BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-255H10
Chromosome14 (Build37)
Map Location 31,457,429 - 31,575,329
singlet/doubletdoublet
Overlap geneEG665466, Rft1
Upstream geneCacna2d3, EG665431, Selk, Actr8, Il17rb, Chdh, Cacna1d, LOC665399, Dcp1a, Tkt, Prkcd
Downstream geneSfmbt1, Tmem110, Mustn1, Itih4, Itih3, Itih1, Nek4, Spcs1, Glt8d1, Gnl3, Pbrm1, EG432834, Nt5dc2, Stab1, Nisch, Tnnc1, Sema3g, Phf7, Bap1, Dnahc1, Capn7, Sh3bp5, Mettl6, Eaf1, Colq, Hacl1, Btd, Ankrd28
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-255H10.bB6Ng01-255H10.g
ACCGA061664GA061665
length1,1991,155
definitionB6Ng01-255H10.b B6Ng01-255H10.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(31,457,429 - 31,458,633)(31,574,174 - 31,575,329)
sequence
gaattctttcttcccttggggcagcctcctatagcatatgacttggaatg
cacacacacacacacacacacacacacagaggcatatatacatgctcata
caaattcacacttattcctatagtcctggcgtacacttgcatgcatatgt
tcatatatccataccatacaactcaagtgaacactcacagaaagataatc
atacattttccccatactcaaagctcactcatgcatcctcacacatgttc
acagacccaagagcacagaaatgcaatcacacatgttttcatatgtttcc
actccttcggatcattatgttcgtagataccaacagcccacattgtcaca
caaactcaggaacaaacacacaaactcaccctgaaaacatgctgttatac
ctgtatgcatatactcatgtgtatccttacgcacaaaaccccacatatgt
gctctcatgtataatcacacacattttcatgcctatgtgatcatacacca
gctagaccactatacatatagttatgtctacacatatgtgtacagtgctt
ttatactcttgcatatgcctacactttcaccttccacaccatgttcactt
acgtgcttgcatacacctacaatactactcatgcagtcacgcaggcacat
atacaccttcacgcacaaacacatacacccctacatatagttattatcac
ataagctcaggcatccagaaacacacaaactcactcagtcacatacacat
aatgcacaattgtacactcagacactctcacacatgcatgtcctctgcta
ctgccttggcctgagcccctcccatgggcagcttgcccctgctcgatttt
ccctcagggttctctttgtttttcttagctacgatgagcatatttggaga
gggattttattttcaccctatctggaaacatatttcccctttggctatga
gcttggcagatcagtgaggcgagacctagttgccattgttgtgggctagg
aggggaaccaaagtcaggacggctccctgggggtggttctggcagcctca
gctgcgctgctgccttctgatgacttctcagtcatcctccacagagcaac
ttatagctgaggaaatagccctccctctttgctgctcatgcacttgggtg
ttcccgggttttgttgtttgttcatgattgattgatttaatacgacatg
gaattcttttgtttggttggttttttttgttttgttttgttttcattttt
tgagacaggtttctctgtaacgccctggctgtcctggaactcactttgta
gaccaggctggcctcgaactcagaaatccgcctgcctctgcctcccaagt
gctgggattaaaggcacatacacggtaaaattgtttagttaaacaaaggg
caaaagctttttcaaagaagattatattgattgattgattgattgattga
ttgattgattttatatgagtacattgtaggtgtctttggacccaccagaa
aagggcatcagatcccatcataaatggttttgagtcaccatgtggttgct
cggaaccgaactcaggacctttggaagagcagtcagtaatctctgagcca
tctctccatccccccagaattctttcttatttactcattaattatttgct
tagtacagattaactgacatatcatactctaggtaaaggaatattctggg
ataaaaaataagaaaaaacctacctcattattctacaatgcagaataagt
aaatggtagataacccctataatacatttgatgaaaaaatgttactggaa
aagctataagaggcaggaagtactactttcagttgagtgatcaaggtctt
aatgtagaagacatgagccaacaactgaggggaagtaaggaaacaaacca
tatagacagctgcagaaacaggaagtacaagaccctgactcaggaggctg
tgtaatgttagaggccactgtatttggaaaagaatgataaagtcactagg
aaatgaactcaagaagttttcagggaaatcacattacataagaacacatg
tataatgctggtcctagtggcacacgcacttgggaggcatttgggaggca
gaggcagaaggatctctgtgagttcaattgttagcctggtctacgtagtg
agatgcaaggacaaccaacgctacgtttgtgagaccctgcctcaaaagaa
aaagaaaaaagtcaatgctgtatcctgaaaagaacacgtgtaggctgctt
ttgagattttgctttggaagaaccctggttgacttattggagcagaagat
gacatataacctgaactttaaggtcactctgtggctcatgttgacggact
gaatc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_31457429_31458633
seq2: B6Ng01-255H10.b_45_1243

seq1  GAATTCTTTCTTCCCTTGGGGCAGCCTCCTATAGCATATGACTTGGAATG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTTCTTCCCTTGGGGCAGCCTCCTATAGCATATGACTTGGAATG  50

seq1  CACACACACACACACACACACACACACAGAGGCATATATACATGCTCATA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACACACACACACACACACACACACAGAGGCATATATACATGCTCATA  100

seq1  CAAATTCACACTTATTCCTATAGTCCTGGCGTACACTTGCATGCATATGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATTCACACTTATTCCTATAGTCCTGGCGTACACTTGCATGCATATGT  150

seq1  TCATATATCCATACCATACAACTCAAGTGAACACTCACAGAAAGATAATC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATATATCCATACCATACAACTCAAGTGAACACTCACAGAAAGATAATC  200

seq1  ATACATTTTCCCCATACTCAAAGCTCACTCATGCATCCTCACACATGTTC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACATTTTCCCCATACTCAAAGCTCACTCATGCATCCTCACACATGTTC  250

seq1  ACAGACCCAAGAGCACAGAAATGCAATCACACATGTTTTCATATGTTTCC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGACCCAAGAGCACAGAAATGCAATCACACATGTTTTCATATGTTTCC  300

seq1  ACTCCTTCGGATCATTATGTTCGTAGATACCAACAGCCCACATTGTCACA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCCTTCGGATCATTATGTTCGTAGATACCAACAGCCCACATTGTCACA  350

seq1  CAAACTCAGGAACAAACACACAAACTCACCCTGAAAACATGCTGTTATAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAACTCAGGAACAAACACACAAACTCACCCTGAAAACATGCTGTTATAC  400

seq1  CTGTATGCATATACTCATGTGTATCCTTACGCACAAAACCCCACATATGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTATGCATATACTCATGTGTATCCTTACGCACAAAACCCCACATATGT  450

seq1  GCTCTCATGTATAATCACACACATTTTCATGCCTATGTGATCATACACCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCTCATGTATAATCACACACATTTTCATGCCTATGTGATCATACACCA  500

seq1  GCTAGACCACTATACATATAGTTATGTCTACACATATGTGTACAGTGCTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTAGACCACTATACATATAGTTATGTCTACACATATGTGTACAGTGCTT  550

seq1  TTATACTCTTGCATATGCCTACACTTTCACCTTCCACACCATGTTCACTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATACTCTTGCATATGCCTACACTTTCACCTTCCACACCATGTTCACTT  600

seq1  ACGTGCTTGCATACACCTACAATACTACTCATGCAGTCACGCAGGCACAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGTGCTTGCATACACCTACAATACTACTCATGCAGTCACGCAGGCACAT  650

seq1  ATACACCTTCACGCACAAACACATACACCCCTACATATAGTTATTATCAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACACCTTCACGCACAAACACATACACCCCTACATATAGTTATTATCAC  700

seq1  ATAAGCTCAGGCATCCAGAAACACACAAACTCACTCAGTCACATACACAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAGCTCAGGCATCCAGAAACACACAAACTCACTCAGTCACATACACAT  750

seq1  AATGCACAATTGTACACTCAGACACTCTCACACATGCATGTCCTCTGCTA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGCACAATTGTACACTCAGACACTCTCACACATGCATGTCCTCTGCTA  800

seq1  CTGCCTTGGCCTGAGCCCCTCCCATGGGCAGCTTGCCCCTGCTCGATTTT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCCTTGGCCTGAGCCCCTCCCATGGGCAGCTTGCCCCTGCTCGATTTT  850

seq1  CCCTCAGGGTTCTCTTTGTTTTTCTTAGCTACGATGAGCATATTTGGAGA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTCAGGGTTCTCTTTGTTTTTCTTAGCTACGATGAGCATATTTGGAGA  900

seq1  GGGA-TCTATTTTCACCCTATCTGGAAACATATTTCCCC-TTGGCTATGA  948
      |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  GGGATTTTATTTTCACCCTATCTGGAAACATATTTCCCCTTTGGCTATGA  950

seq1  GCTTGGCAGATCAGTGAGGCGAGACCTAGTTGCCA-TGTTGTGGGCTAGG  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  GCTTGGCAGATCAGTGAGGCGAGACCTAGTTGCCATTGTTGTGGGCTAGG  1000

seq1  AGGGGAACCAAAGTCAGGACGGCTCCCT-GGGGTGG-TCTGGCAGCCTCA  1045
      |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||
seq2  AGGGGAACCAAAGTCAGGACGGCTCCCTGGGGGTGGTTCTGGCAGCCTCA  1050

seq1  GCTGGCGCTGCTGCC-TCTGATGACTTCTCAGGTCATCCT-CACAGAAGC  1093
      ||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||
seq2  GCT-GCGCTGCTGCCTTCTGATGACTTCTCA-GTCATCCTCCACAG-AGC  1097

seq1  AAC-TATAGCTGAAGGAGATAGCCCTCCCTCTTTGCTGCTTCCATGCAAC  1142
      ||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||  
seq2  AACTTATAGCTG-AGGAAATAGCCCTCCCTCTTTGCTGCT--CATGCA--  1142

seq1  CTGGGTTGTTCCCGGTTTTGTTTGTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTGTTT  1192
      || || ||||||||| |||  |||||| |   || ||| |||       |
seq2  CTTGGGTGTTCCCGGGTTTTGTTGTTTGTTCATGATTGATTG------AT  1186

seq1  TTAATACGACATG  1205
      |||||||||||||
seq2  TTAATACGACATG  1199

seq1: chr14_31574174_31575329
seq2: B6Ng01-255H10.g_67_1221 (reverse)

seq1  GATTCAGTGCTGTTCAACAT-AGCCACAGAGTGACCCTTTAAAAAGTCAG  49
      |||||||| |   ||||||| |||||||||||||||   | |||  ||||
seq2  GATTCAGTCC--GTCAACATGAGCCACAGAGTGACC---TTAAAGTTCAG  45

seq1  GTTATGT-CCATCTTCTGCTC--AT-AGTTCACCAGTGTCTTCCCAAAGC  95
      ||||| |  ||||||||||||  || |||  ||||| ||  | |||||| 
seq2  GTTATATGTCATCTTCTGCTCCAATAAGTCAACCAGGGTTCTTCCAAAG-  94

seq1  CAAAATCTTCACAGCAGCCTACACGTGTTCTTTTCGGGATACAGCATTGA  145
      ||||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  CAAAATCTCAAAAGCAGCCTACACGTGTTCTTTTCAGGATACAGCATTGA  144

seq1  CTTTTTTCTTTTTTCTTTTTGAGGCAGGGTCTCACAAACGTAGCGTTGGT  195
      |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTTTCTTTTT--CTTTTGAGGCAGGGTCTCACAAACGTAGCGTTGGT  192

seq1  TGTCCTTGCATCTCACTACGTAGACCAGGCTAAC-ATTGAACTCACAGAG  244
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  TGTCCTTGCATCTCACTACGTAGACCAGGCTAACAATTGAACTCACAGAG  242

seq1  ATCCTTCTGCCTCTGCCTCCCAAATGCCTCCCAAGTGCGTGTGCCACTAG  294
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCTTCTGCCTCTGCCTCCCAAATGCCTCCCAAGTGCGTGTGCCACTAG  292

seq1  GACCAGCATTATACATGTGTTCTTATGTAATGTGA-TTCCCTGAAAACTT  343
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  GACCAGCATTATACATGTGTTCTTATGTAATGTGATTTCCCTGAAAACTT  342

seq1  CTTGAGTTCATTTCCTAGTGACTTTATCATTCTTTTCCAAATACAGTGGC  393
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGAGTTCATTTCCTAGTGACTTTATCATTCTTTTCCAAATACAGTGGC  392

seq1  CTCTAACATTACACAGCCTCCTGAGTCAGGGTCTTGTACTTCCTGTTTCT  443
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTAACATTACACAGCCTCCTGAGTCAGGGTCTTGTACTTCCTGTTTCT  442

seq1  GCAGCTGTCTATATGGTTTGTTTCCTTACTTCCCCTCAGTTGTTGGCTCA  493
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGCTGTCTATATGGTTTGTTTCCTTACTTCCCCTCAGTTGTTGGCTCA  492

seq1  TGTCTTCTACATTAAGACCTTGATCACTCAACTGAAAGTAGTACTTCCTG  543
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCTTCTACATTAAGACCTTGATCACTCAACTGAAAGTAGTACTTCCTG  542

seq1  CCTCTTATAGCTTTTCCAGTAACATTTTTTCATCAAATGTATTATAGGGG  593
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCTTATAGCTTTTCCAGTAACATTTTTTCATCAAATGTATTATAGGGG  592

seq1  TTATCTACCATTTACTTATTCTGCATTGTAGAATAATGAGGTAGGTTTTT  643
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATCTACCATTTACTTATTCTGCATTGTAGAATAATGAGGTAGGTTTTT  642

seq1  TCTTATTTTTTATCCCAGAATATTCCTTTACCTAGAGTATGATATGTCAG  693
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTATTTTTTATCCCAGAATATTCCTTTACCTAGAGTATGATATGTCAG  692

seq1  TTAATCTGTACTAAGCAAATAATTAATGAGTAAATAAGAAAGAATTCTGG  743
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATCTGTACTAAGCAAATAATTAATGAGTAAATAAGAAAGAATTCTGG  742

seq1  GGGGATGGAGAGATGGCTCAGAGATTACTGACTGCTCTTCCAAAGGTCCT  793
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGATGGAGAGATGGCTCAGAGATTACTGACTGCTCTTCCAAAGGTCCT  792

seq1  GAGTTCGGTTCCGAGCAACCACATGGTGACTCAAAACCATTTATGATGGG  843
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTTCGGTTCCGAGCAACCACATGGTGACTCAAAACCATTTATGATGGG  842

seq1  ATCTGATGCCCTTTTCTGGTGGGTCCAAAGACACCTACAATGTACTCATA  893
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTGATGCCCTTTTCTGGTGGGTCCAAAGACACCTACAATGTACTCATA  892

seq1  TAAAATCAATCAATCAATCAATCAATCAATCAATCAATATAATCTTCTTT  943
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAATCAATCAATCAATCAATCAATCAATCAATCAATATAATCTTCTTT  942

seq1  GAAAAAGCTTTTGCCCTTTGTTTAACTAAACAATTTTACCGTGTATGTGC  993
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAAAGCTTTTGCCCTTTGTTTAACTAAACAATTTTACCGTGTATGTGC  992

seq1  CTTTAATCCCAGCACTTGGGAGGCAGAGGCAGGCGGATTTCTGAGTTCGA  1043
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTAATCCCAGCACTTGGGAGGCAGAGGCAGGCGGATTTCTGAGTTCGA  1042

seq1  GGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGGGCGTTACAGA  1093
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGGGCGTTACAGA  1092

seq1  GAAACCTGTCTCAAAAAATGAAAACAAAACAAAACAAAAAAAACCAACCA  1143
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAACCTGTCTCAAAAAATGAAAACAAAACAAAACAAAAAAAACCAACCA  1142

seq1  AACAAAAGAATTC  1156
      |||||||||||||
seq2  AACAAAAGAATTC  1155