BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-264K07
Chromosome14 (Build37)
Map Location 22,438,936 - 22,576,572
singlet/doubletdoublet
Overlap geneMyst4, EG435391, Dusp13, Samd8
Upstream geneMyoz1, Synpo2l, Sec24c, Fut11, Chchd1, 2310021P13Rik, Ndst2, Camk2g, Plau, EG620119, Vcl, Ap3m1, Adk
Downstream geneVdac2, Comtd1, Zfp503, 1700112E06Rik, EG665075, EG435392
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-264K07.bB6Ng01-264K07.g
ACCGA068492GA068493
length9951,087
definitionB6Ng01-264K07.b B6Ng01-264K07.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(22,575,586 - 22,576,572)(22,438,936 - 22,440,029)
sequence
gaattccttaagctctctagccagcctatttatgtgcttagtgagctatc
tagtctcaaactataacttaaagaagtgcctaaagacatccagcaccaac
cttagccttctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctc
tcacacacacacacacacacacacaacacacagacacagcatcccgtaaa
aatgtgcaattttaagttatatccatttttaatgtttaaagtcatgggga
actggaaagatagctcaggcaataaaacagttgccacatgaacatgaggg
aagttgagatccaatcacccacataagaaagccacatacagacagcagtg
tttgcctgtaatcccagcgtgggctgggagggacagcagaattccttaag
ctctctagccagcctgtctatgtgcttagtgagctatctagtctcaaact
ataacttaaagaagtgcctaaagacatccaccgccaaccttagccttctc
tctctctctctctctctctctcactcacacacacacacacacacatacac
acacacacacatacacactcatacagtttaaacacaagtactaagtgcta
actaacctgctgatttgagttcataaattatgaatatacattgaattacc
actctatacctcacaaacacgtaaactgaagcattttttaattaaaaata
aaaatacaatattttagacaattgattgttgttgatatctaaaagtacac
tttgggaagaaaacaagaatttctgaaaaatgacaggcactcctaactaa
aaagatacaaaactccaccagggcttactatatcaatacacaagagacca
catggtttctaatttgtcattagacaatctttagaatagagaaagcacgt
caataaaatcaacctcttactcttgatctgctcagttttacaaaagtcaa
tttctctgctcaaatgggtagcctacggcgatctaaatggtgctc
gaattctctgtatctggtgtaatatggagttctcttctctgtttgtgtga
gtcagccatgtacctgccctcatgtttataatatggtaaacatttaagaa
tgagcttgcccttttattaatagtatgtatatattgacattgtagaaggt
atagagaatacaaacataaaagaaatataaaggctgggggacaaacagtt
agttaccaagaggttcttgcttctactcgcccttttcaagggagcgttct
gcaaatgtgtgcgtaaccttgagttttcctcttcccaataatagatggta
agcatcctcatgccattgctcgccctcctaaacatgattttacacaagtc
atgttgagcaccataacacggagcagggcttccagacctgcttgtgggcc
atgaataagctttgttggcacgatccttttcaattttaccttgagttgtc
tcaatggggcatgcatgctttgatttgtcaccctgtcactgctccctatt
gtcacgtgttctaatttgctttagtcacatgcagtcgaggtgcttcctga
aggtatttgattttgcagcctcaggtataaatgaaccataattgatttaa
ttaaccaattctctacagtagatacttcaagtgtttcccttacacctgaa
gataaattcgtagagaggaattctctaactagaggccacttacttgaaag
gctgtcagtttttataccgaccaccagtgtatgaggaattatcctcatga
caaagctaatagaaccactgagccaaagacatacttccttttttaccttt
taacatctttaaaataatttttatcatatgagtaatatcttagatttgat
aaaactatagtcttaatattttaaatcagtttgatagtaaggaaaaaaat
catgacttcttttccctttttttagttgaggacaccgaacttctgtattt
gattatttattcgcatcattgtgaatacctgttttatactataatcattt
ttccattgagttcaagtacttacacctttcagctttacagaatataatca
gtttagatctgtgttggcacatttatttttcatgtag
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_22575586_22576572
seq2: B6Ng01-264K07.b_47_1041 (reverse)

seq1  GAGCA-CATTTAGATCGCCGTA-GCTA-CCATCTGAGCAGAGAAATTGAC  47
      ||||| |||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||
seq2  GAGCACCATTTAGATCGCCGTAGGCTACCCATTTGAGCAGAGAAATTGAC  50

seq1  TTTTGTAAAACTGAGCAGATCAAGAGTAAGAGTTTGATTTTATTGACGTG  97
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  TTTTGTAAAACTGAGCAGATCAAGAGTAAGAGGTTGATTTTATTGACGTG  100

seq1  CCTTCTCTATTCTAAAGATTGTCTAATGATAAATTAGAACCCATGTGGTC  147
      | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||
seq2  CTTTCTCTATTCTAAAGATTGTCTAATGACAAATTAGAAACCATGTGGTC  150

seq1  TCTTGTGTATTGATATAGTAAG-CCTGGTGGAGTTTTGTATCTTTTTAGT  196
      |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTGTGTATTGATATAGTAAGCCCTGGTGGAGTTTTGTATCTTTTTAGT  200

seq1  TAGGAGTGCCTGTCATTTTTCAGAAATTCCTG-TTTCTTCCCAAAGTGTA  245
      ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||
seq2  TAGGAGTGCCTGTCATTTTTCAGAAATTCTTGTTTTCTTCCCAAAGTGTA  250

seq1  CTTTTAGATATCAACAACAATCAATTGTCTAAAAT-TTGTATTTTTA-TT  293
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||
seq2  CTTTTAGATATCAACAACAATCAATTGTCTAAAATATTGTATTTTTATTT  300

seq1  TTAATTAAAAAATGCTTCAG-TTATGTGTTTGTGAGGTATAGAGTGGTAA  342
      |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATTAAAAAATGCTTCAGTTTACGTGTTTGTGAGGTATAGAGTGGTAA  350

seq1  TTCAATGTATATTCATAATTTATGAACTCAAATCAGCAGGTTAGTTAGCA  392
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAATGTATATTCATAATTTATGAACTCAAATCAGCAGGTTAGTTAGCA  400

seq1  CTTAGTACTTGTGTTTAAACTGTATGAGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTA  442
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAGTACTTGTGTTTAAACTGTATGAGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTA  450

seq1  TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGTGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAA  492
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGTGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAA  500

seq1  GGCTAAGGTTGGCGGTGGATGTCTTTAGGCACTTCTTTAAGTTATAGTTT  542
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTAAGGTTGGCGGTGGATGTCTTTAGGCACTTCTTTAAGTTATAGTTT  550

seq1  GAGACTAGATAGCTCACTAAGCACATAGACAGGCTGGCTAGAGAGCTTAA  592
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGACTAGATAGCTCACTAAGCACATAGACAGGCTGGCTAGAGAGCTTAA  600

seq1  GGAATTCTGCTGTCCCTCCCAGCCCACGCTGGGATTACAGGCAAACACTG  642
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAATTCTGCTGTCCCTCCCAGCCCACGCTGGGATTACAGGCAAACACTG  650

seq1  CTGTCTGTATGTGGCTTTCTTATGTGGGTGATTGGATCTCAACTTCCCTC  692
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTCTGTATGTGGCTTTCTTATGTGGGTGATTGGATCTCAACTTCCCTC  700

seq1  ATGTTCATGTGGCAACTGTTTTATTGCCTGAGCTATCTTTCCAGTTCCCC  742
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTTCATGTGGCAACTGTTTTATTGCCTGAGCTATCTTTCCAGTTCCCC  750

seq1  ATGACTTTAAACATTAAAAATGGATATAACTTAAAATTGCACATTTTTAC  792
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGACTTTAAACATTAAAAATGGATATAACTTAAAATTGCACATTTTTAC  800

seq1  GGGATGCTGTGTCTGTGTGTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGAGAG  842
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGATGCTGTGTCTGTGTGTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGAGAG  850

seq1  AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAGGCTAAGGTTGG  892
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAGGCTAAGGTTGG  900

seq1  TGCTGGATGTCTTTAGGCACTTCTTTAAGTTATAGTTTGAGACTAGATAG  942
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGGATGTCTTTAGGCACTTCTTTAAGTTATAGTTTGAGACTAGATAG  950

seq1  CTCACTAAGCACATAAATAGGCTGGCTAGAGAGCTTAAGGAATTC  987
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCACTAAGCACATAAATAGGCTGGCTAGAGAGCTTAAGGAATTC  995

seq1: chr14_22438936_22440029
seq2: B6Ng01-264K07.g_66_1152

seq1  GAATTCTCTGTATCTGGTGTAATATGGAGTTCTCTTCTCTGTTTGTGTGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCTGTATCTGGTGTAATATGGAGTTCTCTTCTCTGTTTGTGTGA  50

seq1  GTCAGCCATGTACCTGCCCTCATGTTTATAATATGGTAAACATTTAAGAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCAGCCATGTACCTGCCCTCATGTTTATAATATGGTAAACATTTAAGAA  100

seq1  TGAGCTTGCCCTTTTATTAATAGTATGTATATATTGACATTGTAGAAGGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGCTTGCCCTTTTATTAATAGTATGTATATATTGACATTGTAGAAGGT  150

seq1  ATAGAGAATACAAACATAAAAGAAATATAAAGGCTGGGGGACAAACAGTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGAGAATACAAACATAAAAGAAATATAAAGGCTGGGGGACAAACAGTT  200

seq1  AGTTACCAAGAGGTTCTTGCTTCTACTCGCCCTTTTCAAGGGAGCGTTCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTACCAAGAGGTTCTTGCTTCTACTCGCCCTTTTCAAGGGAGCGTTCT  250

seq1  GCAAATGTGTGCGTAACCTTGAGTTTTCCTCTTCCCAATAATAGATGGTA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAATGTGTGCGTAACCTTGAGTTTTCCTCTTCCCAATAATAGATGGTA  300

seq1  AGCATCCTCATGCCATTGCTCGCCCTCCTAAACATGATTTTACACAAGTC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCATCCTCATGCCATTGCTCGCCCTCCTAAACATGATTTTACACAAGTC  350

seq1  ATGTTGAGCACCATAACACGGAGCAGGGCTTCCAGACCTGCTTGTGGGCC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTTGAGCACCATAACACGGAGCAGGGCTTCCAGACCTGCTTGTGGGCC  400

seq1  ATGAATAAGCTTTGTTGGCACGATCCTTTTCAATTTTACCTTGAGTTGTC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAATAAGCTTTGTTGGCACGATCCTTTTCAATTTTACCTTGAGTTGTC  450

seq1  TCAATGGGGCATGCATGCTTTGATTTGTCACCCTGTCACTGCTCCCTATT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAATGGGGCATGCATGCTTTGATTTGTCACCCTGTCACTGCTCCCTATT  500

seq1  GTCACGTGTTCTAATTTGCTTTAGTCACATGCAGTCGAGGTGCTTCCTGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCACGTGTTCTAATTTGCTTTAGTCACATGCAGTCGAGGTGCTTCCTGA  550

seq1  AGGTATTTGATTTTGCAGCCTCAGGTATAAATGAACCATAATTGATTTAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTATTTGATTTTGCAGCCTCAGGTATAAATGAACCATAATTGATTTAA  600

seq1  TTAACCAATTCTCTACAGTAGATACTTCAAGTGTTTCCCTTACACCTGAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAACCAATTCTCTACAGTAGATACTTCAAGTGTTTCCCTTACACCTGAA  650

seq1  GATAAATTCGTAGAGAGGAATTCTCTAACTAGAGGCCACTTACTTGAAAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAAATTCGTAGAGAGGAATTCTCTAACTAGAGGCCACTTACTTGAAAG  700

seq1  GCTGTCAGTTTTTATACCGACCACCAGTGTATGAGGAATTATCCTCATGA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGTCAGTTTTTATACCGACCACCAGTGTATGAGGAATTATCCTCATGA  750

seq1  CAAAGCTAATAGAACCACTGAGCCAAAGACATACTTCCTTTTTTACCTTT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGCTAATAGAACCACTGAGCCAAAGACATACTTCCTTTTTTACCTTT  800

seq1  TAACATCTTTAAAATAATTTTTATCATATGAGTAATATCTTAGATTTGAT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACATCTTTAAAATAATTTTTATCATATGAGTAATATCTTAGATTTGAT  850

seq1  AAAACTATAGTCTTAATATTTTAAATCAGTTTGATAGTAAGGAAAAAAAT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAACTATAGTCTTAATATTTTAAATCAGTTTGATAGTAAGGAAAAAAAT  900

seq1  CATGACTTCTTTTCCCTTTTTTTAGTTGAGGACACCGAACTTCTGTATTT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGACTTCTTTTCCCTTTTTTTAGTTGAGGACACCGAACTTCTGTATTT  950

seq1  GATTATTTATTCGCATCATTGTGAATACCTGTTTTATACTATAATCATTT  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTATTTATTCGCATCATTGTGAATACCTGTTTTATACTATAATCATTT  1000

seq1  TTCCATTGAGGTTCAAGTACTTACACC-TTCAGCTTTACAGAAATATTAA  1049
      ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||
seq2  TTCCATTGA-GTTCAAGTACTTACACCTTTCAGCTTTACAG-AATA-TAA  1047

seq1  TCAGTTTAGATTCCTGGTGTTTGCCACATTTTATTTTTCATGTAG  1094
      |||||||||||  || ||| ||| |||| ||||||||||||||||
seq2  TCAGTTTAGAT--CT-GTG-TTGGCACA-TTTATTTTTCATGTAG  1087