BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-274H19
Chromosome14 (Build37)
Map Location 85,937,366 - 86,047,636
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC629794, LOC668603
Downstream geneLOC100043301, EG629815, LOC100043306, LOC100043778, LOC100043310, LOC100043311
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-274H19.bB6Ng01-274H19.g
ACCGA075776GA075777
length1,1051,143
definitionB6Ng01-274H19.b B6Ng01-274H19.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(85,937,366 - 85,938,302)(86,046,495 - 86,047,636)
sequence
gaattcactttgtagaccaggctggcctcaaactcagaaatccgcctgcc
tctgcctcctgagtgctgggattaaaggcgtgtgccaccacgcctgacta
gcaataatttttaagtcacatgttagcatagttttgtcaagagacagtca
tctgtgtcttgttagttttgatgttttgtatagataaactcatcaatatt
ttgttttctgtccttgcacctatccattcccaggttatgagcttcagtta
cgagataatgatctctgacacctaatgtagaaggaatgtcttccttgacc
ataaatttgttttaagcctgcttttttctcccctactgcaattagactgt
gaggcatgaaaggttacagagctctatttacagcttttactctatagagg
gcttgaagttacttgtatcaatttaggaattctataaagtcattattagg
aattaagaaaccatcaattcatttacacagcattcctacatgaccatatc
ttcactttgattctggagggaatctgctcagtatggtgaattaatgccag
gaatcatcagactatggaatagtggtagaaaaggcatatgagcagcaaga
agcaatcctaggataaagtctctaaggaccttgcatctcagagctcaccc
atcataggccatgcaaaatggtggacatatacttgatggcttttgacaca
taacatttgtgacactatcacacaagtgtgtcttgcaggcagataatttt
gatgaggtatgatatattactgagaatgagcatggtagaagaaatagctc
ctcagaaaacttcagctgtagtcagattaaaattacatgtagaacaaaac
aaaaattccagtcatgaaacttatgcctatgcttctgtttatagaaatac
tgaattccccccccaccaccaccaccaaaaaatgtttagatttcacactt
agcttctttaggaagaaagacatgatgaaaggccatggttctcctgtatc
tctcattttttagtgcttgtgatgtatatagtgtaccacactatttctga
tagcattgagccaaattattggtcaacatcacttaataaaacatggggat
ataaa

gaattccactcagtccttttattccatgccaggaggattgtggaagggcc
tagctgaatagctgtttttagtgttctgtttctctcataaaatgtttctc
aaaattagaaattatgcttttcaccaagcaaggcacacacacacacacac
acaccttgcatgaactcagtacatactagatacatgaatgaaaaattaaa
gtgtttctatttgagtggctgaattacttatataaaggatgctatttcaa
acacagtattgatggaagatgggaaagatgcagagatgaggttcctttgt
gctagacatattatgattatttaaaaaatgttttgaacaagaagatttat
atacataaatttaaaaatgaaatgagtttacagatgacaaattaaatgac
ttggtatttcttagttagctatatgtgtacacacatgaatgtttccacat
gtgcattactaactaggtaagagaaatatacagatcatatggacagccat
cattgagtttgtatacatctactttttaggagagtcaaattagtaaagtc
acaaatattatcatgactttaagtaaagtataaagtcattgattactcat
aaaatgtttggacatctctgttcaagatatcagtcacagttttatggtga
cagaaaatataattaaaactactacaatttcctttacagttcttccagat
acaagaaaatagaatgatggaacatctatatggaatatttaaggaccgtg
tgtagataagttacacattatctatcatctatctatctctatctatcatc
tatctacttatcaatctatatctatctgcatttattatctctctctctaa
ctctattatctatctaatctagtatcacctatctgtatatcatctatctt
atattgataagtattctctatttgtatcatctatttatctatttattata
tatctgtcatttatctaccttatctatgaatctatcacctatcatctatc
tgtgattatctagagtaaagctaaacaaaaatgttaataggttagtttga
agaaataaaaaaatttcgttgagtgtctatcatgacatgattcttcatat
ggaaaaaaatatcgatattggtgtgattcactttcaagtgtga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_85937366_85938302
seq2: B6Ng01-274H19.b_222_1146

seq1  TAGATAAACTCATCAATATTTTGTTTTCTGTCCTTGCACCTATCCATTCC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGATAAACTCATCAATATTTTGTTTTCTGTCCTTGCACCTATCCATTCC  50

seq1  CAGGTTATGAGCTTCAGTTACGAGATAATGATCTCTGACACCTAATGTAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGTTATGAGCTTCAGTTACGAGATAATGATCTCTGACACCTAATGTAG  100

seq1  AAGGAATGTCTTCCTTGACCATAAATTTGTTTTAAGCCTGCTTTTTTCTC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGAATGTCTTCCTTGACCATAAATTTGTTTTAAGCCTGCTTTTTTCTC  150

seq1  CCCTACTGCAATTAGACTGTGAGGCATGAAAGGTTACAGAGCTCTATTTA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTACTGCAATTAGACTGTGAGGCATGAAAGGTTACAGAGCTCTATTTA  200

seq1  CAGCTTTTACTCTATAGAGGGCTTGAAGTTACTTGTATCAATTTAGGAAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCTTTTACTCTATAGAGGGCTTGAAGTTACTTGTATCAATTTAGGAAT  250

seq1  TCTATAAAGTCATTATTAGGAATTAAGAAACCATCAATTCATTTACACAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTATAAAGTCATTATTAGGAATTAAGAAACCATCAATTCATTTACACAG  300

seq1  CATTCCTACATGACCATATCTTCACTTTGATTCTGGAGGGAATCTGCTCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTCCTACATGACCATATCTTCACTTTGATTCTGGAGGGAATCTGCTCA  350

seq1  GTATGGTGAATTAATGCCAGGAATCATCAGACTATGGAATAGTGGTAGAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATGGTGAATTAATGCCAGGAATCATCAGACTATGGAATAGTGGTAGAA  400

seq1  AAGGCATATGAGCAGCAAGAAGCAATCCTAGGATAAAGTCTCTAAGGACC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGCATATGAGCAGCAAGAAGCAATCCTAGGATAAAGTCTCTAAGGACC  450

seq1  TTGCATCTCAGAGCTCACCCATCATAGGCCATGCAAAATGGTGGACATAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCATCTCAGAGCTCACCCATCATAGGCCATGCAAAATGGTGGACATAT  500

seq1  ACTTGATGGCTTTTGACACATAACATTTGTGACACTATCACACAAGTGTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTGATGGCTTTTGACACATAACATTTGTGACACTATCACACAAGTGTG  550

seq1  TCTTGCAGGCAGATAATTTTGATGAGGTATGATATATTACTGAGAATGAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTGCAGGCAGATAATTTTGATGAGGTATGATATATTACTGAGAATGAG  600

seq1  CATGGTAGAAGAAATAGCTCCTCAGAAAACTTCAGCTGTAGTCAGATTAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGGTAGAAGAAATAGCTCCTCAGAAAACTTCAGCTGTAGTCAGATTAA  650

seq1  AATTACATGTAGAACAAAACAAAAATTCCAGTCATGAAACTTATGCCTAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTACATGTAGAACAAAACAAAAATTCCAGTCATGAAACTTATGCCTAT  700

seq1  GCTTCTGTTTATAGAAATACTGAATTCCCCCCCCACCACCACCACCAAAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTCTGTTTATAGAAATACTGAATTCCCCCCCCACCACCACCACCAAAA  750

seq1  AATGTTTAGATTTCACACTTAGCTTCTTTAGGAAGAAAGACATGATG-AA  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  AATGTTTAGATTTCACACTTAGCTTCTTTAGGAAGAAAGACATGATGAAA  800

seq1  GGCCATGGTTCTCCTGTTATCTCTCATTTTTTAGTGCTTTGTGAATGTTA  849
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||  
seq2  GGCCATGGTTCTCCTG-TATCTCTCATTTTTTAGTGC-TTGTG-ATGT--  845

seq1  TTATAGTGTACCAACACTATTTCTGATAGCCATTTGAGGCCAAATTATTT  899
       ||||||||||| |||||||||||||||||   |||| ||||||||| ||
seq2  ATATAGTGTACC-ACACTATTTCTGATAGC--ATTGA-GCCAAATTA-TT  890

seq1  GGTCAACATCAACTTTAAATAAAACATGGGGATATAAA  937
      |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||
seq2  GGTCAACATC-ACTT--AATAAAACATGGGGATATAAA  925


seq1: chr14_86046495_86047636
seq2: B6Ng01-274H19.g_63_1205 (reverse)

seq1  TCACACTTG-AAGTG-ATCACACCATATTTGATATTTTTTTCATTATGAA  48
      ||||||||| ||||| |||||||||   | ||||||||||||  ||||||
seq2  TCACACTTGAAAGTGAATCACACCAATATCGATATTTTTTTCCATATGAA  50

seq1  G-ATCATGTTCATGATAGACACTCAACCAAAATTTTTTTATTTCTTCAAA  97
      | |||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||
seq2  GAATCATG-TCATGATAGACACTCAA-CGAAATTTTTTTATTTCTTCAAA  98

seq1  CTTAACCTATTAACATTTTTGTTTAGCTTTACTCTAGATAATCACAGATA  147
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  C-TAACCTATTAACATTTTTGTTTAGCTTTACTCTAGATAATCACAGATA  147

seq1  GATGATAGGTGATAGATTCATAGAT-AGGTAGATAAATGACAGATATATA  196
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGATAGGTGATAGATTCATAGATAAGGTAGATAAATGACAGATATATA  197

seq1  ATAAATAGATAAATAGATGATACAAATAGAGAATACTTATCAATATAAGA  246
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAATAGATAAATAGATGATACAAATAGAGAATACTTATCAATATAAGA  247

seq1  TAGATGATATACAGATAGGTGATACTAGATTAGATAGATAATAGAGTTAG  296
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGATGATATACAGATAGGTGATACTAGATTAGATAGATAATAGAGTTAG  297

seq1  AGAGAGAGATAATAAATGCAGATAGATATAGATTGATAAGTAGATAGATG  346
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAGAGATAATAAATGCAGATAGATATAGATTGATAAGTAGATAGATG  347

seq1  ATAGATAGAGATAGATAGATGATAGATAATGTGTAACTTATCTACACACG  396
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGATAGAGATAGATAGATGATAGATAATGTGTAACTTATCTACACACG  397

seq1  GTCCTTAAATATTCCATATAGATGTTCCATCATTCTATTTTCTTGTATCT  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCTTAAATATTCCATATAGATGTTCCATCATTCTATTTTCTTGTATCT  447

seq1  GGAAGAACTGTAAAGGAAATTGTAGTAGTTTTAATTATATTTTCTGTCAC  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAGAACTGTAAAGGAAATTGTAGTAGTTTTAATTATATTTTCTGTCAC  497

seq1  CATAAAACTGTGACTGATATCTTGAACAGAGATGTCCAAACATTTTATGA  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAAAACTGTGACTGATATCTTGAACAGAGATGTCCAAACATTTTATGA  547

seq1  GTAATCAATGACTTTATACTTTACTTAAAGTCATGATAATATTTGTGACT  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAATCAATGACTTTATACTTTACTTAAAGTCATGATAATATTTGTGACT  597

seq1  TTACTAATTTGACTCTCCTAAAAAGTAGATGTATACAAACTCAATGATGG  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACTAATTTGACTCTCCTAAAAAGTAGATGTATACAAACTCAATGATGG  647

seq1  CTGTCCATATGATCTGTATATTTCTCTTACCTAGTTAGTAATGCACATGT  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTCCATATGATCTGTATATTTCTCTTACCTAGTTAGTAATGCACATGT  697

seq1  GGAAACATTCATGTGTGTACACATATAGCTAACTAAGAAATACCAAGTCA  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAACATTCATGTGTGTACACATATAGCTAACTAAGAAATACCAAGTCA  747

seq1  TTTAATTTGTCATCTGTAAACTCATTTCATTTTTAAATTTATGTATATAA  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAATTTGTCATCTGTAAACTCATTTCATTTTTAAATTTATGTATATAA  797

seq1  ATCTTCTTGTTCAAAACATTTTTTAAATAATCATAATATGTCTAGCACAA  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTTCTTGTTCAAAACATTTTTTAAATAATCATAATATGTCTAGCACAA  847

seq1  AGGAACCTCATCTCTGCATCTTTCCCATCTTCCATCAATACTGTGTTTGA  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAACCTCATCTCTGCATCTTTCCCATCTTCCATCAATACTGTGTTTGA  897

seq1  AATAGCATCCTTTATATAAGTAATTCAGCCACTCAAATAGAAACACTTTA  946
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAGCATCCTTTATATAAGTAATTCAGCCACTCAAATAGAAACACTTTA  947

seq1  ATTTTTCATTCATGTATCTAGTATGTACTGAGTTCATGCAAGGTGTGTGT  996
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTTCATTCATGTATCTAGTATGTACTGAGTTCATGCAAGGTGTGTGT  997

seq1  GTGTGTGTGTGTGCCTTGCTTGGTGAAAAGCATAATTTCTAATTTTGAGA  1046
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTGTGTGTGCCTTGCTTGGTGAAAAGCATAATTTCTAATTTTGAGA  1047

seq1  AACATTTTATGAGAGAAACAGAACACTAAAAACAGCTATTCAGCTAGGCC  1096
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACATTTTATGAGAGAAACAGAACACTAAAAACAGCTATTCAGCTAGGCC  1097

seq1  CTTCCACAATCCTCCTGGCATGGAATAAAAGGACTGAGTGGAATTC  1142
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCCACAATCCTCCTGGCATGGAATAAAAGGACTGAGTGGAATTC  1143


| Home | SequenceCutter | Blast | Download |