BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-332N19
Chromosome14 (Build37)
Map Location 76,599,447 - 76,736,244
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100043752, 2900040C04Rik
Upstream geneLcp1, Cpb2, Zc3h13, Gm912, Spert, 4930564B18Rik, Cog3, Slc25a30, LOC100043189, Tpt1, LOC100038852, Gtf2f2, LOC668504, Kctd4, 1200011I18Rik, Nufip1
Downstream geneTsc22d1, 2810032E02Rik, LOC100043753, LOC100043201, 9030625A04Rik, Ccdc122, D230005D02Rik, LOC100043755
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-332N19.bB6Ng01-332N19.g
ACCGA118840GA118841
length1,1301,023
definitionB6Ng01-332N19.b B6Ng01-332N19.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(76,599,447 - 76,600,583)(76,735,223 - 76,736,244)
sequence
gaattccaccctgtctcttgaagcatctcacctctcttcacagtcttaga
atctcaggactgtacctccccccacccccccgcccctgggagagacagtt
ggggcagggccaagccagttgagaacgaggatgctcttttatggggagac
ataggcacggggtggaatagcatctttcactttcagacactctcactctg
taggcagaaacatgcatgtggtctttttgcctcatcctcccaagtactgg
aattacagggtgctactcctaagtctctgagggtatcctctgtccttcaa
agatcactgtctaaccagaagtttcagcactgtttgtcatttgaattgaa
agctccagcaagaggagagctgccacaaaaccctggagcctgcccaggcc
agagaactgaagtgaaggtctcctaaaagcccctttgctttctatgtgta
agaatttcttctccttcttctccttcttcatttatttattattatatata
agtacactgtagctgtcctcagacaatccagaagagggaatcggatccca
ttacagatgattgtgagccatcatgtggttgctgggatttgaactcggga
cctttggaagagcagtcagtgttcttaaccactgagccatctctccagcc
ttcctctcacttctgatacatctggatggagtcacagagtttccaggctc
actcaggatactgggttttcttcaaatctgactttgaggtctgtctcagg
ggggactctaagctctaagcctgcccctttggagctcctggggaggttcc
tgtaggagttgaaagcatgttccccaggggacctttcttttatcctgtgc
accgcagtaggctgaaggctccaacccatcactggatgcccctactctag
aaagcgagctgatggcagtagatacccgtgtggctcccggatgccttgcg
tccaatttattgctactgagctggccttccctgaccaggaaagatcaggt
tgtggtgagtcatgcagattatagagtgtgacacatcactataccatgac
agaagcatcgtgtttttatacagatgtgccaggagggtagggtagagcat
cctccagggctggtgtatgagaccgggagc
gaattctcatgcatgttgggaaaggttagatatgacaacagaaagccaag
gaatctcgagggaaacaaaaaatccttagctactttagggggagggaagg
ctagacttctccagttttttgcttttctctcattgttaaagagaatatgc
accaaagtatagtctttcaagacaatcgcccccagacggcagggaactcc
tgtgtaggagctgggaggacaggcagaagagcactacaagtcagccttct
tgtagaaaaggacgcagcaaaccacaccgccctcaagcacagccagcgtc
actgaccattaaagcaaccaaacaatatggcacaatatggctccaagatt
cttaggcccagtccacagtagatacaactgtaatgacactaacttgtctt
ggagttctctgctatgttctctccacgggctcttcctgctgatttctggg
atttccctcttgcacacacaagtccctattgtttccacaggccttatcct
ccctgctctcctcgttttgcctctgtgcaatgcaatatcccaggagaagt
ggacgtcaaagagtctaacagattctctagccgtggcatccgaatcctgg
ttgcatgtgagaatatctcgggcgctttgtaattacacatctggaagggc
tggggagaaggtccaggttggttaagcacaggacttgagtttgaacccct
gcacccacatgaaaaccacggacaaattccagcatcggagaggcagagac
aagcagatccctgccgctcacaggacagtcaggctagggagcagcaggta
atacaagttcaaagataaaagagatgtgaacaagaggagtagggctctta
tggggggactggggcctgtcctcttttgtctccttgtagggcccttttcc
tccaactgggctgccttgtccagccttggggtgagaccgtgctggggctt
attgtagcttgttatgtcctgtttagttgatgtctctgggagtcctgctc
tttttctgaagggaaagtgtgtg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_76599447_76600583
seq2: B6Ng01-332N19.b_48_1177

seq1  GAATTCCACCCTGTCTCTTGAAGCATCTCACCTCTCTTCACAGTCTTAGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCACCCTGTCTCTTGAAGCATCTCACCTCTCTTCACAGTCTTAGA  50

seq1  ATCTCAGGACTGTACCTCCCCCCACCCCCCCGCCCCTGGGAGAGACAGTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTCAGGACTGTACCTCCCCCCACCCCCCCGCCCCTGGGAGAGACAGTT  100

seq1  GGGGCAGGGCCAAGCCAGTTGAGAACGAGGATGCTCTTTTATGGGGAGAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGCAGGGCCAAGCCAGTTGAGAACGAGGATGCTCTTTTATGGGGAGAC  150

seq1  ATAGGCACGGGGTGGAATAGCATCTTTCACTTTCAGACACTCTCACTCTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGGCACGGGGTGGAATAGCATCTTTCACTTTCAGACACTCTCACTCTG  200

seq1  TAGGCAGAAACATGCATGTGGTCTTTTTGCCTCATCCTCCCAAGTACTGG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGCAGAAACATGCATGTGGTCTTTTTGCCTCATCCTCCCAAGTACTGG  250

seq1  AATTACAGGGTGCTACTCCTAAGTCTCTGAGGGTATCCTCTGTCCTTCAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTACAGGGTGCTACTCCTAAGTCTCTGAGGGTATCCTCTGTCCTTCAA  300

seq1  AGATCACTGTCTAACCAGAAGTTTCAGCACTGTTTGTCATTTGAATTGAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATCACTGTCTAACCAGAAGTTTCAGCACTGTTTGTCATTTGAATTGAA  350

seq1  AGCTCCAGCAAGAGGAGAGCTGCCACAAAACCCTGGAGCCTGCCCAGGCC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTCCAGCAAGAGGAGAGCTGCCACAAAACCCTGGAGCCTGCCCAGGCC  400

seq1  AGAGAACTGAAGTGAAGGTCTCCTAAAAGCCCCTTTGCTTTCTATGTGTA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAACTGAAGTGAAGGTCTCCTAAAAGCCCCTTTGCTTTCTATGTGTA  450

seq1  AGAATTTCTTCTCCTTCTTCTCCTTCTTCATTTATTTATTATTATATATA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAATTTCTTCTCCTTCTTCTCCTTCTTCATTTATTTATTATTATATATA  500

seq1  AGTACACTGTAGCTGTCCTCAGACAATCCAGAAGAGGGAATCGGATCCCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTACACTGTAGCTGTCCTCAGACAATCCAGAAGAGGGAATCGGATCCCA  550

seq1  TTACAGATGATTGTGAGCCATCATGTGGTTGCTGGGATTTGAACTCGGGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACAGATGATTGTGAGCCATCATGTGGTTGCTGGGATTTGAACTCGGGA  600

seq1  CCTTTGGAAGAGCAGTCAGTGTTCTTAACCACTGAGCCATCTCTCCAGCC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTTGGAAGAGCAGTCAGTGTTCTTAACCACTGAGCCATCTCTCCAGCC  650

seq1  TTCCTCTCACTTCTGATACATCTGGATGGAGTCACAGAGTTTCCAGGCTC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCTCTCACTTCTGATACATCTGGATGGAGTCACAGAGTTTCCAGGCTC  700

seq1  ACTCAGGATACTGGGTTTTCTTCAAATCTGACTTTGAGGTCTGTCTCAGG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCAGGATACTGGGTTTTCTTCAAATCTGACTTTGAGGTCTGTCTCAGG  750

seq1  GGGGACTCTAAGCTCTAAGCCTGCCCCTTTGGAGCTCCTGGGGAGGTTCC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGACTCTAAGCTCTAAGCCTGCCCCTTTGGAGCTCCTGGGGAGGTTCC  800

seq1  TGTAGGAGTTGAAAGCATGTTCCCCAGGGGACCTTTCTTTTATCCTGTGC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAGGAGTTGAAAGCATGTTCCCCAGGGGACCTTTCTTTTATCCTGTGC  850

seq1  ACCGCAGTAGGCTGAAGGCTCCAACCCATCACTGGATGCCCCTACTCTAG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCGCAGTAGGCTGAAGGCTCCAACCCATCACTGGATGCCCCTACTCTAG  900

seq1  AAAGCGAGCTGATGGCAGTAGATACCCGTGTGGCTCCCGGATGCCTTGCG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGCGAGCTGATGGCAGTAGATACCCGTGTGGCTCCCGGATGCCTTGCG  950

seq1  TCCAATTTATTGCTACTGAGCTGGCCTTCCCTGACCAGGAAAGAATTCAG  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||
seq2  TCCAATTTATTGCTACTGAGCTGGCCTTCCCTGACCAGGAAAGA--TCAG  998

seq1  GGTTGGTGGTGAGTCATGCAGA-TATAGAGGTGGTGACACAACAAACTAT  1049
      |  | ||||||||||||||||| |||||||   |||||||| |  |||||
seq2  G--TTGTGGTGAGTCATGCAGATTATAGAG--TGTGACACATC--ACTAT  1042

seq1  ACAAATGACAGAAGCATCGTG-TTTTATACAGATGTGCCAGGGAGGGTAG  1098
      ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||
seq2  AC-CATGACAGAAGCATCGTGTTTTTATACAGATGTGCCA-GGAGGGTAG  1090

seq1  GG-AGAGCATCCTTCAGGGTCTGTGGGATGAGA-CGGGAGC  1137
      || |||||||||| ||||| |||  | |||||| |||||||
seq2  GGTAGAGCATCCTCCAGGG-CTGGTGTATGAGACCGGGAGC  1130

seq1: chr14_76735223_76736244
seq2: B6Ng01-332N19.g_69_1091 (reverse)

seq1  CACACACCTTCCCTTCAG-AAAAGAGCAGGACTCCCAGAGACATCAACTA  49
      ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACACTTTCCCTTCAGAAAAAGAGCAGGACTCCCAGAGACATCAACTA  50

seq1  AACAGGACATAACAAGCTACAATAAGCCCCAGCACGGTCTCACCCCAAGG  99
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAGGACATAACAAGCTACAATAAGCCCCAGCACGGTCTCACCCCAAGG  100

seq1  CTGGACAAGGCAGCCCAGTTGGAGGAAAAGGGCCCTACAAGGAGACAAAA  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGACAAGGCAGCCCAGTTGGAGGAAAAGGGCCCTACAAGGAGACAAAA  150

seq1  GAGGACAGGCCCCAGTCCCCCCATAAGAGCCCTACTCCTCTTGTTCACAT  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGACAGGCCCCAGTCCCCCCATAAGAGCCCTACTCCTCTTGTTCACAT  200

seq1  CTCTTTTATCTTTGAACTTGTATTACCTGCTGCTCCCTAGCCTGACTGTC  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTTTTATCTTTGAACTTGTATTACCTGCTGCTCCCTAGCCTGACTGTC  250

seq1  CTGTGAGCGGCAGGGATCTGCTTGTCTCTGCCTCTCCGATGCTGGAATTT  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGAGCGGCAGGGATCTGCTTGTCTCTGCCTCTCCGATGCTGGAATTT  300

seq1  GTCCGTGGTTTTCATGTGGGTGCAGGGGTTCAAACTCAAGTCCTGTGCTT  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCGTGGTTTTCATGTGGGTGCAGGGGTTCAAACTCAAGTCCTGTGCTT  350

seq1  AACCAACCTGGACCTTCTCCCCAGCCCTTCCAGATGTGTAATTACAAAGC  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCAACCTGGACCTTCTCCCCAGCCCTTCCAGATGTGTAATTACAAAGC  400

seq1  GCCCGAGATATTCTCACATGCAACCAGGATTCGGATGCCACGGCTAGAGA  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCGAGATATTCTCACATGCAACCAGGATTCGGATGCCACGGCTAGAGA  450

seq1  ATCTGTTAGACTCTTTGACGTCCACTTCTCCTGGGATATTGCATTGCACA  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTGTTAGACTCTTTGACGTCCACTTCTCCTGGGATATTGCATTGCACA  500

seq1  GAGGCAAAACGAGGAGAGCAGGGAGGATAAGGCCTGTGGAAACAATAGGG  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGCAAAACGAGGAGAGCAGGGAGGATAAGGCCTGTGGAAACAATAGGG  550

seq1  ACTTGTGTGTGCAAGAGGGAAATCCCAGAAATCAGCAGGAAGAGCCCGTG  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTGTGTGTGCAAGAGGGAAATCCCAGAAATCAGCAGGAAGAGCCCGTG  600

seq1  GAGAGAACATAGCAGAGAACTCCAAGACAAGTTAGTGTCATTACAGTTGT  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAGAACATAGCAGAGAACTCCAAGACAAGTTAGTGTCATTACAGTTGT  650

seq1  ATCTACTGTGGACTGGGCCTAAGAATCTTGGAGCCATATTGTGCCATATT  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTACTGTGGACTGGGCCTAAGAATCTTGGAGCCATATTGTGCCATATT  700

seq1  GTTTGGTTGCTTTAATGGTCAGTGACGCTGGCTGTGCTTGAGGGCGGTGT  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTGGTTGCTTTAATGGTCAGTGACGCTGGCTGTGCTTGAGGGCGGTGT  750

seq1  GGTTTGCTGCGTCCTTTTCTACAAGAAGGCTGACTTGTAGTGCTCTTCTG  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTTGCTGCGTCCTTTTCTACAAGAAGGCTGACTTGTAGTGCTCTTCTG  800

seq1  CCTGTCCTCCCAGCTCCTACACAGGAGTTCCCTGCCGTCTGGGGGCGATT  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGTCCTCCCAGCTCCTACACAGGAGTTCCCTGCCGTCTGGGGGCGATT  850

seq1  GTCTTGAAAGACTATACTTTGGTGCATATTCTCTTTAACAATGAGAGAAA  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTTGAAAGACTATACTTTGGTGCATATTCTCTTTAACAATGAGAGAAA  900

seq1  AGCAAAAAACTGGAGAAGTCTAGCCTTCCCTCCCCCTAAAGTAGCTAAGG  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAAAAAACTGGAGAAGTCTAGCCTTCCCTCCCCCTAAAGTAGCTAAGG  950

seq1  ATTTTTTGTTTCCCTCGAGATTCCTTGGCTTTCTGTTGTCATATCTAACC  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTTTGTTTCCCTCGAGATTCCTTGGCTTTCTGTTGTCATATCTAACC  1000

seq1  TTTCCCAACATGCATGAGAATTC  1022
      |||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCCAACATGCATGAGAATTC  1023