BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-314C21
Chromosome14 (Build37)
Map Location 39,626,464 - 39,773,197
singlet/doubletdoublet
Overlap geneNrg3
Upstream geneLOC382872, LOC100041521
Downstream genenone
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-314C21.bB6Ng01-314C21.g
ACCGA105193GA105194
length1,0381,092
definitionB6Ng01-314C21.b B6Ng01-314C21.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(39,626,464 - 39,627,511)(39,772,097 - 39,773,197)
sequence
gaattctccatttttatgattttaaaatctaattgactagtacatgaatc
tataaaataataacatttctggtataagataagatatctccaagcactct
tcctatatctattttattttaacagttttgataaaccattcagttaatac
taaaattgatagcacaaatattatacttgatatatcttgggccaatgtta
atgctgatttatgcagattagaaagtctttggcttatattttctaagcta
ttcattaacatagcgctttgaaggcagtagagcaaagattatcatcatta
tgctgaatttacaaatgaattctgagtctgaagagattagataaattgct
atggaggagaaacctttcctcaaagtcagagtctttatcaaaatgaaatt
tgcatcctttggcagggactctttagtaatctgctgtggctctgacaagc
ccacatgtgaagaaggttctgaccaactagctgggttgagatagtgatat
ttgtagttagaaaaatctctgagggttggcaatgcctctcaaaaaataaa
ggtcatttagagcacaggtgatttccttgtagattgagtttgtcacacaa
tttacttagaatagagaagatttcctgttttattttcattttccactaca
ccatatttgacatgtgattatacatctgtcatgtatatgatgtgaacact
ctagctagttgtacatcatctgtgctctgtaatttcaaaagattttattg
aatgcatgagtcctcaaatgctactttctatataagtagtgcatgcagta
tatgctggtcttcatgctctgattcttggtctaatccctatcttcaagat
aggaaactatattgtgattgtcatagtaagaatgactagagtcaagaagt
ggccatgatcgtgaattaatacctatgccttccttatgatacacttagaa
aatttagaaaataatgtaaatcagctccatgtgtggcaggtgaactacgg
tgggggaagattcacactaaaggttatatttttatcaa
gaattctcttgtttttaaactcattgatcatatatacaaaccaatctaat
atatggtcacatagtataaccctggcaagcttgatattaagattaatcat
cacaagggaacttgcattaactgagttcagtcttgagagtgtgaattgcg
tgttctgatggattagaatggttgaaattctcactagggtttgggaaatg
aaagtcattcataagcaatcactgattccttctgtgttcacccattttta
tttaaaaacttgcttactctgaaaaaaatccctcttgtgcttgcacagcc
tattgttaagtgagggagtatttgcggggcttccctgttcagctcattta
cacagctctggcccagcagtgcgttgtaaatgtctaccataaaggtttgc
tagttattgcgcttaatttgtattccgatggaagcaaagagaaggaaaaa
tacacaagcagtcgtcttgtaattacgctacataaaattattaggcaatc
ttgaaaattgttagtgggaagctgcccatcatgcataaaaataattttga
tttcaacatccagagtttaatgtgagaatgattgtagggagaccacactg
ttaatttttcctttaattattcaagcacatttgaatttgttttaaagaaa
gtgatagcttgataaagttgaatcactgcagtcaagataatgctgctttg
gctgtgagacaaagttcatgttctaagacatgctgtgaactgtaaaacta
tgagaacagcaaagaacatttttcctttgtttccctaacctctctaatga
caagtagtaaataattgatatatttccaggcaaactgaagaacattatgt
tgtaggcatatccaggtttttcagataattttgtctgaatgttgaaaagt
ctttaaactccacgttctcatgacacattattcattcaaatattttttca
atttagtgtcatgtgcttcagtaatttaaaattaataatatatttccatt
attattaatatttctgcaattatctataggtattaaataagtaccctcta
aaggcttcaaatgtaataataccacacatttatttaaaaaaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_39626464_39627511
seq2: B6Ng01-314C21.b_43_1080

seq1  GAATTCTCCATTTTTATGATTTTAAAATCTAATTGACTAGTACATGAATC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCCATTTTTATGATTTTAAAATCTAATTGACTAGTACATGAATC  50

seq1  TATAAAATAATAACATTTCTGGTATAAGATAAGATATCTCCAAGCACTCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAAAATAATAACATTTCTGGTATAAGATAAGATATCTCCAAGCACTCT  100

seq1  TCCTATATCTATTTTATTTTAACAGTTTTGATAAACCATTCAGTTAATAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTATATCTATTTTATTTTAACAGTTTTGATAAACCATTCAGTTAATAC  150

seq1  TAAAATTGATAGCACAAATATTATACTTGATATATCTTGGGCCAATGTTA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAATTGATAGCACAAATATTATACTTGATATATCTTGGGCCAATGTTA  200

seq1  ATGCTGATTTATGCAGATTAGAAAGTCTTTGGCTTATATTTTCTAAGCTA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCTGATTTATGCAGATTAGAAAGTCTTTGGCTTATATTTTCTAAGCTA  250

seq1  TTCATTAACATAGCGCTTTGAAGGCAGTAGAGCAAAGATTATCATCATTA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCATTAACATAGCGCTTTGAAGGCAGTAGAGCAAAGATTATCATCATTA  300

seq1  TGCTGAATTTACAAATGAATTCTGAGTCTGAAGAGATTAGATAAATTGCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGAATTTACAAATGAATTCTGAGTCTGAAGAGATTAGATAAATTGCT  350

seq1  ATGGAGGAGAAACCTTTCCTCAAAGTCAGAGTCTTTATCAAAATGAAATT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGAGGAGAAACCTTTCCTCAAAGTCAGAGTCTTTATCAAAATGAAATT  400

seq1  TGCATCCTTTGGCAGGGACTCTTTAGTAATCTGCTGTGGCTCTGACAAGC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCATCCTTTGGCAGGGACTCTTTAGTAATCTGCTGTGGCTCTGACAAGC  450

seq1  CCACATGTGAAGAAGGTTCTGACCAACTAGCTGGGTTGAGATAGTGATAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACATGTGAAGAAGGTTCTGACCAACTAGCTGGGTTGAGATAGTGATAT  500

seq1  TTGTAGTTAGAAAAATCTCTGAGGGTTGGCAATGCCTCTCAAAAAATAAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTAGTTAGAAAAATCTCTGAGGGTTGGCAATGCCTCTCAAAAAATAAA  550

seq1  GGTCATTTAGAGCACAGGTGATTTCCTTGTAGATTGAGTTTGTCACACAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCATTTAGAGCACAGGTGATTTCCTTGTAGATTGAGTTTGTCACACAA  600

seq1  TTTACTTAGAATAGAGAAGATTTCCTGTTTTATTTTCATTTTCCACTACA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTACTTAGAATAGAGAAGATTTCCTGTTTTATTTTCATTTTCCACTACA  650

seq1  CCATATTTGACATGTGATTATACATCTGTCATGTATATGATGTGAACACT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATATTTGACATGTGATTATACATCTGTCATGTATATGATGTGAACACT  700

seq1  CTAGCTAGTTGTACATCATCTGTGCTCTGTAATTTCAAAAGATTTTATTG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGCTAGTTGTACATCATCTGTGCTCTGTAATTTCAAAAGATTTTATTG  750

seq1  AATGCATGAGTCCTCAAATGCTACTTTCTATATAAGTAGTGCATGCAGTA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGCATGAGTCCTCAAATGCTACTTTCTATATAAGTAGTGCATGCAGTA  800

seq1  TATGCTGGTCTTCATGCTCTGATTCTTGGTCTAATCCCTATCTTCAAGAT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGCTGGTCTTCATGCTCTGATTCTTGGTCTAATCCCTATCTTCAAGAT  850

seq1  AGGAAACTATATTGTGATTGTCATAGTAAGAATGACTAGAGTCAAGAAAG  900
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  AGGAAACTATATTGTGATTGTCATAGTAAGAATGACTAGAGTCAAG-AAG  899

seq1  TGGCCATGATCGTGAATTAATACCTATGCCTTCCTTAATGATACACTTAG  950
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  TGGCCATGATCGTGAATTAATACCTATGCCTTCCTT-ATGATACACTTAG  948

seq1  AAAATTTAGGAAAATAATGTAAATTCAAGCTCCAATGTGTGGCAGGGGTG  1000
      |||||||| |||||||||||||||   |||||| |||||||||||| |  
seq2  AAAATTTA-GAAAATAATGTAAAT--CAGCTCC-ATGTGTGGCAGGTG--  992

seq1  GAAACTAGGGGTGGGGGAAGAATTTCACACTAAA-GTTATA--TTTATCA  1047
        |||||  ||||||||||||  ||||||||||| ||||||  |||||||
seq2  --AACTA-CGGTGGGGGAAGA--TTCACACTAAAGGTTATATTTTTATCA  1037

seq1  A  1048
      |
seq2  A  1038

seq1: chr14_39772097_39773197
seq2: B6Ng01-314C21.g_64_1155 (reverse)

seq1  TTTTTTTTAATAAATGTGTGTAATTAATTACATTTGAACCCTTTTAGAGG  50
      ||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||| || ||||||||
seq2  TTTTTTTAAATAAATGTGTGGTATT-ATTACATTTGAAGCC-TTTAGAGG  48

seq1  TAACTTATTTAAATTAACTATAGATAAATTTTGCAAGAAATTATTAATAA  100
        ||||||||||  || ||||||||||   |||| ||||| |||||||||
seq2  GTACTTATTTAA--TACCTATAGATAA---TTGC-AGAAA-TATTAATAA  91

seq1  TAATGGAAATATATTATTAATTTTAATTTACTGAAGCACATGACACTAAA  150
      |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  TAATGGAAATATATTATTAATTTTAAATTACTGAAGCACATGACACTAAA  141

seq1  TTG-AAAAATATTTGAATGAATAATGTGTCATGAGAACGTGGAGTTTAAA  199
      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAAAAAATATTTGAATGAATAATGTGTCATGAGAACGTGGAGTTTAAA  191

seq1  GACTTTTCAACATTTCAGACAAAATTATCTGAAAAACCTGGATATGCCTA  249
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTTTTCAACA-TTCAGACAAAATTATCTGAAAAACCTGGATATGCCTA  240

seq1  CAACATAATGTTCTTCAGTTTGCCTGGAAATATATCAATTATTTACTACT  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACATAATGTTCTTCAGTTTGCCTGGAAATATATCAATTATTTACTACT  290

seq1  TGTCATTAGAGAGGTTAGGGAAACAAAGGAAAAATGTTCTTTGCTGTTCT  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCATTAGAGAGGTTAGGGAAACAAAGGAAAAATGTTCTTTGCTGTTCT  340

seq1  CATAGTTTTACAGTTCACAGCATGTCTTAGAACATGAACTTTGTCTCACA  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAGTTTTACAGTTCACAGCATGTCTTAGAACATGAACTTTGTCTCACA  390

seq1  GCCAAAGCAGCATTATCTTGACTGCAGTGATTCAACTTTATCAAGCTATC  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAAAGCAGCATTATCTTGACTGCAGTGATTCAACTTTATCAAGCTATC  440

seq1  ACTTTCTTTAAAACAAATTCAAATGTGCTTGAATAATTAAAGGAAAAATT  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTTCTTTAAAACAAATTCAAATGTGCTTGAATAATTAAAGGAAAAATT  490

seq1  AACAGTGTGGTCTCCCTACAATCATTCTCACATTAAACTCTGGATGTTGA  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAGTGTGGTCTCCCTACAATCATTCTCACATTAAACTCTGGATGTTGA  540

seq1  AATCAAAATTATTTTTATGCATGATGGGCAGCTTCCCACTAACAATTTTC  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCAAAATTATTTTTATGCATGATGGGCAGCTTCCCACTAACAATTTTC  590

seq1  AAGATTGCCTAATAATTTTATGTAGCGTAATTACAAGACGACTGCTTGTG  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGATTGCCTAATAATTTTATGTAGCGTAATTACAAGACGACTGCTTGTG  640

seq1  TATTTTTCCTTCTCTTTGCTTCCATCGGAATACAAATTAAGCGCAATAAC  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTTTCCTTCTCTTTGCTTCCATCGGAATACAAATTAAGCGCAATAAC  690

seq1  TAGCAAACCTTTATGGTAGACATTTACAACGCACTGCTGGGCCAGAGCTG  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCAAACCTTTATGGTAGACATTTACAACGCACTGCTGGGCCAGAGCTG  740

seq1  TGTAAATGAGCTGAACAGGGAAGCCCCGCAAATACTCCCTCACTTAACAA  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAAATGAGCTGAACAGGGAAGCCCCGCAAATACTCCCTCACTTAACAA  790

seq1  TAGGCTGTGCAAGCACAAGAGGGATTTTTTTCAGAGTAAGCAAGTTTTTA  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGCTGTGCAAGCACAAGAGGGATTTTTTTCAGAGTAAGCAAGTTTTTA  840

seq1  AATAAAAATGGGTGAACACAGAAGGAATCAGTGATTGCTTATGAATGACT  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAAAAATGGGTGAACACAGAAGGAATCAGTGATTGCTTATGAATGACT  890

seq1  TTCATTTCCCAAACCCTAGTGAGAATTTCAACCATTCTAATCCATCAGAA  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCATTTCCCAAACCCTAGTGAGAATTTCAACCATTCTAATCCATCAGAA  940

seq1  CACGCAATTCACACTCTCAAGACTGAACTCAGTTAATGCAAGTTCCCTTG  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACGCAATTCACACTCTCAAGACTGAACTCAGTTAATGCAAGTTCCCTTG  990

seq1  TGATGATTAATCTTAATATCAAGCTTGCCAGGGTTATACTATGTGACCAT  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATGATTAATCTTAATATCAAGCTTGCCAGGGTTATACTATGTGACCAT  1040

seq1  ATATTAGATTGGTTTGTATATATGATCAATGAGTTTAAAAACAAGAGAAT  1099
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATTAGATTGGTTTGTATATATGATCAATGAGTTTAAAAACAAGAGAAT  1090

seq1  TC  1101
      ||
seq2  TC  1092