BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-257C01
Chromosome14 (Build37)
Map Location 22,184,975 - 22,311,874
singlet/doubletdoublet
Overlap geneAdk
Upstream geneAA536717, Dnajc9, Mrps16, Ttc18, Anxa7, Zmynd17, Ppp3cb, Usp54, Myoz1, Synpo2l, Sec24c, Fut11, Chchd1, 2310021P13Rik, Ndst2, Camk2g, Plau, EG620119, Vcl, Ap3m1
Downstream geneMyst4, EG435391, Dusp13, Samd8, Vdac2, Comtd1, Zfp503, 1700112E06Rik, EG665075
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-257C01.bB6Ng01-257C01.g
ACCGA062905GA062906
length1,1281,088
definitionB6Ng01-257C01.b B6Ng01-257C01.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(22,310,741 - 22,311,874)(22,184,975 - 22,186,066)
sequence
gaattcctggccagccagagctactcagcaagaccttgtctcaagtaaaa
aaaaaaaaaaaaaaaattacacacaggcacacacacacacataaccaaaa
gggcactaatatctaaacattatatacagtgtatatatgattattgctat
ttttcttctatggtatgagtgagtatatacagcagccatctcagcttttc
cctttgaaagatacaagggatacgtcttgagtagctcctgtccactacag
ttattccagctgccccttttggagtttgctgcctattagtctgcttcacg
tgcctggccttggtggttgataggacttggtgaacgagtaactgggacta
gtaactgggactagtaactgggactagtaactgggactgagctcttgttc
cttcccattcttgtgctatatccagtgattgccctagtaaagagtccata
ataagccctagagcttgcttcctgaactaacaacatcaaacctagattac
ctggagtccacagtatccatccttgtgacaactagactactgttccccag
ttcttctccatgttccctcatggatcaatgctttcctttccattagggca
ggccatgggttcaatcctcactggggatgaaaatgagaagcaatgcatct
tatttttggagtcttgtttgtatgtttgttttattacatataagtacact
gtagctgtcttcagacacaccagaagagggcattagatcccattacagat
ggttgtgagccaccatgtggttgcagggaattgaactcaggacctctgga
agagcaatcagtgctcttaatcactgggccatctctccagccctggtcaa
gagtttaaaaacaaaggcacggtaacacatatctataatcccagcactta
aaggctgaaacaggagggttgtaaattggagccaggctggttacatagta
agaaaatgtggaatctggggagatgcctcagtgataggagtgcgttctgt
tacaagaagagattcaaccttttcacccttggtgaaaattaaggcagcat
gacatgcattagtaccgagccacagcatgcctttgcggggacacagtgat
cctgggactgctggccaccagctagctc
gaattctccttaatagggacggggtttcgttttctctctctcttgcttct
tgcgctcttgcttcttgcactctggctcctgaagatgtaagcaataaagc
tttgccgcagaagattctggtttgttgcgtctttcctggccggtcgtgag
aacgcgtctaataacaaagcacggtgacacagcctaaaatcccagcactt
gagagatggaggcaggaacagagatagttcaaagccagctcagacaacat
accaagattcagatcaacttaggttgtataatgtgagctcttgtctaaaa
gaaaaaatacatatataagtatattcttgccattattctgtaatttacca
agttacagttaatttattagtatatgatcaaaaaagctggcattaaaaat
taaaacaacatagccatgcatggtgacacacttctatgattccccacact
ccaacctgtgttatctaaaaacctttttcatacaaatagtgttccagatg
tgggatttaacttggtaatgtggcacttctagcaccttgagggcctgagt
tcggttcctagtactgctccttgcctcagtttaactactgcatggacttg
cagtctttctgtcatagagcaattttaattcctcagattccttttctttt
aatgaccctgaagccccctcacccccaccctgtgtcctacaattcactgt
tgcccaggctgggcatgaaaagtagttcttaggggctggggagatggctt
acttgttaaaagtacttgctgctcttgtaaaggattcagcttggttccca
gcacctacacagtagctcacaaccattggtaactccagttccaggggatc
tgatgccctctcttgataagtacagctaccaactatgcacatggtacaca
aatatatatgcaggccaaacactcatacataaaacaaataaatctaaaat
aatagtaagtgtagtagtagtttcaccagagctattcagttgcattattc
gtctagatttcatttacttaaattatgattgctagaaaacaaacacatga
tatcttttttcactttcacttgacttgatattctcagc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_22310741_22311874
seq2: B6Ng01-257C01.b_46_1173 (reverse)

seq1  GAGCTAGGCTGGTGGCCAGCAAGTCCCAGGTATCCCCCTGTGTCCCCCCA  50
      |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||  | |||||||||| ||
seq2  GAGCTA-GCTGGTGGCCAGC-AGTCCCAGG-AT--CACTGTGTCCCCGCA  45

seq1  A--GCAGTGCTGTGGCTCGGGTGCCTAATGCCATGTCATGCTG-CTTTAT  97
      |  ||| |||||||||||||    |||||| |||||||||||| ||| ||
seq2  AAGGCA-TGCTGTGGCTCGG--TACTAATG-CATGTCATGCTGCCTTAAT  91

seq1  TTTCA-CAGGGGTGAAAAGGTGGATTCTCTTTCTTGT-ACAGGACGCACT  145
      ||||| || |||||||||||| || |||| ||||||| |||| |||||||
seq2  TTTCACCAAGGGTGAAAAGGTTGAATCTC-TTCTTGTAACAGAACGCACT  140

seq1  CTTATCCACTGAGCCATCTCCCCAG-TTCCACATTTTCTTACTATGTAAC  194
      | ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTAT-CACTGAGGCATCTCCCCAGATTCCACATTTTCTTACTATGTAAC  189

seq1  CAGCCTGGCCTCCAATTTACAACCCTCCTGTTTCAGCCTTTAAGTGCTGG  244
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCCTGG-CTCCAATTTACAACCCTCCTGTTTCAGCCTTTAAGTGCTGG  238

seq1  GATTATAGATATGTGTTACCGTGCCCTTGTTTTTAAACTCTTGACCAGGG  294
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTATAGATATGTGTTACCGTGCCTTTGTTTTTAAACTCTTGACCAGGG  288

seq1  CTGGAGAGATGGCCCAGTGATTAAGAGCACTGATTGCTCTTCCAGAGGTC  344
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGAGAGATGGCCCAGTGATTAAGAGCACTGATTGCTCTTCCAGAGGTC  338

seq1  CTGAGTTCAATTCCCTGCAACCACATGGTGGCTCACAACCATCTGTAATG  394
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAGTTCAATTCCCTGCAACCACATGGTGGCTCACAACCATCTGTAATG  388

seq1  GGATCTAATGCCCTCTTCTGGTGTGTCTGAAGACAGCTACAGTGTACTTA  444
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATCTAATGCCCTCTTCTGGTGTGTCTGAAGACAGCTACAGTGTACTTA  438

seq1  TATGTAATAAAACAAACATACAAACAAGACTCCAAAAATAAGATGCATTG  494
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTAATAAAACAAACATACAAACAAGACTCCAAAAATAAGATGCATTG  488

seq1  CTTCTCATTTTCATCCCCAGTGAGGATTGAACCCATGGCCTGCCCTAATG  544
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTCATTTTCATCCCCAGTGAGGATTGAACCCATGGCCTGCCCTAATG  538

seq1  GAAAGGAAAGCATTGATCCATGAGGGAACATGGAGAAGAACTGGGGAACA  594
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAGGAAAGCATTGATCCATGAGGGAACATGGAGAAGAACTGGGGAACA  588

seq1  GTAGTCTAGTTGTCACAAGGATGGATACTGTGGACTCCAGGTAATCTAGG  644
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGTCTAGTTGTCACAAGGATGGATACTGTGGACTCCAGGTAATCTAGG  638

seq1  TTTGATGTTGTTAGTTCAGGAAGCAAGCTCTAGGGCTTATTATGGACTCT  694
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGATGTTGTTAGTTCAGGAAGCAAGCTCTAGGGCTTATTATGGACTCT  688

seq1  TTACTAGGGCAATCACTGGATATAGCACAAGAATGGGAAGGAACAAGAGC  744
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACTAGGGCAATCACTGGATATAGCACAAGAATGGGAAGGAACAAGAGC  738

seq1  TCAGTCCCAGTTACTAGTCCCAGTTACTAGTCCCAGTTACTAGTCCCAGT  794
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGTCCCAGTTACTAGTCCCAGTTACTAGTCCCAGTTACTAGTCCCAGT  788

seq1  TACTCGTTCACCAAGTCCTATCAACCACCAAGGCCAGGCACGTGAAGCAG  844
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTCGTTCACCAAGTCCTATCAACCACCAAGGCCAGGCACGTGAAGCAG  838

seq1  ACTAATAGGCAGCAAACTCCAAAAGGGGCAGCTGGAATAACTGTAGTGGA  894
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTAATAGGCAGCAAACTCCAAAAGGGGCAGCTGGAATAACTGTAGTGGA  888

seq1  CAGGAGCTACTCAAGACGTATCCCTTGTATCTTTCAAAGGGAAAAGCTGA  944
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGAGCTACTCAAGACGTATCCCTTGTATCTTTCAAAGGGAAAAGCTGA  938

seq1  GATGGCTGCTGTATATACTCACTCATACCATAGAAGAAAAATAGCAATAA  994
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGGCTGCTGTATATACTCACTCATACCATAGAAGAAAAATAGCAATAA  988

seq1  TCATATATACACTGTATATAATGTTTAGATATTAGTGCCCTTTTGGTTAT  1044
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATATATACACTGTATATAATGTTTAGATATTAGTGCCCTTTTGGTTAT  1038

seq1  GTGTGTGTGTGTGCCTGTGTGTAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTACTTGA  1094
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTGTGTGTGCCTGTGTGTAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTACTTGA  1088

seq1  GACAAGGTCTTGCTGAGTAGCTCTGGCTGGCCAGGAATTC  1134
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAAGGTCTTGCTGAGTAGCTCTGGCTGGCCAGGAATTC  1128

seq1: chr14_22184975_22186066
seq2: B6Ng01-257C01.g_65_1152

seq1  GAATTCTCCTTAATAGGGACGGGGTTTCGTTTTCTCTCTCTCTTGCTTCT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCCTTAATAGGGACGGGGTTTCGTTTTCTCTCTCTCTTGCTTCT  50

seq1  TGCGCTCTTGCTTCTTGCACTCTGGCTCCTGAAGATGTAAGCAATAAAGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCGCTCTTGCTTCTTGCACTCTGGCTCCTGAAGATGTAAGCAATAAAGC  100

seq1  TTTGCCGCAGAAGATTCTGGTTTGTTGCGTCTTTCCTGGCCGGTCGTGAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGCCGCAGAAGATTCTGGTTTGTTGCGTCTTTCCTGGCCGGTCGTGAG  150

seq1  AACGCGTCTAATAACAAAGCACGGTGACACAGCCTAAAATCCCAGCACTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACGCGTCTAATAACAAAGCACGGTGACACAGCCTAAAATCCCAGCACTT  200

seq1  GAGAGATGGAGGCAGGAACAGAGATAGTTCAAAGCCAGCTCAGACAACAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAGATGGAGGCAGGAACAGAGATAGTTCAAAGCCAGCTCAGACAACAT  250

seq1  ACCAAGATTCAGATCAACTTAGGTTGTATAATGTGAGCTCTTGTCTAAAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAAGATTCAGATCAACTTAGGTTGTATAATGTGAGCTCTTGTCTAAAA  300

seq1  GAAAAAATACATATATAAGTATATTCTTGCCATTATTCTGTAATTTACCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAAAATACATATATAAGTATATTCTTGCCATTATTCTGTAATTTACCA  350

seq1  AGTTACAGTTAATTTATTAGTATATGATCAAAAAAGCTGGCATTAAAAAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTACAGTTAATTTATTAGTATATGATCAAAAAAGCTGGCATTAAAAAT  400

seq1  TAAAACAACATAGCCATGCATGGTGACACACTTCTATGATTCCCCACACT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAACAACATAGCCATGCATGGTGACACACTTCTATGATTCCCCACACT  450

seq1  CCAACCTGTGTTATCTAAAAACCTTTTTCATACAAATAGTGTTCCAGATG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAACCTGTGTTATCTAAAAACCTTTTTCATACAAATAGTGTTCCAGATG  500

seq1  TGGGATTTAACTTGGTAATGTGGCACTTCTAGCACCTTGAGGGCCTGAGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGATTTAACTTGGTAATGTGGCACTTCTAGCACCTTGAGGGCCTGAGT  550

seq1  TCGGTTCCTAGTACTGCTCCTTGCCTCAGTTTAACTACTGCATGGACTTG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGGTTCCTAGTACTGCTCCTTGCCTCAGTTTAACTACTGCATGGACTTG  600

seq1  CAGTCTTTCTGTCATAGAGCAATTTTAATTCCTCAGATTCCTTTTCTTTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTCTTTCTGTCATAGAGCAATTTTAATTCCTCAGATTCCTTTTCTTTT  650

seq1  AATGACCCTGAAGCCCCCTCACCCCCACCCTGTGTCCTACAATTCACTGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGACCCTGAAGCCCCCTCACCCCCACCCTGTGTCCTACAATTCACTGT  700

seq1  TGCCCAGGCTGGGCATGAAAAGTAGTTCTTAGGGGCTGGGGAGATGGCTT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCCAGGCTGGGCATGAAAAGTAGTTCTTAGGGGCTGGGGAGATGGCTT  750

seq1  ACTTGTTAAAAGTACTTGCTGCTCTTGTAAAGGATTCAGGCTTGGTTCCC  800
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  ACTTGTTAAAAGTACTTGCTGCTCTTGTAAAGGATTCA-GCTTGGTTCCC  799

seq1  AGCACCTACACAGTAGCTCACAACCATTGGTAACTCCAGTTCCAGGGGAT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCACCTACACAGTAGCTCACAACCATTGGTAACTCCAGTTCCAGGGGAT  849

seq1  CTGATGCCCTCTCTTGATAAGTACAGCTACCAACTATGCACATGGTACAC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGATGCCCTCTCTTGATAAGTACAGCTACCAACTATGCACATGGTACAC  899

seq1  AAATATATATGCAGGCCAAACACTCATACATAAAACAAATAAATCTAAAA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATATATATGCAGGCCAAACACTCATACATAAAACAAATAAATCTAAAA  949

seq1  TAATAGTAAGTGTAGTAGTAGTTTTCACCAGAGCTATTCAGTTGCATTAT  1000
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATAGTAAGTGTAGTAGTAG-TTTCACCAGAGCTATTCAGTTGCATTAT  998

seq1  TCGTCTAAGAATTCATTTACTTAAATTTATGATGGCTTAGAAAAC-AACA  1049
      |||||| ||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||
seq2  TCGTCT-AGATTTCATTTACTTAAA-TTATGATTGC-TAGAAAACAAACA  1045

seq1  CATTGATATCTTTTCAACCTTTCACTTGACTTGATA-TCTCAGC  1092
      || |||||||||||    |||||||||||||||||| |||||||
seq2  CA-TGATATCTTTTTTCACTTTCACTTGACTTGATATTCTCAGC  1088