BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-200B21
Chromosome14 (Build37)
Map Location 29,607,070 - 29,625,642
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneErc2, LOC100040206, Wnt5a, LOC100040218
Downstream geneCacna2d3, Lrtm1, Ppia-ps15, EG665431
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-200B21.bB6Ng01-200B21.g
ACCGA021267GA021268
length1,1161,108
definitionB6Ng01-200B21.b B6Ng01-200B21.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(29,607,070 - 29,608,173)(29,624,530 - 29,625,642)
sequence
gaattctttgatggagtttatatattttttcttaagcctatgtcctgtgt
catcaagctaattctcactggtgaacatttctataagactgatggatttg
tgggggataagaggataccttgatcctttataatgtttttattcttggga
tgagacctgggaacatggacttgttttgtttgttcttgtcctgataaccc
agataatcttgaaacagaacacagaatgtataagtcaggttgggctttaa
tgttgaatatggctcaggtggaatgaagtcagatagacacagggtactgg
attggtgtgaagggtgtgaagtctgatctaagcctggaggttggaggtag
acctcatgggtgcaaagggtttgtggaggtgaagtatatatatatatata
tacctgagtagaccccgatgaagggtgtgcaagatctggctggacacaga
ggtttgttatagcatggtagaagactataatttgtaggaaagttattatg
gtccttatgaaagccttgagattagggttgacacaaccaggcaggtctag
gctaggctgaatgtgggaccaagactggatctggggccttgggaagggcg
atagagggaagggtcatgtagctgacctgtttaaattacagactgcaact
tccatctcagtactaaaaagtgctattttataattagtaatcagggaagt
tagagagatggctcagtgtttaagagcattggctgttcttccagacaacc
aattcaattcccagctcccacgtggcagttcccaactggactctataatt
ctagttccaggaaatctattgccttcctcttgcccccactgggcaccaca
caggcattaaagtgcacagacatatacagtcaaaacactcatacacagaa
caatgataataaaataagattagcaccagaattcagaagtcaaattccca
aaatagaatgcaaatgggccttccatatgttaaacctcaaaaatatatag
atataaaccactttataatagaaaaataatcttttactattaaattaact
gtcatggtattccattctatggaaatatacctcagttaatggaaagaatt
gaaaatttgacacaga
gaattctttttacttggacttcattgctataatgatcttgtcaaagcaaa
ataaatcagtttctagatgagtttattcttgaactagcaagtctttccaa
tctccttcttatgaggatgtctcattaggggtcttgatcatgctttggta
gctgaatgctagttgacttgatagtaagtaccagaggtcacagtcccaga
agcatgcgaagcatacattcgcaacccagacctgggttgtgaacacggct
gtgggggtagtttcttcttaatacccctgactttaaccgtgttcagaaat
agaaactttataattctcccaaatatgacccttttctttgtttgaaaccc
agtggtctcataatgaagggaaaaaatatctctactgcccctctctagtg
ttgagagataacttggatgtatgggttctcataaagttttatcagagcct
tgctcatcttataatattaccaatggctgaactctgctgtgactgagttt
catttgagcttaaggagagccaagtgaatcatcccaagagaagaatatct
cagatttctgtctgaactctgtcctccctcatccctagttactgtgggag
gaattaaaaacaacatgcacccctccaaaggtttgtagtagaagttctgt
gaatatcactcataaggaaggggaggggaacagaaaacaagcgcttggga
gtacagagtacttgcttggtgctaaacagatacaacctgagtaattagtg
ctgctgtttggacaagaggttggaaatctatacctgtagtccttgggaaa
agcatcttgatcagtgactgttgcttgcctgagccatggaacgggacata
gtctgggatgcaattgcttggttcctgccaatatcccactgtctcaaact
ttctgatagtgcgtgtataggtcaagttttatttgaacatagcaaaattt
caaatatatgagaaaatacagactatagacttatcagaaaatagacagca
tacatagagttcttttctttcaggactccaagttcacacacctaacaaac
agagtatcagtccctgaagaaatcattctgtagcgacctgagtgagtatc
tcaagaaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_29607070_29608173
seq2: B6Ng01-200B21.b_44_1159

seq1  GAATTCTTTGATGGAGTTTATATATTTTTTCTTAAGCCTATGTCCTGTGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTTGATGGAGTTTATATATTTTTTCTTAAGCCTATGTCCTGTGT  50

seq1  CATCAAGCTAATTCTCACTGGTGAACATTTCTATAAGACTGATGGATTTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCAAGCTAATTCTCACTGGTGAACATTTCTATAAGACTGATGGATTTG  100

seq1  TGGGGGATAAGAGGATACCTTGATCCTTTATAATGTTTTTATTCTTGGGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGGGATAAGAGGATACCTTGATCCTTTATAATGTTTTTATTCTTGGGA  150

seq1  TGAGACCTGGGAACATGGACTTGTTTTGTTTGTTCTTGTCCTGATAACCC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGACCTGGGAACATGGACTTGTTTTGTTTGTTCTTGTCCTGATAACCC  200

seq1  AGATAATCTTGAAACAGAACACAGAATGTATAAGTCAGGTTGGGCTTTAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATAATCTTGAAACAGAACACAGAATGTATAAGTCAGGTTGGGCTTTAA  250

seq1  TGTTGAATATGGCTCAGGTGGAATGAAGTCAGATAGACACAGGGTACTGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTGAATATGGCTCAGGTGGAATGAAGTCAGATAGACACAGGGTACTGG  300

seq1  ATTGGTGTGAAGGGTGTGAAGTCTGATCTAAGCCTGGAGGTTGGAGGTAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGGTGTGAAGGGTGTGAAGTCTGATCTAAGCCTGGAGGTTGGAGGTAG  350

seq1  ACCTCATGGGTGCAAAGGGTTTGTGGAGGTGAAGTATATATATATATATA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTCATGGGTGCAAAGGGTTTGTGGAGGTGAAGTATATATATATATATA  400

seq1  TACCTGAGTAGACCCCGATGAAGGGTGTGCAAGATCTGGCTGGACACAGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCTGAGTAGACCCCGATGAAGGGTGTGCAAGATCTGGCTGGACACAGA  450

seq1  GGTTTGTTATAGCATGGTAGAAGACTATAATTTGTAGGAAAGTTATTATG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTTGTTATAGCATGGTAGAAGACTATAATTTGTAGGAAAGTTATTATG  500

seq1  GTCCTTATGAAAGCCTTGAGATTAGGGTTGACACAACCAGGCAGGTCTAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCTTATGAAAGCCTTGAGATTAGGGTTGACACAACCAGGCAGGTCTAG  550

seq1  GCTAGGCTGAATGTGGGACCAAGACTGGATCTGGGGCCTTGGGAAGGGCG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTAGGCTGAATGTGGGACCAAGACTGGATCTGGGGCCTTGGGAAGGGCG  600

seq1  ATAGAGGGAAGGGTCATGTAGCTGACCTGTTTAAATTACAGACTGCAACT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGAGGGAAGGGTCATGTAGCTGACCTGTTTAAATTACAGACTGCAACT  650

seq1  TCCATCTCAGTACTAAAAAGTGCTATTTTATAATTAGTAATCAGGGAAGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCATCTCAGTACTAAAAAGTGCTATTTTATAATTAGTAATCAGGGAAGT  700

seq1  TAGAGAGATGGCTCAGTGTTTAAGAGCATTGGCTGTTCTTCCAGACAACC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAGAGATGGCTCAGTGTTTAAGAGCATTGGCTGTTCTTCCAGACAACC  750

seq1  AATTCAATTCCCAGCTCCCACGTGGCAGTTCCCAACTGGACTCTATAATT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTCAATTCCCAGCTCCCACGTGGCAGTTCCCAACTGGACTCTATAATT  800

seq1  CTAGTTCCAGGAAATCTATTGCCTTCCTCTTGCCCCCACT-GGCACCACA  849
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  CTAGTTCCAGGAAATCTATTGCCTTCCTCTTGCCCCCACTGGGCACCACA  850

seq1  CAGGCA-TAAAGTGCACAGACATATACAAGCAAAACACCCAAACACAGAA  898
      |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||
seq2  CAGGCATTAAAGTGCACAGACATATACAGTCAAAACACTCATACACAGAA  900

seq1  CAATGATAATAAAATAAGATTAGCACCAGAATTCAGAAGTCAAATT-CCA  947
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  CAATGATAATAAAATAAGATTAGCACCAGAATTCAGAAGTCAAATTCCCA  950

seq1  AAATAGAATGCAAATGGG-CTTCCATATGTTAAAACTCAAAAATATATAG  996
      |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  AAATAGAATGCAAATGGGCCTTCCATATGTTAAACCTCAAAAATATATAG  1000

seq1  ATATAAACCACTTAAT-ATAG-AAAATAATC-TTTACTATTAAATAAACT  1043
      ||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||
seq2  ATATAAACCACTTTATAATAGAAAAATAATCTTTTACTATTAAATTAACT  1050

seq1  GTCAT-GTATT-CATTCTATGG-AATATTACTCAG-TAATGAAAAGAAAT  1089
      ||||| ||||| |||||||||| |||||  ||||| ||||| |||||| |
seq2  GTCATGGTATTCCATTCTATGGAAATATACCTCAGTTAATGGAAAGAATT  1100

seq1  G-AAATTTGACACAGA  1104
      | ||||||||||||||
seq2  GAAAATTTGACACAGA  1116

seq1: chr14_29624530_29625642
seq2: B6Ng01-200B21.g_65_1172 (reverse)

seq1  TTTCTTGAGAATACTCACTCAGGTCGCTTACCAGAATGATTTTCTTCAGG  50
      ||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| |||||||| |
seq2  TTTCTTGAG-ATACTCACTCAGGTCGCT--ACAGAATGA-TTTCTTCA-G  45

seq1  GGACTGATACTCTGTTTTGTTTAGTTGTGTGAACTTGGAGTCCTGAA--G  98
      |||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||   
seq2  GGACTGATACTCTGTTT--GTTAGGTGTGTGAACTTGGAGTCCTGAAAGA  93

seq1  AAAGAACTCTATGTATGCTGTCTA-TTTCTGATAAGTCTATAGTCTGTAT  147
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGAACTCTATGTATGCTGTCTATTTTCTGATAAGTCTATAGTCTGTAT  143

seq1  TTTCTTCATATATTTGAAATTTTGCTATGTTCAAATAAAACTTGACTTAT  197
      |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  TTTC-TCATATATTTGAAATTTTGCTATGTTCAAATAAAACTTGACCTAT  192

seq1  ACACGCACTATCAGAAAGTTTGAGACAGTGGGATATTGGCAGGAACCAAG  247
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACGCACTATCAGAAAGTTTGAGACAGTGGGATATTGGCAGGAACCAAG  242

seq1  CAATTGCATCCCAGACTATGTCCCCTTCCATGGCTCAGGCAAGCAACAGT  297
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATTGCATCCCAGACTATGTCCCGTTCCATGGCTCAGGCAAGCAACAGT  292

seq1  CACTGATCAAGATGCTTTTCCCAAGGACTACAGGTATAGATTTCCAACCT  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTGATCAAGATGCTTTTCCCAAGGACTACAGGTATAGATTTCCAACCT  342

seq1  CTTGTCCAAACAGCAGCACTAATTACTCAGGTTGTATCTGTTTAGCACCA  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGTCCAAACAGCAGCACTAATTACTCAGGTTGTATCTGTTTAGCACCA  392

seq1  AGCAAGTACTCTGTACTCCCAAGCGCTTGTTTTCTGTTCCCCTCCCCTTC  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAAGTACTCTGTACTCCCAAGCGCTTGTTTTCTGTTCCCCTCCCCTTC  442

seq1  CTTATGAGTGATATTCACAGAACTTCTACTACAAACCTTTGGAGGGGTGC  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTATGAGTGATATTCACAGAACTTCTACTACAAACCTTTGGAGGGGTGC  492

seq1  ATGTTGTTTTTAATTCCTCCCACAGTAACTAGGGATGAGGGAGGACAGAG  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTTGTTTTTAATTCCTCCCACAGTAACTAGGGATGAGGGAGGACAGAG  542

seq1  TTCAGACAGAAATCTGAGATATTCTTCTCTTGGGATGATTCACTTGGCTC  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAGACAGAAATCTGAGATATTCTTCTCTTGGGATGATTCACTTGGCTC  592

seq1  TCCTTAAGCTCAAATGAAACTCAGTCACAGCAGAGTTCAGCCATTGGTAA  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTTAAGCTCAAATGAAACTCAGTCACAGCAGAGTTCAGCCATTGGTAA  642

seq1  TATTATAAGATGAGCAAGGCTCTGATAAAACTTTATGAGAACCCATACAT  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTATAAGATGAGCAAGGCTCTGATAAAACTTTATGAGAACCCATACAT  692

seq1  CCAAGTTATCTCTCAACACTAGAGAGGGGCAGTAGAGATATTTTTTCCCT  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAGTTATCTCTCAACACTAGAGAGGGGCAGTAGAGATATTTTTTCCCT  742

seq1  TCATTATGAGACCACTGGGTTTCAAACAAAGAAAAGGGTCATATTTGGGA  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATTATGAGACCACTGGGTTTCAAACAAAGAAAAGGGTCATATTTGGGA  792

seq1  GAATTATAAAGTTTCTATTTCTGAACACGGTTAAAGTCAGGGGTATTAAG  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTATAAAGTTTCTATTTCTGAACACGGTTAAAGTCAGGGGTATTAAG  842

seq1  AAGAAACTACCCCCACAGCCGTGTTCACAACCCAGGTCTGGGTTGCGAAT  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAAACTACCCCCACAGCCGTGTTCACAACCCAGGTCTGGGTTGCGAAT  892

seq1  GTATGCTTCGCATGCTTCTGGGACTGTGACCTCTGGTACTTACTATCAAG  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATGCTTCGCATGCTTCTGGGACTGTGACCTCTGGTACTTACTATCAAG  942

seq1  TCAACTAGCATTCAGCTACCAAAGCATGATCAAGACCCCTAATGAGACAT  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAACTAGCATTCAGCTACCAAAGCATGATCAAGACCCCTAATGAGACAT  992

seq1  CCTCATAAGAAGGAGATTGGAAAGACTTGCTAGTTCAAGAATAAACTCAT  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCATAAGAAGGAGATTGGAAAGACTTGCTAGTTCAAGAATAAACTCAT  1042

seq1  CTAGAAACTGATTTATTTTGCTTTGACAAGATCATTATAGCAATGAAGTC  1097
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGAAACTGATTTATTTTGCTTTGACAAGATCATTATAGCAATGAAGTC  1092

seq1  CAAGTAAAAAGAATTC  1113
      ||||||||||||||||
seq2  CAAGTAAAAAGAATTC  1108