BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-267I07
Chromosome14 (Build37)
Map Location 106,120,262 - 106,283,372
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100043469
Upstream geneD130009I18Rik, LOC435420, Rbm26, LOC621103, LOC100043466, Ndfip2, LOC620376
Downstream geneSpry2, EG621364, LOC212084, Trim52, LOC100043807, LOC100043476, LOC100043809, LOC668736, EG668738, EG668739, LOC621487, EG668743, LOC100043811, LOC621499, LOC100043814, EG668742, LOC668748
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-267I07.bB6Ng01-267I07.g
ACCGA070617GA070618
length1,1441,010
definitionB6Ng01-267I07.b B6Ng01-267I07.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(106,282,152 - 106,283,372)(106,120,262 - 106,121,279)
sequence
gaattcattcatagtcccaggaattgcatctttaattaataacttcctaa
gtgaatttttgatgatatcatcaacctaaggttttatgggtgggaagagg
tatgcgttattggcagctgtttgagggagcagatcctcatacatatcgga
atctctatagatgcttaatgagtgcttgatgattgcatatattcaataga
gaataaaagtatactgatgacttctaagattatgaataatgatgtatggc
aaaacagaaacaccaattgttaataaaacagcatagtaaactgtgagtat
tgctcttataaaaaggattatccatttctaagctcttcattcatttattt
ctaaggttatatagtctattttacagtctgaagtgttagacagtagccac
tggttggacaatagcataacacactggacactgtttgctgaccttgaact
gaatcacagttacgcaaaatgtcctgcttcaagtgagcagatatacagtt
ttaagttttatattttaaatttgattgttattattataaatgaaaaagat
atatactctaaaaccaagaatatgttattgggttcaactttggtagggaa
attagttattgtagaaattatttacaatccagttctcttataagacaaac
aacaactgtttcataagacctaagaaaattccagcctggtaacataagac
tttaatccggcgctcgagaggcagaggcaggtggacccacgtgagctgga
gagcagcttgatctccacagcaagttcaggccatctggggctacagagag
acaactaaaggctgttctcacaaatgtatcagcacgctgtcacttccctc
ttggttcgagcacagtagtgccccttacacattcactgtattttgaatga
acttattttgtgtcatgtgtatgagtgttttgcctgcatgtatggaggtg
cactgcgcacatgtttgggttccctcagaccttagaggaagctaagatcc
cttggaagagtagttgtggatgggttgtgagccacagcaagtgctgggac
caaacctgcttccttccacaaggaacagcaaggactcttacagtgagttt
acatctcagaccctgatgcatttatgatatttcttgagaaaacc
gaattcactaggggtgtggtgtgccctggcaggtgactggggagctccca
agtggtaggtgggcgatgaactctaagctataggaccagatttgattttc
tggaactggcaggagggaagtcgtcttattctcatctttatctagccaaa
gagtctcaaaatgttgaagacatttttttttcagtcacatacaattcaga
aagacgccagcgtggccagatggatagttttcagatctacacttgggaaa
cacatggtgcttctctgaggcaattgtgtactgtttcttttaaaatagca
gaaagcatatgggaataggaatggatctgtcagctactatcaagagaatg
gtgaagcttttaaataaatcaaatcaaacctatagggtgacaaaatatct
tatcacattttgaaattctgaagttttacatttgtagatatatttacatt
ttttaatcttttttttttttttcttcacagaaaccacaatccctgttaga
gctgtggagtctgaggcaaagaatgagagaaggtcagggcagtaagaaat
tctgtagacattacataaatcagcaactgagtcccactctgttatattac
agggttctcccccactgaggaacgcgtgtgtagaccagttttgatacttc
ctcccacagactctgctttccttcctaaagacaaacatacaagcagaaac
atgagatttgcacatgtgaaaagcgtgcttcagctaaagtaaaccaggta
tgatagctgctggtcccccagttacagcagcacagagctgtagaaaactg
ctctccctgtgtgctcttagctccttcagcaggatggctccccaccaact
ctaaccacactgctttcatgaatggatttcctaaccaggtcaaatctcct
taatgctagacttagaactccaccatactcttatgttttctatggcatct
agctctccctcaaatgtattatggatttgaaatgatttacttcagaaatg
atttcatagg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_106282152_106283372
seq2: B6Ng01-267I07.b_44_1187 (reverse)

seq1  GGTTTTCTCACATTACTATCTACCCATCAAGTTCCAGACAAATTTCATCT  50
                                                        
seq2  --------------------------------------------------  0

seq1  CTTTTCAATATTTTTTTACTGGTCATGACTGTTTTCTCA--GAATATCTA  98
                                    |||||||||   ||||||  
seq2  -----------------------------GGTTTTCTCAAGAAATATCAT  21

seq1  AAATGCATCAGGTCTTGAGATGT-AACTCACTGGTTAAGAGTCCTTGCTG  147
      ||||||||||||   |||||||| |||||||||  |||||||||||||||
seq2  AAATGCATCAGGGTCTGAGATGTAAACTCACTG--TAAGAGTCCTTGCTG  69

seq1  TT-CTTGTGGA--GGAGCAGGGTTTGGTTCCCAGCACTTGCCTGGTGGCT  194
      || ||||||||  | |||| ||||||| |||||||||||||   ||||||
seq2  TTCCTTGTGGAAGGAAGCA-GGTTTGG-TCCCAGCACTTGC--TGTGGCT  115

seq1  CACAA-CCATCCACAACTACTCTTCCAAGGGATCTTAGCTTCCTCTAAGG  243
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAACCCATCCACAACTACTCTTCCAAGGGATCTTAGCTTCCTCTAAGG  165

seq1  TCTGAGGGAA-CCAAACATGTGCGCAGTGCACCTCCATACATGCAGGCAA  292
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGAGGGAACCCAAACATGTGCGCAGTGCACCTCCATACATGCAGGCAA  215

seq1  AACACTCATACACATGACACAAAATAAGTTCATTCAAAATACAGTGAATG  342
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACACTCATACACATGACACAAAATAAGTTCATTCAAAATACAGTGAATG  265

seq1  TGTAAGGGGCACTACTGTGCTCGAACCAAGAGGGAAGTGACAGCGTGCTG  392
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAAGGGGCACTACTGTGCTCGAACCAAGAGGGAAGTGACAGCGTGCTG  315

seq1  ATACATTTGTGAGAACAGCCTTTAGTTGTCTCTCTGTAGCCCCAGATGGC  442
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACATTTGTGAGAACAGCCTTTAGTTGTCTCTCTGTAGCCCCAGATGGC  365

seq1  CTGAACTTGCTGTGGAGATCAAGCTGCTCTCCAGCTCACGTGGGTCCACC  492
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAACTTGCTGTGGAGATCAAGCTGCTCTCCAGCTCACGTGGGTCCACC  415

seq1  TGCCTCTGCCTCTCGAGCGCCGGATTAAAGTCTTATGTTACCAGGCTGGA  542
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCTCTGCCTCTCGAGCGCCGGATTAAAGTCTTATGTTACCAGGCTGGA  465

seq1  ATTTTCTTAGGTCTTATGAAACAGTTGTTGTTTGTCTTATAAGAGAACTG  592
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTCTTAGGTCTTATGAAACAGTTGTTGTTTGTCTTATAAGAGAACTG  515

seq1  GATTGTAAATAATTTCTACAATAACTAATTTCCCTACCAAAGTTGAACCC  642
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTGTAAATAATTTCTACAATAACTAATTTCCCTACCAAAGTTGAACCC  565

seq1  AATAACATATTCTTGGTTTTAGAGTATATATCTTTTTCATTTATAATAAT  692
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAACATATTCTTGGTTTTAGAGTATATATCTTTTTCATTTATAATAAT  615

seq1  AACAATCAAATTTAAAATATAAAACTTAAAACTGTATATCTGCTCACTTG  742
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAATCAAATTTAAAATATAAAACTTAAAACTGTATATCTGCTCACTTG  665

seq1  AAGCAGGACATTTTGCGTAACTGTGATTCAGTTCAAGGTCAGCAAACAGT  792
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCAGGACATTTTGCGTAACTGTGATTCAGTTCAAGGTCAGCAAACAGT  715

seq1  GTCCAGTGTGTTATGCTATTGTCCAACCAGTGGCTACTGTCTAACACTTC  842
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCAGTGTGTTATGCTATTGTCCAACCAGTGGCTACTGTCTAACACTTC  765

seq1  AGACTGTAAAATAGACTATATAACCTTAGAAATAAATGAATGAAGAGCTT  892
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACTGTAAAATAGACTATATAACCTTAGAAATAAATGAATGAAGAGCTT  815

seq1  AGAAATGGATAATCCTTTTTATAAGAGCAATACTCACAGTTTACTATGCT  942
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAATGGATAATCCTTTTTATAAGAGCAATACTCACAGTTTACTATGCT  865

seq1  GTTTTATTAACAATTGGTGTTTCTGTTTTGCCATACATCATTATTCATAA  992
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTTATTAACAATTGGTGTTTCTGTTTTGCCATACATCATTATTCATAA  915

seq1  TCTTAGAAGTCATCAGTATACTTTTATTCTCTATTGAATATATGCAATCA  1042
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTAGAAGTCATCAGTATACTTTTATTCTCTATTGAATATATGCAATCA  965

seq1  TCAAGCACTCATTAAGCATCTATAGAGATTCCGATATGTATGAGGATCTG  1092
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAGCACTCATTAAGCATCTATAGAGATTCCGATATGTATGAGGATCTG  1015

seq1  CTCCCTCAAACAGCTGCCAATAACGCATACCTCTTCCCACCCATAAAACC  1142
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCCTCAAACAGCTGCCAATAACGCATACCTCTTCCCACCCATAAAACC  1065

seq1  TTAGGTTGATGATATCATCAAAAATTCACTTAGGAAGTTATTAATTAAAG  1192
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGGTTGATGATATCATCAAAAATTCACTTAGGAAGTTATTAATTAAAG  1115

seq1  ATGCAATTCCTGGGACTATGAATGAATTC  1221
      |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCAATTCCTGGGACTATGAATGAATTC  1144

seq1: chr14_106120262_106121279
seq2: B6Ng01-267I07.g_66_1075

seq1  GAATTCACTAGGGGTGTGGTGTGCCCTGGCAGGTGACTGGGGAGCTCCCA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACTAGGGGTGTGGTGTGCCCTGGCAGGTGACTGGGGAGCTCCCA  50

seq1  AGTGGTAGGTGGGCGATGAACTCTAAGCTATAGGACCAGATTTGATTTTC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGGTAGGTGGGCGATGAACTCTAAGCTATAGGACCAGATTTGATTTTC  100

seq1  TGGAACTGGCAGGAGGGAAGTCGTCTTATTCTCATCTTTATCTAGCCAAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAACTGGCAGGAGGGAAGTCGTCTTATTCTCATCTTTATCTAGCCAAA  150

seq1  GAGTCTCAAAATGTTGAAGACATTTTTTTTTCAGTCACATACAATTCAGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTCTCAAAATGTTGAAGACATTTTTTTTTCAGTCACATACAATTCAGA  200

seq1  AAGACGCCAGCGTGGCCAGATGGATAGTTTTCAGATCTACACTTGGGAAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGACGCCAGCGTGGCCAGATGGATAGTTTTCAGATCTACACTTGGGAAA  250

seq1  CACATGGTGCTTCTCTGAGGCAATTGTGTACTGTTTCTTTTAAAATAGCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATGGTGCTTCTCTGAGGCAATTGTGTACTGTTTCTTTTAAAATAGCA  300

seq1  GAAAGCATATGGGAATAGGAATGGATCTGTCAGCTACTATCAAGAGAATG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAGCATATGGGAATAGGAATGGATCTGTCAGCTACTATCAAGAGAATG  350

seq1  GTGAAGCTTTTAAATAAATCAAATCAAACCTATAGGGTGACAAAATATCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAAGCTTTTAAATAAATCAAATCAAACCTATAGGGTGACAAAATATCT  400

seq1  TATCACATTTTGAAATTCTGAAGTTTTACATTTGTAGATATATTTACATT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCACATTTTGAAATTCTGAAGTTTTACATTTGTAGATATATTTACATT  450

seq1  TTTTAATCTTTTTTTTTTTTTTCTTCACAGAAACCACAATCCCTGTTAGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTAATCTTTTTTTTTTTTTTCTTCACAGAAACCACAATCCCTGTTAGA  500

seq1  GCTGTGGAGTCTGAGGCAAAGAATGAGAGAAGGTCAGGGCAGTAAGAAAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGTGGAGTCTGAGGCAAAGAATGAGAGAAGGTCAGGGCAGTAAGAAAT  550

seq1  TCTGTAGACATTACATAAATCAGCAACTGAGTCCCACTCTGTTATATTAC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTAGACATTACATAAATCAGCAACTGAGTCCCACTCTGTTATATTAC  600

seq1  AGGGTTCTCCCCCACTGAGGAACGCGTGTGTAGACCAGTTTTGATACTTC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGTTCTCCCCCACTGAGGAACGCGTGTGTAGACCAGTTTTGATACTTC  650

seq1  CTCCCACAGACTCTGCTTTCCTTCCTAAAGACAAACATACAAGCAGAAAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCCACAGACTCTGCTTTCCTTCCTAAAGACAAACATACAAGCAGAAAC  700

seq1  ATGAGATTTGCACATGTGAAAAGCGTGCTTCAGCTAAAGTAAACCAGGTA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAGATTTGCACATGTGAAAAGCGTGCTTCAGCTAAAGTAAACCAGGTA  750

seq1  TGATAGCTGCTGGTCCCCCAGTTACAGCAGCACAGAGCTGTAGAAAACTG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATAGCTGCTGGTCCCCCAGTTACAGCAGCACAGAGCTGTAGAAAACTG  800

seq1  CTCTCCCTGTGTGCTCTTAGCTCCTTCAGCAGGATGGCTCCCCACCAACT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTCCCTGTGTGCTCTTAGCTCCTTCAGCAGGATGGCTCCCCACCAACT  850

seq1  CTAACCACACTGCTTTCATGAATGGATTTCCTAACCAGGTCAAATCTCCT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAACCACACTGCTTTCATGAATGGATTTCCTAACCAGGTCAAATCTCCT  900

seq1  TAATGCTAGACTTAGAACTCCACCATACTCTTATGTTTTCTATGGCAATC  950
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  TAATGCTAGACTTAGAACTCCACCATACTCTTATGTTTTCTATGGC-ATC  949

seq1  TAGCTCTCCCTCAAATTGTTATTATGGGATTTGAAATGATTTAACTTCAA  1000
      ||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||| |||||| 
seq2  TAGCTCTCCCTCAAAT--GTATTAT-GGATTTGAAATGATTT-ACTTCA-  994

seq1  GGAAAATGATTTCATAGG  1018
         |||||||||||||||
seq2  --GAAATGATTTCATAGG  1010