BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-308G04
Chromosome14 (Build37)
Map Location 34,508,818 - 34,648,116
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream gene1810011H11Rik, 4922501K12Rik, E130203B14Rik, EG665658, Lrrc18, EG622657, Arhgap22, Mapk8, LOC100040079, LOC665681, Frmpd2, LOC100040093, Ptpn20
Downstream geneGdf10, Gdf2, Rbp3, Zfp488, EG665754, EG432838, Antxrl, Anxa8, LOC100041131, LOC665768, Ppyr1, LOC100041163, Gprin2, Syt15, 3110001K24Rik, LOC623142, Glud1, LOC100041231, 2200001I15Rik, Sncg, Mmrn2, Bmpr1a, 9230112D13Rik, LOC665834, Ldb3, Opn4, 5830448L01Rik, Wapal, LOC100041341, Grid1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-308G04.bB6Ng01-308G04.g
ACCGA100901GA100902
length1,1351,130
definitionB6Ng01-308G04.b B6Ng01-308G04.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(34,508,818 - 34,509,936)(34,647,003 - 34,648,116)
sequence
gaattcacatttgtgcatttttttgagtgtgggcccacctctggcatggt
ttagagggtaatctagcccgggtcctagctgacaaaccgtcttcacctca
tcacctcctgttctaataataccacaggatgtcacacagtggggggtaag
ggaacagccaggactcttggaccccctcagttctgcttggccctgtgaaa
gtcatgcacagtccagagctggatgtgaaaaaaaagcaagaaaaaaagaa
ggggttccagcccaagcccaggattcatcataacaggaagggcaccccca
gctcggtctcttcaaggtcccatagaagtctgtggattttgggagagaaa
taggaacaaaaatttatgatggcctaaaagacaagcaccatagccctcag
aatgcccaggatgacacaggagcccacaagagctgcttcacctctgtcca
gggatgtcgctcacaggagtgaacttgtgatgtgtgaagagagctgtttt
aaggccaagatgagtagctgagggaccagaccctcccttccttgcaggtt
cagtgactagccggccttgggtctgcacatgctgggcctcagagccaaca
gcagactctgagtgaaagcaagccaacccaaggacaggggagttagagaa
aggcaaagggggggtctcagccaggggagcatcacgccaggacggctgca
aggcatggagtcatagctccatatttgctcagtagttactgtccctgaag
ctttgtatctatctgtgacatagccacggtacactgggggggaagacaaa
aggtgatctctgcaccacaggtaaccaagagggctaaatgtaggccatcc
tctgccacagggatcagtgggtaccagccactactactctctttgtttcg
gggccttcaggtgagggatttctataacatctaattttagaggtaggctt
ttctgttttataggtaaagaactgaaggcccacggggcttaagctccttc
ccaagctcacatagctgattacccctccagacacccccgcccctgatcat
tctgagagtcaggcccacagaagagctcccttagcttccttaggcccatg
ggggaatgagatgttgtcctggatgatgttccctg
gaattctggccactggtcctctggtatctgggcagaagtgttactgtcag
ggtagtgaggggtttttacctgagagatgacacatcgctgagagatggcc
acattgggatagaaggtgtggggctggttgcaaagagggttgggaacctt
cctgatctctgcatcagctgccaactccccatacacaccagcactcactt
cccagacctgcatcctctgctacctctagtggttgaagaaaatagtgtgg
ctgcccctgagctttgaaggcaattggtcctctgtgtgtggcatgaccct
gacccctgatatctgtccttcgtccatctggaagccaaatgggacagact
gtagggcagggcctgggagttggaagctctgcctcctctaactgtctgct
ttggagaatgccgaagtcccctgcccaacacactctgaccaagaccctcc
aaacaaggaaaaggaactctcccagcaaaacagtaacctaggatagctaa
ctattccctagttggagggccaggcattgaagctgataatcatggaaaga
agaactctagaactagatagaactgtaaagtggtctgtagatcccaggcc
cagatgtgcacatcttataattgttatatcctttgagtgggacaagatcc
atgcaactgtaatacagggccacacttgagtttggccaaaaaacaaaaac
aaaacaaacaaacaaaaaccacatacacacacacacacacacacacacac
acacacacacacacatacgttctcccctcacctatatatcctatatctct
cagtgctccatagtctgcagagggaacccacaccattccaagtccagcag
gttatattctttcactaggacagtgagaaccagagtctgtagtctccttg
ctatggacgtgtaaacctgatcaagggaatagagcacacaaggtttgaaa
gctgttgagactcagtagctgggtgtttactgttgcaccagttatctcca
tactgactatcaaggactgccagacactcttttgttgcttaaaggtgtca
agtagaacaagcaacattggcttaggacactcagcagcaaccacttaatg
gaagaaatcttcctggaatgcgtgccatgt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_34508818_34509936
seq2: B6Ng01-308G04.b_45_1179

seq1  GAATTCACATTTGTGCATTTTTTTGAGTGTGGGCCCACCTCTGGCATGGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACATTTGTGCATTTTTTTGAGTGTGGGCCCACCTCTGGCATGGT  50

seq1  TTAGAGGGTAATCTAGCCCGGGTCCTAGCTGACAAACCGTCTTCACCTCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGAGGGTAATCTAGCCCGGGTCCTAGCTGACAAACCGTCTTCACCTCA  100

seq1  TCACCTCCTGTTCTAATAATACCACAGGATGTCACACAGTGGGGGGTAAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACCTCCTGTTCTAATAATACCACAGGATGTCACACAGTGGGGGGTAAG  150

seq1  GGAACAGCCAGGACTCTTGGACCCCCTCAGTTCTGCTTGGCCCTGTGAAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAACAGCCAGGACTCTTGGACCCCCTCAGTTCTGCTTGGCCCTGTGAAA  200

seq1  GTCATGCACAGTCCAGAGCTGGATGTGAAAAAAAAGCAAGAAAAAAAGAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCATGCACAGTCCAGAGCTGGATGTGAAAAAAAAGCAAGAAAAAAAGAA  250

seq1  GGGGTTCCAGCCCAAGCCCAGGATTCATCATAACAGGAAGGGCACCCCCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGTTCCAGCCCAAGCCCAGGATTCATCATAACAGGAAGGGCACCCCCA  300

seq1  GCTCGGTCTCTTCAAGGTCCCATAGAAGTCTGTGGATTTTGGGAGAGAAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCGGTCTCTTCAAGGTCCCATAGAAGTCTGTGGATTTTGGGAGAGAAA  350

seq1  TAGGAACAAAAATTTATGATGGCCTAAAAGACAAGCACCATAGCCCTCAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGAACAAAAATTTATGATGGCCTAAAAGACAAGCACCATAGCCCTCAG  400

seq1  AATGCCCAGGATGACACAGGAGCCCACAAGAGCTGCTTCACCTCTGTCCA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGCCCAGGATGACACAGGAGCCCACAAGAGCTGCTTCACCTCTGTCCA  450

seq1  GGGATGTCGCTCACAGGAGTGAACTTGTGATGTGTGAAGAGAGCTGTTTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGATGTCGCTCACAGGAGTGAACTTGTGATGTGTGAAGAGAGCTGTTTT  500

seq1  AAGGCCAAGATGAGTAGCTGAGGGACCAGACCCTCCCTTCCTTGCAGGTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGCCAAGATGAGTAGCTGAGGGACCAGACCCTCCCTTCCTTGCAGGTT  550

seq1  CAGTGACTAGCCGGCCTTGGGTCTGCACATGCTGGGCCTCAGAGCCAACA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGACTAGCCGGCCTTGGGTCTGCACATGCTGGGCCTCAGAGCCAACA  600

seq1  GCAGACTCTGAGTGAAAGCAAGCCAACCCAAGGACAGGGGAGTTAGAGAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGACTCTGAGTGAAAGCAAGCCAACCCAAGGACAGGGGAGTTAGAGAA  650

seq1  AGGCAAAGGGGGGGTCTCAGCCAGGGGAGCATCACGCCAGGACGGCTGCA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCAAAGGGGGGGTCTCAGCCAGGGGAGCATCACGCCAGGACGGCTGCA  700

seq1  AGGCATGGAGTCATAGCTCCATATTTGCTCAGTAGTTACTGTCCCTGAAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCATGGAGTCATAGCTCCATATTTGCTCAGTAGTTACTGTCCCTGAAG  750

seq1  CTTTGTATCTATCTGTGACATAGCCACGGTACACT-GGGGGGAAGACAAA  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  CTTTGTATCTATCTGTGACATAGCCACGGTACACTGGGGGGGAAGACAAA  800

seq1  AGGTGATCTCTGCACCACAGGTAACCAAGAGGGCTAAATGTAGGCCATCC  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTGATCTCTGCACCACAGGTAACCAAGAGGGCTAAATGTAGGCCATCC  850

seq1  TCTGCCACAGGGATCAGT-GGTACCAGCCACTACTACTCTCTTTGTTTCG  898
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCCACAGGGATCAGTGGGTACCAGCCACTACTACTCTCTTTGTTTCG  900

seq1  GGGCCTTCAGGTGAGGGATTTCTATAACATCTAATTTTAGAGGTAGGC-T  947
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  GGGCCTTCAGGTGAGGGATTTCTATAACATCTAATTTTAGAGGTAGGCTT  950

seq1  TTCTGTTTTATAGGTAAAGAACTG-AGGCCCACGGGGCTTAAGCTCCTT-  995
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| 
seq2  TTCTGTTTTATAGGTAAAGAACTGAAGGCCCACGGGGCTTAAGCTCCTTC  1000

seq1  CCAAGCTCACATAGCTGATTACCCTCCCAGACA-CCCCGCCCCTGATCA-  1043
      ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| 
seq2  CCAAGCTCACATAGCTGATTACCCCTCCAGACACCCCCGCCCCTGATCAT  1050

seq1  TCTGAGGAGTCA-GCCCACAG-AGAGCTCCC-TAGC-TCCCTAGG-CCAT  1088
      ||||| |||||| |||||||| ||||||||| |||| ||| |||| ||||
seq2  TCTGA-GAGTCAGGCCCACAGAAGAGCTCCCTTAGCTTCCTTAGGCCCAT  1099

seq1  GGGG--ATGAGATG-TGTCCT-GATGATG-TCCCTG  1119
      ||||  |||||||| |||||| ||||||| ||||||
seq2  GGGGGAATGAGATGTTGTCCTGGATGATGTTCCCTG  1135

seq1: chr14_34647003_34648116
seq2: B6Ng01-308G04.g_63_1192 (reverse)

seq1  ACAT-GCACGCATTCCA-GAAGATT--CTCCATTAAGT-GTTGCTGCTGA  45
      |||| |||||||||||| |||||||   |||||||||| |||||||||||
seq2  ACATGGCACGCATTCCAGGAAGATTTCTTCCATTAAGTGGTTGCTGCTGA  50

seq1  GTGTCCTAAGCCAATG-TGCTTG-TCTACCTGACAC--TTTAGCAAC-AA  90
      |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||  || |||||| ||
seq2  GTGTCCTAAGCCAATGTTGCTTGTTCTACTTGACACCTTTAAGCAACAAA  100

seq1  AGAGTGTCTGGCAGTCCCTGATAGTCAGTATGGGAGAT-ACT-GTGCAAC  138
      ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||||
seq2  AGAGTGTCTGGCAGTCCTTGATAGTCAGTAT-GGAGATAACTGGTGCAAC  149

seq1  AGT-AACACCCAGCTACTGAGTCTCAACAGC-TTCAAACCTTGTGTGCTC  186
      ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  AGTAAACACCCAGCTACTGAGTCTCAACAGCTTTCAAACCTTGTGTGCTC  199

seq1  TATT-CCTTGATCAGG-TTACACGTCCATAGCAAGGAGACTACAGACTCT  234
      |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTCCCTTGATCAGGTTTACACGTCCATAGCAAGGAGACTACAGACTCT  249

seq1  GGTTCTCACTGTCCTAGTG-AAGAATATAACCTGCTGGACTTGGAATGGT  283
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTCTCACTGTCCTAGTGAAAGAATATAACCTGCTGGACTTGGAATGGT  299

seq1  GTGGGTTCCCTCTGCAGACTATGGAGCACTGAGAGATATAGGATATATAG  333
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGGTTCCCTCTGCAGACTATGGAGCACTGAGAGATATAGGATATATAG  349

seq1  GTGAGGGGAGAACGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG  383
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAGGGGAGAACGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG  399

seq1  TGTGTGTATGTGGTTTTTGTTTGTTTGTTTTGTTTTTGTTTTTTGGCCAA  433
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTGTATGTGGTTTTTGTTTGTTTGTTTTGTTTTTGTTTTTTGGCCAA  449

seq1  ACTCAAGTGTGGCCCTGTATTACAGTTGCATGGATCTTGTCCCACTCAAA  483
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCAAGTGTGGCCCTGTATTACAGTTGCATGGATCTTGTCCCACTCAAA  499

seq1  GGATATAACAATTATAAGATGTGCACATCTGGGCCTGGGATCTACAGACC  533
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATATAACAATTATAAGATGTGCACATCTGGGCCTGGGATCTACAGACC  549

seq1  ACTTTACAGTTCTATCTAGTTCTAGAGTTCTTCTTTCCATGATTATCAGC  583
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTTACAGTTCTATCTAGTTCTAGAGTTCTTCTTTCCATGATTATCAGC  599

seq1  TTCAATGCCTGGCCCTCCAACTAGGGAATAGTTAGCTATCCTAGGTTACT  633
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAATGCCTGGCCCTCCAACTAGGGAATAGTTAGCTATCCTAGGTTACT  649

seq1  GTTTTGCTGGGAGAGTTCCTTTTCCTTGTTTGGAGGGTCTTGGTCAGAGT  683
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTTGCTGGGAGAGTTCCTTTTCCTTGTTTGGAGGGTCTTGGTCAGAGT  699

seq1  GTGTTGGGCAGGGGACTTCGGCATTCTCCAAAGCAGACAGTTAGAGGAGG  733
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTTGGGCAGGGGACTTCGGCATTCTCCAAAGCAGACAGTTAGAGGAGG  749

seq1  CAGAGCTTCCAACTCCCAGGCCCTGCCCTACAGTCTGTCCCATTTGGCTT  783
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGCTTCCAACTCCCAGGCCCTGCCCTACAGTCTGTCCCATTTGGCTT  799

seq1  CCAGATGGACGAAGGACAGATATCAGGGGTCAGGGTCATGCCACACACAG  833
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGATGGACGAAGGACAGATATCAGGGGTCAGGGTCATGCCACACACAG  849

seq1  AGGACCAATTGCCTTCAAAGCTCAGGGGCAGCCACACTATTTTCTTCAAC  883
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGACCAATTGCCTTCAAAGCTCAGGGGCAGCCACACTATTTTCTTCAAC  899

seq1  CACTAGAGGTAGCAGAGGATGCAGGTCTGGGAAGTGAGTGCTGGTGTGTA  933
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTAGAGGTAGCAGAGGATGCAGGTCTGGGAAGTGAGTGCTGGTGTGTA  949

seq1  TGGGGAGTTGGCAGCTGATGCAGAGATCAGGAAGGTTCCCAACCCTCTTT  983
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGGAGTTGGCAGCTGATGCAGAGATCAGGAAGGTTCCCAACCCTCTTT  999

seq1  GCAACCAGCCCCACACCTTCTATCCCAATGTGGCCATCTCTCAGCGATGT  1033
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAACCAGCCCCACACCTTCTATCCCAATGTGGCCATCTCTCAGCGATGT  1049

seq1  GTCATCTCTCAGGTAAAAACCCCTCACTACCCTGACAGTAACACTTCTGC  1083
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCATCTCTCAGGTAAAAACCCCTCACTACCCTGACAGTAACACTTCTGC  1099

seq1  CCAGATACCAGAGGACCAGTGGCCAGAATTC  1114
      |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGATACCAGAGGACCAGTGGCCAGAATTC  1130