCACTCGAC  1144

seq1  TCTCTGCCATCATCCAA--GTCTTCC-TAGA  1173
      ||||||||||||| | |  ||||||| ||||
seq2  TCTCTGCCATCATACGAGGGTCTTCCGTAGA  1175