BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-308H02
Chromosome14 (Build37)
Map Location 15,675,090 - 15,833,215
singlet/doubletdoublet
Overlap geneNek10
Upstream geneGm281, Thoc7, Atxn7, Psmd6, Olfr720, LOC667125, LOC100042543, Olfr31, Il3ra, LOC627139, Olfr721-ps1, LOC667152, LOC100042147, Slc4a7
Downstream geneLrrc3b, LOC667205
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-308H02.bB6Ng01-308H02.g
ACCGA100945GA100946
length1,1971,121
definitionB6Ng01-308H02.b B6Ng01-308H02.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(15,832,026 - 15,833,215)(15,675,090 - 15,676,214)
sequence
gaattccaaaatgtcttggccttgcttctcttccatgtttggctgctcca
ggtaaggccatatacaaagcaatgaacaaagacttaggaacaatgcttag
tgaaaactggccaagggcaaggaaggtaaggggatgtgtgtcaaggtgat
tcccgacacatagcacctgcacacactgggaagctgccaaaaccaattgt
cagtttcccctgagccagctttcattgacctttgaggatgttccctagag
acaggcaggagatgggttattaggttgactggggagaagcatgaagacag
ggtactggctcgttttaaagccttgtttaaaggtgctgcccatagtgtag
caggttctggcatccagttttgctaagcctactgtgagagcggctcagct
ctgttctacagtagggtgactagttgccctaaggggagttagttaaccca
gtcttgggctttggagagacttccatcagagtccactgcacatcagttac
tttgatgaatctgaccagcaagtaaactgacccaatctgagagcagctat
taaaagcaaatgacgtgttatcttgcttgggatttcttaggttaggttta
aatgacactgtacccaccaggatttgatttgtgacaagaatacacattca
gataaagtttgacaacatgcaaaaaaaaatgatttcttaggcaacaacag
tgcacccctgaaagctatcaaacatttatctacgtgtgatgcttctcgtc
tggagcctgtgtccagtgccactgcagttgcactgagctctgacatctca
gaagaatgggaatctgcttctcttcttcaagcctctcaagaatgtggcca
tgctgagtccctccaaaggcctggctcttgttatgtccactagaccccct
cacatcgactatacaacctctaaaacatttatcttgctcatcatttagtg
tggtattcttatatttactcccatgttaattggagactctgagcttcaaa
ggtacaattcagctactaatggctgagctgagatctgaatcaagaatcca
cgtttgcagagtccgtgtctgaagatctcatgcctaccaagcctcctatg
tagaattattcctaagaagtaaccataggtcagatgcctcatgtgatgcc
ttggggtttgtgccttcagccgtcttccattttagaaaaatatttaa
gaattctttcaactttgggggcattcaggaagaaaccatgaatcactaag
tcctgtgtcccacccttgagtgccacaggcccaggagtactgagcagttc
ttacttacctctctgccatcctaggctcatcctaagacctgcactcttgt
ttcctatgtacttttggtgctggctttctgactggcttattgggttggtc
tttcatgcagtacatggagatcgtggccaacgagtacctgggctacgctg
aggagcagcactgtgtggacaagctggtcaatatgacgtgtaagcattgt
tgccaggcacccaaagaatctcgtggacttgggagaaagaacacctgctg
ctcttattattgttccactcacatggtgtgtgcctttgtgccaatggtat
cacatgtccccacatctccccatggcagctctttctttggcaagcatatt
tgtttcaaggaagaagtctttcataaaagcgacatctgttgtgacattga
aagaaaaccttttgatttctgtgaaaatgtcagaaccagggatttttgct
tctaaaattgggtaataattatgcctagctcatataatgtagactaccca
caacatgaaaaggaaaactgagaatctcccctgaaaacagcaatgtggaa
gctgtggccagggtgtgagacatctcagacattcttctggcttcctcaga
aagcttgaccagtttctcttccttctctctcctattgcccttcacccacc
cctcccccttgcagtccctctaggtgtggtcagccacaggattcctgctg
ctttgggtgccagcacaagcccattgtacttgtgtggatagactggtttc
tcatgctttgctggttgggcctacggtggctcttaggggcaggggagatg
ctgggcaccaggatgttcctttgaggacagctttctcggtgcaggtctta
ttgttctgcctggcctcccatctctttgtaagctgggaataatgagtagg
gtcttttaagtccatgcaatgaccttgtaataaataaggttcagacctgt
ttcaacttaatgcacgggagttgctttgtgctatttgcagattactatac
taaggtggagcttctgagttg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_15832026_15833215
seq2: B6Ng01-308H02.b_46_1242 (reverse)

seq1  TTAAATATT----CAAAATGG-AGACAGCTTGAGGCACAACACCCAAAGC  45
      |||||||||     ||||||| |||| |||  ||||||||  ||||| ||
seq2  TTAAATATTTTTCTAAAATGGAAGACGGCTGAAGGCACAAACCCCAAGGC  50

seq1  ATCCACATGAGGCATCTGACTTTTTGTTTTCTCTTTAGAATAATTCTACA  95
      || ||||||||||||||||| | | |||   ||||  |||||||||||||
seq2  AT-CACATGAGGCATCTGACCTATGGTTACTTCTTAGGAATAATTCTACA  99

seq1  TAGGGAAGCTGGGTA-GCATGAGATC-TCAGACACGGACTCTGCAAACGT  143
      || ||| ||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  TA-GGAGGCTTGGTAGGCATGAGATCTTCAGACACGGACTCTGCAAACGT  148

seq1  GGAT--CTGATTCAGATCTCAGCTCAGCCATTTAGTAGCTGAATTGTACC  191
      ||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  GGATTCTTGATTCAGATCTCAGCTCAGCCA-TTAGTAGCTGAATTGTACC  197

seq1  TTTGAAGCTCAGAGTCTCCAA-TAACATGGGAGTAAATATAAGAATACCA  240
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGAAGCTCAGAGTCTCCAATTAACATGGGAGTAAATATAAGAATACCA  247

seq1  CACTAAATGATGAGCAAGATAAATGTTTTAGAGGTTGTATAGTCGATGTG  290
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTAAATGATGAGCAAGATAAATGTTTTAGAGGTTGTATAGTCGATGTG  297

seq1  AGGGGGTCTAGTGGACATAACAAGAGCCAGGCCTTTGGAGGGACTCAGCA  340
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGGGTCTAGTGGACATAACAAGAGCCAGGCCTTTGGAGGGACTCAGCA  347

seq1  TGGCCACATTCTTGAGAGGCTTGAAGAAGAGAAGCAGATTCCCATTCTTC  390
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCCACATTCTTGAGAGGCTTGAAGAAGAGAAGCAGATTCCCATTCTTC  397

seq1  TGAGATGTCAGAGCTCAGTGCAACTGCAGTGGCACTGGACACAGGCTCCA  440
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGATGTCAGAGCTCAGTGCAACTGCAGTGGCACTGGACACAGGCTCCA  447

seq1  GACGAGAAGCATCACACGTAGATAAATGTTTGATAGCTTTCAGGGGTGCA  490
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACGAGAAGCATCACACGTAGATAAATGTTTGATAGCTTTCAGGGGTGCA  497

seq1  CTGTTGTTGCCTAAGAAATCATTTTTTTTTGCATGTTGTCAAACTTTATC  540
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTTGTTGCCTAAGAAATCATTTTTTTTTGCATGTTGTCAAACTTTATC  547

seq1  TGAATGTGTATTCTTGTCACAAATCAAATCCTGGTGGGTACAGTGTCATT  590
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAATGTGTATTCTTGTCACAAATCAAATCCTGGTGGGTACAGTGTCATT  597

seq1  TAAACCTAACCTAAGAAATCCCAAGCAAGATAACACGTCATTTGCTTTTA  640
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAACCTAACCTAAGAAATCCCAAGCAAGATAACACGTCATTTGCTTTTA  647

seq1  ATAGCTGCTCTCAGATTGGGTCAGTTTACTTGCTGGTCAGATTCATCAAA  690
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGCTGCTCTCAGATTGGGTCAGTTTACTTGCTGGTCAGATTCATCAAA  697

seq1  GTAACTGATGTGCAGTGGACTCTGATGGAAGTCTCTCCAAAGCCCAAGAC  740
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAACTGATGTGCAGTGGACTCTGATGGAAGTCTCTCCAAAGCCCAAGAC  747

seq1  TGGGTTAACTAACTCCCCTTAGGGCAACTAGTCACCCTACTGTAGAACAG  790
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGTTAACTAACTCCCCTTAGGGCAACTAGTCACCCTACTGTAGAACAG  797

seq1  AGCTGAGCCGCTCTCACAGTAGGCTTAGCAAAACTGGATGCCAGAACCTG  840
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTGAGCCGCTCTCACAGTAGGCTTAGCAAAACTGGATGCCAGAACCTG  847

seq1  CTACACTATGGGCAGCACCTTTAAACAAGGCTTTAAAACGAGCCAGTACC  890
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACACTATGGGCAGCACCTTTAAACAAGGCTTTAAAACGAGCCAGTACC  897

seq1  CTGTCTTCATGCTTCTCCCCAGTCAACCTAATAACCCATCTCCTGCCTGT  940
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTCTTCATGCTTCTCCCCAGTCAACCTAATAACCCATCTCCTGCCTGT  947

seq1  CTCTAGGGAACATCCTCAAAGGTCAATGAAAGCTGGCTCAGGGGAAACTG  990
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTAGGGAACATCCTCAAAGGTCAATGAAAGCTGGCTCAGGGGAAACTG  997

seq1  ACAATTGGTTTTGGCAGCTTCCCAGTGTGTGCAGGTGCTATGTGTCGGGA  1040
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAATTGGTTTTGGCAGCTTCCCAGTGTGTGCAGGTGCTATGTGTCGGGA  1047

seq1  ATCACCTTGACACACATCCCCTTACCTTCCTTGCCCTTGGCCAGTTTTCA  1090
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCACCTTGACACACATCCCCTTACCTTCCTTGCCCTTGGCCAGTTTTCA  1097

seq1  CTAAGCATTGTTCCTAAGTCTTTGTTCATTGCTTTGTATATGGCCTTACC  1140
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAGCATTGTTCCTAAGTCTTTGTTCATTGCTTTGTATATGGCCTTACC  1147

seq1  TGGAGCAGCCAAACATGGAAGAGAAGCAAGGCCAAGACATTTTGGAATTC  1190
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAGCAGCCAAACATGGAAGAGAAGCAAGGCCAAGACATTTTGGAATTC  1197

seq1: chr14_15675090_15676214
seq2: B6Ng01-308H02.g_67_1187

seq1  GAATTCTTTCAACTTTGGGGGCATTCAGGAAGAAACCATGAATCACTAAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTTCAACTTTGGGGGCATTCAGGAAGAAACCATGAATCACTAAG  50

seq1  TCCTGTGTCCCACCCTTGAGTGCCACAGGCCCAGGAGTACTGAGCAGTTC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTGTGTCCCACCCTTGAGTGCCACAGGCCCAGGAGTACTGAGCAGTTC  100

seq1  TTACTTACCTCTCTGCCATCCTAGGCTCATCCTAAGACCTGCACTCTTGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACTTACCTCTCTGCCATCCTAGGCTCATCCTAAGACCTGCACTCTTGT  150

seq1  TTCCTATGTACTTTTGGTGCTGGCTTTCTGACTGGCTTATTGGGTTGGTC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCTATGTACTTTTGGTGCTGGCTTTCTGACTGGCTTATTGGGTTGGTC  200

seq1  TTTCATGCAGTACATGGAGATCGTGGCCAACGAGTACCTGGGCTACGCTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCATGCAGTACATGGAGATCGTGGCCAACGAGTACCTGGGCTACGCTG  250

seq1  AGGAGCAGCACTGTGTGGACAAGCTGGTCAATATGACGTGTAAGCATTGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAGCAGCACTGTGTGGACAAGCTGGTCAATATGACGTGTAAGCATTGT  300

seq1  TGCCAGGCACCCAAAGAATCTCGTGGACTTGGGAGAAAGAACACCTGCTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCAGGCACCCAAAGAATCTCGTGGACTTGGGAGAAAGAACACCTGCTG  350

seq1  CTCTTATTATTGTTCCACTCACATGGTGTGTGCCTTTGTGCCAATGGTAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTTATTATTGTTCCACTCACATGGTGTGTGCCTTTGTGCCAATGGTAT  400

seq1  CACATGTCCCCACATCTCCCCATGGCAGCTCTTTCTTTGGCAAGCATATT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATGTCCCCACATCTCCCCATGGCAGCTCTTTCTTTGGCAAGCATATT  450

seq1  TGTTTCAAGGAAGAAGTCTTTCATAAAAGCGACATCTGTTGTGACATTGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTCAAGGAAGAAGTCTTTCATAAAAGCGACATCTGTTGTGACATTGA  500

seq1  AAGAAAACCTTTTGATTTCTGTGAAAATGTCAGAACCAGGGATTTTTGCT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAAAACCTTTTGATTTCTGTGAAAATGTCAGAACCAGGGATTTTTGCT  550

seq1  TCTAAAATTGGGTAATAATTATGCCTAGCTCATATAATGTAGACTACCCA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAAAATTGGGTAATAATTATGCCTAGCTCATATAATGTAGACTACCCA  600

seq1  CAACATGAAAAGGAAAACTGAGAATCTCCCCTGAAAACAGCAATGTGGAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACATGAAAAGGAAAACTGAGAATCTCCCCTGAAAACAGCAATGTGGAA  650

seq1  GCTGTGGCCAGGGTGTGAGACATCTCAGACATTCTTCTGGCTTCCTCAGA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGTGGCCAGGGTGTGAGACATCTCAGACATTCTTCTGGCTTCCTCAGA  700

seq1  AAGCTTGACCAGTTTCTCTTCCTTCTCTCTCCTATTGCCCTTCACCCACC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCTTGACCAGTTTCTCTTCCTTCTCTCTCCTATTGCCCTTCACCCACC  750

seq1  CCTCCCCCTTGCAGTCCCTCTAGGTGTGGTCAGCCACAGGATTCCTGCTG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCCCCCTTGCAGTCCCTCTAGGTGTGGTCAGCCACAGGATTCCTGCTG  800

seq1  CTTTGGGTGCCAGCACAAGCCCATTGTACTTGTGTGGATAGACTGGTTTC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTGGGTGCCAGCACAAGCCCATTGTACTTGTGTGGATAGACTGGTTTC  850

seq1  TCATGCTTTGCTGGTTGGGCCTACGGTGGCTCTTAGGGGCAGGGGAGATG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATGCTTTGCTGGTTGGGCCTACGGTGGCTCTTAGGGGCAGGGGAGATG  900

seq1  CTGGGCACCAGGATGTTCCTTTGAGGACAGCTTTCTCGGTGCAGGTCTTA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGGCACCAGGATGTTCCTTTGAGGACAGCTTTCTCGGTGCAGGTCTTA  950

seq1  -TGTTCTGCCTGGCCTCCCATCTCTTTGTAAGCT-GGAATAATGAGTAGG  998
       ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  TTGTTCTGCCTGGCCTCCCATCTCTTTGTAAGCTGGGAATAATGAGTAGG  1000

seq1  GTCTTTTAAGTCCATGCCATGACCTTGTAATAAATAAGGTTCAGGAACCT  1048
      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||
seq2  GTCTTTTAAGTCCATGCAATGACCTTGTAATAAATAAGGTTCAG--ACCT  1048

seq1  G-TTCAACTTTAAATGCACGGGGAGTTTGCTTTTGTGCTATTTGCAGATT  1097
      | ||||||||  ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| |
seq2  GTTTCAACTT--AATGCAC-GGGAG-TTGC-TTTGTGCTATTTGCAGA-T  1092

seq1  TACTATACT-AGGT-GAGCTTCTAGAGTTG  1125
      ||||||||| |||| |||||||| ||||||
seq2  TACTATACTAAGGTGGAGCTTCT-GAGTTG  1121