BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-282N21
Chromosome14 (Build37)
Map Location 64,281,839 - 64,395,966
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneE130113E03Rik, Ints6, LOC100042969, LOC668263, Wdfy2, LOC668268, EG432867, EG654465, EG654458, 2410125J01Rik, Defb42, LOC100042978, Ctsb, Fdft1, Neil2, Gata4, LOC100042988, LOC432868, Blk, LOC668293, BC065085, Tdh, Mtmr9
Downstream geneXkr6, LOC668306, 2610028A01Rik, Sox7, 4930578I06Rik, Rp1l1, 4933401F05Rik, 1700007N14Rik, 1700049K14Rik, Msra, Kif13b
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-282N21.bB6Ng01-282N21.g
ACCGA081968GA081969
length7161,135
definitionB6Ng01-282N21.b B6Ng01-282N21.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(64,281,839 - 64,282,547)(64,394,821 - 64,395,966)
sequence
gaattcctacctggaaatcatctcacaaggtctgtattagaatatgtaaa
attttttaaactaatatatgtgtagcaaaatgccgccagtttttaaaatc
aggcattattgtagatcagaggtgtttgtgtcgagggaataaggatggct
gttttcacgttcttcctgtctcctccttgtcagttgaagagttagtggga
aggggttagtggtctgtggaaagaggaaaagacaaggcttgaatttcctg
aaaggattaatttccctaaaacaaaacaaaacaaaacaaaacaaaacacc
aaacacccgtaagtgggtttccttccctgtgtgggtgggagagtgttcat
ctaaggacagatggatggtggtgtcgggtgcagagtagagtcgctgtagt
tatccttggtgattccttgtccttcgtctgcctcctgcacctgctggaat
tcagagacttgaggaagctcagttacttcatcagtgtgaaaactgtccta
actgattgcagggaccacagttagagaggacagcctggaagggggaggga
gctcagagagcttctggtgagtcggccattgttcctggacaccatcctca
cctgcagtcactgctattcctcagatttcggtgaggaggtttttcagaga
ctgaaagagctgttccccttggtcattggccccccttctaattaaaatgt
aatggacatacatctt
gaattcccactaggtgctgggctggctgccatctttgcataatcgtctca
tttgatcctgagcacattcccgagaagggaggtgtgagtctcaatttaca
gataagggacaaagattccagggtgtcaaacggtatgctcaaggtcacag
aggaccttgtctaacactcaaaaccagctgtctcaaaatccagctgttct
cccctcccttatctcctcacccactcaatcctcaggagggatgctggttc
tgggctagaatgagaactacaggtacaggccatgggtgagcagggacagc
atatgccactgcctaaagtctcagggaaggcagaatgagcacacagaacc
cagcctaagaagtcgggctttttctaagcacaaagggaaagctaccaata
agatttcaacagggaagcagcaagagccaattgaccaattaagaagatca
ctgtggcattggtgtgccaaccagctgggaatctggtggccatgtgtcag
gcaattggcgacaggcaacattccaagaatggggtcgtgggaacttgaat
gaggcattatgggaacttcgggctggagagactttggaacactggctgtc
tttttcacagagctggggtgtgactaccggacccacgagctgtgactggt
ggaggaagcagtagccagagccatcttgggagccagagttggatgcagcc
ttaggatgggaatggaatgcccagcaaatactcggtgataaagacctctg
aagtcaaggctgtggggattaggagggtagctcaggtacttaaagtgcct
gccacacaagaatgaagactggatttcagatccccaggacctacataaaa
gccaagggcctgtgccttctatctatcacctccacactgggaggagacag
agcccagtggacccctcagtccattgggccagacagcctaggagactgct
gaacccaaggtctagtcagagaccctgtctcttaagggatagtgatgata
actggaaagacagtgcatcacttctgctcacattcacatgtatacagcac
acacaacatcacgcacaccagcacacgcatgttgcctagcatgcaacgta
tacaagcccacatgaacaccgaagcattacatacc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_64281839_64282547
seq2: B6Ng01-282N21.b_45_760

seq1  GAATTCCTACCTGGAAATCATCTCACAAGGTCTGTATTAGAATATGTAAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTACCTGGAAATCATCTCACAAGGTCTGTATTAGAATATGTAAA  50

seq1  ATTTTTTAAACTAATATATGTGTAGCAAAATGCCGCCAGTTTTTAAAATC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTTTAAACTAATATATGTGTAGCAAAATGCCGCCAGTTTTTAAAATC  100

seq1  AGGCATTATTGTAGATCAGAGGTGTTTGTGTCGAGGGAATAAGGATGGCT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCATTATTGTAGATCAGAGGTGTTTGTGTCGAGGGAATAAGGATGGCT  150

seq1  GTTTTCACGTTCTTCCTGTCTCCTCCTTGTCAGTTGAAGAGTTAGTGGGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTTCACGTTCTTCCTGTCTCCTCCTTGTCAGTTGAAGAGTTAGTGGGA  200

seq1  AGGGGTTAGTGGTCTGTGGAAAGAGGAAAAGACAAGGCTTGAATTTCCTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGGTTAGTGGTCTGTGGAAAGAGGAAAAGACAAGGCTTGAATTTCCTG  250

seq1  AAAGGATTAATTTCCCTAAAACAAAACAAAACAAAACAAAACAAAACACC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGGATTAATTTCCCTAAAACAAAACAAAACAAAACAAAACAAAACACC  300

seq1  AAACACCCGTAAGTGGGTTTCCTTCCCTGTGTGGGTGGGAGAGTGTTCAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACACCCGTAAGTGGGTTTCCTTCCCTGTGTGGGTGGGAGAGTGTTCAT  350

seq1  CTAAGGACAGATGGATGGTGGTGTCGGGTGCAGAGTAGAGTCGCTGTAGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAGGACAGATGGATGGTGGTGTCGGGTGCAGAGTAGAGTCGCTGTAGT  400

seq1  TATCCTTGGTGATTCCTTGTCCTTCGTCTGCCTCCTGCACCTGCTGGAAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCCTTGGTGATTCCTTGTCCTTCGTCTGCCTCCTGCACCTGCTGGAAT  450

seq1  TCAGAGACTTGAGGAAGCTCAGTTACTTCATCAGTGTGAAAACTGTCCTA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGAGACTTGAGGAAGCTCAGTTACTTCATCAGTGTGAAAACTGTCCTA  500

seq1  ACTGATTGCAGGGACCACAGTTAGAGAGGACAGCCTGGAAGGGGGAGGGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGATTGCAGGGACCACAGTTAGAGAGGACAGCCTGGAAGGGGGAGGGA  550

seq1  GCTCAGGAGAGCTTCTGGTGAGTCGGCCATTGTTCCTGGACACCATCCTC  600
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCA-GAGAGCTTCTGGTGAGTCGGCCATTGTTCCTGGACACCATCCTC  599

seq1  ACCTGCAGTCACTGCTA-TCCTCAGATTTCGGTGAGGAGG-TTTTCAGAG  648
      ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  ACCTGCAGTCACTGCTATTCCTCAGATTTCGGTGAGGAGGTTTTTCAGAG  649

seq1  ACTG-AAGAGCTGTACCC--TTGTCAGTGG-CCCCCTTCTAATTAAAATG  694
      |||| ||||||||| |||  | |||| ||| |||||||||||||||||||
seq2  ACTGAAAGAGCTGTTCCCCTTGGTCATTGGCCCCCCTTCTAATTAAAATG  699

seq1  TAAT-GACAT-CATCTT  709
      |||| ||||| ||||||
seq2  TAATGGACATACATCTT  716

seq1: chr14_64394821_64395966
seq2: B6Ng01-282N21.g_67_1201 (reverse)

seq1  GGTATGT-ATGCTTTGGTGTTCATGTGGGTATGTATATGTGTGCATGCTA  49
      ||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||| || |||||||||
seq2  GGTATGTAATGCTTCGGTGTTCATGTGGGCTTGTATACGT-TGCATGCTA  49

seq1  GGGCACATGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCTTGTATAC  99
      ||  |||||||||||   ||||| |||  ||| ||||||||| |||||||
seq2  GGCAACATGCGTGTGCTGGTGTGCGTG-ATGT-TGTGTGTGC-TGTATAC  96

seq1  ATGTGAATGTGGAAGCCAGAAGTTGATGGCCACTGTCTTTCCCAGTTATC  149
      |||||||||||  || |||||| |||||  |||||||||| |||||||| 
seq2  ATGTGAATGTG--AG-CAGAAG-TGATG--CACTGTCTTT-CCAGTTAT-  138

seq1  CATCACCTATCCCTT-AGAGACAGGGTCTCTGACTAGACCTTGGGTTCAG  198
      ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCA-CTATCCCTTAAGAGACAGGGTCTCTGACTAGACCTTGGGTTCAG  187

seq1  CAGTTCTCCTAGGCTGTCTGG-CCAATGGACTTGAGGGGTCCACTTGGCT  247
      ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||
seq2  CAG-TCTCCTAGGCTGTCTGGCCCAATGGAC-TGAGGGGTCCACTGGGCT  235

seq1  CTGTCTCCTCCCAGTGTGGAGGTGATAGATAGAAGGCACAGG-CCTTGGC  296
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  CTGTCTCCTCCCAGTGTGGAGGTGATAGATAGAAGGCACAGGCCCTTGGC  285

seq1  TTTTATGTAGGTCCTGGGGATCTGAAATCCAGTCTTCATTCTTGTGTGGC  346
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTATGTAGGTCCTGGGGATCTGAAATCCAGTCTTCATTCTTGTGTGGC  335

seq1  AGGCACTTTAAGTACCTGAGCTACCCTCCTAATCCCCACAGCCTTGACTT  396
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCACTTTAAGTACCTGAGCTACCCTCCTAATCCCCACAGCCTTGACTT  385

seq1  CAGAGGTCTTTATCACCGAGTATTTGCTGGGCATTCCATTCCCATCCTAA  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGGTCTTTATCACCGAGTATTTGCTGGGCATTCCATTCCCATCCTAA  435

seq1  GGCTGCATCCAACTCTGGCTCCCAAGATGGCTCTGGCTACTGCTTCCTCC  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTGCATCCAACTCTGGCTCCCAAGATGGCTCTGGCTACTGCTTCCTCC  485

seq1  ACCAGTCACAGCTCGTGGGTCCGGTAGTCACACCCCAGCTCTGTGAAAAA  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAGTCACAGCTCGTGGGTCCGGTAGTCACACCCCAGCTCTGTGAAAAA  535

seq1  GACAGCCAGTGTTCCAAAGTCTCTCCAGCCCGAAGTTCCCATAATGCCTC  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAGCCAGTGTTCCAAAGTCTCTCCAGCCCGAAGTTCCCATAATGCCTC  585

seq1  ATTCAAGTTCCCACGACCCCATTCTTGGAATGTTGCCTGTCGCCAATTGC  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCAAGTTCCCACGACCCCATTCTTGGAATGTTGCCTGTCGCCAATTGC  635

seq1  CTGACACATGGCCACCAGATTCCCAGCTGGTTGGCACACCAATGCCACAG  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGACACATGGCCACCAGATTCCCAGCTGGTTGGCACACCAATGCCACAG  685

seq1  TGATCTTCTTAATTGGTCAATTGGCTCTTGCTGCTTCCCTGTTGAAATCT  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATCTTCTTAATTGGTCAATTGGCTCTTGCTGCTTCCCTGTTGAAATCT  735

seq1  TATTGGTAGCTTTCCCTTTGTGCTTAGAAAAAGCCCGACTTCTTAGGCTG  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTGGTAGCTTTCCCTTTGTGCTTAGAAAAAGCCCGACTTCTTAGGCTG  785

seq1  GGTTCTGTGTGCTCATTCTGCCTTCCCTGAGACTTTAGGCAGTGGCATAT  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTCTGTGTGCTCATTCTGCCTTCCCTGAGACTTTAGGCAGTGGCATAT  835

seq1  GCTGTCCCTGCTCACCCATGGCCTGTACCTGTAGTTCTCATTCTAGCCCA  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGTCCCTGCTCACCCATGGCCTGTACCTGTAGTTCTCATTCTAGCCCA  885

seq1  GAACCAGCATCCCTCCTGAGGATTGAGTGGGTGAGGAGATAAGGGAGGGG  946
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACCAGCATCCCTCCTGAGGATTGAGTGGGTGAGGAGATAAGGGAGGGG  935

seq1  AGAACAGCTGGATTTTGAGACAGCTGGTTTTGAGTGTTAGACAAGGTCCT  996
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAACAGCTGGATTTTGAGACAGCTGGTTTTGAGTGTTAGACAAGGTCCT  985

seq1  CTGTGACCTTGAGCATACCGTTTGACACCCTGGAATCTTTGTCCCTTATC  1046
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGACCTTGAGCATACCGTTTGACACCCTGGAATCTTTGTCCCTTATC  1035

seq1  TGTAAATTGAGACTCACACCTCCCTTCTCGGGAATGTGCTCAGGATCAAA  1096
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAAATTGAGACTCACACCTCCCTTCTCGGGAATGTGCTCAGGATCAAA  1085

seq1  TGAGACGATTATGCAAAGATGGCAGCCAGCCCAGCACCTAGTGGGAATTC  1146
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGACGATTATGCAAAGATGGCAGCCAGCCCAGCACCTAGTGGGAATTC  1135