BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-285F04
Chromosome14 (Build37)
Map Location 28,692,183 - 28,867,496
singlet/doubletdoublet
Overlap geneErc2
Upstream geneDnahc7c, Asb14, Appl1, Hesx1, Il17rd, LOC665333, Arhgef3, LOC100040147, Ccdc66, LOC665370
Downstream geneLOC100040206, Wnt5a, LOC100040218, Cacna2d3, Lrtm1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-285F04.bB6Ng01-285F04.g
ACCGA083802GA083803
length1,1901,092
definitionB6Ng01-285F04.b B6Ng01-285F04.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(28,866,312 - 28,867,496)(28,692,183 - 28,693,281)
sequence
gaattctttcatgtgctcctataaggtttccttctctaagcagaagatta
atttcctatctgcactggcatttgccagatgacgctttcaacatttctgc
taaaaagtcaacttctcagtggcctagtgaggagcctggagactttatta
tagacattcagctttctgacaagaggaacaatgacacacttctcttgtaa
acacaatgctctcacctattcctcatggcataaaaacctttgtcatagcc
aaaccataacaactaaaatcactgccatttacaaatgtctgtctgagcct
ggactgtgttccatgttcagtgagaatcatggccctgagcctctgagtga
taagcagtaacacagatgtcctcattttacacacaagagacttagacatg
acctaccttgtcacatgtactaactgtacaatgatgacactaacttttgg
aatgtagtctatctatgttcctacatttactgttccaacaatagataata
acttgaaaaaaaactggactaagagtgaaataatatagcataatgtttgt
tctaggacagacacccatgaaacccaagtgccatgatgctttatctggtc
aggaatccctagagtctctacttagcatgcttagatgatgcaggagtgcc
cacacttagcagagtgataggacacctatctgccaattacccagtgagtg
tttctcactaaggcccattcattgcaggttatcaggagattcgccagctg
gcaattactagcctgctcattctctccacagccattatctgtgagcaaca
cagcatgctatccttggaaccatcaaactgaccaatggttcaatagcaga
gggctctgaagttaaatttaaaactactctcttacacttcagctcacaca
tttcagttcagcctggagaataccccagttgaccaatgccaaaggccagg
agagcctgtcccaggaggatgaccctatctgagcaagttgctgcttgcct
tgtcaatgccttctaacaaggtcttccagatctgaaatgcagattgcaag
cagttctccatgaatctgcccttccccacaacaaactatctaccattgtg
cttcacagtaacagaactaagggccctcatgcaggtagctcattgcttcc
aagcctctgtgtggcaatcaacactctttgtgaccccttg
gaattccaggacagccagagctacacagagaaaccctgtctcaaaaaaaa
aaaaaaaaaaattagagtaagttttgggaacccagacagtacaagcctta
gaggtgactcctgaacagaacttaaactcagaggttggaatttcagattg
ctttttgtcttggttttggccaaaaatcaccattgttaactagtgctttg
ccaaatctaaagttaaataaaaggaatagtttgctttgtagaggcagtct
cgtgtcttatgcatctctcatactggcctcaaatttactatgtaaccaag
gatgaccatgaactaacacctgatcctcctgtctctccttccaaaataac
agggttccatgtgccattatgccctgttcagaagtacagaaaagcctctc
tatgagccccctaatttcaggaagatgacataaattagagctgacaagat
attccatacttgtcccttgttccttagggaaactgagggtgaagttctga
actccatttgtttccacaacatttgcatcagctctgcaacggggcttcct
gcaagggtctgcagaatcctgcttctctcaagctttgtgtgagcttcaac
ccactgctctctgggaactctgtgtgccctacagacttgctgatctgtgt
ggaagtctctgcaggtcctggagaagggacctgtatcccgataggggatg
gccctctccagacacaccttccagcacctagttgatcctgggctaaagtc
tgctgagtaaaaggaagagaagagaatgatgtcactgacgatctatcttt
ttgcaggaatctccatggtttaaaattgggccctgattgatctggcaggt
acgccccacatctgtatgtgggaaactgtgtgcacttctctgagaaattc
ctttctcgtggagccccttgctgattctatgggccaaagagctttctcca
ctcctttcccctctgctggagagcagcctgtgaggacagctcaaagccac
gctttcatttccttatttatgctatgccttgaaagatgtattcctaacct
gactcaggtatatctgacacaattatgagcatgttgccaaag
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_28866312_28867496
seq2: B6Ng01-285F04.b_45_1234 (reverse)

seq1  CAAGGG----CAAAGAG---TGATTGCCACAGA---GCTTTGAAGCAATG  40
      ||||||    |||||||   ||||||||||| |   |||| |||||||||
seq2  CAAGGGGTCACAAAGAGTGTTGATTGCCACACAGAGGCTTGGAAGCAATG  50

seq1  AGCTACCTGCATGAGG--CCCTAG-TCTGTTACTGTGAAGGCACAATGGT  87
      ||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||| ||||||||||
seq2  AGCTACCTGCATGAGGGCCCTTAGTTCTGTTACTGTGAA-GCACAATGGT  99

seq1  AGATAGTTTGTTGTGGGGAGGGGCAGAATTTCATGGAGAACTGCTTTGCA  137
      ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||| 
seq2  AGATAGTTTGTTGTGGGGAAGGGCAGA--TTCATGGAGAACTGC-TTGC-  145

seq1  AATCTGCATTTCAGATCTTGGGAAGACCTTGTTAGAAGGCATTGACAAGG  187
      ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCTGCATTTCAGATCT--GGAAGACCTTGTTAGAAGGCATTGACAAGG  193

seq1  CAAGCAGCACCTTGCTCAGATAGGGTCATTCCTCCTGGGACAGGCTCTCC  237
      ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  CAAGCAGCAACTTGCTCAGATAGGGTCA-TCCTCCTGGGACAGGCTCTCC  242

seq1  TGGCCTTTGGCATTGGTCAACTGGGGTATTCTCCAGGCTGAACTGAAATG  287
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCCTTTGGCATTGGTCAACTGGGGTATTCTCCAGGCTGAACTGAAATG  292

seq1  TGTGAGCTGAAGTGTAAGAGAGTAGTTTTAAATTTAACTTCAGAGCCCTC  337
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGAGCTGAAGTGTAAGAGAGTAGTTTTAAATTTAACTTCAGAGCCCTC  342

seq1  TGCTATTGAACCATTGGTCAGTTTGATGGTTCCAAGGATAGCATGCTGTG  387
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTATTGAACCATTGGTCAGTTTGATGGTTCCAAGGATAGCATGCTGTG  392

seq1  TTGCTCACAGATAATGGCTGTGGAGAGAATGAGCAGGCTAGTAATTGCCA  437
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCTCACAGATAATGGCTGTGGAGAGAATGAGCAGGCTAGTAATTGCCA  442

seq1  GCTGGCGAATCTCCTGATAACCTGCAATGAATGGGCCTTAGTGAGAAACA  487
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGGCGAATCTCCTGATAACCTGCAATGAATGGGCCTTAGTGAGAAACA  492

seq1  CTCACTGGGTAATTGGCAGATAGGTGTCCTATCACTCTGCTAAGTGTGGG  537
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCACTGGGTAATTGGCAGATAGGTGTCCTATCACTCTGCTAAGTGTGGG  542

seq1  CACTCCTGCATCATCTAAGCATGCTAAGTAGAGACTCTAGGGATTCCTGA  587
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTCCTGCATCATCTAAGCATGCTAAGTAGAGACTCTAGGGATTCCTGA  592

seq1  CCAGATAAAGCATCATGGCACTTGGGTTTCATGGGTGTCTGTCCTAGAAC  637
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGATAAAGCATCATGGCACTTGGGTTTCATGGGTGTCTGTCCTAGAAC  642

seq1  AAACATTATGCTATATTATTTCACTCTTAGTCCAGTTTTTTTTCAAGTTA  687
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACATTATGCTATATTATTTCACTCTTAGTCCAGTTTTTTTTCAAGTTA  692

seq1  TTATCTATTGTTGGAACAGTAAATGTAGGAACATAGATAGACTACATTCC  737
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATCTATTGTTGGAACAGTAAATGTAGGAACATAGATAGACTACATTCC  742

seq1  AAAAGTTAGTGTCATCATTGTACAGTTAGTACATGTGACAAGGTAGGTCA  787
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGTTAGTGTCATCATTGTACAGTTAGTACATGTGACAAGGTAGGTCA  792

seq1  TGTCTAAGTCTCTTGTGTGTAAAATGAGGACATCTGTGTTACTGCTTATC  837
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCTAAGTCTCTTGTGTGTAAAATGAGGACATCTGTGTTACTGCTTATC  842

seq1  ACTCAGAGGCTCAGGGCCATGATTCTCACTGAACATGGAACACAGTCCAG  887
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCAGAGGCTCAGGGCCATGATTCTCACTGAACATGGAACACAGTCCAG  892

seq1  GCTCAGACAGACATTTGTAAATGGCAGTGATTTTAGTTGTTATGGTTTGG  937
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCAGACAGACATTTGTAAATGGCAGTGATTTTAGTTGTTATGGTTTGG  942

seq1  CTATGACAAAGGTTTTTATGCCATGAGGAATAGGTGAGAGCATTGTGTTT  987
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATGACAAAGGTTTTTATGCCATGAGGAATAGGTGAGAGCATTGTGTTT  992

seq1  ACAAGAGAAGTGTGTCATTGTTCCTCTTGTCAGAAAGCTGAATGTCTATA  1037
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAGAGAAGTGTGTCATTGTTCCTCTTGTCAGAAAGCTGAATGTCTATA  1042

seq1  ATAAAGTCTCCAGGCTCCTCACTAGGCCACTGAGAAGTTGACTTTTTAGC  1087
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAAGTCTCCAGGCTCCTCACTAGGCCACTGAGAAGTTGACTTTTTAGC  1092

seq1  AGAAATGTTGAAAGCGTCATCTGGCAAATGCCAGTGCAGATAGGAAATTA  1137
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAATGTTGAAAGCGTCATCTGGCAAATGCCAGTGCAGATAGGAAATTA  1142

seq1  ATCTTCTGCTTAGAGAAGGAAACCTTATAGGAGCACATGAAAGAATTC  1185
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTTCTGCTTAGAGAAGGAAACCTTATAGGAGCACATGAAAGAATTC  1190

seq1: chr14_28692183_28693281
seq2: B6Ng01-285F04.g_65_1156

seq1  GAATTCCAGGACAGCCAGAGCTACACAGAGAAACCCTGTCTCAAAAAAAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAGGACAGCCAGAGCTACACAGAGAAACCCTGTCTCAAAAAAAA  50

seq1  AAAAAAAAAAATTAGAGTAAGTTTTGGGAACCCAGACAGTACAAGCCTTA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAAAAAAATTAGAGTAAGTTTTGGGAACCCAGACAGTACAAGCCTTA  100

seq1  GAGGTGACTCCTGAACAGAACTTAAACTCAGAGGTTGGAATTTCAGATTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGTGACTCCTGAACAGAACTTAAACTCAGAGGTTGGAATTTCAGATTG  150

seq1  CTTTTTGTCTTGGTTTTGGCCAAAAATCACCATTGTTAACTAGTGCTTTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTTGTCTTGGTTTTGGCCAAAAATCACCATTGTTAACTAGTGCTTTG  200

seq1  CCAAATCTAAAGTTAAATAAAAGGAATAGTTTGCTTTGTAGAGGCAGTCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAATCTAAAGTTAAATAAAAGGAATAGTTTGCTTTGTAGAGGCAGTCT  250

seq1  CGTGTCTTATGCATCTCTCATACTGGCCTCAAATTTACTATGTAACCAAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTGTCTTATGCATCTCTCATACTGGCCTCAAATTTACTATGTAACCAAG  300

seq1  GATGACCATGAACTAACACCTGATCCTCCTGTCTCTCCTTCCAAAATAAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGACCATGAACTAACACCTGATCCTCCTGTCTCTCCTTCCAAAATAAC  350

seq1  AGGGTTCCATGTGCCATTATGCCCTGTTCAGAAGTACAGAAAAGCCTCTC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGTTCCATGTGCCATTATGCCCTGTTCAGAAGTACAGAAAAGCCTCTC  400

seq1  TATGAGCCCCCTAATTTCAGGAAGATGACATAAATTAGAGCTGACAAGAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGAGCCCCCTAATTTCAGGAAGATGACATAAATTAGAGCTGACAAGAT  450

seq1  ATTCCATACTTGTCCCTTGTTCCTTAGGGAAACTGAGGGTGAAGTTCTGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCCATACTTGTCCCTTGTTCCTTAGGGAAACTGAGGGTGAAGTTCTGA  500

seq1  ACTCCATTTGTTTCCACAACATTTGCATCAGCTCTGCAACGGGGCTTCCT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCCATTTGTTTCCACAACATTTGCATCAGCTCTGCAACGGGGCTTCCT  550

seq1  GCAAGGGTCTGCAGAATCCTGCTTCTCTCAAGCTTTGTGTGAGCTTCAAC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAGGGTCTGCAGAATCCTGCTTCTCTCAAGCTTTGTGTGAGCTTCAAC  600

seq1  CCACTGCTCTCTGGGAACTCTGTGTGCCCTACAGACTTGCTGATCTGTGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACTGCTCTCTGGGAACTCTGTGTGCCCTACAGACTTGCTGATCTGTGT  650

seq1  GGAAGTCTCTGCAGGTCCTGGAGAAGGGACCTGTATCCCGATAGGGGATG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAGTCTCTGCAGGTCCTGGAGAAGGGACCTGTATCCCGATAGGGGATG  700

seq1  GCCCTCTCCAGACACACCTTCCAGCACCTAGTTGATCCTGGGCTAAAGTC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCTCTCCAGACACACCTTCCAGCACCTAGTTGATCCTGGGCTAAAGTC  750

seq1  TGCTGAGTAAAAGGAAGAGAAGAGAATGATGTCACTGACGATCTATCTTT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGAGTAAAAGGAAGAGAAGAGAATGATGTCACTGACGATCTATCTTT  800

seq1  TTGCAGGAATCTCCATGGTTTAAAATT-GGCCCTGATTTGATCTGGCAGG  849
      ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||
seq2  TTGCAGGAATCTCCATGGTTTAAAATTGGGCCCTGA-TTGATCTGGCAGG  849

seq1  TACGCCCCACATCTGTATGTGGGAAACTGTGTGCACTTCTCTGAGAAATT  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACGCCCCACATCTGTATGTGGGAAACTGTGTGCACTTCTCTGAGAAATT  899

seq1  CCTTTCTCGTGGAGCCCCTTTGCTGATTCTAT-GGCCAAAGAGGCTTTCT  948
      |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||
seq2  CCTTTCTCGTGGAGCCCC-TTGCTGATTCTATGGGCCAAAGA-GCTTTCT  947

seq1  CCACTCCTTTCCCCTCTGCTGGAGAGCAGCCTGTGAGGACAGCTCAAAAG  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  CCACTCCTTTCCCCTCTGCTGGAGAGCAGCCTGTGAGGACAGCTC-AAAG  996

seq1  CCACGCTTTCATTTTCCCTATTTAATGCTAATGCCTTTGAAAGAATGTAT  1048
      ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||
seq2  CCACGCTTTCA-TTTCCTTATTT-ATGCT-ATGCC-TTGAAAG-ATGTAT  1041

seq1  TCTTAACCTGACTTCAGTATATCTGACACAA-TATGAGCATGTTGCCCAA  1097
      || ||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||
seq2  TCCTAACCTGACTCAGGTATATCTGACACAATTATGAGCATGTTG-CCAA  1090

seq1  AG  1099
      ||
seq2  AG  1092