BAC Information

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BAC

Clone NameB6Ng01-304B10
Chromosome14 (Build37)
Map Location 84,013,746 - 84,149,556
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC100043773
Downstream geneLOC100043279, LOC100043775, LOC100043776, LOC100043280, LOC100043285, Pcdh17, 9630013A20Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-304B10.bB6Ng01-304B10.g
ACCGA097729GA097730
length8131,143
definitionB6Ng01-304B10.b B6Ng01-304B10.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(84,148,744 - 84,149,556)(84,013,746 - 84,014,893)
sequence
gaattcacatgtcttgatacatgaaagcagatttactcatggacctattc
aatactacaattaaataaattaaattgttcacatttttaacttcaatcaa
tgttcaattcagtgtagtaaactaaaataatttgtatggattttaaagtc
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gactatacatgtaaaagcattatattgtaagagaatagaagacgcatcag
ttctattaatttaactcatatagtaacatatgttatagatgtaaaattaa
atacttacggaaaaaccacaaagttactgatgctgacattaaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_84148744_84149556
seq2: B6Ng01-304B10.b_46_858 (reverse)

seq1  CACACACACACACACATATATATATATATCCTTATATTTATAATTTATAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTTAAAATATATATTTACTCATATATACTATATACATTTGAATATAT  150

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  TCTTTGATTCAACTCTATAATCTGTTCACCTTTGTTTAATCAGGAAAACA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  AATTCCTTACTTATATTTCACATATTACTGTGAAATCTAATCATAGCCAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAATTGCTGAATACCATGCAATCAAAATAGCTTTTTATTTAAAAATTGA  500

seq1  TGATCAATTTTGGTGTTTATAGGGGCTGAATTTTATTGTATCTAATAACT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATCAATTTTGGTGTTTATAGGGGCTGAATTTTATTGTATCTAATAACT  550

seq1  TTGTTTACATGGTGTGCTTAATGGAAAATTGGTTCAATAGTAGTCAACAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTTACATGGTGTGCTTAATGGAAAATTGGTTCAATAGTAGTCAACAA  600

seq1  ACAATCTATTACTTAATAAATAATTGGGCAGCAATTTAAAGAATTTATTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAATCTATTACTTAATAAATAATTGGGCAGCAATTTAAAGAATTTATTT  650

seq1  GTAATTAAAAATTGACTTTAAAATCCATACAAATTATTTTAGTTTACTAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAATTAAAAATTGACTTTAAAATCCATACAAATTATTTTAGTTTACTAC  700

seq1  ACTGAATTGAACATTGATTGAAGTTAAAAATGTGAACAATTTAATTTATT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGAATTGAACATTGATTGAAGTTAAAAATGTGAACAATTTAATTTATT  750

seq1  TAATTGTAGTATTGAATAGGTCCATGAGTAAATCTGCTTTCATGTATCAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATTGTAGTATTGAATAGGTCCATGAGTAAATCTGCTTTCATGTATCAA  800

seq1  GACATGTGAATTC  813
      |||||||||||||
seq2  GACATGTGAATTC  813


seq1: chr14_84013746_84014893
seq2: B6Ng01-304B10.g_69_1211

seq1  GAATTCACATGAACTCACTAAAAACAATTATTATAACTGGTAATCAGGTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  TATTAACATTTCCAGATACCTGTTTACATTTTGGCAATGAAAATCCAGAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTAACATTTCCAGATACCTGTTTACATTTTGGCAATGAAAATCCAGAA  100

seq1  GTAAAACTGTAATTTATTTTAATATAATATCCATAGGAAGATATTTAGTA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAAACTGTAATTTATTTTAATATAATATCCATAGGAAGATATTTAGTA  150

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  TTCTAAGTCTATTATTCATGTGGAAATTTAATAAACTGAGAATTATAATG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  TAAGAAACTCTCAAATTATAACAGAATTATGAAGATGGACAGGTCATGTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGAAACTCTCAAATTATAACAGAATTATGAAGATGGACAGGTCATGTG  350

seq1  TAAAAAATTACTAAGCAAGTCGATATTCCACCATGCTGTGTCAAAAGGCC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAAAATTACTAAGCAAGTCGATATTCCACCATGCTGTGTCAAAAGGCC  400

seq1  CTACCCATATCTGAACAATTTTTAACAGTTTATGTCTTCTAAGATGCAGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACCCATATCTGAACAATTTTTAACAGTTTATGTCTTCTAAGATGCAGA  450

seq1  AAACCAAGCTTCTTGATGTCTGTGATATTTGATAGGTGTACCAGAGTCTA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACCAAGCTTCTTGATGTCTGTGATATTTGATAGGTGTACCAGAGTCTA  500

seq1  GTGGATTGCTCTTCACCTATATGTATACTCAGCAAAAATTTGATCAAGTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGATTGCTCTTCACCTATATGTATACTCAGCAAAAATTTGATCAAGTA  550

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGATTAGTATGTAGGAATATGAGATTATCAAAAAATATAATAAAAATA  650

seq1  TTGTGTTGAAATCAAAATTAAAATATTCCATGTTCTCAACTTAAAACTTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGAACTATATTTTCAAAACAGTACTGTGTAGCTGGTTGTTTACAAAT  750

seq1  ACTGAGAGAATAGAAGATGCATATGGTAGTGTGAAATTACAAAGAGAGAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  ATCAAGTGACACTAGAAGAAGGTTTTAATACCAAAAGGATACCAGTACTT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAAGTGACACTAGAAGAAGGTTTTAATACCAAAAGGATACCAGTACTT  850

seq1  GTTTGTGGAAGATGCAAGTAAATTATCACTTTTGCTTATTGATGATAGAA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  TTGTAACAACAAAAGGTAGTTACTTATGATACCATAGCAA-TTCCACTCC  949
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  TTGTAACAAC-AAAGGTAGTTACTTATGATACCATAGCAATTTCCACTCC  949

seq1  CAGTTCCA-CACTAAACAGATGTGAAAACCTTTTAACATGGA-GGGTGGG  997
      |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||
seq2  CAGTTCCACCACTAAACAGATGTGAAAACC-TTTAACATGGAGGGGTGGG  998

seq1  AGAACTATACATGTAAAAGCATTATA-TGTAAGAAGAAATAGAAAGAACG  1046
         ||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||   |||
seq2  GAGACTATACATGTAAAAGCATTATATTGTAAGA--GAATAGAA--GACG  1044

seq1  CATCAG-TCTATTAATTTAAACTCATATAGGTAACATATGTTATAGATGT  1095
      |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  CATCAGTTCTATTAATTT-AACTCATATA-GTAACATATGTTATAGATGT  1092

seq1  AAAATAAAATACTAACGAAAAAACCCACAAAATTACTGATGCTTGACATT  1145
      ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||
seq2  AAAATTAAATACTTACGGAAAAA-CCACAAAGTTACTGATGC-TGACATT  1140

seq1  AAA  1148
      |||
seq2  AAA  1143


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