BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-262L24
Chromosome14 (Build37)
Map Location 121,708,929 - 121,710,111
singlet/doubletsinglet
Overlap geneStk24
Upstream geneMbnl2, Rap2a, LOC668835, LOC668837, Ranbp5, Farp1, LOC100043837
Downstream geneSlc15a1, LOC100043577, Dock9, LOC668843, Phgdhl1, Gpr18, Ebi2, Timm8a2, Tm9sf2, LOC621710, Clybl, 1700108J01Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-262L24.bB6Ng01-262L24.g
ACCGA067084GA067085
length1,186146
definitionB6Ng01-262L24.b B6Ng01-262L24.g
singlet/doubletsinglet---
BLAST hituniqueno hit data
sequence
gaattcaaggctagtcttggcaacatagtaaattccgggttagtacggtg
acagttcccttcgattggctactggtgaaggccaatgtgactccttctag
gtaccttagagttgatagctagaaacaaactgtcttgcaaggaaagccac
tttctgggtgacacaggaacgactctaaactgtttccctaaatggcactg
ggactaacttgtttttgtactccctcatgacctctgtcctggcttgtcta
actgagctcccatctcttgaatttcccaggctttgtctgttaacagcaaa
gtaagctccaggcagccttgtctccaccctgtcccctgtgcaatgcccct
cagaagcgacctttctgctcaggttacctcacagcttcctggacagcaaa
ccccaggtgaccacaccctcaggcctctccagagctcactgaagcaaaca
cctcctgatgagcaggaggcgctgacccaggtttctgtcatccgaacacc
accaggctcctgtactgactggcaaagctctacagctaaaagaccaaaga
ttcaaactccttcctgggaaggaaggtgatgtagaaagaccagcccagcc
cacttctgtccaactttctcctggaacaggggagcaggggacctgcccaa
actcagtggcaccagagcagagggcgtctggaacactgcagttactattt
cctaacgactgaccttggtgcagtcttgtatctaaggctccaacatattc
cctgccccactcacaacagcctcaacaacagaggtgtgagaactgtatca
gagtgtaaccctgggttgaaccgccttggcaaccagagggtgagtaagca
tagtgggccactctgtcaccctgggaagctggaccaagctctctccacag
ccttcaccccaatgcccaaaagtccacagctgtcaggcactaaggaaggg
aacagcttaccatgggaggaagagtgtgagaagagccagggtgggtgggc
cacttgaggagcaccctagattagcaagcccatgtccaggactctccttc
tgcgacactccccagctgtcccttacccaccttactacctgcactatgtg
agtgatctgcctttcagctcttctcagctcacaaggctcaactgactcca
ctgactcttcccaactctccaactggctcgctccca
agattaagagccctacactagtcatatgagctaggggtataactccatgg
agagtactcgcctgacatacacaaggctctgggttctagcccaacactga
aagtagaaaggaggaaggaaggaaggaaggaaggaagggagggagg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_121708929_121710111
seq2: B6Ng01-262L24.b_46_1231

seq1  GAATTCAAGGCTAGTCTTGGCAACATAGTAAATTCCGGGTTAGTACGGTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAGGCTAGTCTTGGCAACATAGTAAATTCCGGGTTAGTACGGTG  50

seq1  ACAGTTCCCTTCGATTGGCTACTGGTGAAGGCCAATGTGACTCCTTCTAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGTTCCCTTCGATTGGCTACTGGTGAAGGCCAATGTGACTCCTTCTAG  100

seq1  GTACCTTAGAGTTGATAGCTAGAAACAAACTGTCTTGCAAGGAAAGCCAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACCTTAGAGTTGATAGCTAGAAACAAACTGTCTTGCAAGGAAAGCCAC  150

seq1  TTTCTGGGTGACACAGGAACGACTCTAAACTGTTTCCCTAAATGGCACTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTGGGTGACACAGGAACGACTCTAAACTGTTTCCCTAAATGGCACTG  200

seq1  GGACTAACTTGTTTTTGTACTCCCTCATGACCTCTGTCCTGGCTTGTCTA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACTAACTTGTTTTTGTACTCCCTCATGACCTCTGTCCTGGCTTGTCTA  250

seq1  ACTGAGCTCCCATCTCTTGAATTTCCCAGGCTTTGTCTGTTAACAGCAAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGAGCTCCCATCTCTTGAATTTCCCAGGCTTTGTCTGTTAACAGCAAA  300

seq1  GTAAGCTCCAGGCAGCCTTGTCTCCACCCTGTCCCCTGTGCAATGCCCCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAGCTCCAGGCAGCCTTGTCTCCACCCTGTCCCCTGTGCAATGCCCCT  350

seq1  CAGAAGCGACCTTTCTGCTCAGGTTACCTCACAGCTTCCTGGACAGCAAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAAGCGACCTTTCTGCTCAGGTTACCTCACAGCTTCCTGGACAGCAAA  400

seq1  CCCCAGGTGACCACACCCTCAGGCCTCTCCAGAGCTCACTGAAGCAAACA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCAGGTGACCACACCCTCAGGCCTCTCCAGAGCTCACTGAAGCAAACA  450

seq1  CCTCCTGATGAGCAGGAGGCGCTGACCCAGGTTTCTGTCATCCGAACACC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCCTGATGAGCAGGAGGCGCTGACCCAGGTTTCTGTCATCCGAACACC  500

seq1  ACCAGGCTCCTGTACTGACTGGCAAAGCTCTACAGCTAAAAGACCAAAGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAGGCTCCTGTACTGACTGGCAAAGCTCTACAGCTAAAAGACCAAAGA  550

seq1  TTCAAACTCCTTCCTGGGAAGGAAGGTGATGTAGAAAGACCAGCCCAGCC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAAACTCCTTCCTGGGAAGGAAGGTGATGTAGAAAGACCAGCCCAGCC  600

seq1  CACTTCTGTCCAACTTTCTCCTGGAACAGGGGAGCAGGGGACCTGCCCAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTTCTGTCCAACTTTCTCCTGGAACAGGGGAGCAGGGGACCTGCCCAA  650

seq1  ACTCAGTGGCACCAGAGCAGAGGGCGTCTGGAACACTGCAGTTACTATTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCAGTGGCACCAGAGCAGAGGGCGTCTGGAACACTGCAGTTACTATTT  700

seq1  CCTAACGACTGACCTTGGTGCAGTCTTGTATCTAAGGCTCCAACATATTC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTAACGACTGACCTTGGTGCAGTCTTGTATCTAAGGCTCCAACATATTC  750

seq1  CCTGCCCCACTCACAACAGCCTCAACAACAGAGGTGTGAGAACTGTATCA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGCCCCACTCACAACAGCCTCAACAACAGAGGTGTGAGAACTGTATCA  800

seq1  GAGTGTAACCCTGGGTTGAACCGCCTTGGCAACCAGAGGGTGAGTAAGCA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTGTAACCCTGGGTTGAACCGCCTTGGCAACCAGAGGGTGAGTAAGCA  850

seq1  TAGT-GGCCACTCTGTCACCCTGGGAAGCTGGACCAAGCTCTCTCCACAG  899
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTGGGCCACTCTGTCACCCTGGGAAGCTGGACCAAGCTCTCTCCACAG  900

seq1  CCTTCACCCCAATGCCCAAAAGTCCACAGCTGTCAGGCACTAAGGAAGGG  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTCACCCCAATGCCCAAAAGTCCACAGCTGTCAGGCACTAAGGAAGGG  950

seq1  AACAGC-TAACAT-GGAGGAAGAGTGTGAGAAGAGCCAGGGTGGGTGGG-  996
      |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  AACAGCTTACCATGGGAGGAAGAGTGTGAGAAGAGCCAGGGTGGGTGGGC  1000

seq1  CACCTGAGGAGCACCCTAGATTAGCAAAGCCATGTCCAGAACTCTCCCTT  1046
      ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||
seq2  CACTTGAGGAGCACCCTAGATTAGCAAGCCCATGTCCAGGACTCT-CCTT  1049

seq1  CTGCAGACACTCCCCAGCTGTCCCTTACCCACC-TACTAACTGCACTATG  1095
      |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||
seq2  CTGC-GACACTCCCCAGCTGTCCCTTACCCACCTTACTACCTGCACTATG  1098

seq1  TGAGTGATCTGCCTTCCAGGCTTCCTTCTCAGCTCACAAAGCTCACCTGC  1145
      ||||||||||||||| || |||  ||||||||||||||| ||||| ||| 
seq2  TGAGTGATCTGCCTTTCA-GCT--CTTCTCAGCTCACAAGGCTCAACTGA  1145

seq1  CTCCACTGGCTCCTCCC-ACTCTCC-ACTGGCTC-CTCCCA  1183
      |||||||| ||| |||| ||||||| |||||||| ||||||
seq2  CTCCACTGACTCTTCCCAACTCTCCAACTGGCTCGCTCCCA  1186