BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-304P14
Chromosome14 (Build37)
Map Location 22,066,796 - 22,236,100
singlet/doubletdoublet
Overlap geneAdk
Upstream geneLOC100039106, Kcnk16, Nudt13, Ecd, AA536717, Dnajc9, Mrps16, Ttc18, Anxa7, Zmynd17, Ppp3cb, Usp54, Myoz1, Synpo2l, Sec24c, Fut11, Chchd1, 2310021P13Rik, Ndst2, Camk2g, Plau, EG620119, Vcl, Ap3m1
Downstream geneMyst4, EG435391, Dusp13, Samd8, Vdac2, Comtd1, Zfp503, 1700112E06Rik, EG665075
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-304P14.bB6Ng01-304P14.g
ACCGA098384GA098385
length1,0811,105
definitionB6Ng01-304P14.b B6Ng01-304P14.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(22,066,796 - 22,067,885)(22,234,992 - 22,236,100)
sequence
gaattcaaagtgcttcttgaaatttagtaattaatctttgcaatattctt
ctgagattattaaaaagttgggacagttgaactacacttgaccttttatc
caaaatgtcagtttttgtgttaaaattccattgtcttggtcaaataggtg
tttactctatagattcattcctggtttttgttatttatttttttaactct
attttttttttcccaagtgccctagtctggactgctttttgcctttttag
ggcttacctgatcatattgagcctttatctgacaatggccttacatgtaa
ccttaaggtgcactgcatttaaaaaattagactagtaagtcaggcataaa
ggtgtacacctataatccttggcctctggagtctgagctgtgttggtcta
ttgttttatcaacttgacacaggtagaataatctagtaagaggggacttt
ctccagtagatttgcctgagggcaagtctgtagaatagttttgattgttt
gatatacgagggtccagcctactgtgggcaacaccagccttgaggagaga
gagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagaggcc
aggtgagcagtagataacaaggtggacaagcaaccttccccattcgtctc
tgctttagctcctgcctctgggcttctacttgggttcctatcgtgacttc
cctctataatggatggtggtgtggacttgtaagccaaatacacctttttc
ctcctccccaagctgcttttgctcatgctctttatcacaaaaatagaaac
caaactaagacaaaaaatcacatgaactcaggttgccaagaggccaacct
gagcaacacaggttcttgtatcccaaataaaaagtgagtatatgagtaaa
acactgaaatgaaaagaatgggttgtttgtttgactagagctttcatgtt
agtgtatatcttaacatacaatgcatctctgccatacaggtgtgtacatt
gtatgtgccaaatgggtctctctttagtaatgcccaacagtgatgtgtaa
catagttgatagtgtgaaaactcagtatttc
gaattccatcctctaaacccatatagtagaagcagagaacaagcccacag
ttgttctcattggccctctgagcgccacacacactgtgtgcacacaagaa
aaacagtaaatacaaatgtctttattttttaagagagaggcattactgct
atttcaagggtttgtgtgtacgtgcacacgtgtgtgtgtgtgtgtatgtg
tgcgcgcactcgtgacatcagaatgtataaagcttaaagcagccagagga
aaagctagtccacagtaaacactcacagctcctatgaatacctgaaaaaa
atgcattacttatcttaaattgagacgtagtagagacataggggatccag
gtctcatttaacgtggtggtttctcacttagacatacaggtgcacagctg
caattccatcactcagaagactacagcaagaggagttcaaacttaaggta
ccatcttaaggttctttctcaaagagtggatgaagcaaattgctgtttct
gatggcacgggctcacagatcaactaactatatactattgtttgtaggag
gctctctgttcacattttcttctagttaatgtgaattttcagtgctggat
ataggtaggtaagagaatagatggattactttgaatatgaaacagttttg
aaagggctagggatgtagttcagtggttgggcatgtgggaggccctgggt
ctcatccgtatttattactgctaaaaaaagaagtttgcagtagaaatgat
aaaaccagcataacaagagttggaaccagtgctctaaaaacttattctac
tctgtgcttggtgtgcatttttaaaaagatgtatggatgcatgtgtgtgt
gagtatgtgcatgtatatatgctggtaagtttacggataccacatgcatg
tacatgtctatagagtgtagaacttgtggatcctgggactggagtgaaag
gctgttgtgagcctcttgatatggctgccaacccaaggctttgggtctct
gagagggtcagtgaacaccttcttatctgctgaacatcctctcagcaatg
gtgtcaaaaggggttttcttttaaggaggtttttgataacttcttttttt
tttgg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_22066796_22067885
seq2: B6Ng01-304P14.b_47_1127

seq1  GAATTCAAAGTGCTTCTTGAAATTTAGTAATTAATCTTTGCAATATTCTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAAGTGCTTCTTGAAATTTAGTAATTAATCTTTGCAATATTCTT  50

seq1  CTGAGATTATTAAAAAGTTGGGACAGTTGAACTACACTTGACCTTTTATC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAGATTATTAAAAAGTTGGGACAGTTGAACTACACTTGACCTTTTATC  100

seq1  CAAAATGTCAGTTTTTGTGTTAAAATTCCATTGTCTTGGTCAAATAGGTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAATGTCAGTTTTTGTGTTAAAATTCCATTGTCTTGGTCAAATAGGTG  150

seq1  TTTACTCTATAGATTCATTCCTGGTTTTTGTTATTTATTTTTTTAACTCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTACTCTATAGATTCATTCCTGGTTTTTGTTATTTATTTTTTTAACTCT  200

seq1  ATTTTTTTTTTCCCAAGTGCCCTAGTCTGGACTGCTTTTTGCCTTTTTAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTTTTTTTCCCAAGTGCCCTAGTCTGGACTGCTTTTTGCCTTTTTAG  250

seq1  GGCTTACCTGATCATATTGAGCCTTTATCTGACAATGGCCTTACATGTAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTTACCTGATCATATTGAGCCTTTATCTGACAATGGCCTTACATGTAA  300

seq1  CCTTAAGGTGCACTGCATTTAAAAAATTAGACTAGTAAGTCAGGCATAAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTAAGGTGCACTGCATTTAAAAAATTAGACTAGTAAGTCAGGCATAAA  350

seq1  GGTGTACACCTATAATCCTTGGCCTCTGGAGTCTGAGCTGTGTTGGTCTA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGTACACCTATAATCCTTGGCCTCTGGAGTCTGAGCTGTGTTGGTCTA  400

seq1  TTGTTTTATCAACTTGACACAGGTAGAATAATCTAGTAAGAGGGGACTTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTTTATCAACTTGACACAGGTAGAATAATCTAGTAAGAGGGGACTTT  450

seq1  CTCCAGTAGATTTGCCTGAGGGCAAGTCTGTAGAATAGTTTTGATTGTTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCAGTAGATTTGCCTGAGGGCAAGTCTGTAGAATAGTTTTGATTGTTT  500

seq1  GATATACGAGGGTCCAGCCTACTGTGGGCAACACCAGCCTTGAGGAGAGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATATACGAGGGTCCAGCCTACTGTGGGCAACACCAGCCTTGAGGAGAGA  550

seq1  GAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGCC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGCC  600

seq1  AGGTGAGCAGTAGATAACAAGGTGGACAAGCAACCTTCCCCATTCGTCTC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTGAGCAGTAGATAACAAGGTGGACAAGCAACCTTCCCCATTCGTCTC  650

seq1  TGCTTTAGCTCCTGCCTCTGGGCTTCTACTTGGGTTCCTATCGTGACTTC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTTAGCTCCTGCCTCTGGGCTTCTACTTGGGTTCCTATCGTGACTTC  700

seq1  CCTCTATAATGGATGGTGGTGTGGACTTGTAAGCCAAATACACC-TTTTC  749
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  CCTCTATAATGGATGGTGGTGTGGACTTGTAAGCCAAATACACCTTTTTC  750

seq1  CTCCTCCCCAAGCTGCTTTTGCTCATGCTCTTTATCACAAAAATAGAAAC  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCTCCCCAAGCTGCTTTTGCTCATGCTCTTTATCACAAAAATAGAAAC  800

seq1  CAAACTAAGACAAAAAATCACATGAACTCAGGTTGCCAAGAGGCCAACCT  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAACTAAGACAAAAAATCACATGAACTCAGGTTGCCAAGAGGCCAACCT  850

seq1  GAGCAACACAGGTTCTTGTATCCCAAATAAAAAGTGAGTATATGAGTAAA  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCAACACAGGTTCTTGTATCCCAAATAAAAAGTGAGTATATGAGTAAA  900

seq1  ACACTGAAATGAAAAAGAATGGGTTGTTTGTTTGACTAGAGCTTTTCATG  949
      ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  ACACTGAAATG-AAAAGAATGGGTTGTTTGTTTGACTAGAGC-TTTCATG  948

seq1  TTAGTGTATATCTTAACAATACAAATGCATCTCTGCCATACAGGTGTGTA  999
      ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGTGTATATCTTAAC-ATAC-AATGCATCTCTGCCATACAGGTGTGTA  996

seq1  CAATTGTATGTGCCAAATTGGTCTCTCTTTAAGTAATGGCCCAAACAGTG  1049
      | |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  || |||||||
seq2  C-ATTGTATGTGCCAAATGGGTCTCTCTTT-AGTAATG--CCCAACAGTG  1042

seq1  AAGTGTAGCATAGTAGATAGTGTGAAAAACTCAGTTATTTC  1090
      | ||||| |||||| ||||||||| ||||||||| ||||||
seq2  ATGTGTAACATAGTTGATAGTGTG-AAAACTCAG-TATTTC  1081

seq1: chr14_22234992_22236100
seq2: B6Ng01-304P14.g_68_1172 (reverse)

seq1  CCAAAAAAAAAAAAAAAAAGTATCAAAAACTTCCTTAAAAGGAAAAACCC  50
      ||   |||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||  |||||||
seq2  CC---AAAAAAAAAAGAAGTTATCAAAAACCTCCTTAAAAG--AAAACCC  45

seq1  CTTTTTACA-CATGGCTGGAGAGATGGTTCAGCAGATAAGA--GTGTTCA  97
      ||||| ||| ||| ||| |||||   |||||||||||||||  |||||||
seq2  CTTTTGACACCATTGCT-GAGAGGATGTTCAGCAGATAAGAAGGTGTTCA  94

seq1  CTGACCCCTCTTCAGAGGACCCAAG-CTTGGTTTGGGCAGCCATATCAAG  146
      |||| ||||| ||||||  || ||| ||||| || |||||||||||||||
seq2  CTGA-CCCTC-TCAGAGACCCAAAGCCTTGGGTT-GGCAGCCATATCAAG  141

seq1  AGGCTCACAACAGCC-TTCACTCCAGTCCCAGGATCCACAAGTTCTACAC  195
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCTCACAACAGCCTTTCACTCCAGTCCCAGGATCCACAAGTTCTACAC  191

seq1  TCTATAGACATGTACATGCATGTGGTATCCGTAAACTTACCAGCATATAT  245
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTATAGACATGTACATGCATGTGGTATCCGTAAACTTACCAGCATATAT  241

seq1  ACATGCACATACTCACACACACATGCATCCATACATCTTTTTAAAAATGC  295
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGCACATACTCACACACACATGCATCCATACATCTTTTTAAAAATGC  291

seq1  ACACCAAGCACAGAGTAGAATAAGTTTTTAGAGCACTGGTTCCAACTCTT  345
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACCAAGCACAGAGTAGAATAAGTTTTTAGAGCACTGGTTCCAACTCTT  341

seq1  GTTATGCTGGTTTTATCATTTCTACTGCAAACTTCTTTTTTTAGCAGTAA  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTATGCTGGTTTTATCATTTCTACTGCAAACTTCTTTTTTTAGCAGTAA  391

seq1  TAAATACGGATGAGACCCAGGGCCTCCCACATGCCCAACCACTGAACTAC  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAATACGGATGAGACCCAGGGCCTCCCACATGCCCAACCACTGAACTAC  441

seq1  ATCCCTAGCCCTTTCAAAACTGTTTCATATTCAAAGTAATCCATCTATTC  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCCTAGCCCTTTCAAAACTGTTTCATATTCAAAGTAATCCATCTATTC  491

seq1  TCTTACCTACCTATATCCAGCACTGAAAATTCACATTAACTAGAAGAAAA  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTACCTACCTATATCCAGCACTGAAAATTCACATTAACTAGAAGAAAA  541

seq1  TGTGAACAGAGAGCCTCCTACAAACAATAGTATATAGTTAGTTGATCTGT  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGAACAGAGAGCCTCCTACAAACAATAGTATATAGTTAGTTGATCTGT  591

seq1  GAGCCCGTGCCATCAGAAACAGCAATTTGCTTCATCCACTCTTTGAGAAA  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCCCGTGCCATCAGAAACAGCAATTTGCTTCATCCACTCTTTGAGAAA  641

seq1  GAACCTTAAGATGGTACCTTAAGTTTGAACTCCTCTTGCTGTAGTCTTCT  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACCTTAAGATGGTACCTTAAGTTTGAACTCCTCTTGCTGTAGTCTTCT  691

seq1  GAGTGATGGAATTGCAGCTGTGCACCTGTATGTCTAAGTGAGAAACCACC  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTGATGGAATTGCAGCTGTGCACCTGTATGTCTAAGTGAGAAACCACC  741

seq1  ACGTTAAATGAGACCTGGATCCCCTATGTCTCTACTACGTCTCAATTTAA  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGTTAAATGAGACCTGGATCCCCTATGTCTCTACTACGTCTCAATTTAA  791

seq1  GATAAGTAATGCATTTTTTTCAGGTATTCATAGGAGCTGTGAGTGTTTAC  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAAGTAATGCATTTTTTTCAGGTATTCATAGGAGCTGTGAGTGTTTAC  841

seq1  TGTGGACTAGCTTTTCCTCTGGCTGCTTTAAGCTTTATACATTCTGATGT  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGACTAGCTTTTCCTCTGGCTGCTTTAAGCTTTATACATTCTGATGT  891

seq1  CACGAGTGCGCGCACACATACACACACACACACACGTGTGCACGTACACA  945
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACGAGTGCGCGCACACATACACACACACACACACGTGTGCACGTACACA  941

seq1  CAAACCCTTGAAATAGCAGTAATGCCTCTCTCTTAAAAAATAAAGACATT  995
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAACCCTTGAAATAGCAGTAATGCCTCTCTCTTAAAAAATAAAGACATT  991

seq1  TGTATTTACTGTTTTTCTTGTGTGCACACAGTGTGTGTGGCGCTCAGAGG  1045
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTATTTACTGTTTTTCTTGTGTGCACACAGTGTGTGTGGCGCTCAGAGG  1041

seq1  GCCAATGAGAACAACTGTGGGCTTGTTCTCTGCTTCTACTATATGGGTTT  1095
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAATGAGAACAACTGTGGGCTTGTTCTCTGCTTCTACTATATGGGTTT  1091

seq1  AGAGGATGGAATTC  1109
      ||||||||||||||
seq2  AGAGGATGGAATTC  1105