BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-273A24
Chromosome14 (Build37)
Map Location 35,282,136 - 35,432,138
singlet/doubletdoublet
Overlap geneBmpr1a, 9230112D13Rik, LOC665834, Ldb3, Opn4
Upstream geneFrmpd2, LOC100040093, Ptpn20, Gdf10, Gdf2, Rbp3, Zfp488, EG665754, EG432838, Antxrl, Anxa8, LOC100041131, LOC665768, Ppyr1, LOC100041163, Gprin2, Syt15, 3110001K24Rik, LOC623142, Glud1, LOC100041231, 2200001I15Rik, Sncg, Mmrn2
Downstream gene5830448L01Rik, Wapal, LOC100041341, Grid1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-273A24.bB6Ng01-273A24.g
ACCGA074729GA074730
length1,167994
definitionB6Ng01-273A24.b B6Ng01-273A24.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(35,430,967 - 35,432,138)(35,282,136 - 35,283,133)
sequence
gaattctctgtgcaggctgggccccgtggaaatcagctgcctctgcctcc
caggtgcagagactgcaagcacgtgccaccaggcttgactaaatagacat
tttcttcttcaaaactaattgtttagaatcgaacagagcccaaagccagg
ctagaggggaaagcgctttgtctcctgtaaattccaccttccctctcccc
ttgtcatcgtgtttcctgcggtttcaccttgaaataaggaaacaaaagct
tccctgtaccacggcaattgtgtggccatggaatacactaaatgaagagt
gacctgtgctccctaactggggtgagcaaaggtaacttggaggctggaca
tagggaaacagtagtgtccaaccccacccctacccccttccacctcaccc
acccaccctccgacagccctcacctaccatgctaagctgcttggagaagc
cagtctcaaacctcagccttggaggaaaatcgctacaggttcagcataga
tgtctgagacccagtcttcaacaaaccaacaaaacccaaaagcttagcca
gtccatctccactttgggttttgatttgccaaaatgaatttagttaaaac
atttgaatatgaactgcaaccccattcgagttaagttctaaagagagtat
gtaaaaaaacacggattttacaaaattattgattgattgatttagagata
gaatccagttatatggttccgactggcccagtactgctgtgcagaccagg
gtggcctcaaacttgcaacagtcctaagtcaggcgccaggatgttagcca
tagatagatacattagatagatgcatatgccactatggaaactaatcgac
tttgtcttacctgtaagtatttagtaacgatgtatctactgggtattaac
tgtctctactgcaaacctgagccctcccattttacagacactgtggagat
gactgacttctggcttgccatggctcctttccttcctggctgaagttagc
agaggagaacccctcatcccacactatcccacctctccagccaacagaga
cccttttcacagaacatagtcattgagtcttgagagctccttgagaaaca
agtcaaatacaagcctggaaaccttggaactgagtctactcagaagtcac
aagccaaaggatagggg
gaattctaggtcactcaagggtatacagggaaaccctgtctgggaaaaac
aaacaagaaccatggcctggcaacagtgacataatactgagccccattta
ctgaacactgccagttctatgtgttaagttctacatattcattgtcttgt
tcagttccttaagtaacctattagagaagcatacctattcattctatact
atagacaacctcatgagacatcagagactagacagagactccacaccaat
caatggcagtcatttaaggagttggataaagggaacctcatacactgttg
gtgggaaactaaactagtccagcaatggacagcagtatggcagtccctaa
aaaccctaaaacaatagttctaccatgcaacccagctatgtcactcctgt
gtatttatttactcagaagattccaaagcaacatgtcaagagatgcctgc
aacactatttacaatagctaagttactgagccaacataggcatcagcaac
aaagaaacgggtaaaaaaatatgtggcacatattcaccatcgaatttttt
tagaattagctttttgcaggaaaatggatgcaaacatggaaaaatcatta
agtgaattacatgtctcacaaactatgtattttgtgttttatcatttttg
tggttccttaattttatagatatataaaatctatagatacattaaaatgt
atctatatggcatattcccaacatgtagaggaaaagttgtctaggggaac
aaggagaaagggcacagatgggggtatggaggatatatacttggtgtaca
atacatagtcgtatgaaaatgtcctcatttaacacgttccatgtacaagg
aatataccaccatgaaaatttaaaaatcagagagaggctagagttgactc
agtagttagagagcttgtcgctcttagaggccctcagttcggctcctaga
acccacagagcatcatactgcatggcctccagttccaggatcca
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_35430967_35432138
seq2: B6Ng01-273A24.b_45_1211 (reverse)

seq1  CCCCTATCCTTTTGC-TGTGCCTTTCTGGGGTTAGACCTCATGTCCCAAG  49
      |||||||||||| || |||| | ||||| |  |||| ||||  ||| | |
seq2  CCCCTATCCTTTGGCTTGTGAC-TTCTGAG--TAGA-CTCAGTTCCAAGG  46

seq1  TTTCCA-GCTTGTATTTGACCT-TGTCTC-AGGAGCTCTCAAGGCTCAAT  96
      |||||| ||||||||||||| | | |||| ||||||||||||| ||||||
seq2  TTTCCAGGCTTGTATTTGACTTGTTTCTCAAGGAGCTCTCAAGACTCAAT  96

seq1  GACTATG-TCTGTGAAAAGGGTCCTTCCTGGTGGGCTGGAGGAGGTGGGG  145
      ||||||| |||||||||||||||  |    || ||||||| ||||| |||
seq2  GACTATGTTCTGTGAAAAGGGTCTCT----GTTGGCTGGA-GAGGT-GGG  140

seq1  ATAGTGTGGGATGAGGGGTTCTCCTCTGCTAACTTCAGCCAGGAAGG-AA  194
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  ATAGTGTGGGATGAGGGGTTCTCCTCTGCTAACTTCAGCCAGGAAGGAAA  190

seq1  GGAGCCATGGCAAGCCAGAAGTCAGTCATTCTCCACAGTGTCTGTAAAAT  244
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  GGAGCCATGGCAAGCCAGAAGTCAGTCA-TCTCCACAGTGTCTGTAAAAT  239

seq1  GGGAGGGCTCAGGTTTGCAGTAGAGACAGTTAATACCCAGTAGATACATC  294
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAGGGCTCAGGTTTGCAGTAGAGACAGTTAATACCCAGTAGATACATC  289

seq1  GTTACTAAATACTTACAGGTAAGACAAAGTCGATTAGTTTCCATAGTGGC  344
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTACTAAATACTTACAGGTAAGACAAAGTCGATTAGTTTCCATAGTGGC  339

seq1  ATATGCATCTATCTAATGTATCTATCTATGGCTAACATCCTGGCGCCTGA  394
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATGCATCTATCTAATGTATCTATCTATGGCTAACATCCTGGCGCCTGA  389

seq1  CTTAGGACTGTTGCAAGTTTGAGGCCACCCTGGTCTGCACAGCAGTACTG  444
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAGGACTGTTGCAAGTTTGAGGCCACCCTGGTCTGCACAGCAGTACTG  439

seq1  GGCCAGTCGGAACCATATAACTGGATTCTATCTCTAAATCAATCAATCAA  494
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCAGTCGGAACCATATAACTGGATTCTATCTCTAAATCAATCAATCAA  489

seq1  TAATTTTGTAAAATCCGTGTTTTTTTACATACTCTCTTTAGAACTTAACT  544
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATTTTGTAAAATCCGTGTTTTTTTACATACTCTCTTTAGAACTTAACT  539

seq1  CGAATGGGGTTGCAGTTCATATTCAAATGTTTTAACTAAATTCATTTTGG  594
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGAATGGGGTTGCAGTTCATATTCAAATGTTTTAACTAAATTCATTTTGG  589

seq1  CAAATCAAAACCCAAAGTGGAGATGGACTGGCTAAGCTTTTGGGTTTTGT  644
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATCAAAACCCAAAGTGGAGATGGACTGGCTAAGCTTTTGGGTTTTGT  639

seq1  TGGTTTGTTGAAGACTGGGTCTCAGACATCTATGCTGAACCTGTAGCGAT  694
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTTTGTTGAAGACTGGGTCTCAGACATCTATGCTGAACCTGTAGCGAT  689

seq1  TTTCCTCCAAGGCTGAGGTTTGAGACTGGCTTCTCCAAGCAGCTTAGCAT  744
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCTCCAAGGCTGAGGTTTGAGACTGGCTTCTCCAAGCAGCTTAGCAT  739

seq1  GGTAGGTGAGGGCTGTCGGAGGGTGGGTGGGTGAGGTGGAAGGGGGTAGG  794
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTAGGTGAGGGCTGTCGGAGGGTGGGTGGGTGAGGTGGAAGGGGGTAGG  789

seq1  GGTGGGGTTGGACACTACTGTTTCCCTATGTCCAGCCTCCAAGTTACCTT  844
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGGGGTTGGACACTACTGTTTCCCTATGTCCAGCCTCCAAGTTACCTT  839

seq1  TGCTCACCCCAGTTAGGGAGCACAGGTCACTCTTCATTTAGTGTATTCCA  894
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTCACCCCAGTTAGGGAGCACAGGTCACTCTTCATTTAGTGTATTCCA  889

seq1  TGGCCACACAATTGCCGTGGTACAGGGAAGCTTTTGTTTCCTTATTTCAA  944
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCCACACAATTGCCGTGGTACAGGGAAGCTTTTGTTTCCTTATTTCAA  939

seq1  GGTGAAACCGCAGGAAACACGATGACAAGGGGAGAGGGAAGGTGGAATTT  994
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGAAACCGCAGGAAACACGATGACAAGGGGAGAGGGAAGGTGGAATTT  989

seq1  ACAGGAGACAAAGCGCTTTCCCCTCTAGCCTGGCTTTGGGCTCTGTTCGA  1044
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGGAGACAAAGCGCTTTCCCCTCTAGCCTGGCTTTGGGCTCTGTTCGA  1039

seq1  TTCTAAACAATTAGTTTTGAAGAAGAAAATGTCTATTTAGTCAAGCCTGG  1094
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTAAACAATTAGTTTTGAAGAAGAAAATGTCTATTTAGTCAAGCCTGG  1089

seq1  TGGCACGTGCTTGCAGTCTCTGCACCTGGGAGGCAGAGGCAGCTGATTTC  1144
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCACGTGCTTGCAGTCTCTGCACCTGGGAGGCAGAGGCAGCTGATTTC  1139

seq1  CACGGGGCCCAGCCTGCACAGAGAATTC  1172
      ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACGGGGCCCAGCCTGCACAGAGAATTC  1167

seq1: chr14_35282136_35283133
seq2: B6Ng01-273A24.g_61_1054

seq1  GAATTCTAGGTCACTCAAGGGTATACAGGGAAACCCTGTCTGGGAAAAAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTAGGTCACTCAAGGGTATACAGGGAAACCCTGTCTGGGAAAAAC  50

seq1  AAACAAGAACCATGGCCTGGCAACAGTGACATAATACTGAGCCCCATTTA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACAAGAACCATGGCCTGGCAACAGTGACATAATACTGAGCCCCATTTA  100

seq1  CTGAACACTGCCAGTTCTATGTGTTAAGTTCTACATATTCATTGTCTTGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAACACTGCCAGTTCTATGTGTTAAGTTCTACATATTCATTGTCTTGT  150

seq1  TCAGTTCCTTAAGTAACCTATTAGAGAAGCATACCTATTCATTCTATACT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGTTCCTTAAGTAACCTATTAGAGAAGCATACCTATTCATTCTATACT  200

seq1  ATAGACAACCTCATGAGACATCAGAGACTAGACAGAGACTCCACACCAAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGACAACCTCATGAGACATCAGAGACTAGACAGAGACTCCACACCAAT  250

seq1  CAATGGCAGTCATTTAAGGAGTTGGATAAAGGGAACCTCATACACTGTTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATGGCAGTCATTTAAGGAGTTGGATAAAGGGAACCTCATACACTGTTG  300

seq1  GTGGGAAACTAAACTAGTCCAGCAATGGACAGCAGTATGGCAGTCCCTAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGGAAACTAAACTAGTCCAGCAATGGACAGCAGTATGGCAGTCCCTAA  350

seq1  AAACCCTAAAACAATAGTTCTACCATGCAACCCAGCTATGTCACTCCTGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACCCTAAAACAATAGTTCTACCATGCAACCCAGCTATGTCACTCCTGT  400

seq1  GTATTTATTTACTCAGAAGATTCCAAAGCAACATGTCAAGAGATGCCTGC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATTTATTTACTCAGAAGATTCCAAAGCAACATGTCAAGAGATGCCTGC  450

seq1  AACACTATTTACAATAGCTAAGTTACTGAGCCAACATAGGCATCAGCAAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACACTATTTACAATAGCTAAGTTACTGAGCCAACATAGGCATCAGCAAC  500

seq1  AAAGAAACGGGTAAAAAAATATGTGGCACATATTCACCATCGAATTTTTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGAAACGGGTAAAAAAATATGTGGCACATATTCACCATCGAATTTTTT  550

seq1  TAGAATTAGCTTTTTGCAGGAAAATGGATGCAAACATGGAAAAATCATTA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAATTAGCTTTTTGCAGGAAAATGGATGCAAACATGGAAAAATCATTA  600

seq1  AGTGAATTACATGTCTCACAAACTATGTATTTTGTGTTTTATCATTTTTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGAATTACATGTCTCACAAACTATGTATTTTGTGTTTTATCATTTTTG  650

seq1  TGGTTCCTTAATTTTATAGATATATAAAATCTATAGATACATTAAAATGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTTCCTTAATTTTATAGATATATAAAATCTATAGATACATTAAAATGT  700

seq1  ATCTATATGGCATATT-CCAACATGTAGAGGAAAAGTTGTCTAGGGGAAC  749
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTATATGGCATATTCCCAACATGTAGAGGAAAAGTTGTCTAGGGGAAC  750

seq1  AAGGAG-AAGGGCACAGATGGGGGTATGGAGGATATATACTTGGTGTACA  798
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGAGAAAGGGCACAGATGGGGGTATGGAGGATATATACTTGGTGTACA  800

seq1  ATACATAGTCGTATGAAAATGTCCTCATTTAACACGTTCCATGTACAAGG  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACATAGTCGTATGAAAATGTCCTCATTTAACACGTTCCATGTACAAGG  850

seq1  AATATA-CACCATGAAAATTTAAAAATCAGAGAGAGGCTAGAGTTGACTC  897
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATATACCACCATGAAAATTTAAAAATCAGAGAGAGGCTAGAGTTGACTC  900

seq1  AGTAGTTAAGAGAGCTTGTCGCTCTTAGAGGCCCTCAGTTCGGCTCCTAG  947
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTAGTT-AGAGAGCTTGTCGCTCTTAGAGGCCCTCAGTTCGGCTCCTAG  949

seq1  AACCCACAGAGCAATTCATTACTGCATGGGCCTCCAGTTCCAGGGGATCC  997
      |||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||
seq2  AACCCACAGAGCA--TCA-TACTGCAT-GGCCTCCAGTTCCA--GGATCC  993

seq1  A  998
      |
seq2  A  994