BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-344I19
Chromosome14 (Build37)
Map Location 21,375,690 - 21,408,693
singlet/doubletdoublet
Overlap geneUsp54
Upstream geneLOC100038983, LOC100039441, EG432825, LOC673583, EG664855, Nid2, 2700060E02Rik, LOC100039534, Gng2, 1810063B07Rik, Kcnk5, LOC100039106, Kcnk16, Nudt13, Ecd, AA536717, Dnajc9, Mrps16, Ttc18, Anxa7, Zmynd17, Ppp3cb
Downstream geneMyoz1, Synpo2l, Sec24c, Fut11, Chchd1, 2310021P13Rik, Ndst2, Camk2g, Plau, EG620119, Vcl, Ap3m1, Adk, Myst4
LinkOpen Mouse BAC browser

no map image available.



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-344I19.bB6Ng01-344I19.g
ACCGA127006GA127007
length1,139935
definitionB6Ng01-344I19.b B6Ng01-344I19.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(21,407,534 - 21,408,693)(21,375,690 - 21,376,621)
sequence
gaattcacttccatattgctgatgaaaccaaagaggatatatgtactgct
caacactgcatatcccaccagaaatttgcaatgacattgtttgagcaggt
aaatctataccttggactttttctttaagaatattttatctgaggatgta
aagtttcaaaacagttcatgactggctgcttagtgtccctttccctctgg
cccagtgtgtgtgcagcagctgtggcgccacgtccgacccgctgcccttt
atccagatggtgcactacatctccaccactgccctctggtgagttctagg
caggtttttttttttttttcctttaaggcttaaatatttttattttatat
gtatgaatgttttatctgtatgtatgtttgaacactatgcttatgcctgg
tgcctgcagtgatcagggagagtgttggaggatcccctggaactggggtt
atagatagccatgagcttacatgtggtgctaggaactgaacctgggtcct
ctgcaagaacagctagtacttttacttgttacttgaaccatttttccaga
tcattcttacagaatttgtcctgttaggcattcctccagttgaatgggtt
ttaactgaaggctaccaaatagcatatatctttattgctgaatttgtgtt
gtaaacttcagaatttgtaggcttatttgtggatagcaaaatacaaagag
aaatggggattctgtgggttttgaatttgggaactgtgtttgtagggcac
tgagactagtcaggacagagtaaatgaaaaaaatcacacatacccacacc
tttaatcccagtcctttggaggcagaggctggtgtatctctgtgtgttgg
aggccagactgagactggtctacatagcaagttccaagacagccagagag
agctacacaatgaggccctgtcttaaagaaaaagtgagttagggtttgta
tgaatgattttattttttagtgagccatatttggaataacactactacca
tacctttctcctttcccatcttgaagtaaccagctatttgattgctggaa
gcgagagaaccttaccaagtattgttgtggagctgctccgatgcccgcac
atggggaactgcgactgtcgggagatatgctatggaatt
gaattcagtgcagaggcatggtccttgaatctataaacgccaaatttcag
aatatggataaattcctataggtcacaaagatcaaaactactgaagacat
ttccaggaaaggagctgtaagaacagtcagctgaagatcgtcatccgtca
acatttctcctttatgaataaaatgagctttgttttcagaatcaagccca
atacttgtaatctataaagaaaactatgtgacagagtgatcttctctaac
atagtgtggtaagaaaggaaattatatctctagttcagaatttaaatgat
catagttattgtatatcaaaccttcttcctttgctgtaatagggaaatga
gttgcagagttgattgagatggtgttttaaccagaattgaaactcaaatc
tttcaaggttaagcacagtattttcttagcttttaataccctcccacttt
ctctctctgagcagcatcactttagaaatatttagcatgtgtaatattct
gttataccaacttactcctagctttttacaatcacttaaattataatcaa
atatcaatactgctttgaactggatatgtgaagccccacatgtcttatga
aaatgtacctgcccttgacctacatttggtgcatatttatgtatgtatgt
atgtatgtatgtatgtatgtatagcatacacatgtctggatatgatacta
tgatatatgtacacacacacatacagagagagagtgcttaagtatactgt
tgatgtcagtacttagactgcttttgttctatattttaaattttctagga
ctttcaagttgcatagaaataattttatcagccaagcgtggtggcgcacg
cctttaatcccagcactcggaaggcagaggcaggcggatttctgagttcg
aggccagtcttggtctacagagtgaagtttccagg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_21407534_21408693
seq2: B6Ng01-344I19.b_48_1186 (reverse)

seq1  AATTCCATAGCATTAACTCACCGGACAGTTCCGCAGGTCCCCCATGGTGC  50
      |||||||||||||    || || ||||||  |||| || |||||| ||||
seq2  AATTCCATAGCAT---ATCTCCCGACAGT--CGCA-GTTCCCCAT-GTGC  43

seq1  TGGCATTCTGAAGCAGCTCACCAAACATACTTGGTGAGGGTTTCTCTCGC  100
       |||||   | ||||||||  |||  ||||||||| |||  |||||||||
seq2  GGGCAT--CGGAGCAGCTCCACAACAATACTTGGTAAGG--TTCTCTCGC  89

seq1  TTTTCCAGCATACAAATAGCCTGGTTACTTCAAGATGGGGAAAGGAGGAA  150
        ||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||
seq2  --TTCCAGCAATCAAATAG-CTGGTTACTTCAAGAT-GGGAAAGGAGAAA  135

seq1  GGTAATGGTAGTAGGTGTTATTCCAAATTATGGCTCAACTAAAAAATAAA  200
      ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||
seq2  GGT-ATGGTAGTA-GTGTTATTCCAAA-TATGGCTC-ACTAAAAAATAAA  181

seq1  ATCATTCATACAAACCCCTAACTCACTTCTTTCTTTAAGACAGGGCCTCA  250
      |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  ATCATTCATACAAA-CCCTAACTCACTT-TTTCTTTAAGACAGGGCCTCA  229

seq1  TTGTGTAGCTCTCTCTGGCTGTCTTGGAACTTGCTATGTAGACCAGTCTC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTGTAGCTCTCTCTGGCTGTCTTGGAACTTGCTATGTAGACCAGTCTC  279

seq1  AGTCTGGCCTCCAACACACAGAGATACACCAGCCTCTGCCTCCAAAGGAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCTGGCCTCCAACACACAGAGATACACCAGCCTCTGCCTCCAAAGGAC  329

seq1  TGGGATTAAAGGTGTGGGTATGTGTGATTTTTTTCATTTACTCTGTCCTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGATTAAAGGTGTGGGTATGTGTGATTTTTTTCATTTACTCTGTCCTG  379

seq1  ACTAGTCTCAGTGCCCTACAAACACAGTTCCCAAATTCAAAACCCACAGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTAGTCTCAGTGCCCTACAAACACAGTTCCCAAATTCAAAACCCACAGA  429

seq1  ATCCCCATTTCTCTTTGTATTTTGCTATCCACAAATAAGCCTACAAATTC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCCCATTTCTCTTTGTATTTTGCTATCCACAAATAAGCCTACAAATTC  479

seq1  TGAAGTTTACAACACAAATTCAGCAATAAAGATATATGCTATTTGGTAGC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAGTTTACAACACAAATTCAGCAATAAAGATATATGCTATTTGGTAGC  529

seq1  CTTCAGTTAAAACCCATTCAACTGGAGGAATGCCTAACAGGACAAATTCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCAGTTAAAACCCATTCAACTGGAGGAATGCCTAACAGGACAAATTCT  579

seq1  GTAAGAATGATCTGGAAAAATGGTTCAAGTAACAAGTAAAAGTACTAGCT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAGAATGATCTGGAAAAATGGTTCAAGTAACAAGTAAAAGTACTAGCT  629

seq1  GTTCTTGCAGAGGACCCAGGTTCAGTTCCTAGCACCACATGTAAGCTCAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCTTGCAGAGGACCCAGGTTCAGTTCCTAGCACCACATGTAAGCTCAT  679

seq1  GGCTATCTATAACCCCAGTTCCAGGGGATCCTCCAACACTCTCCCTGATC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTATCTATAACCCCAGTTCCAGGGGATCCTCCAACACTCTCCCTGATC  729

seq1  ACTGCAGGCACCAGGCATAAGCATAGTGTTCAAACATACATACAGATAAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGCAGGCACCAGGCATAAGCATAGTGTTCAAACATACATACAGATAAA  779

seq1  ACATTCATACATATAAAATAAAAATATTTAAGCCTTAAAGGAAAAAAAAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATTCATACATATAAAATAAAAATATTTAAGCCTTAAAGGAAAAAAAAA  829

seq1  AAAAAACCTGCCTAGAACTCACCAGAGGGCAGTGGTGGAGATGTAGTGCA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAACCTGCCTAGAACTCACCAGAGGGCAGTGGTGGAGATGTAGTGCA  879

seq1  CCATCTGGATAAAGGGCAGCGGGTCGGACGTGGCGCCACAGCTGCTGCAC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATCTGGATAAAGGGCAGCGGGTCGGACGTGGCGCCACAGCTGCTGCAC  929

seq1  ACACACTGGGCCAGAGGGAAAGGGACACTAAGCAGCCAGTCATGAACTGT  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACTGGGCCAGAGGGAAAGGGACACTAAGCAGCCAGTCATGAACTGT  979

seq1  TTTGAAACTTTACATCCTCAGATAAAATATTCTTAAAGAAAAAGTCCAAG  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGAAACTTTACATCCTCAGATAAAATATTCTTAAAGAAAAAGTCCAAG  1029

seq1  GTATAGATTTACCTGCTCAAACAATGTCATTGCAAATTTCTGGTGGGATA  1100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATAGATTTACCTGCTCAAACAATGTCATTGCAAATTTCTGGTGGGATA  1079

seq1  TGCAGTGTTGAGCAGTACATATATCCTCTTTGGTTTCATCAGCAATATGG  1150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAGTGTTGAGCAGTACATATATCCTCTTTGGTTTCATCAGCAATATGG  1129

seq1  AAGTGAATTC  1160
      ||||||||||
seq2  AAGTGAATTC  1139

seq1: chr14_21375690_21376621
seq2: B6Ng01-344I19.g_64_998

seq1  GAATTCAGTGCAGAGGCATGGTCCTTGAATCTATAAACGCCAAATTTCAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGTGCAGAGGCATGGTCCTTGAATCTATAAACGCCAAATTTCAG  50

seq1  AATATGGATAAATTCCTATAGGTCACAAAGATCAAAACTACTGAAGACAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATATGGATAAATTCCTATAGGTCACAAAGATCAAAACTACTGAAGACAT  100

seq1  TTCCAGGAAAGGAGCTGTAAGAACAGTCAGCTGAAGATCGTCATCCGTCA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCAGGAAAGGAGCTGTAAGAACAGTCAGCTGAAGATCGTCATCCGTCA  150

seq1  ACATTTCTCCTTTATGAATAAAATGAGCTTTGTTTTCAGAATCAAGCCCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATTTCTCCTTTATGAATAAAATGAGCTTTGTTTTCAGAATCAAGCCCA  200

seq1  ATACTTGTAATCTATAAAGAAAACTATGTGACAGAGTGATCTTCTCTAAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACTTGTAATCTATAAAGAAAACTATGTGACAGAGTGATCTTCTCTAAC  250

seq1  ATAGTGTGGTAAGAAAGGAAATTATATCTCTAGTTCAGAATTTAAATGAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGTGTGGTAAGAAAGGAAATTATATCTCTAGTTCAGAATTTAAATGAT  300

seq1  CATAGTTATTGTATATCAAACCTTCTTCCTTTGCTGTAATAGGGAAATGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAGTTATTGTATATCAAACCTTCTTCCTTTGCTGTAATAGGGAAATGA  350

seq1  GTTGCAGAGTTGATTGAGATGGTGTTTTAACCAGAATTGAAACTCAAATC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGCAGAGTTGATTGAGATGGTGTTTTAACCAGAATTGAAACTCAAATC  400

seq1  TTTCAAGGTTAAGCACAGTATTTTCTTAGCTTTTAATACCCTCCCACTTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCAAGGTTAAGCACAGTATTTTCTTAGCTTTTAATACCCTCCCACTTT  450

seq1  CTCTCTCTGAGCAGCATCACTTTAGAAATATTTAGCATGTGTAATATTCT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTCTCTGAGCAGCATCACTTTAGAAATATTTAGCATGTGTAATATTCT  500

seq1  GTTATACCAACTTACTCCTAGCTTTTTACAATCACTTAAATTATAATCAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTATACCAACTTACTCCTAGCTTTTTACAATCACTTAAATTATAATCAA  550

seq1  ATATCAATACTGCTTTGAACTGGATATGTGAAGCCCCACATGTCTTATGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATCAATACTGCTTTGAACTGGATATGTGAAGCCCCACATGTCTTATGA  600

seq1  AAATGTACCTGCCCTTGACCTACATTTGGTGCATATTTATGTATGTATGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGTACCTGCCCTTGACCTACATTTGGTGCATATTTATGTATGTATGT  650

seq1  ATGTATGTATGTATGTATGTATAGCATACACATGTCTGGATATGATACTA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTATGTATGTATGTATGTATAGCATACACATGTCTGGATATGATACTA  700

seq1  TGATATATGTACACACACACATACAGAGAGAGAGTGCTTAAGTATACTGT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATATATGTACACACACACATACAGAGAGAGAGTGCTTAAGTATACTGT  750

seq1  TGATGTCAGTACTTAGACTGCTTTTGTTCTATATTTTAAATTTTCTAGGA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATGTCAGTACTTAGACTGCTTTTGTTCTATATTTTAAATTTTCTAGGA  800

seq1  CTTTCAAGTTGCATAGAAATAATTTTATCAGCCAAGCGTGGTGGCGCACG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTCAAGTTGCATAGAAATAATTTTATCAGCCAAGCGTGGTGGCGCACG  850

seq1  CCTTTAATCCCAGCACTCGGAAGGCAGAGGCAGGCGGATTTCTGAGTTCG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTTAATCCCAGCACTCGGAAGGCAGAGGCAGGCGGATTTCTGAGTTCG  900

seq1  AGGCCAG-CCTGGTCTACAGAGTGA--GTTCCAGG  932
      ||||||| | |||||||||||||||   |||||||
seq2  AGGCCAGTCTTGGTCTACAGAGTGAAGTTTCCAGG  935