BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-318L23
Chromosome14 (Build37)
Map Location 73,893,087 - 74,014,501
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100043152, Med4, Nudt15, Sucla2
Upstream geneLOC675957, Fndc3a, LOC100043721, LOC100043723, LOC668487, LOC668489, Cysltr2, LOC100043149, Rcbtb2, Rb1, P2ry5, Itm2b
Downstream geneLOC100043734, EG629578, LOC629583
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-318L23.bB6Ng01-318L23.g
ACCGA108556GA108557
length1,1041,084
definitionB6Ng01-318L23.b B6Ng01-318L23.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(73,893,087 - 73,894,207)(74,013,424 - 74,014,501)
sequence
gaattcatttcagaggatgggaagtacttctaaccatcacgtggagaaga
cctgaagaaagatgctgtagatatcagatggtggattccatcattaaaaa
gagatactacgattcccatattcttcaaagaggagcaacccctttccagt
gttttcctcattagttcacctggattttgatgctggactcactgtgatgt
aatggatcatgttttcatgcaagtgacaggaaagaagcacattgcgctgt
tcagtcttggggatgcacaacatttatatgtatcgggttgtaaatcagaa
gtgctgaatgccggcagcccagagctggataaatccccacctttcctaag
gtgaggaggtatgagttctcttgaagctggtgatggcctactcactcccg
ccttgtggttccatactgtaatttctgaggagtttgtagtgggagggaat
agctttcggaagcaccttccatgggaacgctacgacacaacagatacctg
tggtaacagagatcctgtagcaacatccagagctgtgcagatcttggaca
gacctttaaaaacactggctgaattcccagaggaatacagggacttctat
acatgccaaatggtctcacatattcaagacaaagcctatagcaagaggga
aaaaaaaagaactaaatgtagtaaaaaattaaaaataaataaaactcagc
tcaagtatttgaaaactgtaaccagtataaatatttaaagatgcttttta
aaaacaggaaaaataagtctcagatttatagtataaaaggagatgcttat
ctgatttctacctggtatagatttagaatgcttagaggaaccattcttta
gctctaaaatgtaaataactaaaattctgacgacctacctacctacctac
ctacctacctacctatctagagagagcctgccagccaccatataacacag
cacaggaggagagacattcagagacctgtcacgtcatgccacacatagca
gaggtaagatgcctagagactgctgcacatgctatgcagtgtgtgtacag
ataagggagagctggcggctagcagctcagttatcttgcccgccacgccc
tctg
gaattcaccagaacagaaggagaaagaagaaagtcaaatataatagatta
attatgcacactaaggccaactgaatagtcacgcacaaatgaaatctata
cagctgttgtccaggactaaggttaggagaaatgggaaaaactgtttttt
acaaacagttgccacaggctactgagatgtctccatccaggcagtgcctt
atttcagatggcgggttccctggagggattgtggctcctgtttctcaggg
tcccagatgctgtcctttctaacaagatgctgccgtgggcttctgagatg
tctccatcccagccaactgcaggcagtccctgtcattgtatgccatcccc
agcaactctccttctctgtggctgcatgaaagccactgggtctgctctat
ctaccatccctgatagaaacaactcttttgttgctaacaagcctcagatc
ttttccatcattgtattggtttctctttttccatagagctcagcagtgtt
gtgatgatcctcctgcctgaacctcccaaactcacagcacacacgcgcgc
gcacgcacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacca
cctcccacaaccgggctagaacactcagattgagagtagcatttatgtgt
gtgaacatttatgagcaacaatctatgtacagccaacatttgatatggaa
aaattactcttctgggaaatgaaagacttatatacaatctaaaattatta
gtctacattttctagtgttttgaaaagactcggggcatctttcaattaaa
ccattttcatttccctcgtgaaaagcagtgtgcttatctaagaatcatat
aaaccatagctggagggattagatagctcagcgggttaagaacactatct
gctttttccagaggacctgggtttgaatcccaacactcacatggtggctc
acagtaatctatattccccaagatccaatgctctttttctgccttctaaa
agcatcaggcacgcattgtagtacaccagatatccacacaagacaaagca
gtcatacaccatacaggatcatagaaattcagac
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_73893087_73894207
seq2: B6Ng01-318L23.b_49_1152

seq1  GAATTCATTTCAGAGGATGGGAAGTACTTCTAACCATCACGTGGAGAAGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATTTCAGAGGATGGGAAGTACTTCTAACCATCACGTGGAGAAGA  50

seq1  CCTGAAGAAAGATGCTGTAGATATCAGATGGTGGATTCCATCATTAAAAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGAAGAAAGATGCTGTAGATATCAGATGGTGGATTCCATCATTAAAAA  100

seq1  GAGATACTACGATTCCCATATTCTTCAAAGAGGAGCAACCCCTTTCCAGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGATACTACGATTCCCATATTCTTCAAAGAGGAGCAACCCCTTTCCAGT  150

seq1  GTTTTCCTCATTAGTTCACCTGGATTTTGATGCTGGACTCACTGTGATGT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTTCCTCATTAGTTCACCTGGATTTTGATGCTGGACTCACTGTGATGT  200

seq1  AATGGATCATGTTTTCATGCAAGTGACAGGAAAGAAGCACATTGCGCTGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGGATCATGTTTTCATGCAAGTGACAGGAAAGAAGCACATTGCGCTGT  250

seq1  TCAGTCTTGGGGATGCACAACATTTATATGTATCGGGTTGTAAATCAGAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGTCTTGGGGATGCACAACATTTATATGTATCGGGTTGTAAATCAGAA  300

seq1  GTGCTGAATGCCGGCAGCCCAGAGCTGGATAAATCCCCACCTTTCCTAAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCTGAATGCCGGCAGCCCAGAGCTGGATAAATCCCCACCTTTCCTAAG  350

seq1  GTGAGGAGGTATGAGTTCTCTTGAAGCTGGTGATGGCCTACTCACTCCCG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAGGAGGTATGAGTTCTCTTGAAGCTGGTGATGGCCTACTCACTCCCG  400

seq1  CCTTGTGGTTCCATACTGTAATTTCTGAGGAGTTTGTAGTGGGAGGGAAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTGTGGTTCCATACTGTAATTTCTGAGGAGTTTGTAGTGGGAGGGAAT  450

seq1  AGCTTTCGGAAGCACCTTCCATGGGAACGCTACGACACAACAGATACCTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTTTCGGAAGCACCTTCCATGGGAACGCTACGACACAACAGATACCTG  500

seq1  TGGTAACAGAGATCCTGTAGCAACATCCAGAGCTGTGCAGATCTTGGACA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTAACAGAGATCCTGTAGCAACATCCAGAGCTGTGCAGATCTTGGACA  550

seq1  GACCTTTAAAAACACTGGCTGAATTCCCAGAGGAATACAGGGACTTCTAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCTTTAAAAACACTGGCTGAATTCCCAGAGGAATACAGGGACTTCTAT  600

seq1  ACATGCCAAATGGTCTCACATATTCAAGACAAAGCCTATAGCAAGAGGGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGCCAAATGGTCTCACATATTCAAGACAAAGCCTATAGCAAGAGGGA  650

seq1  AAAAAAAAGAACTAAATGTAGTAAAAAATTAAAAATAAATAAAACTCAGC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAAAAGAACTAAATGTAGTAAAAAATTAAAAATAAATAAAACTCAGC  700

seq1  TCAAGTATTTGAAAACTGTAACCAGTATAAATATTTAAAGATGCTTTTTA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAGTATTTGAAAACTGTAACCAGTATAAATATTTAAAGATGCTTTTTA  750

seq1  AAAACAGGAAAAATAAGTCTCAGATTTATAGTATAAAAGGAGATGCTTAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAACAGGAAAAATAAGTCTCAGATTTATAGTATAAAAGGAGATGCTTAT  800

seq1  CTGATTTCTACCTGGTATAGATTTAGAATGCTTAGAGGAACCATTCTTTA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGATTTCTACCTGGTATAGATTTAGAATGCTTAGAGGAACCATTCTTTA  850

seq1  GCTCTAAAATGTAAATAACTAAAATTCTGACGACCTACCTACCTACCTAC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCTAAAATGTAAATAACTAAAATTCTGACGACCTACCTACCTACCTAC  900

seq1  CTACCTACCTACCTATCTAGAGAGAAGCCTGCCAGCCACCATATAACACA  950
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACCTACCTACCTATCTAGAGAG-AGCCTGCCAGCCACCATATAACACA  949

seq1  GCACAGGAGGAGGAAGACATTCAGAGACCTGTTCACCGCCATGCCACACA  1000
      ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||
seq2  GCACAGGAGGAG--AGACATTCAGAGACCTG-TCA-CGTCATGCCACACA  995

seq1  TAGCAGAGGGAAAGATGCCCAGAGACCTGCCTGCCACCATGCTATGCAGT  1050
      ||||||| || |||||||| ||||| ||| ||||   |||||||||||||
seq2  TAGCAGA-GGTAAGATGCCTAGAGA-CTG-CTGC--ACATGCTATGCAGT  1040

seq1  GTGGTGGTACAGATAAGGGAGAGCTGGCGGGCTAAGCAGCTCAGTTATC-  1099
      |||   |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| 
seq2  GTG--TGTACAGATAAGGGAGAGCTGGC-GGCT-AGCAGCTCAGTTATCT  1086

seq1  TGCCCGCCCCTCCGCCCCTCTG  1121
      |||||||| |     |||||||
seq2  TGCCCGCCAC----GCCCTCTG  1104

seq1: chr14_74013424_74014501
seq2: B6Ng01-318L23.g_67_1150 (reverse)

seq1  GTCTG-ATTTCTATGATTCTTGTTATGTGTATGACTGCTTTGTC-TGTGT  48
      ||||| |||||||||| || |||   |||||||||||||||||| |||||
seq2  GTCTGAATTTCTATGA-TCCTGTATGGTGTATGACTGCTTTGTCTTGTGT  49

seq1  GATTATCT-GTGTACTAC-ATGCGTGCCTGATGCTTTTAGAAGGCAG-AA  95
      |  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  GGATATCTGGTGTACTACAATGCGTGCCTGATGCTTTTAGAAGGCAGAAA  99

seq1  AAGAGCATTGGATTCTTGGGGAATATAGATTACTGTGAGCCACCATGTGA  145
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGCATTGGA-TCTTGGGGAATATAGATTACTGTGAGCCACCATGTGA  148

seq1  GTGTTGGGATTCAAACCCAGGTCCTCTGG-AAAAGCAGATAGTGTTCTTA  194
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  GTGTTGGGATTCAAACCCAGGTCCTCTGGAAAAAGCAGATAGTGTTCTTA  198

seq1  A-CCGCTGAGCTATCTAATCCCTCCAGCTATGGTTTATATGATTCTTAGA  243
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCGCTGAGCTATCTAATCCCTCCAGCTATGGTTTATATGATTCTTAGA  248

seq1  TAAGCACACTGCTTTTCACGAGGGAAATGAAAATGGTTTAATTGAAAGAT  293
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGCACACTGCTTTTCACGAGGGAAATGAAAATGGTTTAATTGAAAGAT  298

seq1  GCCCCGAGTCTTTTCAAAACACTAGAAAATGTAGACTAATAATTTTAGAT  343
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCCGAGTCTTTTCAAAACACTAGAAAATGTAGACTAATAATTTTAGAT  348

seq1  TGTATATAAGTCTTTCATTT-CCAGAAGAGTAATTTTTCCATATCAAATG  392
      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTATATAAGTCTTTCATTTCCCAGAAGAGTAATTTTTCCATATCAAATG  398

seq1  TTGGCTGTACATAGATTGTTGCTCATAAATGTTCACACACATAAATGCTA  442
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGCTGTACATAGATTGTTGCTCATAAATGTTCACACACATAAATGCTA  448

seq1  CTCTCAATCTGAGTGTTCTAGCCCGGTTGTGGGAGGTGGTGTGTGTGTGT  492
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTCAATCTGAGTGTTCTAGCCCGGTTGTGGGAGGTGGTGTGTGTGTGT  498

seq1  GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGTGCGCGCGCGTGTGTGC  542
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGTGCGCGCGCGTGTGTGC  548

seq1  TGTGAGTTTGGGAGGTTCAGGCAGGAGGATCATCACAACACTGCTGAGCT  592
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGAGTTTGGGAGGTTCAGGCAGGAGGATCATCACAACACTGCTGAGCT  598

seq1  CTATGGAAAAAGAGAAACCAATACAATGATGGAAAAGATCTGAGGCTTGT  642
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATGGAAAAAGAGAAACCAATACAATGATGGAAAAGATCTGAGGCTTGT  648

seq1  TAGCAACAAAAGAGTTGTTTCTATCAGGGATGGTAGATAGAGCAGACCCA  692
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCAACAAAAGAGTTGTTTCTATCAGGGATGGTAGATAGAGCAGACCCA  698

seq1  GTGGCTTTCATGCAGCCACAGAGAAGGAGAGTTGCTGGGGATGGCATACA  742
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGCTTTCATGCAGCCACAGAGAAGGAGAGTTGCTGGGGATGGCATACA  748

seq1  ATGACAGGGACTGCCTGCAGTTGGCTGGGATGGAGACATCTCAGAAGCCC  792
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGACAGGGACTGCCTGCAGTTGGCTGGGATGGAGACATCTCAGAAGCCC  798

seq1  ACGGCAGCATCTTGTTAGAAAGGACAGCATCTGGGACCCTGAGAAACAGG  842
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGGCAGCATCTTGTTAGAAAGGACAGCATCTGGGACCCTGAGAAACAGG  848

seq1  AGCCACAATCCCTCCAGGGAACCCGCCATCTGAAATAAGGCACTGCCTGG  892
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCACAATCCCTCCAGGGAACCCGCCATCTGAAATAAGGCACTGCCTGG  898

seq1  ATGGAGACATCTCAGTAGCCTGTGGCAACTGTTTGTAAAAAACAGTTTTT  942
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGAGACATCTCAGTAGCCTGTGGCAACTGTTTGTAAAAAACAGTTTTT  948

seq1  CCCATTTCTCCTAACCTTAGTCCTGGACAACAGCTGTATAGATTTCATTT  992
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCATTTCTCCTAACCTTAGTCCTGGACAACAGCTGTATAGATTTCATTT  998

seq1  GTGCGTGACTATTCAGTTGGCCTTAGTGTGCATAATTAATCTATTATATT  1042
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCGTGACTATTCAGTTGGCCTTAGTGTGCATAATTAATCTATTATATT  1048

seq1  TGACTTTCTTCTTTCTCCTTCTGTTCTGGTGAATTC  1078
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACTTTCTTCTTTCTCCTTCTGTTCTGGTGAATTC  1084