BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-264F20
Chromosome14 (Build37)
Map Location 4,881,452 - 4,997,412
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC673676, LOC100041007, LOC100041317, LOC100041306, LOC100041024, LOC100041336
Upstream geneLOC100040652, LOC100040935, LOC100040852, LOC100040674, LOC100040906, LOC100040688, LOC100040701, LOC100040897, LOC100041012, LOC100041019, ENSMUSG00000068790, LOC100041054, LOC666442, LOC100040793, LOC100041076, LOC100040801, LOC666336, LOC100041100, LOC100040808, LOC100041119, 2610042L04Rik, LOC100041139, LOC100041151, LOC100041177, LOC100041162, LOC100040889, LOC100040900, LOC100040917, LOC100040928, EG666560, LOC666555, EG666549, LOC100041262, LOC665981, LOC100041283, LOC100040996
Downstream geneEG666815, LOC666808, EG666800, LOC100041374, 4930555G01Rik, EG666772, LOC666765, LOC100041401, LOC100041105, EG666750, LOC666743, LOC100041447, LOC673138, LOC666740, LOC641258, LOC673685, LOC100041158, LOC100041501, LOC100041515, LOC100041184, EG666706, LOC100041195, LOC100041545, LOC100041565, LOC100041215, LOC100041226, ENSMUSG00000057445, LOC100041598, LOC100041243, EG666684
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-264F20.bB6Ng01-264F20.g
ACCGA068288GA068289
length1,1761,170
definitionB6Ng01-264F20.b B6Ng01-264F20.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(4,881,452 - 4,882,644)(4,996,230 - 4,997,412)
sequence
gaattcaacataattaaatcacaacatgagaagacaatgttggatatgaa
taaaatgacccagtccataattggtgccatgcagtactccaaggaactga
tagaagataactattcctacaggtgagtcagtgacacaactgagatcccc
agaactaggcaaggaatgcttctatcctgttaggactttgaacaaaagca
agggctctggttctatgctatctgttttttatccaggaaccctgccttga
ggcaaggatcttggatttgtacctcttggactcagtcgtcctaagtgtga
agagtgtccaacaccctccaatctttattcttccaaattcaagatcctgt
acattgaaaacttttccaacttgctgggaatatccagacaccctgaacct
ctaggtttctgaccacagattaaaagatatacgattcccgacaaaaatga
aaagagtgtacaccttttgggtcttctacaactctcagaggggataagcc
ctctccctgctgaaggttttatgttaccacagacctataatcaaccatga
ggaacatgtcctcttctgtgatgtatatggtgcactcttggtgtcagggt
ttttagaagtttgttgagtcctctggaatatgggtggtatcttgatttga
cttgtctttgtttggttctggtatgtatattgtggactcttctcgggatt
tctggggatcaggcccttgaagggatcatgggacttgtaggagtggcaag
gcaatggaatctgcctgggaatcaccaatttttctttgtggatcagcatt
aaggaggaccaccttctccgtgagtgcactcaactcaacgaaaaagtaaa
ggatattactgaatgagaacagaaagctgctggtggagcagctggaacgc
aagtgtcctgtgaggaagaaaagaggttctgtgaggaggccagcagaaca
tctgtgcctcaagtgcaaaggaacagcaggtaggaagatgtgtatcagag
gcagattgccctcatgtctacataaacatagacattcccaatatcacagt
cacactctcagcacctcactatggtctctcaggatttgtttatgtgatca
tctacagctctctgtgaagttagcctgatcaggacctgcatatgcaatgc
atgttctgcctcggctagaaatcact
gaattcagtgttcatcctgtgttaggacatagcccaagaagcaaataatc
tgctgaattaaggattcaataatcatgtgcaaacagtccgtatcatggac
tacccaaaccaagtacatgccacatcctggctcattcaaactgggtcccc
ttggtgctaattaaacttactatcctgggcagaggacagcagagccaggg
gaccaaatggagctagctgaccttcaagagcttcctgggcaagcatgaag
gaatagactacttcaatgacaattttccactacactgtgccacaggcttg
ggtccagtagatatttgtaatgactttcctcttatttttaaggcagggat
tttcattccttaggtcctgttgttatttgatttcccagaggacacaacta
gtatttacaggagaaaggctttatcacacctcctctcccaggtgattcct
gtgtgacaccaaggaaaccaggagaaaacttccctgatgatcactttggg
cctctatggactcaacacgaataggacctacaaactgtgcatcacacaaa
tcctcagaccccatcaaaggtcccagaaccccagtcctgaacaaaacaca
cacaactaagttcacacacacagacacaattagaatgccaaataaatcct
gtgaggtgccatctctcagaatataaggaacaatacaggcattgcattca
cacactgagagacagtaagtgtgagcaggtccttccaactgtttacagca
acaatcagattgcaagcaccccaaggtcaagtacaaaaaaaaaatgataa
taaacacacagctccttttttatccaacaattaaacacctgtcagggcta
cctaattgaatgatgagagatgacacagtccattcatgggaaggaaattg
ggtttaacagatggcacactacagtcacagggcataatttctacctgtag
ttcaaatcctcataatatgtaagttccaggattccacccatttcctccat
gtcattgctgatcttcctcatatccattcagttcttctaggtcatttatt
tttgatcctctgctagtgatttgattttggatggagtatttcctagcaga
ccctgcagtagaataaacacaagattgctactgatggctaggccaggaga
ctattctggaagtccagaag
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_4881452_4882644
seq2: B6Ng01-264F20.b_45_1220

seq1  GAATTCAACATAATTAAATCACAACATGAGAAGACAATGTTGGATATGAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAACATAATTAAATCACAACATGAGAAGACAATGTTGGATATGAA  50

seq1  TAAAATGACCCAGTCCATAATTGGTGCCATGCAGTACTCCAAGGAACTGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAATGACCCAGTCCATAATTGGTGCCATGCAGTACTCCAAGGAACTGA  100

seq1  TAGAAGATAACTATTCCTACAGGTGAGTCAGTGACACAACTGAGATCCCC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAAGATAACTATTCCTACAGGTGAGTCAGTGACACAACTGAGATCCCC  150

seq1  AGAACTAGGCAAGGAATGCTTCTATCCTGTTAGGACTTTGAACAAAAGCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAACTAGGCAAGGAATGCTTCTATCCTGTTAGGACTTTGAACAAAAGCA  200

seq1  AGGGCTCTGGTTCTATGCTATCTGTTTTTTATCCAGGAACCCTGCCTTGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGCTCTGGTTCTATGCTATCTGTTTTTTATCCAGGAACCCTGCCTTGA  250

seq1  GGCAAGGATCTTGGATTTGTACCTCTTGGACTCAGTCGTCCTAAGTGTGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAAGGATCTTGGATTTGTACCTCTTGGACTCAGTCGTCCTAAGTGTGA  300

seq1  AGAGTGTCCAACACCCTCCAATCTTTATTCTTCCAAATTCAAGATCCTGT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGTGTCCAACACCCTCCAATCTTTATTCTTCCAAATTCAAGATCCTGT  350

seq1  ACATTGAAAACTTTTCCAACTTGCTGGGAATATCCAGACACCCTGAACCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATTGAAAACTTTTCCAACTTGCTGGGAATATCCAGACACCCTGAACCT  400

seq1  CTAGGTTTCTGACCACAGATTAAAAGATATACGATTCCCGACAAAAATGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGGTTTCTGACCACAGATTAAAAGATATACGATTCCCGACAAAAATGA  450

seq1  AAAGAGTGTACACCTTTTGGGTCTTCTACAACTCTCAGAGGGGATAAGCC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGAGTGTACACCTTTTGGGTCTTCTACAACTCTCAGAGGGGATAAGCC  500

seq1  CTCTCCCTGCTGAAGGTTTTATGTTACCACAGACCTATAATCAACCATGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTCCCTGCTGAAGGTTTTATGTTACCACAGACCTATAATCAACCATGA  550

seq1  GGAACATGTCCTCTTCTGTGATGTATATGGTGCACTCTTGGTGTCAGGGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAACATGTCCTCTTCTGTGATGTATATGGTGCACTCTTGGTGTCAGGGT  600

seq1  TTTTAGAAGTTTGTTGAGTCCTCTGGAATATGGGTGGTATCTTGATTTGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTAGAAGTTTGTTGAGTCCTCTGGAATATGGGTGGTATCTTGATTTGA  650

seq1  CTTGTCTTTGTTTGGTTCTGGTATGTATATTGTGGACTCTTCTCGGGATT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGTCTTTGTTTGGTTCTGGTATGTATATTGTGGACTCTTCTCGGGATT  700

seq1  TCTGGGGATCAGGCCCTTGAAGGGATCATGGGACTTGTAGGAGTGGCAAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGGGGATCAGGCCCTTGAAGGGATCATGGGACTTGTAGGAGTGGCAAG  750

seq1  GCAATGGAATCTGCCTGGGAATCACCAATTTTTCTTTGTGGATCAGCATT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAATGGAATCTGCCTGGGAATCACCAATTTTTCTTTGTGGATCAGCATT  800

seq1  AAGGAGGACCACCTTCTCCGTGAGTGCACTCAACTCAACGAAAAAGT-AA  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  AAGGAGGACCACCTTCTCCGTGAGTGCACTCAACTCAACGAAAAAGTAAA  850

seq1  GGATATTACTGAATGAGAACAGAAAGCTGCTGGTGGAGCAGGCTGGAACG  899
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  GGATATTACTGAATGAGAACAGAAAGCTGCTGGTGGAGCA-GCTGGAACG  899

seq1  CAAGTGTCCTGTGAGGAAGAAAAGAGGTTCTGTGAGGAGGCCAGCAAGAA  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  CAAGTGTCCTGTGAGGAAGAAAAGAGGTTCTGTGAGGAGGCCAGC-AGAA  948

seq1  CATCTGTGCCTCAAGTGCAAAGGAACAGCAGGTAGGAAGATGTGTATCAG  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTGTGCCTCAAGTGCAAAGGAACAGCAGGTAGGAAGATGTGTATCAG  998

seq1  AGGCAGATTGCCCTCATGTCTAACCATAAACATAGACAATCCCAATATCA  1049
      ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||
seq2  AGGCAGATTGCCCTCATGTCTA--CATAAACATAGACATTCCCAATATCA  1046

seq1  CAGTC-CACCAACTTCTCCAGGCACTCACCTAT-GTCTCCTCCAAGGGTT  1097
      ||||| |||     ||| |||   |||| |||| |||| |||  ||| ||
seq2  CAGTCACAC-----TCT-CAGCACCTCA-CTATGGTCT-CTC--AGGATT  1086

seq1  TGTTTATGTGATCATCTACAGGGCTCTCTGTGGAGGTAGCCTGGTTCAAG  1147
      ||||||||||||||||||||  |||||||||| || ||||||| |   ||
seq2  TGTTTATGTGATCATCTACA--GCTCTCTGTGAAGTTAGCCTGAT--CAG  1132

seq1  AAACTGCATATTTGGCATGCAAATGTTCTG-CTCTGCTAG-AATCACT  1193
       | |||||||  ||  ||||  |||||||| ||| ||||| |||||||
seq2  GACCTGCATA--TGCAATGC--ATGTTCTGCCTCGGCTAGAAATCACT  1176

seq1: chr14_4996230_4997412
seq2: B6Ng01-264F20.g_66_1235 (reverse)

seq1  CTTCTTGGGACT--CAGAATAGTCTCCCCTGCCCCTAGGCCATCAAGTAT  48
      |||||  |||||  |||||||||||  ||||  |||| |||||| |||| 
seq2  CTTCT--GGACTTCCAGAATAGTCT--CCTG-GCCTA-GCCATC-AGTA-  42

seq1  GCAAATTCTTTTGTGTTTATCTAACTGCAGGGTCTGCTA-GAAATACTTC  97
      ||||    | ||||||||||   |||||||||||||||| ||||||| ||
seq2  GCAA----TCTTGTGTTTATTCTACTGCAGGGTCTGCTAGGAAATAC-TC  87

seq1  AACCCAAAATTCCAAAATCACTAAGCAGA-GATCAAAAATAAATGAACTA  146
       | |||||||    |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||
seq2  CATCCAAAAT---CAAATCACT-AGCAGAGGATCAAAAATAAATGACCTA  133

seq1  GAAGAACTGAAATTGGATATGAGGAAGATCAGCAATGACATGGAGGAAAT  196
      |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGAACTGAA--TGGATATGAGGAAGATCAGCAATGACATGGAGGAAAT  181

seq1  GGGTGGAATCCTGGAACTTTACATA-TATGAGGATTTGAACTACAGGTAG  245
      ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTGGAATCCTGGAAC-TTACATATTATGAGGATTTGAACTACAGGTAG  230

seq1  AAATTATGCCCTGTTGACTGTAGTGTGCCATCTGTT-AACCCAATTTCCT  294
      ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  AAATTATGCCCTG-TGACTGTAGTGTGCCATCTGTTAAACCCAATTTCCT  279

seq1  T-CCATGAATGGACTGTGTCATCTCTCATCATTCAATTAGGTAGCCCTGA  343
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCATGAATGGACTGTGTCATCTCTCATCATTCAATTAGGTAGCCCTGA  329

seq1  CAGGTGTTTAATTGTTGGATAAAAAAGGAGCTGTGTGTTTATTATCA-TT  392
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  CAGGTGTTTAATTGTTGGATAAAAAAGGAGCTGTGTGTTTATTATCATTT  379

seq1  TTTTTTTGTACTTGACCTTGGGGTGCTTGCAATCTGATTGTTGCTGTAAA  442
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTTTGTACTTGACCTTGGGGTGCTTGCAATCTGATTGTTGCTGTAAA  429

seq1  CAGTTGGAAGGACCTGCTCACACTTACTGTCTCTCAGTGTGTGAATGCAA  492
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTTGGAAGGACCTGCTCACACTTACTGTCTCTCAGTGTGTGAATGCAA  479

seq1  TGCCTGTATTGTTCCTTATATTCTGAGAGATGGCACCTCACAGGATTTAT  542
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCTGTATTGTTCCTTATATTCTGAGAGATGGCACCTCACAGGATTTAT  529

seq1  TTGGCATTCTAATTGTGTCTGTGTGTGTGAACTTAGTTGTGTGTGTTTTG  592
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGCATTCTAATTGTGTCTGTGTGTGTGAACTTAGTTGTGTGTGTTTTG  579

seq1  TTCAGGACTGGGGTTCTGGGACCTTTGATGGGGTCTGAGGATTTGTGTGA  642
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAGGACTGGGGTTCTGGGACCTTTGATGGGGTCTGAGGATTTGTGTGA  629

seq1  TGCACAGTTTGTAGGTCCTATTCGTGTTGAGTCCATAGAGGCCCAAAGTG  692
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCACAGTTTGTAGGTCCTATTCGTGTTGAGTCCATAGAGGCCCAAAGTG  679

seq1  ATCATCAGGGAAGTTTTCTCCTGGTTTCCTTGGTGTCACACAGGAATCAC  742
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCATCAGGGAAGTTTTCTCCTGGTTTCCTTGGTGTCACACAGGAATCAC  729

seq1  CTGGGAGAGGAGGTGTGATAAAGCCTTTCTCCTGTAAATACTAGTTGTGT  792
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGGAGAGGAGGTGTGATAAAGCCTTTCTCCTGTAAATACTAGTTGTGT  779

seq1  CCTCTGGGAAATCAAATAACAACAGGACCTAAGGAATGAAAATCCCTGCC  842
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCTGGGAAATCAAATAACAACAGGACCTAAGGAATGAAAATCCCTGCC  829

seq1  TTAAAAATAAGAGGAAAGTCATTACAAATATCTACTGGACCCAAGCCTGT  892
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAAAATAAGAGGAAAGTCATTACAAATATCTACTGGACCCAAGCCTGT  879

seq1  GGCACAGTGTAGTGGAAAATTGTCATTGAAGTAGTCTATTCCTTCATGCT  942
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCACAGTGTAGTGGAAAATTGTCATTGAAGTAGTCTATTCCTTCATGCT  929

seq1  TGCCCAGGAAGCTCTTGAAGGTCAGCTAGCTCCATTTGGTCCCCTGGCTC  992
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCCAGGAAGCTCTTGAAGGTCAGCTAGCTCCATTTGGTCCCCTGGCTC  979

seq1  TGCTGTCCTCTGCCCAGGATAGTAAGTTTAATTAGCACCAAGGGGACCCA  1042
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGTCCTCTGCCCAGGATAGTAAGTTTAATTAGCACCAAGGGGACCCA  1029

seq1  GTTTGAATGAGCCAGGATGTGGCATGTACTTGGTTTGGGTAGTCCATGAT  1092
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTGAATGAGCCAGGATGTGGCATGTACTTGGTTTGGGTAGTCCATGAT  1079

seq1  ACGGACTGTTTGCACATGATTATTGAATCCTTAATTCAGCAGATTATTTG  1142
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGGACTGTTTGCACATGATTATTGAATCCTTAATTCAGCAGATTATTTG  1129

seq1  CTTCTTGGGCTATGTCCTAACACAGGATGAACACTGAATTC  1183
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTTGGGCTATGTCCTAACACAGGATGAACACTGAATTC  1170