BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-295K15
Chromosome14 (Build37)
Map Location 13,744,118 - 13,886,881
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100042022, LOC100042026
Upstream genePtprg, LOC100042441, 3830406C13Rik, EG667072, Fezf2, Cadps, EG432822
Downstream geneEG328354, Synpr, A430083B19Rik, EG382844, LOC100042045, Gm281, Thoc7, Atxn7
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-295K15.bB6Ng01-295K15.g
ACCGA091474GA091475
length1,190728
definitionB6Ng01-295K15.b B6Ng01-295K15.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(13,885,693 - 13,886,881)(13,744,118 - 13,744,845)
sequence
gaattcatgtttgttgactgataccatctataactctagctcctggtgat
ccatcacctttttctggccttcaaaggcacctgcacacacatacccatac
ttatacatacacataattaaaaataaagtataaataaatcataaaaacca
tcaaaccaataaaatcctagttctgctaccttgttactaagaaatgatga
gagagttatgcaatggggtttattcatattgacctcaaggaaacatctag
ggatattctccattttcctgacagtctgtcaaaacatgacttcttatgga
ctgaggcctggacattgctaaatgtctgcagtacaaattcctcacagcaa
gtaatttcctatcccagtgtcaggattgtcaaggtagagaaactgtgctc
aatgatactagttctctgctgcagtaagcactaaaggttcttttaaaaag
aaagagggaaatgcctttcttaaagtagaagtgatatgagtctccttagt
gtaaggaaagagggagcaagtgtctgtatagcataactagggagggtaca
ctgcctgtggaagatttatacacatcaataaactatacagacataattgt
gggtttttaaaattgttattaccaaatagcagaaattatggacaatgtta
ttagccaaataactacttctacccacagggcacttcatttccatagcccc
tgtcacccctttacctctgtatactgcaacttactaagaatgtcatactt
aagtgtctaatataggggaaagaaaccaaccttggggagaactatcaaag
gattttgcaggaagtttgtttgttttcccatttgtttgctcgttttgaga
tatgagctcatgtatcccagcatgacctcaatgaagctatgtagctaaag
gatgatctgaagttttgattctcttgcctttactctactctcccaagtac
gtgagacacatatatgtgctaccatgcccagctaattgggtgttgtggat
tgacctccccaaggctgcatgcatgccagaagaagagaattcttaccaac
tgagctaatcctcagcacaaaggatgtactattgttctgtaaccactttt
tgtaggtagtggaacctggaacctgaaacaaaggtaacttcttaaagttt
tcccacgctataaggtttcagagtttctgttgtacaaacc
gaattcactcctagtcactcccattctcggggtgtaatagtgaggtgatg
ggcaagcaacgaaccaggagctgtcacgccatatcaggtgctgaaacgtc
atgctgcgggttataaaagcagcgccattttcccggtttgggatcttcct
gagaagcaagcaataaagctcttgccgcggaagattctggtttgttgcgt
ctttcttgccggtcgagcgggacgcaataaccttacatatgcatcagcaa
ctgaatggataaaactggcctcaaactcacaatgtatccaatttaaactt
ctcattttgaattagaacttctgatctttttgcctctaacacccaagtac
tgggactacaggattacaaagtcttacgaccccagacctttaggcacacc
aagcaaatgctgaaccaactgagccacctccacagtcctctgtgggcttt
tgattagctaagtgagctcagttacaatagcagttctcaacctgttgttt
gcaaccctttgggggtagaatgacactttctaagcaggtgcatatcagat
atttacattatgattcataacaatagcaaaattttagttatgaagtagca
gtggaaataatattatggttgggggttaccacagcatgaaaatggtattg
aagagctgcagcattaggaaggttgagaaccactgagttagggataatgt
agatttttggtaggggagaggagaaaga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_13885693_13886881
seq2: B6Ng01-295K15.b_46_1235 (reverse)

seq1  GGTTTGTACCAACAGAACACTTCTGAAAAACTTTATAGCTGTGAAAAATT  50
      |||||||| |||||||| || ||||  |||| |||||||   | |||| |
seq2  GGTTTGTA-CAACAGAA-AC-TCTG--AAACCTTATAGCGTGGGAAAACT  45

seq1  TTAAGAGTTTAACCCCTTTG-TTCAGG-TCCA-GTTCCACTACCTAC-AA  96
      ||||||  |||   |||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||
seq2  TTAAGAAGTTA---CCTTTGTTTCAGGTTCCAGGTTCCACTACCTACAAA  92

seq1  AAGTGTTTACAGA--CATAGTAACATCCTTTGTGCTGAGGATTTAGCTCA  144
      ||||| |||||||   ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  AAGTGGTTACAGAACAATAGT-ACATCCTTTGTGCTGAGGA-TTAGCTCA  140

seq1  GTTGGT-AGAATTCTTCTC-TCT-GCATGCATGCAGCCTTGGG--AGTCA  189
      |||||| ||||||||  || ||| |||||||||||||||||||   ||||
seq2  GTTGGTAAGAATTCTCTTCTTCTGGCATGCATGCAGCCTTGGGGAGGTCA  190

seq1  ATCCACAACACCCAATTAGCTGGGCATGGTAGCACATATATGTTGTCTCA  239
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  ATCCACAACACCCAATTAGCTGGGCATGGTAGCACATATATG-TGTCTCA  239

seq1  CGTACTTGGGAGAGTAGAGTAAAGGCAAGAGAATCAAAACTTCAGATCAT  289
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTACTTGGGAGAGTAGAGTAAAGGCAAGAGAATCAAAACTTCAGATCAT  289

seq1  CC-TTAGCTACATAGCTTCATTGAGGTCATGCTGGGATACATGAGCTCAT  338
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTTAGCTACATAGCTTCATTGAGGTCATGCTGGGATACATGAGCTCAT  339

seq1  ATCTCAAAACGAGCAAACAAATGGGAAAACAAACAAACTTCCTGCAAAAT  388
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTCAAAACGAGCAAACAAATGGGAAAACAAACAAACTTCCTGCAAAAT  389

seq1  CCTTTGATAGTTCTCCCCAAGGTTGGTTTCTTTCCCCTATATTAGACACT  438
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTTGATAGTTCTCCCCAAGGTTGGTTTCTTTCCCCTATATTAGACACT  439

seq1  TAAGTATGACATTCTTAGTAAGTTGCAGTATACAGAGGTAAAGGGGTGAC  488
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGTATGACATTCTTAGTAAGTTGCAGTATACAGAGGTAAAGGGGTGAC  489

seq1  AGGGGCTATGGAAATGAAGTGCCCTGTGGGTAGAAGTAGTTATTTGGCTA  538
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGGCTATGGAAATGAAGTGCCCTGTGGGTAGAAGTAGTTATTTGGCTA  539

seq1  ATAACATTGTCCATAATTTCTGCTATTTGGTAATAACAATTTTAAAAACC  588
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAACATTGTCCATAATTTCTGCTATTTGGTAATAACAATTTTAAAAACC  589

seq1  CACAATTATGTCTGTATAGTTTATTGATGTGTATAAATCTTCCACAGGCA  638
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAATTATGTCTGTATAGTTTATTGATGTGTATAAATCTTCCACAGGCA  639

seq1  GTGTACCCTCCCTAGTTATGCTATACAGACACTTGCTCCCTCTTTCCTTA  688
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTACCCTCCCTAGTTATGCTATACAGACACTTGCTCCCTCTTTCCTTA  689

seq1  CACTAAGGAGACTCATATCACTTCTACTTTAAGAAAGGCATTTCCCTCTT  738
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTAAGGAGACTCATATCACTTCTACTTTAAGAAAGGCATTTCCCTCTT  739

seq1  TCTTTTTAAAAGAACCTTTAGTGCTTACTGCAGCAGAGAACTAGTATCAT  788
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTTTAAAAGAACCTTTAGTGCTTACTGCAGCAGAGAACTAGTATCAT  789

seq1  TGAGCACAGTTTCTCTACCTTGACAATCCTGACACTGGGATAGGAAATTA  838
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGCACAGTTTCTCTACCTTGACAATCCTGACACTGGGATAGGAAATTA  839

seq1  CTTGCTGTGAGGAATTTGTACTGCAGACATTTAGCAATGTCCAGGCCTCA  888
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGCTGTGAGGAATTTGTACTGCAGACATTTAGCAATGTCCAGGCCTCA  889

seq1  GTCCATAAGAAGTCATGTTTTGACAGACTGTCAGGAAAATGGAGAATATC  938
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCATAAGAAGTCATGTTTTGACAGACTGTCAGGAAAATGGAGAATATC  939

seq1  CCTAGATGTTTCCTTGAGGTCAATATGAATAAACCCCATTGCATAACTCT  988
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTAGATGTTTCCTTGAGGTCAATATGAATAAACCCCATTGCATAACTCT  989

seq1  CTCATCATTTCTTAGTAACAAGGTAGCAGAACTAGGATTTTATTGGTTTG  1038
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCATCATTTCTTAGTAACAAGGTAGCAGAACTAGGATTTTATTGGTTTG  1039

seq1  ATGGTTTTTATGATTTATTTATACTTTATTTTTAATTATGTGTATGTATA  1088
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGTTTTTATGATTTATTTATACTTTATTTTTAATTATGTGTATGTATA  1089

seq1  AGTATGGGTATGTGTGTGCAGGTGCCTTTGAAGGCCAGAAAAAGGTGATG  1138
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTATGGGTATGTGTGTGCAGGTGCCTTTGAAGGCCAGAAAAAGGTGATG  1139

seq1  GATCACCAGGAGCTAGAGTTATAGATGGTATCAGTCAACAAACATGAATT  1188
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCACCAGGAGCTAGAGTTATAGATGGTATCAGTCAACAAACATGAATT  1189

seq1  C  1189
      |
seq2  C  1190

seq1: chr14_13744118_13744845
seq2: B6Ng01-295K15.g_67_794

seq1  GAATTCACTCCTAGTCACTCCCATTCTCGGGGTGTAATAGTGAGGTGATG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACTCCTAGTCACTCCCATTCTCGGGGTGTAATAGTGAGGTGATG  50

seq1  GGCAAGCAACGAACCAGGAGCTGTCACGCCATATCAGGTGCTGAAACGTC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAAGCAACGAACCAGGAGCTGTCACGCCATATCAGGTGCTGAAACGTC  100

seq1  ATGCTGCGGGTTATAAAAGCAGCGCCATTTTCCCGGTTTGGGATCTTCCT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCTGCGGGTTATAAAAGCAGCGCCATTTTCCCGGTTTGGGATCTTCCT  150

seq1  GAGAAGCAAGCAATAAAGCTCTTGCCGCGGAAGATTCTGGTTTGTTGCGT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAAGCAAGCAATAAAGCTCTTGCCGCGGAAGATTCTGGTTTGTTGCGT  200

seq1  CTTTCTTGCCGGTCGAGCGGGACGCAATAACCTTACATATGCATCAGCAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTCTTGCCGGTCGAGCGGGACGCAATAACCTTACATATGCATCAGCAA  250

seq1  CTGAATGGATAAAACTGGCCTCAAACTCACAATGTATCCAATTTAAACTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAATGGATAAAACTGGCCTCAAACTCACAATGTATCCAATTTAAACTT  300

seq1  CTCATTTTGAATTAGAACTTCTGATCTTTTTGCCTCTAACACCCAAGTAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCATTTTGAATTAGAACTTCTGATCTTTTTGCCTCTAACACCCAAGTAC  350

seq1  TGGGACTACAGGATTACAAAGTCTTACGACCCCAGACCTTTAGGCACACC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGACTACAGGATTACAAAGTCTTACGACCCCAGACCTTTAGGCACACC  400

seq1  AAGCAAATGCTGAACCAACTGAGCCACCTCCACAGTCCTCTGTGGGCTTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCAAATGCTGAACCAACTGAGCCACCTCCACAGTCCTCTGTGGGCTTT  450

seq1  TGATTAGCTAAGTGAGCTCAGTTACAATAGCAGTTCTCAACCTGTTGTTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATTAGCTAAGTGAGCTCAGTTACAATAGCAGTTCTCAACCTGTTGTTT  500

seq1  GCAACCCTTTGGGGGTAGAATGACACTTTCTAAGCAGGTGCATATCAGAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAACCCTTTGGGGGTAGAATGACACTTTCTAAGCAGGTGCATATCAGAT  550

seq1  ATTTACATTATGATTCATAACAATAGCAAAATTTTAGTTATGAAGTAGCA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTACATTATGATTCATAACAATAGCAAAATTTTAGTTATGAAGTAGCA  600

seq1  GTGGAAATAATATTATGGTTGGGGGTTACCACAGCATGAAAATGGTATTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGAAATAATATTATGGTTGGGGGTTACCACAGCATGAAAATGGTATTG  650

seq1  AAGAGCTGCAGCATTAGGAAGGTTGAGAACCACTGAGTTAGGGATAATGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGCTGCAGCATTAGGAAGGTTGAGAACCACTGAGTTAGGGATAATGT  700

seq1  AGATTTTTGGTAGGGGAGAGGAGAAAGA  728
      ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATTTTTGGTAGGGGAGAGGAGAAAGA  728