BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-337L14
Chromosome14 (Build37)
Map Location 67,220,887 - 67,358,425
singlet/doubletdoublet
Overlap geneAdra1a
Upstream geneGm600, Scara5, Pbk, Esco2, Ccdc25, Scara3, Clu, Gulo, Adam2, LOC100043675, Ephx2, Chrna2, Ptk2b, LOC100043676, Trim35, Stmn4
Downstream geneENSMUSG00000057913, LOC668366, Dpysl2, EG432870, Pnma2, LOC672614, Bnip3l, Ppp2r2a, Ebf2, EG628416, LOC100043046, LOC100043056, Cdca2, Kctd9
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-337L14.bB6Ng01-337L14.g
ACCGA122260GA122261
length9931,102
definitionB6Ng01-337L14.b B6Ng01-337L14.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(67,357,438 - 67,358,425)(67,220,887 - 67,221,987)
sequence
gaattctcccttatagagcatagagcacataccagactcttagcgtgatt
tacactaactgaaggaaacatgattatcaactccaccgaccaaagaccaa
acctgaaactggtgggcatagctctcgatcgctgggcagtaaggaactgc
tgtacctcctgggaatgttacatatcaaaggttatgggagcataatggca
gctaaaaccagccaggcagcccacatctacatctctggcagcatggaagt
cgtgtgtttgtatattcagcagctctgaggaagagacaggcagaaaagct
gcatcaggccagcaaatgtcagggttcgtgctggaatagcagcagctttc
ttttatttactgagacacactttcccccagacctagtaagttaagttggt
aagcgccggcaggctgtaaaagtgtagtccaagtccttcgatttatctgc
tctcccctctgcttcctgggctgtttaatttgcaataatcaccaaacacc
attggctgcacacttgtcctggcagaaacagctactgccccttcctctct
ggcatggaaggcaaccaggggggcattgtagtgatgcatgcagttcactg
ctgtattgttttgcaagataaaactccttccccccctaaatatattgtac
aatgtttccttgctataacagtttttctactcttaattgcacagaattgc
ctttcctacaattttcttactaagccttctcaagcccttggctattcttt
cggattaaacacctcatgtttgagagaatggacaatgagaaataaattag
atttttttttttcctgtacaggcatctcactataatattgtagaaagctt
tgacaacaaatgcaggctacaagataaccaatgctttccgattttcagcc
agggcaaacctggtgggttctactggaaaaagagcccctacattctctgt
gtactgggtttttccagggagttttccatgagagagagaggga
gaattcaactgcattcagctgaactaaactcaactcaactgaactctcca
ttgcctgaactcagctgaaacgcactccaccttgactcactctatgctgt
tctccaggagcctctctttcctcactgttctcatgagaattgggtacatc
ctctctccgactcatcctgtcaaatctttctctgattctccactttgcct
gcccctcaattagatatcactttcaaatgttgctatatgtttctacaaac
tcacattacctatagtatttgggaataaaggtgtctactaagggtgtgtt
tatattccagccaaggggattaaaggtgtgtccagccagattacacagac
ctagaagatctttggatgtgatcccttgccagagcaaccatatgactaga
ttaaagttcttctacacagaaggcacttccattatgtgataaaggaggtt
gccctcatccttcagaaaccccacactttccagcctccctttcactgttt
ctgactgctttattccaggtgatgatctgggtttgggagctgccactctc
ccactgatgcttggtttttagctgaagtgcatgagtggaagggacagtaa
acaaaacaaatccaaacacccccagagagtgatctgtgctatgaagaaaa
gtaaaagaaggctatgaggtggactgtgctggatagagtgctggagggca
gaaggttgtatgtccttcactcgggagtctgaaggcacacttgtggaaca
acttgtgaaatacacaggacacccaggaagcaagggatgtctggatccca
atcccactctctccacatacaccacatcccattagtctatctgctatagg
gtaaataatgtccctaaaattcagatatttgggagcactaaccccctagt
agggcatatgaggaggtaaattaaagggatctgataaaatagtggaaata
gaggacttttgtcaaaaaagagaaaaaaaacacagaatcagtggaggggg
gcctgcatggatacaggagctgctgccagccttaagacctgagtccattc
ccccaggacttacatggggtgaaagaagagcacaggtttctgctaagctt
cc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_67357438_67358425
seq2: B6Ng01-337L14.b_49_1041 (reverse)

seq1  TCCCTCTCTCTCTCATGGAAAACT-CCTGGAAAAA-CCAGTACACAGAGA  48
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||
seq2  TCCCTCTCTCTCTCATGGAAAACTCCCTGGAAAAACCCAGTACACAGAGA  50

seq1  ATGTAGGGGCTC-TTTTCCAGTAGAA-CCACCAGGTTTGCCCTGGCTGAA  96
      |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTAGGGGCTCTTTTTCCAGTAGAACCCACCAGGTTTGCCCTGGCTGAA  100

seq1  AATCGGAAAGCATTGGTTATCTTGTAGCCTGCATTTGTTGTCAAAGCTTT  146
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCGGAAAGCATTGGTTATCTTGTAGCCTGCATTTGTTGTCAAAGCTTT  150

seq1  CTACAATATTATAGTGAGATGCCTGTACAGG-AAAAAAAAAATCTAATTT  195
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  CTACAATATTATAGTGAGATGCCTGTACAGGAAAAAAAAAAATCTAATTT  200

seq1  ATTTCTCATTGTCCATTCTCTCAAACATGAGGTGTTTAATCCGAAAGAAT  245
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTCTCATTGTCCATTCTCTCAAACATGAGGTGTTTAATCCGAAAGAAT  250

seq1  AGCCAAGGGCTTGAGAAGGCTTAGTAAGAAAATTGTAGGAAAGGCAATTC  295
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCAAGGGCTTGAGAAGGCTTAGTAAGAAAATTGTAGGAAAGGCAATTC  300

seq1  TGTGCAATTAAGAGTAGAAAAACTGTTATAGCAAGGAAACATTGTACAAT  345
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGCAATTAAGAGTAGAAAAACTGTTATAGCAAGGAAACATTGTACAAT  350

seq1  ATATTTAGGGGGGGAAGGAGTTTTATCTTGCAAAACAATACAGCAGTGAA  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATTTAGGGGGGGAAGGAGTTTTATCTTGCAAAACAATACAGCAGTGAA  400

seq1  CTGCATGCATCACTACAATGCCCCCCTGGTTGCCTTCCATGCCAGAGAGG  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCATGCATCACTACAATGCCCCCCTGGTTGCCTTCCATGCCAGAGAGG  450

seq1  AAGGGGCAGTAGCTGTTTCTGCCAGGACAAGTGTGCAGCCAATGGTGTTT  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGGGCAGTAGCTGTTTCTGCCAGGACAAGTGTGCAGCCAATGGTGTTT  500

seq1  GGTGATTATTGCAAATTAAACAGCCCAGGAAGCAGAGGGGAGAGCAGATA  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGATTATTGCAAATTAAACAGCCCAGGAAGCAGAGGGGAGAGCAGATA  550

seq1  AATCGAAGGACTTGGACTACACTTTTACAGCCTGCCGGCGCTTACCAACT  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCGAAGGACTTGGACTACACTTTTACAGCCTGCCGGCGCTTACCAACT  600

seq1  TAACTTACTAGGTCTGGGGGAAAGTGTGTCTCAGTAAATAAAAGAAAGCT  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACTTACTAGGTCTGGGGGAAAGTGTGTCTCAGTAAATAAAAGAAAGCT  650

seq1  GCTGCTATTCCAGCACGAACCCTGACATTTGCTGGCCTGATGCAGCTTTT  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGCTATTCCAGCACGAACCCTGACATTTGCTGGCCTGATGCAGCTTTT  700

seq1  CTGCCTGTCTCTTCCTCAGAGCTGCTGAATATACAAACACACGACTTCCA  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCCTGTCTCTTCCTCAGAGCTGCTGAATATACAAACACACGACTTCCA  750

seq1  TGCTGCCAGAGATGTAGATGTGGGCTGCCTGGCTGGTTTTAGCTGCCATT  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGCCAGAGATGTAGATGTGGGCTGCCTGGCTGGTTTTAGCTGCCATT  800

seq1  ATGCTCCCATAACCTTTGATATGTAACATTCCCAGGAGGTACAGCAGTTC  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCTCCCATAACCTTTGATATGTAACATTCCCAGGAGGTACAGCAGTTC  850

seq1  CTTACTGCCCAGCGATCGAGAGCTATGCCCACCAGTTTCAGGTTTGGTCT  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTACTGCCCAGCGATCGAGAGCTATGCCCACCAGTTTCAGGTTTGGTCT  900

seq1  TTGGTCGGTGGAGTTGATAATCATGTTTCCTTCAGTTAGTGTAAATCACG  945
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGTCGGTGGAGTTGATAATCATGTTTCCTTCAGTTAGTGTAAATCACG  950

seq1  CTAAGAGTCTGGTATGTGCTCTATGCTCTATAAGGGAGAATTC  988
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAGAGTCTGGTATGTGCTCTATGCTCTATAAGGGAGAATTC  993

seq1: chr14_67220887_67221987
seq2: B6Ng01-337L14.g_69_1170

seq1  GAATTCAACTGCATTCAGCTGAACTAAACTCAACTCAACTGAACTCTCCA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAACTGCATTCAGCTGAACTAAACTCAACTCAACTGAACTCTCCA  50

seq1  TTGCCTGAACTCAGCTGAAACGCACTCCACCTTGACTCACTCTATGCTGT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCCTGAACTCAGCTGAAACGCACTCCACCTTGACTCACTCTATGCTGT  100

seq1  TCTCCAGGAGCCTCTCTTTCCTCACTGTTCTCATGAGAATTGGGTACATC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCCAGGAGCCTCTCTTTCCTCACTGTTCTCATGAGAATTGGGTACATC  150

seq1  CTCTCTCCGACTCATCCTGTCAAATCTTTCTCTGATTCTCCACTTTGCCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTCTCCGACTCATCCTGTCAAATCTTTCTCTGATTCTCCACTTTGCCT  200

seq1  GCCCCTCAATTAGATATCACTTTCAAATGTTGCTATATGTTTCTACAAAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCCTCAATTAGATATCACTTTCAAATGTTGCTATATGTTTCTACAAAC  250

seq1  TCACATTACCTATAGTATTTGGGAATAAAGGTGTCTACTAAGGGTGTGTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACATTACCTATAGTATTTGGGAATAAAGGTGTCTACTAAGGGTGTGTT  300

seq1  TATATTCCAGCCAAGGGGATTAAAGGTGTGTCCAGCCAGATTACACAGAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATTCCAGCCAAGGGGATTAAAGGTGTGTCCAGCCAGATTACACAGAC  350

seq1  CTAGAAGATCTTTGGATGTGATCCCTTGCCAGAGCAACCATATGACTAGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGAAGATCTTTGGATGTGATCCCTTGCCAGAGCAACCATATGACTAGA  400

seq1  TTAAAGTTCTTCTACACAGAAGGCACTTCCATTATGTGATAAAGGAGGTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAAGTTCTTCTACACAGAAGGCACTTCCATTATGTGATAAAGGAGGTT  450

seq1  GCCCTCATCCTTCAGAAACCCCACACTTTCCAGCCTCCCTTTCACTGTTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCTCATCCTTCAGAAACCCCACACTTTCCAGCCTCCCTTTCACTGTTT  500

seq1  CTGACTGCTTTATTCCAGGTGATGATCTGGGTTTGGGAGCTGCCACTCTC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGACTGCTTTATTCCAGGTGATGATCTGGGTTTGGGAGCTGCCACTCTC  550

seq1  CCACTGATGCTTGGTTTTTAGCTGAAGTGCATGAGTGGAAGGGACAGTAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACTGATGCTTGGTTTTTAGCTGAAGTGCATGAGTGGAAGGGACAGTAA  600

seq1  ACAAAACAAATCCAAACACCCCCAGAGAGTGATCTGTGCTATGAAGAAAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAAACAAATCCAAACACCCCCAGAGAGTGATCTGTGCTATGAAGAAAA  650

seq1  GTAAAAGAAGGCTATGAGGTGGACTGTGCTGGATAGAGTGCTGGAGGGCA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAAAGAAGGCTATGAGGTGGACTGTGCTGGATAGAGTGCTGGAGGGCA  700

seq1  GAAGGTTGTATGTCCTTCACTCGGGAGTCTGAAGGCACACTTGTGGAACA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGGTTGTATGTCCTTCACTCGGGAGTCTGAAGGCACACTTGTGGAACA  750

seq1  ACTTGTGAAATACACAGGACACCCAGGAAGCAAGGGATGTCTGGATCCCA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTGTGAAATACACAGGACACCCAGGAAGCAAGGGATGTCTGGATCCCA  800

seq1  ATCCCACTCTCTCCACATACACCACATCCCATTAGTCTATCTGCTATAGG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCCACTCTCTCCACATACACCACATCCCATTAGTCTATCTGCTATAGG  850

seq1  GTAAATAATGTCCCTAAAATTCAGATATTT-GGAGCACTAA-CCCCTAGT  898
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||
seq2  GTAAATAATGTCCCTAAAATTCAGATATTTGGGAGCACTAACCCCCTAGT  900

seq1  AGGGCATATGAGGAGGT-AATTAAAGGGATCTGATAAAATAGTGGAAATA  947
      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGCATATGAGGAGGTAAATTAAAGGGATCTGATAAAATAGTGGAAATA  950

seq1  GA-GAC-TTTGTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAGAATCAGT-  994
      || ||| ||||||       |||||| | |||||||| ||||||||||| 
seq2  GAGGACTTTTGTC-------AAAAAAGAGAAAAAAAACACAGAATCAGTG  993

seq1  GAGGGGG--CTGCATGGATACAGGAGCCTGCTGCCAAGCCTAAAGACCTG  1042
      |||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||
seq2  GAGGGGGGCCTGCATGGATACAGGAG-CTGCTGCC-AGCCTTAAGACCTG  1041

seq1  AGTTCAATCCCCCAAGGACCTACATGGTG-GAAAG-AGAGCACCAGTTCC  1090
      ||| || |||||| ||||| ||||||| | ||||| |||||||  ||| |
seq2  AGTCCATTCCCCC-AGGACTTACATGGGGTGAAAGAAGAGCACAGGTTTC  1090

seq1  TG-TAAGCTTCC  1101
      || |||||||||
seq2  TGCTAAGCTTCC  1102