BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-234K19
Chromosome14 (Build37)
Map Location 20,730,720 - 20,839,564
singlet/doubletdoublet
Overlap geneGng2
Upstream geneLOC627741, LOC100042299, LOC675069, LOC100042322, LOC632470, EG632477, EG632498, EG667341, LOC667344, LOC619996, EG434616, LOC675165, 1700110I01Rik, EG664814, LOC100039452, LOC100038983, LOC100039441, EG432825, LOC673583, EG664855, Nid2, 2700060E02Rik, LOC100039534
Downstream gene1810063B07Rik, Kcnk5, LOC100039106, Kcnk16, Nudt13, Ecd, AA536717, Dnajc9, Mrps16, Ttc18, Anxa7, Zmynd17, Ppp3cb, Usp54, Myoz1, Synpo2l, Sec24c, Fut11, Chchd1, 2310021P13Rik, Ndst2, Camk2g, Plau, EG620119, Vcl
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-234K19.bB6Ng01-234K19.g
ACCGA046373GA046374
length1,0911,139
definitionB6Ng01-234K19.b B6Ng01-234K19.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(20,838,481 - 20,839,564)(20,730,720 - 20,731,854)
sequence
gaattctcagcgagttccaatggatggaaagcttttgaaactttgaccca
gtgatagtcggtgtagatggagctccggtgagccccagactttgttctaa
tggtttgttctgttgtatgcatgttctggttgaatgtaggtgagaccatg
tttattaacagcaaggacatctttgttacccatgtgtgaagatggccaaa
atgcctcagatttactttttgtaatagcatgagagaatcagcagaaaata
aaatagaaaaaattgagttacaggtccacatatacctgcacatatagtaa
caaacacatatacagacatttatagacatacataaacacatacagatatc
catatagagacatacgtagacatatccatatttatgcacagacattcaca
tatggtcatacacaatcatatatacacatgtgcacatacacatagactta
catattcttacacacacatatactcatccatacacacatagattatatga
atatacatatacatgtatgcacacagatacacacagatgcacagccacat
gcacacacactcatgtttggctcagcttactcatgagagcttgtcttgga
aataaaacagtgttgtaattcatgcagtttatgaaacggactaagaaaaa
tcactaaataagtagttgtcatagaaacatagcaaatctgtacattacca
agtcacatgcataagcagactgtatacaaattatacagactttgctctaa
ataaaatatggttgcaattcaaggtgaaggcaactaaacgagatgcaagt
ctgttgtgtgacatttcaaggattcccttcaattttagcattttctcgtc
aattatgaatgttttcttaattattcttcagctttcttcccagccaggta
ttcaaatgcttgcctgcacaggctgcattatctgtgtgtgctcgaaggac
agttcagagcttcatatagggaagatgttctgggaattgtggaggatgca
gtgaaagacaacacaacttcccttcacttccagctgagaaaaagacagga
cgcacacgtcttgtgtttggagaatggtcctgaaaggtgga
gaattctctgcctttgaactgtccctcaaagctactggacagagacttaa
ccaggctcacatgccatcatatgtcaaggagcctcccagtctcccagcag
ccttgcctggttctttttctaccacagcagctggtaaggcccccgagtcc
tggctggacaggacacttaggtgagtctggaacagtaagagtgctaagtg
agcacagaccacaggacccacctctatgagaacccagagttcactacagt
ggatcctgtttcccaccctcatgtccccagttccctttgaatgatttttc
cacccttttcttctttcctcaaagctcttcttgtacccccttgctctctg
tgctcattctcagctggtcaatttgcttcttatctcagagagaaaacagc
aacaactagatgagaatgtgcatatccgccctcctggatgtcccctcccc
caccccaccccacctgagcatccttcctaagcctggcttctagggtgagt
gagtgcctcctgccctgtgccatctcctccttccctgtgccatctcctcc
ttccctgtgccatctcctccttccctgtgccatctccccctgccctgtgc
catctcctcctgtcctgtgccaactccttctgtcctgtgccatctccccc
tgccctgtgccatctcctcctgccctgtgccatctcttcctgccctgtgc
catctcctcctgccctgtgtcatctccccctgccctgtgccatctcctcc
tgccctgtgtcatctccccctgccctgtgccatctcctcctgccctgtgt
catcttccccctgccctgtgccatctcctcctgcctgtgccatctcctcc
tgcctgtgccaattccttctgtcctgtaccatctcctcctgcccctgagc
tctggtttttctctgacaatcaataggtgctcgagtcctcttttattcgg
agaccacttcattcacatggtagacataccaaacaacctctcattcttag
aataaacaaaaggcttagagagatggattcagtaagagtgctggtgacta
gaatgagcttcaagtgtagatcttggaactcattgtcctcaaacatgggg
aggcattatgcctggaatgttaactccagtgcctattcg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_20838481_20839564
seq2: B6Ng01-234K19.b_49_1139 (reverse)

seq1  TCCACC-TTCAGGACCA-TCTC--AACAC-AGACGTGGTGCGT-CTGTCT  44
      |||||| |||||||||| ||||  ||||| |||||| |||||| ||||| 
seq2  TCCACCTTTCAGGACCATTCTCCAAACACAAGACGT-GTGCGTCCTGTC-  48

seq1  TTTTTCTCAGCTGGAAGTGAA-GGAAGTTGTG-TGTCTTTCACTGCATCC  92
      ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||
seq2  TTTTTCTCAGCTGGAAGTGAAGGGAAGTTGTGTTGTCTTTCACTGCATCC  98

seq1  TCCAC-ATTCCCAGAACATCTTCCCTATATGAAGCTCTGAACTGTCCTTC  141
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCACAATTCCCAGAACATCTTCCCTATATGAAGCTCTGAACTGTCCTTC  148

seq1  GAGCACACACAGATAATGCAGCCTGTGCAGGCAAGCATTTGAATACCTGG  191
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCACACACAGATAATGCAGCCTGTGCAGGCAAGCATTTGAATACCTGG  198

seq1  CTGGGAAGAAAGCTGAAGAATAATTAAGAAAACATTCATAATTGACGAGA  241
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGGAAGAAAGCTGAAGAATAATTAAGAAAACATTCATAATTGACGAGA  248

seq1  AAATGCTAAAATTGAAGGGAATCCTTGAAATGTCACACAACAGACTTGCA  291
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGCTAAAATTGAAGGGAATCCTTGAAATGTCACACAACAGACTTGCA  298

seq1  TCTCGTTTAGTTGCCTTCACCTTGAATTGCAACCATATTTTATTTAGAGC  341
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCGTTTAGTTGCCTTCACCTTGAATTGCAACCATATTTTATTTAGAGC  348

seq1  AAAGTCTGTATAATTTGTATACAGTCTGCTTATGCATGTGACTTGGTAAT  391
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTCTGTATAATTTGTATACAGTCTGCTTATGCATGTGACTTGGTAAT  398

seq1  GTACAGATTTGCTATGTTTCTATGACAACTACTTATTTAGTGATTTTTCT  441
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACAGATTTGCTATGTTTCTATGACAACTACTTATTTAGTGATTTTTCT  448

seq1  TAGTCCGTTTCATAAACTGCATGAATTACAACACTGTTTTATTTCCAAGA  491
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTCCGTTTCATAAACTGCATGAATTACAACACTGTTTTATTTCCAAGA  498

seq1  CAAGCTCTCATGAGTAAGCTGAGCCAAACATGAGTGTGTGTGCATGTGGC  541
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGCTCTCATGAGTAAGCTGAGCCAAACATGAGTGTGTGTGCATGTGGC  548

seq1  TGTGCATCTGTGTGTATCTGTGTGCATACATGTATATGTATATTCATATA  591
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGCATCTGTGTGTATCTGTGTGCATACATGTATATGTATATTCATATA  598

seq1  ATCTATGTGTGTATGGATGAGTATATGTGTGTGTAAGAATATGTAAGTCT  641
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTATGTGTGTATGGATGAGTATATGTGTGTGTAAGAATATGTAAGTCT  648

seq1  ATGTGTATGTGCACATGTGTATATATGATTGTGTATGACCATATGTGAAT  691
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTGTATGTGCACATGTGTATATATGATTGTGTATGACCATATGTGAAT  698

seq1  GTCTGTGCATAAATATGGATATGTCTACGTATGTCTCTATATGGATATCT  741
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTGTGCATAAATATGGATATGTCTACGTATGTCTCTATATGGATATCT  748

seq1  GTATGTGTTTATGTATGTCTATAAATGTCTGTATATGTGTTTGTTACTAT  791
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATGTGTTTATGTATGTCTATAAATGTCTGTATATGTGTTTGTTACTAT  798

seq1  ATGTGCAGGTATATGTGGACCTGTAACTCAATTTTTTCTATTTTATTTTC  841
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTGCAGGTATATGTGGACCTGTAACTCAATTTTTTCTATTTTATTTTC  848

seq1  TGCTGATTCTCTCATGCTATTACAAAAAGTAAATCTGAGGCATTTTGGCC  891
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGATTCTCTCATGCTATTACAAAAAGTAAATCTGAGGCATTTTGGCC  898

seq1  ATCTTCACACATGGGTAACAAAGATGTCCTTGCTGTTAATAAACATGGTC  941
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTTCACACATGGGTAACAAAGATGTCCTTGCTGTTAATAAACATGGTC  948

seq1  TCACCTACATTCAACCAGAACATGCATACAACAGAACAAACCATTAGAAC  991
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACCTACATTCAACCAGAACATGCATACAACAGAACAAACCATTAGAAC  998

seq1  AAAGTCTGGGGCTCACCGGAGCTCCATCTACACCGACTATCACTGGGTCA  1041
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTCTGGGGCTCACCGGAGCTCCATCTACACCGACTATCACTGGGTCA  1048

seq1  AAGTTTCAAAAGCTTTCCATCCATTGGAACTCGCTGAGAATTC  1084
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTTTCAAAAGCTTTCCATCCATTGGAACTCGCTGAGAATTC  1091

seq1: chr14_20730720_20731854
seq2: B6Ng01-234K19.g_64_1202

seq1  GAATTCTCTGCCTTTGAACTGTCCCTCAAAGCTACTGGACAGAGACTTAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCTGCCTTTGAACTGTCCCTCAAAGCTACTGGACAGAGACTTAA  50

seq1  CCAGGCTCACATGCCATCATATGTCAAGGAGCCTCCCAGTCTCCCAGCAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGCTCACATGCCATCATATGTCAAGGAGCCTCCCAGTCTCCCAGCAG  100

seq1  CCTTGCCTGGTTCTTTTTCTACCACAGCAGCTGGTAAGGCCCCCGAGTCC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTGCCTGGTTCTTTTTCTACCACAGCAGCTGGTAAGGCCCCCGAGTCC  150

seq1  TGGCTGGACAGGACACTTAGGTGAGTCTGGAACAGTAAGAGTGCTAAGTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCTGGACAGGACACTTAGGTGAGTCTGGAACAGTAAGAGTGCTAAGTG  200

seq1  AGCACAGACCACAGGACCCACCTCTATGAGAACCCAGAGTTCACTACAGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCACAGACCACAGGACCCACCTCTATGAGAACCCAGAGTTCACTACAGT  250

seq1  GGATCCTGTTTCCCACCCTCATGTCCCCAGTTCCCTTTGAATGATTTTTC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATCCTGTTTCCCACCCTCATGTCCCCAGTTCCCTTTGAATGATTTTTC  300

seq1  CACCCTTTTCTTCTTTCCTCAAAGCTCTTCTTGTACCCCCTTGCTCTCTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCCTTTTCTTCTTTCCTCAAAGCTCTTCTTGTACCCCCTTGCTCTCTG  350

seq1  TGCTCATTCTCAGCTGGTCAATTTGCTTCTTATCTCAGAGAGAAAACAGC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTCATTCTCAGCTGGTCAATTTGCTTCTTATCTCAGAGAGAAAACAGC  400

seq1  AACAACTAGATGAGAATGTGCATATCCGCCCTCCTGGATGTCCCCTCCCC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAACTAGATGAGAATGTGCATATCCGCCCTCCTGGATGTCCCCTCCCC  450

seq1  CACCCCACCCCACCTGAGCATCCTTCCTAAGCCTGGCTTCTAGGGTGAGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCCCACCCCACCTGAGCATCCTTCCTAAGCCTGGCTTCTAGGGTGAGT  500

seq1  GAGTGCCTCCTGCCCTGTGCCATCTCCTCCTTCCCTGTGCCATCTCCTCC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTGCCTCCTGCCCTGTGCCATCTCCTCCTTCCCTGTGCCATCTCCTCC  550

seq1  TTCCCTGTGCCATCTCCTCCTTCCCTGTGCCATCTCCCCCTGCCCTGTGC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCCTGTGCCATCTCCTCCTTCCCTGTGCCATCTCCCCCTGCCCTGTGC  600

seq1  CATCTCCTCCTGTCCTGTGCCAACTCCTTCTGTCCTGTGCCATCTCCCCC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTCCTCCTGTCCTGTGCCAACTCCTTCTGTCCTGTGCCATCTCCCCC  650

seq1  TGCCCTGTGCCATCTCCTCCTGCCCTGTGCCATCTCTTCCTGCCCTGTGC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCCTGTGCCATCTCCTCCTGCCCTGTGCCATCTCTTCCTGCCCTGTGC  700

seq1  CATCTCCTCCTGCCCTGTGTCATCTCCCCCTGCCCTGTGCCATCTCCTCC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTCCTCCTGCCCTGTGTCATCTCCCCCTGCCCTGTGCCATCTCCTCC  750

seq1  TGCCCTGTGTCATCTCCCCCTGCCCTGTGCCATCTCCTCCTGCCCTGTGT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCCTGTGTCATCTCCCCCTGCCCTGTGCCATCTCCTCCTGCCCTGTGT  800

seq1  CATC-TCCCCCTGCCCTGTGCCATCTCCTCCTGCCCTGTGCCATCTCCTC  849
      |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  CATCTTCCCCCTGCCCTGTGCCATCTCCTCCTG-CCTGTGCCATCTCCTC  849

seq1  CTGCCCTGTGCCAAATCCTTCTGTCCTGTACCATCTCCTCCTGCCCCTGA  899
      ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTG-CCTGTGCCAATTCCTTCTGTCCTGTACCATCTCCTCCTGCCCCTGA  898

seq1  GCTCCTGGTTTTCTCTGAC-ATCAATAGGTGCTCGAGT-CTCTTT--ATC  945
      ||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||   ||
seq2  GCTCTGGTTTTTCTCTGACAATCAATAGGTGCTCGAGTCCTCTTTTATTC  948

seq1  GGAGAACAC-TCATCAACAT-GTAGACATACCAAACCACCTCTCA-TCTT  992
      ||||| ||| ||||  |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||
seq2  GGAGACCACTTCATTCACATGGTAGACATACCAAACAACCTCTCATTCTT  998

seq1  AGAAATAAACAAAAGGGCTAGAGAGAT-GATTCAGTAAGAGTGCTTGGTG  1041
      || |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||
seq2  AG-AATAAACAAAAGGCTTAGAGAGATGGATTCAGTAAGAGTGC-TGGTG  1046

seq1  ACTAGACATGAGCCTC-AGTGTAGATTCTGGTACTCATGTTCTTAAAACA  1090
      |||||| |||||| || |||||||||  ||| ||||||  || | |||||
seq2  ACTAGA-ATGAGCTTCAAGTGTAGATCTTGGAACTCATTGTCCTCAAACA  1095

seq1  AGGGGGGAGGCAGTATGGCTGGACATG-TAACTCCAGTG-CTATTCG  1135
         ||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||
seq2  --TGGGGAGGCATTATGCCTGGA-ATGTTAACTCCAGTGCCTATTCG  1139