BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-324P22
Chromosome14 (Build37)
Map Location 107,242,330 - 107,371,797
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC100043469, Spry2, EG621364, LOC212084, Trim52, LOC100043807, LOC100043476, LOC100043809, LOC668736, EG668738, EG668739, LOC621487, EG668743, LOC100043811, LOC621499, LOC100043814, EG668742, LOC668748
Downstream geneLOC668752, EG668754
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-324P22.bB6Ng01-324P22.g
ACCGA113166GA113167
length1,1721,085
definitionB6Ng01-324P22.b B6Ng01-324P22.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(107,370,626 - 107,371,797)(107,242,330 - 107,243,414)
sequence
gaattctggtgctgaagtaggacagaatgttgatggtgataatgcaaact
agcccataccataattgaaaacatgttagttaccaatgtctttttgggta
atggttaactgacgattctgcacttatacttccttgccacgtggatcaaa
ggctgaacacggagggttcaccaggagatatggtatgaccgtcagcactt
gggagcaaccaatatacttcagtaaagaaggaaaaataaagagtggtgta
atcatgaagtaaacttacacatatgtgggacgtcgtaatagaaattaacc
tacaaatatgatgcagtgtgacaccccatgtgataccccatgtgacaccc
catgtgagtgtcaatggtgaatgctttggtgatggctaggggtttagagt
cagggagggatgggcagggtctttagcagagtgaaagtattcttgatggt
actaagatgacagtaaacagtatgagacattgatcagccccaaacaatct
acagtatcaagactgatccctgatgtacagaatgggttgggagcaacagg
gctatgacagtgccgattcttcaggtgctggcactggctgtggctatgca
tttatcaaactgtctatgccttgctgtctatttagttgtatatctgaagt
gctttaaaatacaatggtttaaaattattatttatgtctgttgaacagta
tagtatattagagtctattttaaggtattccttgggttttcgaagcaaga
aaaattataacctggtatgtgattgcctgagaatgactaaacaattcaag
aaaaaaaccttaaatattattcatcttcttccagcttcctgatcaccact
aagtatttttatgttctcatcccctagaacttttcaaatatttccattgt
atatttatattataatataattatataattgccctgtccaaagcttccca
tatatctctccttgatctcttttaaatttttgacctctagttttcattat
tattgttatatgtataatacaaattgtctatacatatacacacaatatat
tccccaaacataaaaccaccttttcacttcaatgtaatgtattttgttat
gacatttcagacctgcataggaccaatccgaatagccatggtgtgctatt
tcctctgggggaagacatattt

gaattctcacctgaggaataccgaaatgatgtatttttgttaaccaaaag
ttccatcattctcagctttagaaaattgatcccagtcaggtgtctcatag
ctctggaatgcattataacttactctggcatacctctatgctctgctgcc
tccaaaacaaaggcaattcaagaacaaaggagtatctagctggatagtca
gggagcaggggcaacatgggataccatctcacctaacattttttataaat
gtattattagcaattagaacaatgttagttccaaagaggtaatgaagaga
tgggagatatattgtgcaagtatctaaagtcagagcagaattaaaataca
tgtgtaggagtttctcagatacagtgaatctcccagacaaatgtcccaag
acagggatatgtctgccatcattcagaacatgtgtaccataatagaagag
aaaaaatttttattagaaccaaggaaaacccagtaaaagaaaagagtttg
actttgcaggatattagaaaaactccactgattactctgatgatatgtgg
gagctacagtggtgttgtagccaaggaattaaatcgtctgattgcatagt
tcaaaaattatttcaagtgcaaagagcctggatatgatccttaatgaagg
agtataatcactttccttaaaagtaagggaacacttaatacactggtagt
taggaagcctgtcatccagacatgggagttattatgactttgttatccat
gatcattagctaattatagcaggatagtttcttctctgttaatggattta
gcagccttaaagattagagtgttgaaataatgggtcagagcaacctcctt
gctataaggaatcacatcacactgccaaaattacaacagtcatttaaatc
ctgtttctctctttaattaatgcttctttaaggatgatattatgtatcaa
tgggcctattcaagaccttgaatcagttcctcttttttttttcagttctc
acaagctgcagaacaaatcctgcaaatcctgtcttctgttcttgttctgc
agtaacttctatagtaataacgattaaccttatat
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_107370626_107371797
seq2: B6Ng01-324P22.b_49_1220 (reverse)

seq1  AAATA-GTCTT-CCCCAGAG--AATAGCACACCAATTGCTTATCTGAT--  44
      ||||| ||||| ||||||||  ||||||||||| || |||  || |||  
seq2  AAATATGTCTTCCCCCAGAGGAAATAGCACACC-ATGGCTATTCGGATTG  49

seq1  GTCCTATGGCCAGTCTTGAAAATGTTCAT-ACAAATAACATTACA-TGGA  92
      ||||||| ||  ||||   ||||| |||| |||||  |||||||| || |
seq2  GTCCTAT-GCAGGTCT--GAAATG-TCATAACAAAATACATTACATTGAA  95

seq1  GTGAAAAGGTGGTTTTATGTTTGGGGAAATATATTTGTGTGTATATGTAT  142
      |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||
seq2  GTGAAAAGGTGGTTTTATGTTTGGGG-AATATA-TTGTGTGTATATGTAT  143

seq1  AGAC-ATTTGTATATAACAATATAACAATAATTAATGAAAACTAGAGGTC  191
      |||| |||||||| ||   |||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  AGACAATTTGTAT-TATACATATAACAATAA-TAATGAAAACTAGAGGTC  191

seq1  AAAAATTTAAAAGAGATCAAGGAGAGATATATGGGAAGCTTTGGACAGGG  241
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAATTTAAAAGAGATCAAGGAGAGATATATGGGAAGCTTTGGACAGGG  241

seq1  CAATTATATAATTATATTATAATATAAATATACAATGGAAATATTTGAAA  291
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATTATATAATTATATTATAATATAAATATACAATGGAAATATTTGAAA  291

seq1  AGTTCTAGGGGATGAGAACATAAAAATACTTAGTGGTGATCAGGAAGCTG  341
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTCTAGGGGATGAGAACATAAAAATACTTAGTGGTGATCAGGAAGCTG  341

seq1  GAAGAAGATGAATAATATTTAAGGTTTTTTTCTTGAATTGTTTAGTCATT  391
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGAAGATGAATAATATTTAAGGTTTTTTTCTTGAATTGTTTAGTCATT  391

seq1  CTCAGGCAATCACATACCAGGTTATAATTTTTCTTGCTTCGAAAACCCAA  441
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGGCAATCACATACCAGGTTATAATTTTTCTTGCTTCGAAAACCCAA  441

seq1  GGAATACCTTAAAATAGACTCTAATATACTATACTGTTCAACAGACATAA  491
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAATACCTTAAAATAGACTCTAATATACTATACTGTTCAACAGACATAA  491

seq1  ATAATAATTTTAAACCATTGTATTTTAAAGCACTTCAGATATACAACTAA  541
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAATAATTTTAAACCATTGTATTTTAAAGCACTTCAGATATACAACTAA  541

seq1  ATAGACAGCAAGGCATAGACAGTTTGATAAATGCATAGCCACAGCCAGTG  591
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGACAGCAAGGCATAGACAGTTTGATAAATGCATAGCCACAGCCAGTG  591

seq1  CCAGCACCTGAAGAATCGGCACTGTCATAGCCCTGTTGCTCCCAACCCAT  641
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGCACCTGAAGAATCGGCACTGTCATAGCCCTGTTGCTCCCAACCCAT  641

seq1  TCTGTACATCAGGGATCAGTCTTGATACTGTAGATTGTTTGGGGCTGATC  691
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTACATCAGGGATCAGTCTTGATACTGTAGATTGTTTGGGGCTGATC  691

seq1  AATGTCTCATACTGTTTACTGTCATCTTAGTACCATCAAGAATACTTTCA  741
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGTCTCATACTGTTTACTGTCATCTTAGTACCATCAAGAATACTTTCA  741

seq1  CTCTGCTAAAGACCCTGCCCATCCCTCCCTGACTCTAAACCCCTAGCCAT  791
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGCTAAAGACCCTGCCCATCCCTCCCTGACTCTAAACCCCTAGCCAT  791

seq1  CACCAAAGCATTCACCATTGACACTCACATGGGGTGTCACATGGGGTATC  841
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCAAAGCATTCACCATTGACACTCACATGGGGTGTCACATGGGGTATC  841

seq1  ACATGGGGTGTCACACTGCATCATATTTGTAGGTTAATTTCTATTACGAC  891
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGGGGTGTCACACTGCATCATATTTGTAGGTTAATTTCTATTACGAC  891

seq1  GTCCCACATATGTGTAAGTTTACTTCATGATTACACCACTCTTTATTTTT  941
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCCACATATGTGTAAGTTTACTTCATGATTACACCACTCTTTATTTTT  941

seq1  CCTTCTTTACTGAAGTATATTGGTTGCTCCCAAGTGCTGACGGTCATACC  991
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTCTTTACTGAAGTATATTGGTTGCTCCCAAGTGCTGACGGTCATACC  991

seq1  ATATCTCCTGGTGAACCCTCCGTGTTCAGCCTTTGATCCACGTGGCAAGG  1041
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATCTCCTGGTGAACCCTCCGTGTTCAGCCTTTGATCCACGTGGCAAGG  1041

seq1  AAGTATAAGTGCAGAATCGTCAGTTAACCATTACCCAAAAAGACATTGGT  1091
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTATAAGTGCAGAATCGTCAGTTAACCATTACCCAAAAAGACATTGGT  1091

seq1  AACTAACATGTTTTCAATTATGGTATGGGCTAGTTTGCATTATCACCATC  1141
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTAACATGTTTTCAATTATGGTATGGGCTAGTTTGCATTATCACCATC  1141

seq1  AACATTCTGTCCTACTTCAGCACCAGAATTC  1172
      |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACATTCTGTCCTACTTCAGCACCAGAATTC  1172


seq1: chr14_107242330_107243414
seq2: B6Ng01-324P22.g_62_1146

seq1  GAATTCTCACCTGAGGAATACCGAAATGATGTATTTTTGTTAACCAAAAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCACCTGAGGAATACCGAAATGATGTATTTTTGTTAACCAAAAG  50

seq1  TTCCATCATTCTCAGCTTTAGAAAATTGATCCCAGTCAGGTGTCTCATAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCATCATTCTCAGCTTTAGAAAATTGATCCCAGTCAGGTGTCTCATAG  100

seq1  CTCTGGAATGCATTATAACTTACTCTGGCATACCTCTATGCTCTGCTGCC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGGAATGCATTATAACTTACTCTGGCATACCTCTATGCTCTGCTGCC  150

seq1  TCCAAAACAAAGGCAATTCAAGAACAAAGGAGTATCTAGCTGGATAGTCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAAAACAAAGGCAATTCAAGAACAAAGGAGTATCTAGCTGGATAGTCA  200

seq1  GGGAGCAGGGGCAACATGGGATACCATCTCACCTAACATTTTTTATAAAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAGCAGGGGCAACATGGGATACCATCTCACCTAACATTTTTTATAAAT  250

seq1  GTATTATTAGCAATTAGAACAATGTTAGTTCCAAAGAGGTAATGAAGAGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATTATTAGCAATTAGAACAATGTTAGTTCCAAAGAGGTAATGAAGAGA  300

seq1  TGGGAGATATATTGTGCAAGTATCTAAAGTCAGAGCAGAATTAAAATACA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGAGATATATTGTGCAAGTATCTAAAGTCAGAGCAGAATTAAAATACA  350

seq1  TGTGTAGGAGTTTCTCAGATACAGTGAATCTCCCAGACAAATGTCCCAAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTAGGAGTTTCTCAGATACAGTGAATCTCCCAGACAAATGTCCCAAG  400

seq1  ACAGGGATATGTCTGCCATCATTCAGAACATGTGTACCATAATAGAAGAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGGGATATGTCTGCCATCATTCAGAACATGTGTACCATAATAGAAGAG  450

seq1  AAAAAATTTTTATTAGAACCAAGGAAAACCCAGTAAAAGAAAAGAGTTTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAATTTTTATTAGAACCAAGGAAAACCCAGTAAAAGAAAAGAGTTTG  500

seq1  ACTTTGCAGGATATTAGAAAAACTCCACTGATTACTCTGATGATATGTGG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTTGCAGGATATTAGAAAAACTCCACTGATTACTCTGATGATATGTGG  550

seq1  GAGCTACAGTGGTGTTGTAGCCAAGGAATTAAATCGTCTGATTGCATAGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCTACAGTGGTGTTGTAGCCAAGGAATTAAATCGTCTGATTGCATAGT  600

seq1  TCAAAAATTATTTCAAGTGCAAAGAGCCTGGATATGATCCTTAATGAAGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAAAATTATTTCAAGTGCAAAGAGCCTGGATATGATCCTTAATGAAGG  650

seq1  AGTATAATCACTTTCCTTAAAAGTAAGGGAACACTTAATACACTGGTAGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTATAATCACTTTCCTTAAAAGTAAGGGAACACTTAATACACTGGTAGT  700

seq1  TAGGAAGCCTGTCATCCAGACATGGGAGTTATTATGACTTTGTTATCCAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGAAGCCTGTCATCCAGACATGGGAGTTATTATGACTTTGTTATCCAT  750

seq1  GATCATTAGCTAATTATAGCAGGATAGTTTCTTCTCTGTTAATGGATTTA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCATTAGCTAATTATAGCAGGATAGTTTCTTCTCTGTTAATGGATTTA  800

seq1  GCAGCCTTAAAGATTAGAGTGTTGAAATAATGGGTCAGAGCAACCTCCTT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGCCTTAAAGATTAGAGTGTTGAAATAATGGGTCAGAGCAACCTCCTT  850

seq1  GCTATAAGGAATCACATCACACTGCCAAAATTACAACAGTCATTTAAATC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTATAAGGAATCACATCACACTGCCAAAATTACAACAGTCATTTAAATC  900

seq1  CTGTTTCTCTCTTTAATTAATGCTTCTTTAAGGATGATATTATGTATCAA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTTTCTCTCTTTAATTAATGCTTCTTTAAGGATGATATTATGTATCAA  950

seq1  T-GGCCTATTCAAGACCTTGAATCAAGTTCCTC--TTTTTTTTCAGGTTC  997
      | |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||
seq2  TGGGCCTATTCAAGACCTTGAATC-AGTTCCTCTTTTTTTTTTCA-GTTC  998

seq1  TCAC-AGCTGCAG-ACAAATCCTGGCAAATCCTGGTCTCTGTTCCTTGTT  1045
      |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||   |||||| ||||||
seq2  TCACAAGCTGCAGAACAAATCCT-GCAAATCCTGTCTTCTGTT-CTTGTT  1046

seq1  CTGCAGTAACTTCTATAGTTAATACCGATTAACCTTATAT  1085
      |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||
seq2  CTGCAGTAACTTCTATAG-TAATAACGATTAACCTTATAT  1085


| Home | SequenceCutter | Blast | Download |