seq1: chr18_16278330_16279374
seq2: B6Ng01-221J17.b_47_1099
seq1 GAATTCCCAGTCTATGTACATAAGTCCATGTACTTAGATCAGACAAAGAA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GAATTCCCAGTCTATGTACATAAGTCCATGTACTTAGATCAGACAAAGAA 50
seq1 TGAGTTCATATTTAGAATTCAAGCTTTTCTCATCTTCATTTCTGCCACAG 100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TGAGTTCATATTTAGAATTCAAGCTTTTCTCATCTTCATTTCTGCCACAG 100
seq1 TAACCTTGAGTCACTGAAATTTCCTGCAAAGTAGTTTCTTGGCTCTCTTT 150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TAACCTTGAGTCACTGAAATTTCCTGCAAAGTAGTTTCTTGGCTCTCTTT 150
seq1 TCCTTAACAGACTCTTCTATGGAAAATAGCAGCCATGTAACATCTTTTCT 200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TCCTTAACAGACTCTTCTATGGAAAATAGCAGCCATGTAACATCTTTTCT 200
seq1 GTCTTTGGAATCCTCAAGTAGCTCCTACTGTCATGGAGGAAATCCAAATC 250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GTCTTTGGAATCCTCAAGTAGCTCCTACTGTCATGGAGGAAATCCAAATC 250
seq1 CTATTCAAGACTTCCAGTCCCTAGTTGGCACCATTTTCTATATTCTTCAC 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CTATTCAAGACTTCCAGTCCCTAGTTGGCACCATTTTCTATATTCTTCAC 300
seq1 TTAAATCTATGCTGTCTGTGTGGCCATACCATAGCCTCCATGTCTTGCCC 350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TTAAATCTATGCTGTCTGTGTGGCCATACCATAGCCTCCATGTCTTGCCC 350
seq1 ACTCTGTATTCAGAACCGTCACATCCCTGCCCTTGTACAGCATCACTTCT 400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 ACTCTGTATTCAGAACCGTCACATCCCTGCCCTTGTACAGCATCACTTCT 400
seq1 GCCAAAGTGTACCAGGTTACCACTATTCAACAGTGACACCTGCATCCCAC 450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GCCAAAGTGTACCAGGTTACCACTATTCAACAGTGACACCTGCATCCCAC 450
seq1 CTTCCTCCCAACCGTCACTTTTCCTTCAGGTCTATAATGTTGGCATATGC 500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CTTCCTCCCAACCGTCACTTTTCCTTCAGGTCTATAATGTTGGCATATGC 500
seq1 CGTGTGAATTTGCATCTTTGTCGTTCCTTAACAACTCAAGACATTACCTC 550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CGTGTGAATTTGCATCTTTGTCGTTCCTTAACAACTCAAGACATTACCTC 550
seq1 ATTGGCATTAATAAAAATCTGATCAGAATGTACAAGGCAGGACTTTCTGT 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 ATTGGCATTAATAAAAATCTGATCAGAATGTACAAGGCAGGACTTTCTGT 600
seq1 GAGGCAGAAAGGAGCTCTGGGAGGAAGAAGGAGTAAGGCCTTTTCATGAG 650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GAGGCAGAAAGGAGCTCTGGGAGGAAGAAGGAGTAAGGCCTTTTCATGAG 650
seq1 GAGATATCAGAGAGGACAGATGTGACTACTGGCCAGGAAGGTATACTAGC 700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GAGATATCAGAGAGGACAGATGTGACTACTGGCCAGGAAGGTATACTAGC 700
seq1 CATATGGCTAAATGGGGCTAGGTTGTTGGGTTAATTTAAATGAGCCAGTT 750
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CATATGGCTAAATGGGGCTAGGTTGTTGGGTTAATTTAAATGAGCCAGTT 750
seq1 TAAAGTCAGCCCAGCTAAGGCCTAAACTTTGAAATATTAAAAGGTCTCTG 800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TAAAGTCAGCCCAGCTAAGGCCTAAACTTTGAAATATTAAAAGGTCTCTG 800
seq1 TGTAATAATTTGGGTAACTGGTGCCATATTAGGTTCTAGCATTAGAGAGA 850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TGTAATAATTTGGGTAACTGGTGCCATATTAGGTTCTAGCATTAGAGAGA 850
seq1 GAGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATTGATAAT 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GAGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATTGATAAT 900
seq1 CACACTATAAAAACAGTCATTGTCTAGCACTTGAGCTTGATTATT-CACT 949
|||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||
seq2 CACACTAT-AAAACAGTCATTGTCTAGCACTTGAAGCTGATTATTCCACT 949
seq1 AGATTTATTTTTTCTC-TTTCTCAGTCCATCGATGAGCCCCTTCT-CTTA 997
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2 AGATTTATTTTTTCTCTTTTCTCAGTCCATCGATGAGCCCCTTCTCCTTA 999
seq1 GTTTTAGTTCCTTAAG-AGAA--GA-TATTTCTG-CTTATGTTCA-TTAA 1041
|||| || ||||||| |||| || |||||||| |||||||||| | ||
seq2 GTTTAGGTCCCTTAAGAAGAAAGGACTATTTCTGCCTTATGTTCACTAAA 1049
seq1 TGAA 1045
||||
seq2 TGAA 1053
| seq1: chr14_102269507_102269762
seq2: B6Ng01-221J17.g_100_149 (reverse)
seq1 ACACACACACACACACACACACACACACACTCTCAGATGCTATC--TTTG 48
||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || | ||||
seq2 ACACACACACACACACACAAACACACACACTCTAATCTCTTAACATTTTG 50
seq1 CCAGCCCTGTGAGTAATTCTCTGATAAACCACGTGTTGGGATGGCTCCAG 98
seq2 -------------------------------------------------- 50
seq1 TTTTCCCTGGTCCCCGAGGCTATGGAGCAAAGCTGTGGTGGGTGTGGTGT 148
seq2 -------------------------------------------------- 50
seq1 GTGGGCCCAGAGTGAGCTCTTTGAAAGATTTTCAGAGTTACTTTGGGTAG 198
seq2 -------------------------------------------------- 50
seq1 AGCAGTGGATGACTGCTGGCTGGCACGTACTGGCAAATTATAATCTCTTA 248
seq2 -------------------------------------------------- 50
seq1 ACATTTTG 256
seq2 -------- 50
|
