BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-201B12
Chromosome14 (Build37)
Map Location 4,502,609 - 4,607,899
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100041139, LOC100041151, LOC100041177, LOC100041162
Upstream geneLOC100038846, EG666890, LOC100040544, LOC100040797, LOC100040555, LOC100040565, LOC100040578, LOC100040807, LOC100040859, LOC100040870, LOC100040880, LOC100040615, LOC100040923, LOC100040621, LOC100040641, LOC100040652, LOC100040935, LOC100040852, LOC100040674, LOC100040906, LOC100040688, LOC100040701, LOC100040897, LOC100041012, LOC100041019, ENSMUSG00000068790, LOC100041054, LOC666442, LOC100040793, LOC100041076, LOC100040801, LOC666336, LOC100041100, LOC100040808, LOC100041119, 2610042L04Rik
Downstream geneLOC100040889, LOC100040900, LOC100040917, LOC100040928, EG666560, LOC666555, EG666549, LOC100041262, LOC665981, LOC100041283, LOC100040996, LOC673676, LOC100041007, LOC100041317, LOC100041306, LOC100041024, LOC100041336, EG666815, LOC666808, EG666800, LOC100041374, 4930555G01Rik, EG666772, LOC666765, LOC100041401, LOC100041105, EG666750, LOC666743, LOC100041447, LOC673138, LOC666740, LOC641258, LOC673685, LOC100041158, LOC100041501, LOC100041515
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-201B12.bB6Ng01-201B12.g
ACCGA021964GA021965
length1,1911,168
definitionB6Ng01-201B12.b B6Ng01-201B12.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(4,502,609 - 4,503,799)(4,606,727 - 4,607,899)
sequence
gaattcaacatcattaaatcacaacatgagaagacaatgttggatatgga
taaaatgacccagtccataattgcttccatgaagttctccgaggaactgt
taaatgataactattcctacaggtgagtcagtgacacaactgacaccccc
agaactaggcagggaatgcttctgtccttttaggactttgaacaaaagca
aggactctggttctatgctatctgtttttttgtccaggaaccctgccctg
aggcaagggtcttttatttgtacctcttggacacagttttcctaagtgtg
aagagtgtccaagaccctccaaactttatccttccaaatttaagatcctc
tacatagaaaacttttccaccacgctgggaatatccaggaaccctgaacc
tctagggttctgaccacaaattaaaagatctaggattcccgacaaaaatg
gaaagagtgtacatctgttgggtcagctcacctctctgagaggggataag
acatcttcctgctgaaggttttatggtaccacagacctataatcaaccat
gaggaacatttcctcttctgtgatgcagagggaaaactcttggtgatagg
gttttcagaaggttgtggagtcctctggaatatgggtggtatcttgattt
gacttgtctttgtttggttctgctacgtatattgtgtcctcttctagggc
ttctggggatcagggcccttgcagggatcatgggacttgtaggagtggca
agccaatggaatctggctgggaatcaccaatttttctttgtggatcagca
ttaaggaggaccacctcctccgtgaatgcactcaactcaacgaaaaagta
aggatattactgaatgagaacagaaaagctgctggtggagcagctggaac
gcaagtgtcctgtggggaagtaaagaggttcttgtgaggaggccagcaag
aacatctgtgcctcaagtgccaaggagcagcaagtaggatgatgtgttat
cagaggcacatcgccctcatgtctaaccataaacatagacaatccaatgc
acagtctcaccaactttctccaggcactcacttatgtttcctcaagtgtt
gcctatgtgaatcatctacaaggctctctgttgaaggtagcttgattaag
aaactgcatgtggcatgcaatgttccggctcggcttagaat
gaattcaccacagaactcaaatatttcatcaagttggacacataatgcaa
gtgcattgttgcttgaagtatggtttccagtcctaagcattggcattgtc
agcagactgtaaggcaggcaattcctcaggtcctaccacatacccttatg
accagaatatagagagagtcacacacacacacacatgcatgcacacagaa
tcagggtgtgtttgcagggagaatgagaaagtacaatttaaatagaatcc
agaggaaatgcagaggacattctgtttataagacccaaaatctgagaaaa
gtattaatgagcctaagaccttccatcatttatcagaatggaccaaatgg
gaccaagctttcctggtgatataggaagcttcagcaagcaacacctgcca
gacaattacaaagctttgcgaacaaacaaacaacgaactcaagcaagcaa
acaatcaatcaaaacctcacagcaactaatatctcactcaaacggtcaca
tgtcagtgcctctatcaatacatgctgagacatcacatcctcttcaatcc
ctcagttgtaggctttcattttcatataaaaaaaatagaataccctttgt
ccgcagctcactcctgctctgacttcaagttcagcctgtgagaatgttta
gtgagaaaaggttgggcacagtgacaccctggagttacagtctccaagta
ccataaaatttaataagaataaattgtaggccataccatagactcaagaa
attgaccatgatgtttgacataatgaaaaatacctcttgtgcaaagcttt
ctcactgatgaagatcaggtgatcttgtagctcatttttcccactggtca
tcggctgagtggttaggctttccactttccctcacccatcttctgaacag
gagtgttggggatgatggtagtacaccagcagcccctatgggtagatgaa
cacaagtgaattatacatactgtcaaggctcagagcattgacagaacact
gagtcctatacagacatctgacaaacaggaatgcatgtgacccagtcatc
tctttcattcactttgcacatgcatcatgtgaacagacagatcctcaagc
tatcatagctgcgtatgatttaattagcagtactgtccataagccttttg
gttatatgaaaccatcag
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_4502609_4503799
seq2: B6Ng01-201B12.b_47_1237

seq1  GAATTCAACATCATTAAATCACAACATGAGAAGACAATGTTGGATATGGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAACATCATTAAATCACAACATGAGAAGACAATGTTGGATATGGA  50

seq1  TAAAATGACCCAGTCCATAATTGCTTCCATGAAGTTCTCCGAGGAACTGT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAATGACCCAGTCCATAATTGCTTCCATGAAGTTCTCCGAGGAACTGT  100

seq1  TAAATGATAACTATTCCTACAGGTGAGTCAGTGACACAACTGACACCCCC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAATGATAACTATTCCTACAGGTGAGTCAGTGACACAACTGACACCCCC  150

seq1  AGAACTAGGCAGGGAATGCTTCTGTCCTTTTAGGACTTTGAACAAAAGCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAACTAGGCAGGGAATGCTTCTGTCCTTTTAGGACTTTGAACAAAAGCA  200

seq1  AGGACTCTGGTTCTATGCTATCTGTTTTTTTGTCCAGGAACCCTGCCCTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGACTCTGGTTCTATGCTATCTGTTTTTTTGTCCAGGAACCCTGCCCTG  250

seq1  AGGCAAGGGTCTTTTATTTGTACCTCTTGGACACAGTTTTCCTAAGTGTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCAAGGGTCTTTTATTTGTACCTCTTGGACACAGTTTTCCTAAGTGTG  300

seq1  AAGAGTGTCCAAGACCCTCCAAACTTTATCCTTCCAAATTTAAGATCCTC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGTGTCCAAGACCCTCCAAACTTTATCCTTCCAAATTTAAGATCCTC  350

seq1  TACATAGAAAACTTTTCCACCACGCTGGGAATATCCAGGAACCCTGAACC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACATAGAAAACTTTTCCACCACGCTGGGAATATCCAGGAACCCTGAACC  400

seq1  TCTAGGGTTCTGACCACAAATTAAAAGATCTAGGATTCCCGACAAAAATG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAGGGTTCTGACCACAAATTAAAAGATCTAGGATTCCCGACAAAAATG  450

seq1  GAAAGAGTGTACATCTGTTGGGTCAGCTCACCTCTCTGAGAGGGGATAAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAGAGTGTACATCTGTTGGGTCAGCTCACCTCTCTGAGAGGGGATAAG  500

seq1  ACATCTTCCTGCTGAAGGTTTTATGGTACCACAGACCTATAATCAACCAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATCTTCCTGCTGAAGGTTTTATGGTACCACAGACCTATAATCAACCAT  550

seq1  GAGGAACATTTCCTCTTCTGTGATGCAGAGGGAAAACTCTTGGTGATAGG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGAACATTTCCTCTTCTGTGATGCAGAGGGAAAACTCTTGGTGATAGG  600

seq1  GTTTTCAGAAGGTTGTGGAGTCCTCTGGAATATGGGTGGTATCTTGATTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTTCAGAAGGTTGTGGAGTCCTCTGGAATATGGGTGGTATCTTGATTT  650

seq1  GACTTGTCTTTGTTTGGTTCTGCTACGTATATTGTGTCCTCTTCTAGGGC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTTGTCTTTGTTTGGTTCTGCTACGTATATTGTGTCCTCTTCTAGGGC  700

seq1  TTCTGGGGATCAGGGCCCTTGCAGGGATCATGGGACTTGTAGGAGTGGCA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGGGGATCAGGGCCCTTGCAGGGATCATGGGACTTGTAGGAGTGGCA  750

seq1  AGCCAATGGAATCTGGCTGGGAATCACCAATTTTTCTTTGTGGATCAGCA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCAATGGAATCTGGCTGGGAATCACCAATTTTTCTTTGTGGATCAGCA  800

seq1  TTAAGGAGGACCACCTCCTCCGTGAATGCACTCAACTCAACGAAAAAGTA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAGGAGGACCACCTCCTCCGTGAATGCACTCAACTCAACGAAAAAGTA  850

seq1  AGGATATTACTGAATGAGAACAG-AAAGCTGCTGGTGGAGCAGGCTGGAA  899
      ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||
seq2  AGGATATTACTGAATGAGAACAGAAAAGCTGCTGGTGGAGCA-GCTGGAA  899

seq1  CGCAAGTGTCCTGTGGGGAAGTAAAGAGGTTC-TGTGAGGAGGCCAGCAA  948
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  CGCAAGTGTCCTGTGGGGAAGTAAAGAGGTTCTTGTGAGGAGGCCAGCAA  949

seq1  GAACATCTGTGCCTCAAGTGCCAAGGAGCAGCAGGTAGGATGATGTG-TA  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||
seq2  GAACATCTGTGCCTCAAGTGCCAAGGAGCAGCAAGTAGGATGATGTGTTA  999

seq1  TCAGAGGCACATCGCCCTCATGTCTAACCATAAACATAGACAATCCAATG  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGAGGCACATCGCCCTCATGTCTAACCATAAACATAGACAATCCAATG  1049

seq1  CAACAGTC-CACCAAC-TTCTCCAGGCACTCACCTATGTTTCCTCCAAGT  1095
      | |||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||
seq2  C-ACAGTCTCACCAACTTTCTCCAGGCACTCACTTATGTTTCCT-CAAGT  1097

seq1  GTTTGCTTATGTG-ATCATCTACAGGGCTCTCTG-TGGAGGTAGCCTGGT  1143
      | |||| |||||| |||||||||| ||||||||| || |||||| || | 
seq2  G-TTGCCTATGTGAATCATCTACAAGGCTCTCTGTTGAAGGTAG-CTTGA  1145

seq1  TTAAGAAACTGCATGTTTGGCATGCAAATGTTCCTGCTCTGC-TAGAAT  1191
      |||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||| || ||||||
seq2  TTAAGAAACTGCATG--TGGCATGC-AATGTTCCGGCTCGGCTTAGAAT  1191

seq1: chr14_4606727_4607899
seq2: B6Ng01-201B12.g_64_1231 (reverse)

seq1  CTGATGGTTTC-TAT-ACCAAAA-GCTTATGGACAGTACTGCCTAATTAA  47
      ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||
seq2  CTGATGGTTTCATATAACCAAAAGGCTTATGGACAGTACTG-CTAATTAA  49

seq1  ATCATACGCAGCTATGAATAAGCCTGAGGATCCTGTCCTTGGTCACATGA  97
      |||||||||||||||||   ||| ||||||| |||||  || ||||||||
seq2  ATCATACGCAGCTATGA--TAGCTTGAGGAT-CTGTC--TGTTCACATGA  94

seq1  TGCATGTGCAAAGTGAAATGAAAGAGGAATGACTGGGTCACATGCATTCC  147
      ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||
seq2  TGCATGTGCAAAGTG-AATGAAAGAG--ATGACTGGGTCACATGCATTCC  141

seq1  TGTTTTGTCAGATGTCTGTATAGGACTCAGTGTTCTGTCAATGCTCTGAG  197
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TG-TTTGTCAGATGTCTGTATAGGACTCAGTGTTCTGTCAATGCTCTGAG  190

seq1  CCTTGACAGTATGTAT-ATTCACTTGTGTTCATCTACCCATAGGGGCTGC  246
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTGACAGTATGTATAATTCACTTGTGTTCATCTACCCATAGGGGCTGC  240

seq1  TGGTGTACTACCATCATCCCCAACACTCCTGTTCAGAAGATGGGTGA-GG  295
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  TGGTGTACTACCATCATCCCCAACACTCCTGTTCAGAAGATGGGTGAGGG  290

seq1  AAAGTGGAAAGCCTAACCACTCAGCCGATGACCAGTGGGAAAAATGAGCT  345
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTGGAAAGCCTAACCACTCAGCCGATGACCAGTGGGAAAAATGAGCT  340

seq1  ACAAGATCACCTGATCTTCATCAGTGAGAAAGCTTTGCACAAGAGGTATT  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAGATCACCTGATCTTCATCAGTGAGAAAGCTTTGCACAAGAGGTATT  390

seq1  TTTCATTATGTCAAACATCATGGTCAATTTCTTGAGTCTATGGTATGGCC  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCATTATGTCAAACATCATGGTCAATTTCTTGAGTCTATGGTATGGCC  440

seq1  TACAATTTATTCTTATTAAATTTTATGGTACTTGGAGACTGTAACTCCAG  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAATTTATTCTTATTAAATTTTATGGTACTTGGAGACTGTAACTCCAG  490

seq1  GGTGTCACTGTGCCCAACCTTTTCTCACTAAACATTCTCACAGGCTGAAC  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGTCACTGTGCCCAACCTTTTCTCACTAAACATTCTCACAGGCTGAAC  540

seq1  TTGAAGTCAGAGCAGGAGTGAGCTGCGGACAAAGGGTATTCTATTTTTTT  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAAGTCAGAGCAGGAGTGAGCTGCGGACAAAGGGTATTCTATTTTTTT  590

seq1  TATATGAAAATGAAAGCCTACAACTGAGGGATTGAAGAGGATGTGATGTC  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATGAAAATGAAAGCCTACAACTGAGGGATTGAAGAGGATGTGATGTC  640

seq1  TCAGCATGTATTGATAGAGGCACTGACATGTGACCGTTTGAGTGAGATAT  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGCATGTATTGATAGAGGCACTGACATGTGACCGTTTGAGTGAGATAT  690

seq1  TAGTTGCTGTGAGGTTTTGATTGATTGTTTGCTTGCTTGAGTTCGTTGTT  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTTGCTGTGAGGTTTTGATTGATTGTTTGCTTGCTTGAGTTCGTTGTT  740

seq1  TGTTTGTTCGCAAAGCTTTGTAATTGTCTGGCAGGTGTTGCTTGCTGAAG  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTGTTCGCAAAGCTTTGTAATTGTCTGGCAGGTGTTGCTTGCTGAAG  790

seq1  CTTCCTATATCACCAGGAAAGCTTGGTCCCATTTGGTCCATTCTGATAAA  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCCTATATCACCAGGAAAGCTTGGTCCCATTTGGTCCATTCTGATAAA  840

seq1  TGATGGAAGGTCTTAGGCTCATTAATACTTTTCTCAGATTTTGGGTCTTA  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATGGAAGGTCTTAGGCTCATTAATACTTTTCTCAGATTTTGGGTCTTA  890

seq1  TAAACAGAATGTCCTCTGCATTTCCTCTGGATTCTATTTAAATTGTACTT  945
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAACAGAATGTCCTCTGCATTTCCTCTGGATTCTATTTAAATTGTACTT  940

seq1  TCTCATTCTCCCTGCAAACACACCCTGATTCTGTGTGCATGCATGTGTGT  995
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCATTCTCCCTGCAAACACACCCTGATTCTGTGTGCATGCATGTGTGT  990

seq1  GTGTGTGTGACTCTCTCTATATTCTGGTCATAAGGGTATGTGGTAGGACC  1045
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTGTGACTCTCTCTATATTCTGGTCATAAGGGTATGTGGTAGGACC  1040

seq1  TGAGGAATTGCCTGCCTTACAGTCTGCTGACAATGCCAATGCTTAGGACT  1095
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGGAATTGCCTGCCTTACAGTCTGCTGACAATGCCAATGCTTAGGACT  1090

seq1  GGAAACCATACTTCAAGCAACAATGCACTTGCATTATGTGTCCAACTTGA  1145
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAACCATACTTCAAGCAACAATGCACTTGCATTATGTGTCCAACTTGA  1140

seq1  TGAAATATTTGAGTTCTGTGGTGAATTC  1173
      ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAATATTTGAGTTCTGTGGTGAATTC  1168