BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-249D24
Chromosome14 (Build37)
Map Location 57,914,749 - 58,112,939
singlet/doubletdoublet
Overlap geneCryl1, LOC668090, AU040096, Ift88
Upstream geneAtp12a, Rnf17, Cenpj, Parp4, LOC100042788, 4930548G07Rik, Pspc1, LOC100043499, 9830124H08Rik, LOC100042797, LOC219106, LOC668118, Zmym2, LOC100042817, B020004C17Rik, Gja3, Gjb2, LOC100043515, Gjb6, LOC668140
Downstream geneIl17d, N6amt2, Xpo4, Lats2, Sap18, F630043A04Rik, Mrp63, Zdhhc20, Efha1, LOC668160, Fgf9, LOC100043554
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-249D24.bB6Ng01-249D24.g
ACCGA057120GA057121
length1,1271,151
definitionB6Ng01-249D24.b B6Ng01-249D24.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(58,111,816 - 58,112,939)(57,914,749 - 57,915,916)
sequence
gaattcaactccagcttccaggagcctgtgccagcttccaatgcaacatc
agtttctgagtcaccgcatccctttccataggagtggagtgccgctcacc
aggaggtgctggcactgtcatggttctgtctaccagaatacaggcatgta
ttctctctcctgctctcactaggataacttccttcagtactgctgggctg
caggctcctaccatcctgccaggcttaaaccatattccttgacagcctta
gaataaggaggtatgcagcatatttctccccttaccacaactgccatcaa
aattatactttataagtgttagctagatgctaaactaatttctaccctca
tttgattgaacatagaaaaaatcccacttaagctctaaagtttttttgtt
ttgttttgttttttttaaattttatttatttatttatttatttatgtgca
gatggttgtaagccttcatgtggttcttcagaattgaatttttaggacct
ctgctggctccagtcggccccgctccagtctcttagtctctgctcactcc
agcccaaagacttattttttattatacacaagtacactgtagctgacttc
agatgcaccaggagagggcattgggttccattacaggtggttgtgagcca
ccatgtggttgctgggatttgaactcaggaccttcggaagaacagtcagt
gctcttacccgctgagccatctcgccagcccttgttttgttttttgagac
agggtttctctgtatagccctggctgtctctgtagaccagactggccttg
aactcagaaatctgcctgcctctgcctcccaagtgctgggattaaaggcg
tgagcctccacgcccggctgagctctcaagttgagtcagctttctagtga
atttccaaactaagttttaagccagccctttgcttctccaagaggtgaaa
tgagcatatttgctaggccctaagttttctaagactatggtcctgctgcg
tccacacacacaggtagactgtcccactgcgtggtatttgggtgttcagc
cagtgctgacgctacttgtgtctggcttccttgtaaaatggagtgctttt
ctgtatctgggaaacattttacttcct
gaattcaaagccagcttggtctacatagcaagttccaaaacagccaaggc
tacatagtgagaccctgtgtcaaaaatcaattttcacatcccttaaggaa
cagtcagcggtatttggtgctttaaactggggtttaaactcacagtgtca
acatcacctgagtctctatttacgtagacgctggtatcaatgggaagcct
gcatcccagataaaaagacagaacaaaacacatataaacagatggagaaa
aataaaaacaattgagaaataaaatgtcacataagacatgaaatgaagac
tccatcaagtacacattaaattagtattaatatctgattaggaaacagag
ctgccagtcaactaagctaccccaccagctataatggatagagtttatct
ttgaacagatgaaacagtctagagagacctttaggcccaggcctcaggga
agtcacactccgggcttctccaatattgacatccattagaatcccctagc
ttgtcacagagcagcgtctggctccacagcccgggaagacctagagactg
catttcttatgagcacccacatgaggcttgggaaccctgggagagatcgc
ctctgctaagctgaggatgtgaggacctcggcttaggatgtccctggtga
cagctggtgcacatgagaaagaaggctaaattcagaagctatcacctaag
ctacgtggcagatactggcctgagcccttacacagagacccccacctagt
cctcatcataaaccagtaagaaatcatctctgctttatagaccctgcagc
agaggcaggtcttaatttccaaccatgctgtagcatgtggaccaagccac
ttaacgtattagtcaatttcctattgcataaagtctttagacagcatgtt
tctcctggcattgagaagtgactggcaggtctgaaatgaggtgatcgtgg
gaaatgggaaggaaagctttccaggttctgaattcctacccagaggacag
actgctatgagcagtagccgccctagtgggctcgcgatcctaatctgcct
cattgcagtaagtaatcacctggttagtctgattgcatgactcgaagcca
gcttgtaaatggatatccttccagcacttggcactcagtctgaaaccaag
c
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_58111816_58112939
seq2: B6Ng01-249D24.b_47_1173 (reverse)

seq1  AAGAAGAAAAATGTT--CCAGA-ACAGAAAAGCACT-CATCTACAAAGAA  46
      | |||| ||||||||  ||||| ||||||||||||| ||| |   ||| |
seq2  AGGAAGTAAAATGTTTCCCAGATACAGAAAAGCACTCCATTTTACAAGGA  50

seq1  AGCCAGACACAAGTAGCCGTCAGCACT-GCTGAACA-CCAAATACCAACG  94
      |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||   
seq2  AGCCAGACACAAGTAG-CGTCAGCACTGGCTGAACACCCAAATACCA--C  97

seq1  GCAGTGGGACAGTCTACCTGTGTGTGTGAACGCAGCAGGACCATAGTCTT  144
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  GCAGTGGGACAGTCTACCTGTGTGTGTGGACGCAGCAGGACCATAGTCTT  147

seq1  AG-AAACTTAGGGCCTAGCAAATATGCTCATTTCACTTCTTGGAGAAGCA  193
      || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  AGAAAACTTAGGGCCTAGCAAATATGCTCATTTCACCTCTTGGAGAAGCA  197

seq1  AAAGGCTGGCTTAAAACTTAGTTTGGAAATTCACTAGAAAGCTGACTCAA  243
      || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  AAGGGCTGGCTTAAAACTTAGTTTGGAAATTCACTAGAAAGCTGACTC-A  246

seq1  ACTTGAGAGCTCAGCCGGGCGTGGAGGCTCACGCCTTTAATCCCAGCACT  293
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTGAGAGCTCAGCCGGGCGTGGAGGCTCACGCCTTTAATCCCAGCACT  296

seq1  TGGGAGGCAGAGGCAGGCAGATTTCTGAGTTCAAGGCCAGTCTGGTCTAC  343
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGAGGCAGAGGCAGGCAGATTTCTGAGTTCAAGGCCAGTCTGGTCTAC  346

seq1  AGAGACAGCCAGGGCTATACAGAGAAACCCTGTCTCAAAAAACAAAACAA  393
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGACAGCCAGGGCTATACAGAGAAACCCTGTCTCAAAAAACAAAACAA  396

seq1  GGGCTGGCGAGATGGCTCAGCGGGTAAGAGCACTGACTGTTCTTCCGAAG  443
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCTGGCGAGATGGCTCAGCGGGTAAGAGCACTGACTGTTCTTCCGAAG  446

seq1  GTCCTGAGTTCAAATCCCAGCAACCACATGGTGGCTCACAACCACCTGTA  493
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCTGAGTTCAAATCCCAGCAACCACATGGTGGCTCACAACCACCTGTA  496

seq1  ATGGAACCCAATGCCCTCTCCTGGTGCATCTGAAGTCAGCTACAGTGTAC  543
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGAACCCAATGCCCTCTCCTGGTGCATCTGAAGTCAGCTACAGTGTAC  546

seq1  TTGTGTATAATAAAAAATAAGTCTTTGGGCTGGAGTGAGCAGAGACTAAG  593
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTGTATAATAAAAAATAAGTCTTTGGGCTGGAGTGAGCAGAGACTAAG  596

seq1  AGACTGGAGCGGGGCCGACTGGAGCCAGCAGAGGTCCTAAAAATTCAATT  643
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACTGGAGCGGGGCCGACTGGAGCCAGCAGAGGTCCTAAAAATTCAATT  646

seq1  CTGAAGAACCACATGAAGGCTTACAACCATCTGCACATAAATAAATAAAT  693
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAAGAACCACATGAAGGCTTACAACCATCTGCACATAAATAAATAAAT  696

seq1  AAATAAATAAAATTTAAAAAAAACAAAACAAAACAAAAAAACTTTAGAGC  743
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATAAATAAAATTTAAAAAAAACAAAACAAAACAAAAAAACTTTAGAGC  746

seq1  TTAAGTGGGATTTTTTCTATGTTCAATCAAATGAGGGTAGAAATTAGTTT  793
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAGTGGGATTTTTTCTATGTTCAATCAAATGAGGGTAGAAATTAGTTT  796

seq1  AGCATCTAGCTAACACTTATAAAGTATAATTTTGATGGCAGTTGTGGTAA  843
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCATCTAGCTAACACTTATAAAGTATAATTTTGATGGCAGTTGTGGTAA  846

seq1  GGGGAGAAATATGCTGCATACCTCCTTATTCTAAGGCTGTCAAGGAATAT  893
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGAGAAATATGCTGCATACCTCCTTATTCTAAGGCTGTCAAGGAATAT  896

seq1  GGTTTAAGCCTGGCAGGATGGTAGGAGCCTGCAGCCCAGCAGTACTGAAG  943
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTTAAGCCTGGCAGGATGGTAGGAGCCTGCAGCCCAGCAGTACTGAAG  946

seq1  GAAGTTATCCTAGTGAGAGCAGGAGAGAGAATACATGCCTGTATTCTGGT  993
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGTTATCCTAGTGAGAGCAGGAGAGAGAATACATGCCTGTATTCTGGT  996

seq1  AGACAGAACCATGACAGTGCCAGCACCTCCTGGTGAGCGGCACTCCACTC  1043
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACAGAACCATGACAGTGCCAGCACCTCCTGGTGAGCGGCACTCCACTC  1046

seq1  CTATGGAAAGGGATGCGGTGACTCAGAAACTGATGTTGCATTGGAAGCTG  1093
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATGGAAAGGGATGCGGTGACTCAGAAACTGATGTTGCATTGGAAGCTG  1096

seq1  GCACAGGCTCCTGGAAGCTGGAGTTGAATTC  1124
      |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACAGGCTCCTGGAAGCTGGAGTTGAATTC  1127

seq1: chr14_57914749_57915916
seq2: B6Ng01-249D24.g_66_1216

seq1  GAATTCAAAGCCAGCTTGGTCTACATAGCAAGTTCCAAAACAGCCAAGGC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAAGCCAGCTTGGTCTACATAGCAAGTTCCAAAACAGCCAAGGC  50

seq1  TACATAGTGAGACCCTGTGTCAAAAATCAATTTTCACATCCCTTAAGGAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACATAGTGAGACCCTGTGTCAAAAATCAATTTTCACATCCCTTAAGGAA  100

seq1  CAGTCAGCGGTATTTGGTGCTTTAAACTGGGGTTTAAACTCACAGTGTCA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTCAGCGGTATTTGGTGCTTTAAACTGGGGTTTAAACTCACAGTGTCA  150

seq1  ACATCACCTGAGTCTCTATTTACGTAGACGCTGGTATCAATGGGAAGCCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATCACCTGAGTCTCTATTTACGTAGACGCTGGTATCAATGGGAAGCCT  200

seq1  GCATCCCAGATAAAAAGACAGAACAAAACACATATAAACAGATGGAGAAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATCCCAGATAAAAAGACAGAACAAAACACATATAAACAGATGGAGAAA  250

seq1  AATAAAAACAATTGAGAAATAAAATGTCACATAAGACATGAAATGAAGAC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAAAAACAATTGAGAAATAAAATGTCACATAAGACATGAAATGAAGAC  300

seq1  TCCATCAAGTACACATTAAATTAGTATTAATATCTGATTAGGAAACAGAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCATCAAGTACACATTAAATTAGTATTAATATCTGATTAGGAAACAGAG  350

seq1  CTGCCAGTCAACTAAGCTACCCCACCAGCTATAATGGATAGAGTTTATCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCCAGTCAACTAAGCTACCCCACCAGCTATAATGGATAGAGTTTATCT  400

seq1  TTGAACAGATGAAACAGTCTAGAGAGACCTTTAGGCCCAGGCCTCAGGGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAACAGATGAAACAGTCTAGAGAGACCTTTAGGCCCAGGCCTCAGGGA  450

seq1  AGTCACACTCCGGGCTTCTCCAATATTGACATCCATTAGAATCCCCTAGC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCACACTCCGGGCTTCTCCAATATTGACATCCATTAGAATCCCCTAGC  500

seq1  TTGTCACAGAGCAGCGTCTGGCTCCACAGCCCGGGAAGACCTAGAGACTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTCACAGAGCAGCGTCTGGCTCCACAGCCCGGGAAGACCTAGAGACTG  550

seq1  CATTTCTTATGAGCACCCACATGAGGCTTGGGAACCCTGGGAGAGATCGC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTCTTATGAGCACCCACATGAGGCTTGGGAACCCTGGGAGAGATCGC  600

seq1  CTCTGCTAAGCTGAGGATGTGAGGACCTCGGCTTAGGATGTCCCTGGTGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGCTAAGCTGAGGATGTGAGGACCTCGGCTTAGGATGTCCCTGGTGA  650

seq1  CAGCTGGTGCACATGAGAAAGAAGGCTAAATTCAGAAGCTATCACCTAAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCTGGTGCACATGAGAAAGAAGGCTAAATTCAGAAGCTATCACCTAAG  700

seq1  CTACGTGGCAGATACTGGCCTGAGCCCTTACACAGAGACCCCCACCTAGT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACGTGGCAGATACTGGCCTGAGCCCTTACACAGAGACCCCCACCTAGT  750

seq1  CCTCATCATAAACCAGTAAGAAATCATCTCTGCTTTATAGACCCTGCAGC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCATCATAAACCAGTAAGAAATCATCTCTGCTTTATAGACCCTGCAGC  800

seq1  AGAGGCAGGTCTTAATTTCCAACCATGCTGTAGCATGTGGACCAAGCCAC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGGCAGGTCTTAATTTCCAACCATGCTGTAGCATGTGGACCAAGCCAC  850

seq1  TTAACGTATTAGTCAATTTCCTATTGCATAAAGTCTTTAGACAGCATGTT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAACGTATTAGTCAATTTCCTATTGCATAAAGTCTTTAGACAGCATGTT  900

seq1  TCTCCTGGCATTGAGAAGTGACTGGCAGGTCTGAAATGAGGTGATCGTGG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCCTGGCATTGAGAAGTGACTGGCAGGTCTGAAATGAGGTGATCGTGG  950

seq1  GAAATGGGAAGGAAAGCTTTCCAGGTTCTGAAATCCTACCCCAGAGGACA  1000
      |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| 
seq2  GAAATGGGAAGGAAAGCTTTCCAGGTTCTGAATTCCTA-CCCAGAGGAC-  998

seq1  AGACTGCTATGAGCAGTAGGCCGCCCTAGGTGGGCTCGGCGAATTCCTAA  1050
      |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||  ||||||
seq2  AGACTGCTATGAGCAGTA-GCCGCCCTA-GTGGGCTC-GCGA--TCCTAA  1043

seq1  TTCTTGCTCCAATGGCAGGTAAGTAATCACCT-GTTAGTCTGATGGCATG  1099
       |||  |||  || ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||
seq2  -TCTGCCTC--ATTGCA-GTAAGTAATCACCTGGTTAGTCTGATTGCATG  1089

seq1  ACCTTCGAAGCACGCTTGGTTAAATGGAGTAATCCTCTCAGCACTTGGCA  1149
      ||  |||||||  |||||  ||||||||   |||||  ||||||||||||
seq2  AC--TCGAAGCCAGCTTG--TAAATGGA--TATCCTTCCAGCACTTGGCA  1133

seq1  CTCATGTCTGAAACAAAGC  1168
      |||| ||||||||| ||||
seq2  CTCA-GTCTGAAACCAAGC  1151