BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-298G07
Chromosome14 (Build37)
Map Location 7,432,054 - 7,572,856
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100042024, LOC100041664, LOC100042077, LOC100041675, LOC666329, EG666833, LOC100042043
Upstream geneLOC100041735, LOC100041406, LOC100041825, LOC100041421, LOC100041817, LOC100041431, LOC100041438, LOC100041442, LOC100041848, LOC100041456, LOC100041758, LOC100041470, LOC100041804, LOC100041487, LOC100041747, LOC100041507, LOC100041836, LOC100041728, LOC100041774, LOC100041530, LOC100041540, LOC100041840, EG666844, LOC666851, LOC100041569, LOC100041970, LOC100042000, EG666874, B930046C15Rik, LOC100041600, LOC100041958, LOC100041964, LOC546590, LOC666906
Downstream geneEG666918, LOC100041700, LOC100042054, LOC100042100, EG622781, LOC100041740, LOC100038847, LOC100042129, LOC100041770, LOC100042149, LOC544988, EG626456, LOC100041791, LOC100042164, LOC100042182, LOC100041808, LOC100042192, LOC100042207, EG432817, LOC100042217, LOC100041830, LOC100042235, EG545013, EG666947, LOC623215, LOC100042286, LOC666957, LOC100042263, LOC100042258, LOC100042272, LOC100041874, LOC100042304, LOC100041881, LOC100042312, LOC100041893
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-298G07.bB6Ng01-298G07.g
ACCGA093510GA093511
length1,0671,133
definitionB6Ng01-298G07.b B6Ng01-298G07.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(7,571,786 - 7,572,856)(7,432,054 - 7,433,189)
sequence
gaattcaacatcattaaatcacaacatgagaagacaatgttggatatgaa
taaaatgatccagtcaataattggttccatgcagtactctaaggaactga
tagaagataactattcctacaggtgagtcagtgacacaaatgagaccccc
agaactaggcagggaatgcttctgtccttttaggactttgaacaaaagca
agggttctggttctatgctatctgttttttatttaggaaccgtgccctga
ggcaagggtcttggatttgtacctcttggacacaggtgtcctaagtgtga
agagtgtccaagaccctccaatctttattcttccaaattcaagatcctct
acatagaaaacttttccaccacgctgggaatatccaggaaccctgaacct
ctgggtttctgaccacagattaaaagatctaggattcccaacaaaaatgt
aaagattggacacctgtttggtggtctcacctctctcagaggggctaagc
cctctccctgctgaaggttttatggtaccacagacctataatcaaccatg
aggaacatttcctcttctgtcatgtatatggtgtacacttggtgtcaggg
tttttagaagtttgttgagtcctgtggattatggctggtatcttgatatg
acctgcctctgtttggtgctgctatgtaactgtggactcttctgggggct
gtctgggaatcagggcccttgcagggatcataggacttgtaggagtggca
agccaatggaatctggctgggaatcaccaatttttctttgtggatcagca
ttaaggaggaccacctcctccgtgactgcactcaactccacgaaaacgta
aggatattactgaatgagaacagaaagctgctggtggagcagctggccac
aagtgtcctgtggggaagaaaagaggttctctgaggaggccagcaagaac
atctgtgtcccaagtgccaaggaacagcaggtagatgatgtgtatcagag
cagattgccctcatgtctaacataacatagacattcaaatgttaatagtc
caccaacttctccaggc
gaattcaccacagaactcaaatatttcatcaagttgaacacataatgcaa
gtgcattgttgcttgaagtatggtttccagtcctaagcattggcattgtc
agcagactgtaaggcaggcaattcctcaggtcctaccacatacccttatg
accagaatatagagagagtcacacacacacacacatgcctgcacacagaa
tcagggtgtgtttgcagggagaatgagaaagtacaattgaaatagaatcc
agaggaaatgcagaggacattctgtttataagacccaaaatctgagaaga
gtattaatgagcccaagaccttccatcatgtatcaggatggaccaaatgg
gaccaagctttcctggtgatatagcaagcttcagcaagcaacacctgcca
gaaaattgcaaagctttgcaaacaaacaaacaacgaactcaagcaagcaa
acaatctatcaaaacctcacagcaactaatatctcactcaaacggtcaca
tgtcagtgcctctatcaatacatgctgagacatcacatcctcttcaatcc
ctcagttgtaggctttcattttcatataaaaaaaaatagaataccctatg
tccgcagctcactcctgctttgacttcaagttcagcctgtgagaatgttt
agcgagaaaaggttgggcacagtgacaccctggagttacagtctcccagt
agcataaaatttaataagaataaattgtaggccataccatagacccaaga
aattgaccatgatgtttgacagaatgaaaaatacctcttgtgcaaagctt
tctcactgatgaagatcaggtgatcttgtagctcatttttcccactggtc
atcggctgactgattagactttccactttcctcacccatcttctgaacag
gagtgttggggatgatggtgatacaccagcagcccctatggggtagatga
acacaagtgaatatgcatactgtcaaaggcacagaagcattgacagaaca
ctgagtcctatacagacatctgacaaaacagatccatgtgacccagtcat
tcctctttcgctcacttgcaacatgcatcatgtgaacaggacagatctca
ggcttatcatagcctgcgtgtgaattaactagg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_7571786_7572856
seq2: B6Ng01-298G07.b_47_1113 (reverse)

seq1  GCCTGGAGAAGTTGGTGGACTATT-ACATTTGATTGTCTATGTTTATGTT  49
      |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |
seq2  GCCTGGAGAAGTTGGTGGACTATTAACATTTGAATGTCTATG-TTATG-T  48

seq1  TAGACATGAGGGCAATCTGCCTCTGATACACATCATCCTACCTGCTGTTC  99
      ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  TAGACATGAGGGCAATCTG-CTCTGATACACATCAT-CTACCTGCTGTTC  96

seq1  CTTGGCACTTGGGACACAGATGTTCTTGCTGGCCTCCTCAGAGAACCTCT  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGGCACTTGGGACACAGATGTTCTTGCTGGCCTCCTCAGAGAACCTCT  146

seq1  TTTCTTCCCCACAGGACACTTGTGGCCAGCCTGCTCCACCAGCAGCCTTC  199
      ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||
seq2  TTTCTTCCCCACAGGACACTTGTGGCCAG-CTGCTCCACCAGCAGCTTTC  195

seq1  TGTTCTCATTCAGTAATATCCTTACGTTTTCGTGGAGTTGAGTGCAGTCA  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTCTCATTCAGTAATATCCTTACGTTTTCGTGGAGTTGAGTGCAGTCA  245

seq1  CGGAGGAGGTGGTCCTCCTTAATGCTGATCCACAAAGAAAAATTGGTGAT  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGAGGAGGTGGTCCTCCTTAATGCTGATCCACAAAGAAAAATTGGTGAT  295

seq1  TCCCAGCCAGATTCCATTGGCTTGCCACTCCTACAAGTCCTATGATCCCT  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCAGCCAGATTCCATTGGCTTGCCACTCCTACAAGTCCTATGATCCCT  345

seq1  GCAAGGGCCCTGATTCCCAGACAGCCCCCAGAAGAGTCCACAGTTACATA  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAGGGCCCTGATTCCCAGACAGCCCCCAGAAGAGTCCACAGTTACATA  395

seq1  GCAGCACCAAACAGAGGCAGGTCATATCAAGATACCAGCCATAATCCACA  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGCACCAAACAGAGGCAGGTCATATCAAGATACCAGCCATAATCCACA  445

seq1  GGACTCAACAAACTTCTAAAAACCCTGACACCAAGTGTACACCATATACA  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACTCAACAAACTTCTAAAAACCCTGACACCAAGTGTACACCATATACA  495

seq1  TGACAGAAGAGGAAATGTTCCTCATGGTTGATTATAGGTCTGTGGTACCA  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACAGAAGAGGAAATGTTCCTCATGGTTGATTATAGGTCTGTGGTACCA  545

seq1  TAAAACCTTCAGCAGGGAGAGGGCTTAGCCCCTCTGAGAGAGGTGAGACC  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAACCTTCAGCAGGGAGAGGGCTTAGCCCCTCTGAGAGAGGTGAGACC  595

seq1  ACCAAACAGGTGTCCAATCTTTACATTTTTGTTGGGAATCCTAGATCTTT  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAAACAGGTGTCCAATCTTTACATTTTTGTTGGGAATCCTAGATCTTT  645

seq1  TAATCTGTGGTCAGAAACCCAGAGGTTCAGGGTTCCTGGATATTCCCAGC  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATCTGTGGTCAGAAACCCAGAGGTTCAGGGTTCCTGGATATTCCCAGC  695

seq1  GTGGTGGAAAAGTTTTCTATGTAGAGGATCTTGAATTTGGAAGAATAAAG  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGTGGAAAAGTTTTCTATGTAGAGGATCTTGAATTTGGAAGAATAAAG  745

seq1  ATTGGAGGGTCTTGGACACTCTTCACACTTAGGACACCTGTGTCCAAGAG  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGGAGGGTCTTGGACACTCTTCACACTTAGGACACCTGTGTCCAAGAG  795

seq1  GTACAAATCCAAGACCCTTGCCTCAGGGCACGGTTCCTAAATAAAAAACA  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACAAATCCAAGACCCTTGCCTCAGGGCACGGTTCCTAAATAAAAAACA  845

seq1  GATAGCATAGAACCAGAACCCTTGCTTTTGTTCAAAGTCCTAAAAGGACA  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAGCATAGAACCAGAACCCTTGCTTTTGTTCAAAGTCCTAAAAGGACA  895

seq1  GAAGCATTCCCTGCCTAGTTCTGGGGGTCTCATTTGTGTCACTGACTCAC  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGCATTCCCTGCCTAGTTCTGGGGGTCTCATTTGTGTCACTGACTCAC  945

seq1  CTGTAGGAATAGTTATCTTCTATCAGTTCCTTAGAGTACTGCATGGAACC  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTAGGAATAGTTATCTTCTATCAGTTCCTTAGAGTACTGCATGGAACC  995

seq1  AATTATTGACTGGATCATTTTATTCATATCCAACATTGTCTTCTCATGTT  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTATTGACTGGATCATTTTATTCATATCCAACATTGTCTTCTCATGTT  1045

seq1  GTGATTTAATGATGTTGAATTC  1071
      ||||||||||||||||||||||
seq2  GTGATTTAATGATGTTGAATTC  1067

seq1: chr14_7432054_7433189
seq2: B6Ng01-298G07.g_67_1199

seq1  GAATTCACCACAGAACTCAAATATTTCATCAAGTTGAACACATAATGCAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACCACAGAACTCAAATATTTCATCAAGTTGAACACATAATGCAA  50

seq1  GTGCATTGTTGCTTGAAGTATGGTTTCCAGTCCTAAGCATTGGCATTGTC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCATTGTTGCTTGAAGTATGGTTTCCAGTCCTAAGCATTGGCATTGTC  100

seq1  AGCAGACTGTAAGGCAGGCAATTCCTCAGGTCCTACCACATACCCTTATG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAGACTGTAAGGCAGGCAATTCCTCAGGTCCTACCACATACCCTTATG  150

seq1  ACCAGAATATAGAGAGAGTCACACACACACACACATGCCTGCACACAGAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAGAATATAGAGAGAGTCACACACACACACACATGCCTGCACACAGAA  200

seq1  TCAGGGTGTGTTTGCAGGGAGAATGAGAAAGTACAATTGAAATAGAATCC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGGGTGTGTTTGCAGGGAGAATGAGAAAGTACAATTGAAATAGAATCC  250

seq1  AGAGGAAATGCAGAGGACATTCTGTTTATAAGACCCAAAATCTGAGAAGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGGAAATGCAGAGGACATTCTGTTTATAAGACCCAAAATCTGAGAAGA  300

seq1  GTATTAATGAGCCCAAGACCTTCCATCATGTATCAGGATGGACCAAATGG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATTAATGAGCCCAAGACCTTCCATCATGTATCAGGATGGACCAAATGG  350

seq1  GACCAAGCTTTCCTGGTGATATAGCAAGCTTCAGCAAGCAACACCTGCCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCAAGCTTTCCTGGTGATATAGCAAGCTTCAGCAAGCAACACCTGCCA  400

seq1  GAAAATTGCAAAGCTTTGCAAACAAACAAACAACGAACTCAAGCAAGCAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAATTGCAAAGCTTTGCAAACAAACAAACAACGAACTCAAGCAAGCAA  450

seq1  ACAATCTATCAAAACCTCACAGCAACTAATATCTCACTCAAACGGTCACA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAATCTATCAAAACCTCACAGCAACTAATATCTCACTCAAACGGTCACA  500

seq1  TGTCAGTGCCTCTATCAATACATGCTGAGACATCACATCCTCTTCAATCC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCAGTGCCTCTATCAATACATGCTGAGACATCACATCCTCTTCAATCC  550

seq1  CTCAGTTGTAGGCTTTCATTTTCATATAAAAAAAAATAGAATACCCTATG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGTTGTAGGCTTTCATTTTCATATAAAAAAAAATAGAATACCCTATG  600

seq1  TCCGCAGCTCACTCCTGCTTTGACTTCAAGTTCAGCCTGTGAGAATGTTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCGCAGCTCACTCCTGCTTTGACTTCAAGTTCAGCCTGTGAGAATGTTT  650

seq1  AGCGAGAAAAGGTTGGGCACAGTGACACCCTGGAGTTACAGTCTCCCAGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCGAGAAAAGGTTGGGCACAGTGACACCCTGGAGTTACAGTCTCCCAGT  700

seq1  AGCATAAAATTTAATAAGAATAAATTGTAGGCCATACCATAGACCCAAGA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCATAAAATTTAATAAGAATAAATTGTAGGCCATACCATAGACCCAAGA  750

seq1  AATTGACCATGATGTTTGACAGAATGAAAAATACCTCTTGTGCAAAGCTT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTGACCATGATGTTTGACAGAATGAAAAATACCTCTTGTGCAAAGCTT  800

seq1  TCTCACTGATGAAGATCAGGTGATCTTGTAGCTCATTTTTCCCACTGGTC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCACTGATGAAGATCAGGTGATCTTGTAGCTCATTTTTCCCACTGGTC  850

seq1  ATCGGCTGACTGATTAGACTTTCCACTTTCCTCACCCATCTTCTGAACAG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCGGCTGACTGATTAGACTTTCCACTTTCCTCACCCATCTTCTGAACAG  900

seq1  GAGTGTTGGGGATGATGGTGATACACCAGCAGCCCCTAT-GGGTAGATGA  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  GAGTGTTGGGGATGATGGTGATACACCAGCAGCCCCTATGGGGTAGATGA  950

seq1  ACACAAGTGAATATGCATACTGTC-AAGGCACAG-AGCATTGACAGAACA  997
      |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||
seq2  ACACAAGTGAATATGCATACTGTCAAAGGCACAGAAGCATTGACAGAACA  1000

seq1  CTGAGTCCTATACAGACATCTGACAAAACAGGAATCCATGTGACCCAGTC  1047
      |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||
seq2  CTGAGTCCTATACAGACATCTGACAAAACAG--ATCCATGTGACCCAGTC  1048

seq1  ATTCCTCTTTCGCTTCACTTTGCACATGCATCATGTGACCAAGGACAGGA  1097
      ||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||| | |||||| ||
seq2  ATTCCTCTTTCGC-TCACTTGCAACATGCATCATGTGAAC-AGGACA-GA  1095

seq1  TCCTCAGGCTTATTCATAG-CTGCGTGTGATTTAATTAGG  1136
      | |||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||
seq2  T-CTCAGGCTTA-TCATAGCCTGCGTGTGAATTAACTAGG  1133