BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-218P22
Chromosome14 (Build37)
Map Location 47,412,512 - 47,546,027
singlet/doubletdoublet
Overlap geneGmfb, Cgrrf1, Samd4
Upstream geneLOC666834, LOC100041685, LOC625377, LOC218963, LOC100041724, Bmp4, LOC100041732, LOC100041754, Cdkn3, Cnih
Downstream geneGch1, Wdhd1, Socs4, LOC670795, C130032J12Rik, Lgals3, Dlg7, LOC666895, Fbxo34, D14Ertd436e, EG625730, LOC100042787, Ktn1, 4930447J18Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-218P22.bB6Ng01-218P22.g
ACCGA034965GA034966
length1,0691,140
definitionB6Ng01-218P22.b B6Ng01-218P22.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(47,412,512 - 47,413,575)(47,544,899 - 47,546,027)
sequence
gaattcttggtccctagagtggaactatgtggtaaggattagaagttgtg
gcccttgtctgagaaggtatgttctgaactttcaaaaacctagtctcttt
ctgcctgcttacaacttgcagatcggatatgagctctcggctactgctcc
agcgccatgcctacctgccgccacactgcaagccatgatgctaagagact
aaccctttgaaacagtaaataagacccccaactaaatgttctcttttata
aactgccttgttcatgctgtctcctcacagcaagagaacagtgagtaagc
agggtgtgtcctggaaagacccatgaccctagtgctcctggctgacagag
gggaactactctagtccacagccctgctctctcatgatgttcttccagga
acaatggaaccagcacaacagagcgtacactgcaacctcagaaaccagga
gccaaaagccttccctccttaaagctgcctagctcaggtgtttatcacag
tttgtcaccgcaccataagtgtaaaaagtatccacacttccttctcattg
gcagcccttagcatcttcttgaggactcgtggccctttagctgtcactag
gaggaaccttttccagctcaaggtcgcaggggaaaagtcgctcccgttac
ttgagagtgattttcatctgctctctatggtggtttagatgagaatggta
tatatttggggtgctcgggcctcagttggtgaaactgtttgggaagtact
tggaggtgtggccttcttggaggagatgtgtcactgggaatgggctttga
ggtttcaaaagtctactggccgattaggatgtaagccttcagctgccgcc
caaagggccttagctgggcctgccatggtggtcacagactcaccctctgg
aagtgtgagctcaaataaactcttctgttcgtcccttggtcatggtgtct
caccacagccactgaaatgtaaccacgggtttcttcatgctactttctcg
tgcctttctttttttacttggacacaagctggagtaccctggggaagaga
cctcaccttgaagaacata
gaattcccatgaggacgctgttctttctgctgttgactgtctctgggaaa
ccctgcttggtggtatgtgccacctttagccgtcacatccaagtctggta
ccaaggtatgaggttgagattgaatcacccccgaatgggtaattcaagaa
aaccagtgttcttcagtcttcttgtgtgactccccctcctgcttcttatt
acatgacagaaaatggaaataagtcatcttcgtgcacttattggtacact
taggaaagaggctgctatagtaattagcctaatgaagatgaccctggatt
gaagaaacagcaattagagtcgacagaataggcattaggggaaatgaaca
cattcacattcaaagaaagatgaggtttttaaataagagataaaattaat
aacagtccaaattgtatcaagccggaaaaggctcctgtggactcaaaaag
gatggggtgatgtatgacaacagcccatcacctttgagcaaaaaaaaaaa
atgcactgatggcctgacacaggataaaattggtttcaggacaggcaaaa
gaaccataagagcctggctgtctctctcaaatgtaagttttccgtgtatg
ttcttgtttaattttctctccctgaacataataaccagcttcttaaagct
ctggtttaaatcccataaaacctccctcctgtggtccccactgctgctcc
ccgaacccatcttagcaaatgcatgtgcagctctgggcttgcaaaggtgg
aggtgtacatccaccaatggaggagacttgtctgtgtgtgcgtgtgtggg
tggaggccagagtttgacatcaagcaacctcttctatgagtctactgagg
tacgatctctctctaaatccagaagttaccaattaggggttgtctaccta
agcagagcccgcctcaaggcgctgttctgctttgctaatgctggcgttgc
aggcaggtttgcccagcttttatgtagtgctggagttctgggatgctggt
gcttcaagcttggtggggggaaagtcttatcaaatggagccatctccccc
agcacagggttccatcccggagtcctcccagcccagagacacggagggat
taaatgaccagtaggagagtccacccgtaggccttcccaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_47412512_47413575
seq2: B6Ng01-218P22.b_48_1116

seq1  GAATTCTTGGTCCCTAGAGTGGAACTATGTGGTAAGGATTAGAAGTTGTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTGGTCCCTAGAGTGGAACTATGTGGTAAGGATTAGAAGTTGTG  50

seq1  GCCCTTGTCTGAGAAGGTATGTTCTGAACTTTCAAAAACCTAGTCTCTTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCTTGTCTGAGAAGGTATGTTCTGAACTTTCAAAAACCTAGTCTCTTT  100

seq1  CTGCCTGCTTACAACTTGCAGATCGGATATGAGCTCTCGGCTACTGCTCC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCCTGCTTACAACTTGCAGATCGGATATGAGCTCTCGGCTACTGCTCC  150

seq1  AGCGCCATGCCTACCTGCCGCCACACTGCAAGCCATGATGCTAAGAGACT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCGCCATGCCTACCTGCCGCCACACTGCAAGCCATGATGCTAAGAGACT  200

seq1  AACCCTTTGAAACAGTAAATAAGACCCCCAACTAAATGTTCTCTTTTATA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCCTTTGAAACAGTAAATAAGACCCCCAACTAAATGTTCTCTTTTATA  250

seq1  AACTGCCTTGTTCATGCTGTCTCCTCACAGCAAGAGAACAGTGAGTAAGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTGCCTTGTTCATGCTGTCTCCTCACAGCAAGAGAACAGTGAGTAAGC  300

seq1  AGGGTGTGTCCTGGAAAGACCCATGACCCTAGTGCTCCTGGCTGACAGAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGTGTGTCCTGGAAAGACCCATGACCCTAGTGCTCCTGGCTGACAGAG  350

seq1  GGGAACTACTCTAGTCCACAGCCCTGCTCTCTCATGATGTTCTTCCAGGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAACTACTCTAGTCCACAGCCCTGCTCTCTCATGATGTTCTTCCAGGA  400

seq1  ACAATGGAACCAGCACAACAGAGCGTACACTGCAACCTCAGAAACCAGGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAATGGAACCAGCACAACAGAGCGTACACTGCAACCTCAGAAACCAGGA  450

seq1  GCCAAAAGCCTTCCCTCCTTAAAGCTGCCTAGCTCAGGTGTTTATCACAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAAAAGCCTTCCCTCCTTAAAGCTGCCTAGCTCAGGTGTTTATCACAG  500

seq1  TTTGTCACCGCACCATAAGTGTAAAAAGTATCCACACTTCCTTCTCATTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTCACCGCACCATAAGTGTAAAAAGTATCCACACTTCCTTCTCATTG  550

seq1  GCAGCCCTTAGCATCTTCTTGAGGACTCGTGGCCCTTTAGCTGTCACTAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGCCCTTAGCATCTTCTTGAGGACTCGTGGCCCTTTAGCTGTCACTAG  600

seq1  GAGGAACCTTTTCCAGCTCAAGGTCGCAGGGGAAAAGTCGCTCCCGTTAC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGAACCTTTTCCAGCTCAAGGTCGCAGGGGAAAAGTCGCTCCCGTTAC  650

seq1  TTGAGAGTGATTTTCATCTGCTCTCTATGGTGGTTTAGATGAGAATGGTA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAGAGTGATTTTCATCTGCTCTCTATGGTGGTTTAGATGAGAATGGTA  700

seq1  TATATTTGGGGTGCTCGGGCCTCAGTTGGTGAAACTGTTTGGGAAGTACT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATTTGGGGTGCTCGGGCCTCAGTTGGTGAAACTGTTTGGGAAGTACT  750

seq1  TGGAGGTGTGGCCTTCTTGGAGGAGATGTGTCACTGGGAATGGGCTTTGA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAGGTGTGGCCTTCTTGGAGGAGATGTGTCACTGGGAATGGGCTTTGA  800

seq1  GGTTTCAAAAGTCTACTGGCCGATTAGGATGTAAGCCTTCAGCTGCCGCC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTTCAAAAGTCTACTGGCCGATTAGGATGTAAGCCTTCAGCTGCCGCC  850

seq1  C-AAGGGCCTTAGCTGGGCCTGCCATGGTGGTCACAGACTCACCCTCTGG  899
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGGGCCTTAGCTGGGCCTGCCATGGTGGTCACAGACTCACCCTCTGG  900

seq1  AAGTGTGAGCTCAAATAAACTCTTCTGTTCGTCCCTTGGTCATGGTGTCT  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTGTGAGCTCAAATAAACTCTTCTGTTCGTCCCTTGGTCATGGTGTCT  950

seq1  CACCACAGCCACTGAAATGTAACCACGGG-TTCTTCATGCTACTTTCTCG  998
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  CACCACAGCCACTGAAATGTAACCACGGGTTTCTTCATGCTACTTTCTCG  1000

seq1  TGCTTTTC-TTTTTAACTT-GACACAAGCTGGAGTTACCT-GGGAAGAGG  1045
      ||| |||| ||||| |||| |||||||||||||||  ||| |||||||| 
seq2  TGCCTTTCTTTTTTTACTTGGACACAAGCTGGAGTACCCTGGGGAAGAG-  1049

seq1  AACCTCA-CTTG-AGAACATA  1064
       |||||| |||| ||||||||
seq2  -ACCTCACCTTGAAGAACATA  1069

seq1: chr14_47544899_47546027
seq2: B6Ng01-218P22.g_65_1204 (reverse)

seq1  TTGGGAAGGCCTTATGGGT-GACTCTTCCTCCTGCTCTTTTTATCCCTC-  48
      ||||||||||| || |||| ||||| |||| ||| || ||| ||||||| 
seq2  TTGGGAAGGCC-TACGGGTGGACTC-TCCTACTGGTCATTTAATCCCTCC  48

seq1  -TGTCTTTGGCTTGTGA-GACTTCGGGAT-GAACCTGGTGCT-GGGGAGA  94
       ||||| |||  || || |||| |||||| |||||  ||||| |||||||
seq2  GTGTCTCTGGGCTGGGAGGACTCCGGGATGGAACCCTGTGCTGGGGGAGA  98

seq1  TGGCT-CATTTGATAAAGACTTTCCCAC--ACAAGC-TGAAGCACCAGCA  140
      ||||| |||||||| ||||||||||| |   ||||| |||||||||||||
seq2  TGGCTCCATTTGAT-AAGACTTTCCCCCCACCAAGCTTGAAGCACCAGCA  147

seq1  T-CCAGAACTCCAGCACCTACATAAAAGCTGGGC-AACCTGCCTGCAACG  188
      | |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  TCCCAGAACTCCAGCA-CTACATAAAAGCTGGGCAAACCTGCCTGCAACG  196

seq1  CCAGCATTAGCAAAGCAG-ACAGCGCC-TGGGGCGGGCTCTGCTTAGGTA  236
      |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||
seq2  CCAGCATTAGCAAAGCAGAACAGCGCCTTGAGGCGGGCTCTGCTTAGGTA  246

seq1  GACAA-CCCTAATTGGTAACTTCTGGATTTAGAGAGAGATCGTACCTCAG  285
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAACCCCTAATTGGTAACTTCTGGATTTAGAGAGAGATCGTACCTCAG  296

seq1  TAGACTCATAGAAGAGGTTGCTTGATGTCAAACTCTGGCCTCCACCCACA  335
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGACTCATAGAAGAGGTTGCTTGATGTCAAACTCTGGCCTCCACCCACA  346

seq1  CACGCACACACAGACAAGTCTCCTCCATTGGTGGATGTACACCTCCACCT  385
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACGCACACACAGACAAGTCTCCTCCATTGGTGGATGTACACCTCCACCT  396

seq1  TTGCAAGCCCAGAGCTGCACATGCATTTGCTAAGATGGGTTCGGGGAGCA  435
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCAAGCCCAGAGCTGCACATGCATTTGCTAAGATGGGTTCGGGGAGCA  446

seq1  GCAGTGGGGACCACAGGAGGGAGGTTTTATGGGATTTAAACCAGAGCTTT  485
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGTGGGGACCACAGGAGGGAGGTTTTATGGGATTTAAACCAGAGCTTT  496

seq1  AAGAAGCTGGTTATTATGTTCAGGGAGAGAAAATTAAACAAGAACATACA  535
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAAGCTGGTTATTATGTTCAGGGAGAGAAAATTAAACAAGAACATACA  546

seq1  CGGAAAACTTACATTTGAGAGAGACAGCCAGGCTCTTATGGTTCTTTTGC  585
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGAAAACTTACATTTGAGAGAGACAGCCAGGCTCTTATGGTTCTTTTGC  596

seq1  CTGTCCTGAAACCAATTTTATCCTGTGTCAGGCCATCAGTGCATTTTTTT  635
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTCCTGAAACCAATTTTATCCTGTGTCAGGCCATCAGTGCATTTTTTT  646

seq1  TTTTTGCTCAAAGGTGATGGGCTGTTGTCATACATCACCCCATCCTTTTT  685
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTGCTCAAAGGTGATGGGCTGTTGTCATACATCACCCCATCCTTTTT  696

seq1  GAGTCCACAGGAGCCTTTTCCGGCTTGATACAATTTGGACTGTTATTAAT  735
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTCCACAGGAGCCTTTTCCGGCTTGATACAATTTGGACTGTTATTAAT  746

seq1  TTTATCTCTTATTTAAAAACCTCATCTTTCTTTGAATGTGAATGTGTTCA  785
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATCTCTTATTTAAAAACCTCATCTTTCTTTGAATGTGAATGTGTTCA  796

seq1  TTTCCCCTAATGCCTATTCTGTCGACTCTAATTGCTGTTTCTTCAATCCA  835
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCCCTAATGCCTATTCTGTCGACTCTAATTGCTGTTTCTTCAATCCA  846

seq1  GGGTCATCTTCATTAGGCTAATTACTATAGCAGCCTCTTTCCTAAGTGTA  885
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTCATCTTCATTAGGCTAATTACTATAGCAGCCTCTTTCCTAAGTGTA  896

seq1  CCAATAAGTGCACGAAGATGACTTATTTCCATTTTCTGTCATGTAATAAG  935
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAATAAGTGCACGAAGATGACTTATTTCCATTTTCTGTCATGTAATAAG  946

seq1  AAGCAGGAGGGGGAGTCACACAAGAAGACTGAAGAACACTGGTTTTCTTG  985
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCAGGAGGGGGAGTCACACAAGAAGACTGAAGAACACTGGTTTTCTTG  996

seq1  AATTACCCATTCGGGGGTGATTCAATCTCAACCTCATACCTTGGTACCAG  1035
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTACCCATTCGGGGGTGATTCAATCTCAACCTCATACCTTGGTACCAG  1046

seq1  ACTTGGATGTGACGGCTAAAGGTGGCACATACCACCAAGCAGGGTTTCCC  1085
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTGGATGTGACGGCTAAAGGTGGCACATACCACCAAGCAGGGTTTCCC  1096

seq1  AGAGACAGTCAACAGCAGAAAGAACAGCGTCCTCATGGGAATTC  1129
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGACAGTCAACAGCAGAAAGAACAGCGTCCTCATGGGAATTC  1140