BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-260O09
Chromosome14 (Build37)
Map Location 32,670,564 - 32,822,498
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneTmem110, Mustn1, Itih4, Itih3, Itih1, Nek4, Spcs1, Glt8d1, Gnl3, Pbrm1, EG432834, Nt5dc2, Stab1, Nisch, Tnnc1, Sema3g, Phf7, Bap1, Dnahc1, Capn7, Sh3bp5, Mettl6, Eaf1, Colq, Hacl1, Btd, Ankrd28
Downstream geneGalntl2, Dph3, Oxnad1, Msmb, Ncoa4, Timm23, Parg, LOC665601, Ogdhl, 1700024G13Rik, Chat, Slc18a3, LOC100040834, EG665618, Ercc6, 9430077A04Rik, Prrxl1, 3425401B19Rik, 1810011H11Rik, 4922501K12Rik, E130203B14Rik, EG665658, Lrrc18
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-260O09.bB6Ng01-260O09.g
ACCGA065704GA065705
length1,121313
definitionB6Ng01-260O09.b B6Ng01-260O09.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(32,821,382 - 32,822,498)(32,670,564 - 32,670,876)
sequence
gaattcacagaggtggaacttgtgaaacaactagtactttgttttgactt
cttaaaatcattccagctgaaactatataaatattatttactgacttcct
caatgtttgtttttagtttgaacgtataaataccatgaaagccaggcccc
taggtgacttgtccatggtatttcatgcactcaaccctacttacctcaca
gaaatgtcatatatgtgtgtgtacacatgtacacacatataattgacaca
tacatatacatattcagtagcttacccctctcttacattgctcagagctc
tcttgcccagggcagttatgcctcccacagtggacaggtctttctgtatg
tatatataggatataggatatgtatatgtatatacatacagagagagaga
gagagaataaataaaatatgtatagaatggcctgaaaaatattcatgggc
atatcatccaggtgcctgaagataggaaaacatcattttgcctatagaag
actgagggaagacacaggtcaggacactgagccgaggagattatcaacag
ctcaagggcagcctggtttacatagagtgttctagaccagcctgaactgc
aatatgaaacctgtctcacgtggattggaaagagggctcagcagttaaga
gcactgccagaggatccaggctcaattcccagcacccacgtggtggctca
taacctccgtagctccagttccaggagatcctatgctttcttctggtctc
tgtgagcactgtatccacatagtatactcacatgcaagccaaaacaccca
cacccacctacacacacacacacacacacacacacacacacacacagaga
gagagagagagagagagagagagaaggaaacacgggggaagagattccac
agtgtaagacaactgtcaagtttgcaaaccatgtttacttgttttgtgtt
tacaacctgctgccttccacctgtttaacagtgttagtttggccaattcc
agttactctaagtgatctcacgcaacatcacaatgaacagcatattattt
tcatttggcacctgtttggattcactaggaagtttattggttccctgaac
ctgtgcttaaatgtgtactta
agatgagactgaggaatgtgtttttgtgagcatctggaatttgagtgccg
gtgggtgtgtcttgggaatacagaacactctagaccataatatgctgcca
ccttgtgaaaagagatgaagagccattgaaaagcgcaggtttgccctggc
tagtgaccccttcccagacttctggcttcagggacacctgagccccagga
ccctcttgtacttcactccacagctgagttgtctttggtgaccttggacc
atactgtgggcgcggggtgggggacagggagagcagaggtggggagttag
aggtaggtaggtg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_32821382_32822498
seq2: B6Ng01-260O09.b_46_1166 (reverse)

seq1  TAAGTACACAAATAAAGAAAGTTTCA-GGAACCAAT-AACTTACTA-AGA  47
      ||||||||||  |||  | || |||| ||||||||| ||||| |||  ||
seq2  TAAGTACACATTTAAGCACAGGTTCAGGGAACCAATAAACTTCCTAGTGA  50

seq1  ATCC-AACAGGTGCCAAAAGAAAATAAAAGGC-GTTCATTGTGATGGTGC  95
      |||| ||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||| |||
seq2  ATCCAAACAGGTGCCAAATGAAAATAATATGCTGTTCATTGTGATGTTGC  100

seq1  G-GAGAACACTTAGAGTAACTGGAATTGGCCAAACTAACACTGTTAAACA  144
      | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAGATCACTTAGAGTAACTGGAATTGGCCAAACTAACACTGTTAAACA  150

seq1  GGTGGAATGCAGCAGGCTGGTAAACACAAAACAAGTTAAACATGGTTTGC  194
      ||||||| |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  GGTGGAAGGCAGCAGG-TTGTAAACACAAAACAAG-TAAACATGGTTTGC  198

seq1  AAACTTGACAGTTGTCTTACAATGTGGAATCTCTTCCCCCGTGTTTCCTT  244
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACTTGACAGTTGTCTTACACTGTGGAATCTCTTCCCCCGTGTTTCCTT  248

seq1  CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT  294
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT  298

seq1  GTGTGTGTGTGTGTAGGTGGGTGTGGGTGTTTTGGCTTGCATGTGAGTAT  344
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTGTGTGTGTAGGTGGGTGTGGGTGTTTTGGCTTGCATGTGAGTAT  348

seq1  ACTATGTGGATACAGTGCTCACAGAGACCAGAAGAAAGCATAGGATCTCC  394
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTATGTGGATACAGTGCTCACAGAGACCAGAAGAAAGCATAGGATCTCC  398

seq1  TGGAACTGGAGCTACGGAGGTTATGAGCCACCACGTGGGTGCTGGGAATT  444
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAACTGGAGCTACGGAGGTTATGAGCCACCACGTGGGTGCTGGGAATT  448

seq1  GAGCCTGGATCCTCTGGCAGTGCTCTTAACTGCTGAGCCCTCTTTCCAAT  494
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCCTGGATCCTCTGGCAGTGCTCTTAACTGCTGAGCCCTCTTTCCAAT  498

seq1  CCACGTGAGACAGGTTTCATATTGCAGTTCAGGCTGGTCTAGAACACTCT  544
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACGTGAGACAGGTTTCATATTGCAGTTCAGGCTGGTCTAGAACACTCT  548

seq1  ATGTAAACCAGGCTGCCCTTGAGCTGTTGATAATCTCCTCGGCTCAGTGT  594
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTAAACCAGGCTGCCCTTGAGCTGTTGATAATCTCCTCGGCTCAGTGT  598

seq1  CCTGACCTGTGTCTTCCCTCAGTCTTCTATAGGCAAAATGATGTTTTCCT  644
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGACCTGTGTCTTCCCTCAGTCTTCTATAGGCAAAATGATGTTTTCCT  648

seq1  ATCTTCAGGCACCTGGATGATATGCCCATGAATATTTTTCAGGCCATTCT  694
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTTCAGGCACCTGGATGATATGCCCATGAATATTTTTCAGGCCATTCT  698

seq1  ATACATATTTTATTTATTCTCTCTCTCTCTCTCTGTATGTATATACATAT  744
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACATATTTTATTTATTCTCTCTCTCTCTCTCTGTATGTATATACATAT  748

seq1  ACATATCCTATATCCTATATATACATACAGAAAGACCTGTCCACTGTGGG  794
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATATCCTATATCCTATATATACATACAGAAAGACCTGTCCACTGTGGG  798

seq1  AGGCATAACTGCCCTGGGCAAGAGAGCTCTGAGCAATGTAAGAGAGGGGT  844
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCATAACTGCCCTGGGCAAGAGAGCTCTGAGCAATGTAAGAGAGGGGT  848

seq1  AAGCTACTGAATATGTATATGTATGTGTCAATTATATGTGTGTACATGTG  894
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCTACTGAATATGTATATGTATGTGTCAATTATATGTGTGTACATGTG  898

seq1  TACACACACATATATGACATTTCTGTGAGGTAAGTAGGGTTGAGTGCATG  944
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACACACACATATATGACATTTCTGTGAGGTAAGTAGGGTTGAGTGCATG  948

seq1  AAATACCATGGACAAGTCACCTAGGGGCCTGGCTTTCATGGTATTTATAC  994
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATACCATGGACAAGTCACCTAGGGGCCTGGCTTTCATGGTATTTATAC  998

seq1  GTTCAAACTAAAAACAAACATTGAGGAAGTCAGTAAATAATATTTATATA  1044
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCAAACTAAAAACAAACATTGAGGAAGTCAGTAAATAATATTTATATA  1048

seq1  GTTTCAGCTGGAATGATTTTAAGAAGTCAAAACAAAGTACTAGTTGTTTC  1094
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTCAGCTGGAATGATTTTAAGAAGTCAAAACAAAGTACTAGTTGTTTC  1098

seq1  ACAAGTTCCACCTCTGTGAATTC  1117
      |||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAGTTCCACCTCTGTGAATTC  1121

seq1: chr14_32670564_32670876
seq2: B6Ng01-260O09.g_74_386

seq1  AGATGAGACTGAGGAATGTGTTTTTGTGAGCATCTGGAATTTGAGTGCCG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATGAGACTGAGGAATGTGTTTTTGTGAGCATCTGGAATTTGAGTGCCG  50

seq1  GTGGGTGTGTCTTGGGAATACAGAACACTCTAGACCATAATATGCTGCCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGGTGTGTCTTGGGAATACAGAACACTCTAGACCATAATATGCTGCCA  100

seq1  CCTTGTGAAAAGAGATGAAGAGCCATTGAAAAGCGCAGGTTTGCCCTGGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTGTGAAAAGAGATGAAGAGCCATTGAAAAGCGCAGGTTTGCCCTGGC  150

seq1  TAGTGACCCCTTCCCAGACTTCTGGCTTCAGGGACACCTGAGCCCCAGGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTGACCCCTTCCCAGACTTCTGGCTTCAGGGACACCTGAGCCCCAGGA  200

seq1  CCCTCTTGTACTTCACTCCACAGCTGAGTTGTCTTTGGTGACCTTGGACC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTCTTGTACTTCACTCCACAGCTGAGTTGTCTTTGGTGACCTTGGACC  250

seq1  ATACTGTGGGCGCGGGGTGGGGGACAGGGAGAGCAGAGGTGGGGAGTTAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACTGTGGGCGCGGGGTGGGGGACAGGGAGAGCAGAGGTGGGGAGTTAG  300

seq1  AGGTAGGTAGGTG  313
      |||||||||||||
seq2  AGGTAGGTAGGTG  313