BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-268C09
Chromosome14 (Build37)
Map Location 50,240,051 - 50,416,650
singlet/doubletdoublet
Overlap gene3632451O06Rik
Upstream geneOtx2, LOC100041864, LOC666972, Exoc5, 4932432K03Rik, LOC218997, Nat12, 1700011H14Rik, Slc35f4
Downstream geneLOC667006, Olfr722, Olfr723, Olfr724, LOC100041975, Olfr725, LOC100042882, Olfr726, Olfr727, Olfr728, Olfr729, Olfr730, Olfr731, Olfr732, Olfr733, Olfr734, Olfr735, Tlr11, Olfr736, Olfr737-ps1, Olfr738, Olfr739, Olfr740, Olfr741, GA_x5J8B7U07Q4-325-757, GA_x5J8B7TYL6J-3-280, Olfr742, Olfr743-ps1, Olfr744, Olfr745, Olfr746, Olfr747, Olfr748, Olfr749, Ttc5, Gm288
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-268C09.bB6Ng01-268C09.g
ACCGA071084GA071085
length3881,047
definitionB6Ng01-268C09.b B6Ng01-268C09.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(50,416,257 - 50,416,650)(50,240,051 - 50,241,086)
sequence
caccattcaactgcagtaaatagatttttgtcctttgcatcaagatgtca
agatatgagaggggaggactgaggcagagacagagtaaacacaggtgtct
aaagcagtgcagttcttagtagaatcttttaaagataaactctcaggctg
aaacatttacataaaataaatcttaattttatagcaataaaaggatcctt
gtgaaatgggttataaaaattccctttaaatgtcttgctcatcaaagaga
tcatgtctttcattgaatagatccttttattgcaaatgaattgttcacca
ggaataactctgtccataatggtagccatgacttgtgcttcatttattgg
acaatattgtgtcttcctcctcctcctcctcctccacc
gaattccaatactcatatcatttgagttccttaaaaagagacttgtacag
aaaatatttatagatttaatacccaaaattttcctaaacttgatgcatac
atgcagcatgcacacacacaagtacacatgcacactcacataaagttaag
tcagagcgaagcacaggcatagtggtgcctgtctgtaattacatatgtag
attacatatgcagcattacagttgtagatacagtaggatcaggagctcaa
gggcatccttagctacacagtgaattccatggcagcctgaaactttgcat
taaaaaaacaaaagaacaagatggtgtacagttgatcttcatcattcaaa
gagtccatctttataaatgtgcctactcttgaaaatttatttaccaatat
tcttgttacttgtttggtcatccatggacttgtgcagagcagtgaagaat
ctgggtccctcaacatacacacttccaggtaatagtgatcaaggtaatgc
atgctctttttcttctggatcccagcagaaaaggccagtgaacagcacaa
gataacaaaagaagctgtgcttgtagaggtcaactgaacatggctggaac
cccagctctggctcctgttagtcatctcaggcaagtaatctaatatccct
gaatatcatgttcacttttatgtaaaaaataaaacatgtagctggagcca
tgagtcccaccatgtgtactttttggttgatagtttagtccctaggagct
ctggaggtactggttagtttatattgttgttcctcctatggagctgcaaa
ctccttcaactccttgggtcctttctctagctccttcattggggaccctg
tgctcagtccaatggaaggttgtgaacacccttctgtatttgtcaggcac
tggcagagcctctcaggggacagcttatatcagctcctgtcagcaagcac
ttgttggcatccacaatagtgtctgggtttgttgattgcataggggatgg
atccccagtggtagtctctggatgtcattcctttgtctctgcttcaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_50416257_50416650
seq2: B6Ng01-268C09.b_49_442 (reverse)

seq1  GGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAAGACACAATATTGTCCAATAAATGAA  50
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAAGACACAATATTGTCCAATAAATGAA  50

seq1  GCACAAGTCATGGCTACCATTATGGACAGAGTTATTCCTGGTGAACAATT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACAAGTCATGGCTACCATTATGGACAGAGTTATTCCTGGTGAACAATT  100

seq1  CATTTGCAATAAAAGGATCTATTCAATGAAAGACATGATCTCTTTGATGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTGCAATAAAAGGATCTATTCAATGAAAGACATGATCTCTTTGATGA  150

seq1  GCAAGACATTTAAAGGGAATTTTTATAACCCATTTCACAAGGATCCTTTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAGACATTTAAAGGGAATTTTTATAACCCATTTCACAAGGATCCTTTT  200

seq1  ATTGCTATAAAATTAAGATTTATTTTATGTAAATGTTTCAGCCTGAGAGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGCTATAAAATTAAGATTTATTTTATGTAAATGTTTCAGCCTGAGAGT  250

seq1  TTATCTTTAAAAGATTCTACTAAGAACTGCACTGCTTTAGACACCTGTGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATCTTTAAAAGATTCTACTAAGAACTGCACTGCTTTAGACACCTGTGT  300

seq1  TTACTCTGTCTCTGCCTCAGTCCTCCCCTCTCATATCTTGACATCTTGAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACTCTGTCTCTGCCTCAGTCCTCCCCTCTCATATCTTGACATCTTGAT  350

seq1  GCAAAGGACAAAAATCTATTTACTGCAGTTGAATGGTGGAATTC  394
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAAGGACAAAAATCTATTTACTGCAGTTGAATGGTGGAATTC  394

seq1: chr14_50240051_50241086
seq2: B6Ng01-268C09.g_68_1099

seq1  GAATTCCAATACTCATATCATTTGAGTTCCTTAAAAAGAGACTTGTACAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAATACTCATATCATTTGAGTTCCTTAAAAAGAGACTTGTACAG  50

seq1  AAAATATTTATAGATTTAATACCCAAAATTTTCCTAAACTTGATGCATAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATATTTATAGATTTAATACCCAAAATTTTCCTAAACTTGATGCATAC  100

seq1  ATGCAGCATGCACACACACAAGTACACATGCACACTCACATAAAGTTAAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCAGCATGCACACACACAAGTACACATGCACACTCACATAAAGTTAAG  150

seq1  TCAGAGCGAAGCACAGGCATAGTGGTGCCTGTCTGTAATTACATATGTAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGAGCGAAGCACAGGCATAGTGGTGCCTGTCTGTAATTACATATGTAG  200

seq1  ATTACATATGCAGCATTACAGTTGTAGATACAGTAGGATCAGGAGCTCAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTACATATGCAGCATTACAGTTGTAGATACAGTAGGATCAGGAGCTCAA  250

seq1  GGGCATCCTTAGCTACACAGTGAATTCCATGGCAGCCTGAAACTTTGCAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCATCCTTAGCTACACAGTGAATTCCATGGCAGCCTGAAACTTTGCAT  300

seq1  TAAAAAAACAAAAGAACAAGATGGTGTACAGTTGATCTTCATCATTCAAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAAAAACAAAAGAACAAGATGGTGTACAGTTGATCTTCATCATTCAAA  350

seq1  GAGTCCATCTTTATAAATGTGCCTACTCTTGAAAATTTATTTACCAATAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTCCATCTTTATAAATGTGCCTACTCTTGAAAATTTATTTACCAATAT  400

seq1  TCTTGTTACTTGTTTGGTCATCCATGGACTTGTGCAGAGCAGTGAAGAAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTGTTACTTGTTTGGTCATCCATGGACTTGTGCAGAGCAGTGAAGAAT  450

seq1  CTGGGTCCCTCAACATACACACTTCCAGGTAATAGTGATCAAGGTAATGC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGGTCCCTCAACATACACACTTCCAGGTAATAGTGATCAAGGTAATGC  500

seq1  ATGCTCTTTTTCTTCTGGATCCCAGCAGAAAAGGCCAGTGAACAGCACAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCTCTTTTTCTTCTGGATCCCAGCAGAAAAGGCCAGTGAACAGCACAA  550

seq1  GATAACAAAAGAAGCTGTGCTTGTAGAGGTCAACTGAACATGGCTGGAAC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAACAAAAGAAGCTGTGCTTGTAGAGGTCAACTGAACATGGCTGGAAC  600

seq1  CCCAGCTCTGGCTCCTGTTAGTCATCTCAGGCAAGTAATCTAATATCCCT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAGCTCTGGCTCCTGTTAGTCATCTCAGGCAAGTAATCTAATATCCCT  650

seq1  GAATATCATGTTCACTTTTATGTAAAAAATAAAACATGTAGCTGGAGCCA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATATCATGTTCACTTTTATGTAAAAAATAAAACATGTAGCTGGAGCCA  700

seq1  TGAGTCCCACCATGTGTACTTTTTGGTTGATAGTTTAGTCCCTAGGAGCT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGTCCCACCATGTGTACTTTTTGGTTGATAGTTTAGTCCCTAGGAGCT  750

seq1  CTGGAGGTACTGGTTAGTTTATATTGTTGTTCCTCCTATGGAGCTGCAAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGAGGTACTGGTTAGTTTATATTGTTGTTCCTCCTATGGAGCTGCAAA  800

seq1  CTCCTTCAACTCCTTGGGTCCTTTCTCTAGCTCCTTCATTGGGGACCCTG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCTTCAACTCCTTGGGTCCTTTCTCTAGCTCCTTCATTGGGGACCCTG  850

seq1  TGCTCAGTCCAATGGAAGGTTGTGAACACCCTTCTGTATTTGTCAGGCAC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTCAGTCCAATGGAAGGTTGTGAACACCCTTCTGTATTTGTCAGGCAC  900

seq1  TGGCAGAGCCTCTCAGGGGACAGC-TATATCAGGCTCCTGTCAGCAAGCA  949
      |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||
seq2  TGGCAGAGCCTCTCAGGGGACAGCTTATATCA-GCTCCTGTCAGCAAGCA  949

seq1  CTTGTTGGCATCCACAATAGTGTCTGGGTTTGTTGATTGCATAGGGGATG  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGTTGGCATCCACAATAGTGTCTGGGTTTGTTGATTGCATAGGGGATG  999

seq1  GATCCCCAGGTGGGGTAGTCTCTGGATGGTCATTCCT  1036
      ||||||||   | |||||||||||||| |||||||||
seq2  GATCCCCA---GTGGTAGTCTCTGGAT-GTCATTCCT  1032