BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-197E17
Chromosome14 (Build37)
Map Location 62,509,583 - 62,629,834
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneMipep, LOC100043586, Tnfrsf19, Sacs, Sgcg, Arl11, EG432864, Ebpl, Kpna3, LOC100042933, EG432865, 6330409N04Rik, LOC100042941, Trim13, Kcnrg, LOC668253
Downstream geneDleu7, Rnaseh2b, Gucy1b2, LOC100042960, Ppia-ps14_723.1, LOC545062, EG629059, E130113E03Rik, Ints6, LOC100042969, LOC668263, Wdfy2, LOC668268, EG432867, EG654465
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-197E17.bB6Ng01-197E17.g
ACCGA019197GA019198
length1,188817
definitionB6Ng01-197E17.b B6Ng01-197E17.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(62,509,583 - 62,510,782)(62,629,018 - 62,629,834)
sequence
gaattctccatgtcactctacccaattctctgcagatccctttagaacgg
tatagtaaccagtaatctgcttatttggggcagggggtgcgctttggtga
tttctatagaaggtcatagacacagcactgtttagtgtccaaaacacttg
gaaacaaactaattgatcgttaggatagggctttcacgaagaattatgga
aatccacggaagaaagcaccaggcagccattgcaatagttggatgtttat
gaaatgggtggaagaggctttgagccaagcaagtgcagaaccacagagga
cgaacccaacaaagcagcattttagataaacactctgtttgttaaataga
taaatgcacacacaaaagaatctgcgtcgtaactgggctacaaatgtagg
aaactcgcttccatggtgatgcgtgcacccatcattaataatgagaggaa
gagccttcttgggaacacccatggtgtctgaatgcagtttggttttatga
ctggtaatgaaggtgctactggtgccagagatgctgctgacactctctgg
gacagcaaataattatctacccctactggtttagaaggtcttggttaaaa
gcttcaacctgtcctccccggaatggtggcacacactagcacagcttgct
tcctcgcatcaccttctgacgggcagcatgtgagctataaactcaggcgc
cagctgccagggaaaggctcatcaaacaagaagctctcatcagcttcctt
tgaccaaatccgttattctgctggttggaaaacactagctatctcttagc
aaaagcctcatctgtattggaatatgtgttttggttataacaaatcatgt
gcttctacaaatggaaaaagaaccctaaacggcaacagatgtgacttagt
gctgacttaagaaggtggcaaggactcctataggacagccatcctgcata
ttttccgctctgctcagctttagaccaaacgtttgcaaattgaaagtaat
ggccactgctgtacttgttagataaaccaagaaaaacaggctctggccta
tgcttctatcatcgagccataattagcctgtggtgctctgaacttcaggc
cttaagtaggataaataaatttatggttcctcaaggtatcatcaatgctt
ataaatggcaggttctcctgaattgccggtgtcagtgt
gaattccatgcctaaagcaaacaggattaaattctaaagggaagaggaga
gccaagttatccaatgctgccctttgcccagatcctgaccatcttgctag
tccccagaggtgggcactcaccgcaaggcatggtggtcatctcagtttcc
attgctcttggcatgtctgttgagtgacatctcaattatagtccaattgc
ccttgattgcaggggccgtctgaacctttgagagctcactcttaatccat
cccagaacgcacaagatcacattccacgctggtggttaaatgtaccagat
ggtccacatggccaagatgctgtggcccatgaaccttcgggggccatgtg
cttgctgaagaaaactgagacttagccacttgggaaagctgaccagaggg
ctgagtccttggggttgcttttagggagcctaacttgaaagctgctgccc
cactatgttagcatagtgtgagaagagccagaatagaccaagtagacccc
tctgcaaatttgcaaatcctgtcatctggaggtgcccagccagctagaaa
cagttgagtttagtagtttcaaacaagaacattaatggctccactccatg
gagctgtctggtgtgtcatgtgatgttcattgcaatctagtgtgatttag
acatgtctctaaacttttatagaggagaaactgtagacaggagtcttgga
gagaggtaaaggcccccaagaagccattttacaggtgagaaggccaaatc
tcaggtttgtaagaattaaaagcttgtgggtttgtttgttctgttggtgt
ttggggggttttgtttt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_62509583_62510782
seq2: B6Ng01-197E17.b_46_1233

seq1  GAATTCTCCATGTCACTCTACCCAATTCTCTGCAGATCCCTTTAGAACGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCCATGTCACTCTACCCAATTCTCTGCAGATCCCTTTAGAACGG  50

seq1  TATAGTAACCAGTAATCTGCTTATTTGGGGCAGGGGGTGCGCTTTGGTGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAGTAACCAGTAATCTGCTTATTTGGGGCAGGGGGTGCGCTTTGGTGA  100

seq1  TTTCTATAGAAGGTCATAGACACAGCACTGTTTAGTGTCCAAAACACTTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTATAGAAGGTCATAGACACAGCACTGTTTAGTGTCCAAAACACTTG  150

seq1  GAAACAAACTAATTGATCGTTAGGATAGGGCTTTCACGAAGAATTATGGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAACAAACTAATTGATCGTTAGGATAGGGCTTTCACGAAGAATTATGGA  200

seq1  AATCCACGGAAGAAAGCACCAGGCAGCCATTGCAATAGTTGGATGTTTAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCCACGGAAGAAAGCACCAGGCAGCCATTGCAATAGTTGGATGTTTAT  250

seq1  GAAATGGGTGGAAGAGGCTTTGAGCCAAGCAAGTGCAGAACCACAGAGGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAATGGGTGGAAGAGGCTTTGAGCCAAGCAAGTGCAGAACCACAGAGGA  300

seq1  CGAACCCAACAAAGCAGCATTTTAGATAAACACTCTGTTTGTTAAATAGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGAACCCAACAAAGCAGCATTTTAGATAAACACTCTGTTTGTTAAATAGA  350

seq1  TAAATGCACACACAAAAGAATCTGCGTCGTAACTGGGCTACAAATGTAGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAATGCACACACAAAAGAATCTGCGTCGTAACTGGGCTACAAATGTAGG  400

seq1  AAACTCGCTTCCATGGTGATGCGTGCACCCATCATTAATAATGAGAGGAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACTCGCTTCCATGGTGATGCGTGCACCCATCATTAATAATGAGAGGAA  450

seq1  GAGCCTTCTTGGGAACACCCATGGTGTCTGAATGCAGTTTGGTTTTATGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCCTTCTTGGGAACACCCATGGTGTCTGAATGCAGTTTGGTTTTATGA  500

seq1  CTGGTAATGAAGGTGCTACTGGTGCCAGAGATGCTGCTGACACTCTCTGG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGTAATGAAGGTGCTACTGGTGCCAGAGATGCTGCTGACACTCTCTGG  550

seq1  GACAGCAAATAATTATCTACCCCTACTGGTTTAGAAGGTCTTGGTTAAAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAGCAAATAATTATCTACCCCTACTGGTTTAGAAGGTCTTGGTTAAAA  600

seq1  GCTTCAACCTGTCCTCCCCGGAATGGTGGCACACACTAGCACAGCTTGCT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTCAACCTGTCCTCCCCGGAATGGTGGCACACACTAGCACAGCTTGCT  650

seq1  TCCTCGCATCACCTTCTGACGGGCAGCATGTGAGCTATAAACTCAGGCGC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTCGCATCACCTTCTGACGGGCAGCATGTGAGCTATAAACTCAGGCGC  700

seq1  CAGCTGCCAGGGAAAGGCTCATCAAACAAGAAGCTCTCATCAGCTTCCTT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCTGCCAGGGAAAGGCTCATCAAACAAGAAGCTCTCATCAGCTTCCTT  750

seq1  TGACCAAATCCGTTATTCTGCTGGTTGGAAAACACTAGCTATCTCTTAGC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACCAAATCCGTTATTCTGCTGGTTGGAAAACACTAGCTATCTCTTAGC  800

seq1  AAAAGCCTCATCTGTATTGGAATATGTGTTTTGGTTATAACAAATCATGT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGCCTCATCTGTATTGGAATATGTGTTTTGGTTATAACAAATCATGT  850

seq1  GCTTCTACAAATGGAAAAAGAACCCTAAACGGCAACAGATGTGACTTAGT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTCTACAAATGGAAAAAGAACCCTAAACGGCAACAGATGTGACTTAGT  900

seq1  GCTGACTTAAGAAGGTGGCAAGGACTCCTATAGGACAAGCCATCCTGCAT  950
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  GCTGACTTAAGAAGGTGGCAAGGACTCCTATAGGAC-AGCCATCCTGCAT  949

seq1  ATTTTCCGCTCTGCTCAGCCTTTAGACCAAAACGTTTGCAAATTGAAAGT  1000
      |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTCCGCTCTGCTCAG-CTTTAGACC-AAACGTTTGCAAATTGAAAGT  997

seq1  AATGGCCACTGCTGTACTTGTTAGGATAAACC-AGAAAAACAGGCTCTGG  1049
      ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||
seq2  AATGGCCACTGCTGTACTTGTTA-GATAAACCAAGAAAAACAGGCTCTGG  1046

seq1  CTTAATGCTTCTATCATCGAGCCATAATTAG-CTGTGGTGCTTGGACCTT  1098
      | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||
seq2  CCT-ATGCTTCTATCATCGAGCCATAATTAGCCTGTGGTGCTCTGAACTT  1095

seq1  CCAAGGCCTACAGTAAGATAAATAATATTTATGGTTTCCTCAATGTATCA  1148
      |  ||||||  |||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| 
seq2  C--AGGCCTTAAGTAGGATAAATAA-ATTTATGG-TTCCTCAAGGTATC-  1140

seq1  AATCAATGCTTATAAAATGCAGTGTCCTCTGAATTGCCGTGTGTGTCAGT  1198
       |||||||||||||||  ||||  ||  |||||||||||   ||||||||
seq2  -ATCAATGCTTATAAATGGCAGGTTCTCCTGAATTGCCG---GTGTCAGT  1186

seq1  GT  1200
      ||
seq2  GT  1188

seq1: chr14_62629018_62629834
seq2: B6Ng01-197E17.g_68_884 (reverse)

seq1  AAAACAAAACCCCCCAAACACCAACAGAACAAACAAACCCACAAGCTTTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAACAAAACCCCCCAAACACCAACAGAACAAACAAACCCACAAGCTTTT  50

seq1  AATTCTTACAAACCTGAGATTTGGCCTTCTCACCTGTAAAATGGCTTCTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTCTTACAAACCTGAGATTTGGCCTTCTCACCTGTAAAATGGCTTCTT  100

seq1  GGGGGCCTTTACCTCTCTCCAAGACTCCTGTCTACAGTTTCTCCTCTATA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGGCCTTTACCTCTCTCCAAGACTCCTGTCTACAGTTTCTCCTCTATA  150

seq1  AAAGTTTAGAGACATGTCTAAATCACACTAGATTGCAATGAACATCACAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTTTAGAGACATGTCTAAATCACACTAGATTGCAATGAACATCACAT  200

seq1  GACACACCAGACAGCTCCATGGAGTGGAGCCATTAATGTTCTTGTTTGAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACACACCAGACAGCTCCATGGAGTGGAGCCATTAATGTTCTTGTTTGAA  250

seq1  ACTACTAAACTCAACTGTTTCTAGCTGGCTGGGCACCTCCAGATGACAGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTACTAAACTCAACTGTTTCTAGCTGGCTGGGCACCTCCAGATGACAGG  300

seq1  ATTTGCAAATTTGCAGAGGGGTCTACTTGGTCTATTCTGGCTCTTCTCAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTGCAAATTTGCAGAGGGGTCTACTTGGTCTATTCTGGCTCTTCTCAC  350

seq1  ACTATGCTAACATAGTGGGGCAGCAGCTTTCAAGTTAGGCTCCCTAAAAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTATGCTAACATAGTGGGGCAGCAGCTTTCAAGTTAGGCTCCCTAAAAG  400

seq1  CAACCCCAAGGACTCAGCCCTCTGGTCAGCTTTCCCAAGTGGCTAAGTCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACCCCAAGGACTCAGCCCTCTGGTCAGCTTTCCCAAGTGGCTAAGTCT  450

seq1  CAGTTTTCTTCAGCAAGCACATGGCCCCCGAAGGTTCATGGGCCACAGCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTTTTCTTCAGCAAGCACATGGCCCCCGAAGGTTCATGGGCCACAGCA  500

seq1  TCTTGGCCATGTGGACCATCTGGTACATTTAACCACCAGCGTGGAATGTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTGGCCATGTGGACCATCTGGTACATTTAACCACCAGCGTGGAATGTG  550

seq1  ATCTTGTGCGTTCTGGGATGGATTAAGAGTGAGCTCTCAAAGGTTCAGAC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTTGTGCGTTCTGGGATGGATTAAGAGTGAGCTCTCAAAGGTTCAGAC  600

seq1  GGCCCCTGCAATCAAGGGCAATTGGACTATAATTGAGATGTCACTCAACA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCCCTGCAATCAAGGGCAATTGGACTATAATTGAGATGTCACTCAACA  650

seq1  GACATGCCAAGAGCAATGGAAACTGAGATGACCACCATGCCTTGCGGTGA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACATGCCAAGAGCAATGGAAACTGAGATGACCACCATGCCTTGCGGTGA  700

seq1  GTGCCCACCTCTGGGGACTAGCAAGATGGTCAGGATCTGGGCAAAGGGCA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCCCACCTCTGGGGACTAGCAAGATGGTCAGGATCTGGGCAAAGGGCA  750

seq1  GCATTGGATAACTTGGCTCTCCTCTTCCCTTTAGAATTTAATCCTGTTTG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATTGGATAACTTGGCTCTCCTCTTCCCTTTAGAATTTAATCCTGTTTG  800

seq1  CTTTAGGCATGGAATTC  817
      |||||||||||||||||
seq2  CTTTAGGCATGGAATTC  817