BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-347P05
Chromosome14 (Build37)
Map Location 12,661,229 - 12,738,347
singlet/doubletdoublet
Overlap genePtprg
Upstream geneFhit, LOC100041974, LOC667030, EG382843, LOC100042427, LOC667059, LOC100041996
Downstream geneLOC100042441, 3830406C13Rik, EG667072, Fezf2, Cadps, EG432822
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-347P05.bB6Ng01-347P05.g
ACCGA129396GA129397
length1,1521,106
definitionB6Ng01-347P05.b B6Ng01-347P05.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(12,737,172 - 12,738,347)(12,661,229 - 12,662,350)
sequence
gaattccagagttcacttcggccctgatttccccagatctgttacaaacc
tgagaccactcctgctacactcttacacactcctcctcaccttcaaagga
gcaaactccagcgtctcccacataatcaaggacccctgtgctcttcctca
gtcctccccagggcaccacagggcactgcggttaagactcctcctgaaat
ctccagttcccagcatgtaattcctctggcgcaaacccagtgaatgggaa
ggcttccttcccactgggctcctaaaccctctctcatttttaaggacttt
ctccacttgagacagatgctcagtccgtaggcaaccacagcactgacctt
tcttccacctgagtttatctctttctgcaggcctgcaaattagcatggga
tcaaaagcctaaatgtagccctgattagttgagctaattaacattgctaa
taaaagcgctgtcaccctggttggtccactctggtgattcttaaaaggaa
ccagggccttttctgcaaacctctgctaaaacctgagagaaccttcctta
cttaaccccaagctcacagcccccatgaagggattcgagcagaacggttt
cttttattagaagctgtcatttcgcatcatgctatgtctaaatttgctca
aatgttttcactaattttcaacaattgggtaaaaatgttctagcagagag
aagataccgcaaagatccctaatggaggaacaggctcgtgtcctacagac
tctgtgcttgacaaggtctttgagagttgaaagtaaacagatgtcttcaa
atttctgcaatagaagagagtgatgccaaaatagcacaccgatgcagagc
atgacactaattacccagcacaggtattttgggcctctcatttacaaaat
caagatggctgaatctatagccgcggtacctcatgcctcagctatgccaa
cctgtgggtgtgtcccatctggtttgcaacatactctcggccatgcacag
gtaccaagatgtcttctgaagcggagcacactcacagtcacatcccacag
cacttattttttctttattatttttattccatttttattaggatttcgcc
tcattaatttgcaaggcattacaaagtccccatagccacccacaccccct
tc
gaattccaaggtcagataagggactaaccaagtacttctagaacaactca
gaccttcctggtcgctttgccaggttcctgctgagccgggatgtgaactc
tggaagtctgtgtgcattggctactctctcccagggaggctacacactca
gagcctttcctgggcatctggagtggtaggtgcaacacaaatgatgaccc
attttaaggttagccacatcccaggagttccccttatcgggtgaacatta
tgcaggtcaagggaggggcatgtttttgactgagtgttgagccatgcttt
tacaacattaaacatttcattcttatcttcctcacccactcgcttattta
ctgagacaggtaaataagctggcttcaaacttgctcagttgctgaattct
taaccctctttttgaaaaataatttactattttttcaaaattatatatat
gtatatgtgtttttgcttgtgtgtatgtctatacagtatgtgtgtgcagt
gcccttagattccagaagagggtgtcagatctcttgggactagagttaca
gatgattgtgggccaccatgtgggtgctggcaaccagactgtgaaagggc
agctggtgttcctcaccacttagccatctctccagctcctctgatcctcc
tgcctctacctgctgagtgataggattacaggcatgtgctgctgcacagc
tgatcttatgcagttctggggctcaaaccctgggcctcctgcctgctaga
caagcacactccctgaggaagcctcgccacattctagccttcattcacat
gcagcaggtcaccccctgaggaagcctccccatgctctgtgccttcattc
acatgcagcagatctatttagagctgtttctttaggaaaaccacagagat
catagtgcataaggccacttcactgccccttcctacacacagttcctttt
aaactttcaagatagtctcaatcattgcatctgagcaccctggcctcctg
actccctggtcatctgcccttttattctctcattttctgttcacttcatc
tatgtgttgctttcaagatttatttgggccaagtgaactccgcttatgaa
ttgcct
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_12737172_12738347
seq2: B6Ng01-347P05.b_48_1199 (reverse)

seq1  GAAGGG---GTGGGTGGCTATGGGGGACTTTTGGTATAGCATTGCAAATG  47
      ||||||   |||||||||||| |||||||||  |||  || |||||||  
seq2  GAAGGGGGTGTGGGTGGCTAT-GGGGACTTT--GTAATGCCTTGCAAA--  45

seq1  TAAATGA-GCGAAATACCTAATAAAAAATGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAA  96
      | ||||| ||||||| |||||| ||||||||            || ||||
seq2  TTAATGAGGCGAAAT-CCTAAT-AAAAATGG------------AATAAAA  81

seq1  AAAAAAAAAAAAAAAAAAGTGCCTGTTGGGATTGTTGACCTGTGAGTGTG  146
      | || ||| |||||| ||||| ||| ||||||   ||| |||||||||||
seq2  ATAATAAAGAAAAAATAAGTG-CTG-TGGGAT--GTGA-CTGTGAGTGTG  126

seq1  CTCCCGCCTTCAGAAGACATCCTTTGGTACCTGTGCATGGCCGAGAGTAT  196
      ||||   ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCC--GCTTCAGAAGACATC--TTGGTACCTGTGCATGGCCGAGAGTAT  172

seq1  GTTGCAAACCAGATGGGACACACCCACAGGTTGGCATAGCTGAGGCATGA  246
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGCAAACCAGATGGGACACACCCACAGGTTGGCATAGCTGAGGCATGA  222

seq1  GGTACCGCGGCTATAGATTCAGCCATCTTGATTTTGTAAATGAGAGGCCC  296
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTACCGCGGCTATAGATTCAGCCATCTTGATTTTGTAAATGAGAGGCCC  272

seq1  AAAATACCTGTGCTGGGTAATTAGTGTCATGCTCTGCATCGGTGTGCTAT  346
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATACCTGTGCTGGGTAATTAGTGTCATGCTCTGCATCGGTGTGCTAT  322

seq1  TTTGGCATCACTCTCTTCTATTGCAGAAATTTGAAGACATCTGTTTACTT  396
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGGCATCACTCTCTTCTATTGCAGAAATTTGAAGACATCTGTTTACTT  372

seq1  TCAACTCTCAAAGACCTTGTCAAGCACAGAGTCTGTAGGACACGAGCCTG  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAACTCTCAAAGACCTTGTCAAGCACAGAGTCTGTAGGACACGAGCCTG  422

seq1  TTCCTCCATTAGGGATCTTTGCGGTATCTTCTCTCTGCTAGAACATTTTT  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCTCCATTAGGGATCTTTGCGGTATCTTCTCTCTGCTAGAACATTTTT  472

seq1  ACCCAATTGTTGAAAATTAGTGAAAACATTTGAGCAAATTTAGACATAGC  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCAATTGTTGAAAATTAGTGAAAACATTTGAGCAAATTTAGACATAGC  522

seq1  ATGATGCGAAATGACAGCTTCTAATAAAAGAAACCGTTCTGCTCGAATCC  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGATGCGAAATGACAGCTTCTAATAAAAGAAACCGTTCTGCTCGAATCC  572

seq1  CTTCATGGGGGCTGTGAGCTTGGGGTTAAGTAAGGAAGGTTCTCTCAGGT  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCATGGGGGCTGTGAGCTTGGGGTTAAGTAAGGAAGGTTCTCTCAGGT  622

seq1  TTTAGCAGAGGTTTGCAGAAAAGGCCCTGGTTCCTTTTAAGAATCACCAG  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAGCAGAGGTTTGCAGAAAAGGCCCTGGTTCCTTTTAAGAATCACCAG  672

seq1  AGTGGACCAACCAGGGTGACAGCGCTTTTATTAGCAATGTTAATTAGCTC  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGGACCAACCAGGGTGACAGCGCTTTTATTAGCAATGTTAATTAGCTC  722

seq1  AACTAATCAGGGCTACATTTAGGCTTTTGATCCCATGCTAATTTGCAGGC  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTAATCAGGGCTACATTTAGGCTTTTGATCCCATGCTAATTTGCAGGC  772

seq1  CTGCAGAAAGAGATAAACTCAGGTGGAAGAAAGGTCAGTGCTGTGGTTGC  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCAGAAAGAGATAAACTCAGGTGGAAGAAAGGTCAGTGCTGTGGTTGC  822

seq1  CTACGGACTGAGCATCTGTCTCAAGTGGAGAAAGTCCTTAAAAATGAGAG  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACGGACTGAGCATCTGTCTCAAGTGGAGAAAGTCCTTAAAAATGAGAG  872

seq1  AGGGTTTAGGAGCCCAGTGGGAAGGAAGCCTTCCCATTCACTGGGTTTGC  946
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGTTTAGGAGCCCAGTGGGAAGGAAGCCTTCCCATTCACTGGGTTTGC  922

seq1  GCCAGAGGAATTACATGCTGGGAACTGGAGATTTCAGGAGGAGTCTTAAC  996
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAGAGGAATTACATGCTGGGAACTGGAGATTTCAGGAGGAGTCTTAAC  972

seq1  CGCAGTGCCCTGTGGTGCCCTGGGGAGGACTGAGGAAGAGCACAGGGGTC  1046
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGCAGTGCCCTGTGGTGCCCTGGGGAGGACTGAGGAAGAGCACAGGGGTC  1022

seq1  CTTGATTATGTGGGAGACGCTGGAGTTTGCTCCTTTGAAGGTGAGGAGGA  1096
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGATTATGTGGGAGACGCTGGAGTTTGCTCCTTTGAAGGTGAGGAGGA  1072

seq1  GTGTGTAAGAGTGTAGCAGGAGTGGTCTCAGGTTTGTAACAGATCTGGGG  1146
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTAAGAGTGTAGCAGGAGTGGTCTCAGGTTTGTAACAGATCTGGGG  1122

seq1  AAATCAGGGCCGAAGTGAACTCTGGAATTC  1176
      ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATCAGGGCCGAAGTGAACTCTGGAATTC  1152

seq1: chr14_12661229_12662350
seq2: B6Ng01-347P05.g_65_1170

seq1  GAATTCCAAGGTCAGATAAGGGACTAACCAAGTACTTCTAGAACAACTCA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAAGGTCAGATAAGGGACTAACCAAGTACTTCTAGAACAACTCA  50

seq1  GACCTTCCTGGTCGCTTTGCCAGGTTCCTGCTGAGCCGGGATGTGAACTC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCTTCCTGGTCGCTTTGCCAGGTTCCTGCTGAGCCGGGATGTGAACTC  100

seq1  TGGAAGTCTGTGTGCATTGGCTACTCTCTCCCAGGGAGGCTACACACTCA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAAGTCTGTGTGCATTGGCTACTCTCTCCCAGGGAGGCTACACACTCA  150

seq1  GAGCCTTTCCTGGGCATCTGGAGTGGTAGGTGCAACACAAATGATGACCC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCCTTTCCTGGGCATCTGGAGTGGTAGGTGCAACACAAATGATGACCC  200

seq1  ATTTTAAGGTTAGCCACATCCCAGGAGTTCCCCTTATCGGGTGAACATTA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTAAGGTTAGCCACATCCCAGGAGTTCCCCTTATCGGGTGAACATTA  250

seq1  TGCAGGTCAAGGGAGGGGCATGTTTTTGACTGAGTGTTGAGCCATGCTTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAGGTCAAGGGAGGGGCATGTTTTTGACTGAGTGTTGAGCCATGCTTT  300

seq1  TACAACATTAAACATTTCATTCTTATCTTCCTCACCCACTCGCTTATTTA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAACATTAAACATTTCATTCTTATCTTCCTCACCCACTCGCTTATTTA  350

seq1  CTGAGACAGGTAAATAAGCTGGCTTCAAACTTGCTCAGTTGCTGAATTCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAGACAGGTAAATAAGCTGGCTTCAAACTTGCTCAGTTGCTGAATTCT  400

seq1  TAACCCTCTTTTTGAAAAATAATTTACTATTTTTTCAAAATTATATATAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACCCTCTTTTTGAAAAATAATTTACTATTTTTTCAAAATTATATATAT  450

seq1  GTATATGTGTTTTTGCTTGTGTGTATGTCTATACAGTATGTGTGTGCAGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATATGTGTTTTTGCTTGTGTGTATGTCTATACAGTATGTGTGTGCAGT  500

seq1  GCCCTTAGATTCCAGAAGAGGGTGTCAGATCTCTTGGGACTAGAGTTACA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCTTAGATTCCAGAAGAGGGTGTCAGATCTCTTGGGACTAGAGTTACA  550

seq1  GATGATTGTGGGCCACCATGTGGGTGCTGGCAACCAGACTGTGAAAGGGC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGATTGTGGGCCACCATGTGGGTGCTGGCAACCAGACTGTGAAAGGGC  600

seq1  AGCTGGTGTTCCTCACCACTTAGCCATCTCTCCAGCTCCTCTGATCCTCC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTGGTGTTCCTCACCACTTAGCCATCTCTCCAGCTCCTCTGATCCTCC  650

seq1  TGCCTCTACCTGCTGAGTGATAGGATTACAGGCATGTGCTGCTGCACAGC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCTCTACCTGCTGAGTGATAGGATTACAGGCATGTGCTGCTGCACAGC  700

seq1  TGATCTTATGCAGTTCTGGGGCTCAAACCCTGGGCCTCCTGCCTGCTAGA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATCTTATGCAGTTCTGGGGCTCAAACCCTGGGCCTCCTGCCTGCTAGA  750

seq1  CAAGCACACTCCCTGAGGAAGCCTCGCCACATTCTAGCCTTCATTCACAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGCACACTCCCTGAGGAAGCCTCGCCACATTCTAGCCTTCATTCACAT  800

seq1  GCAGCAGGTCACCCCCTGAGGAAGCCTCCCCATGCTCTGTGCCTTCATTC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGCAGGTCACCCCCTGAGGAAGCCTCCCCATGCTCTGTGCCTTCATTC  850

seq1  ACATGCAGCAGATCTATTTAGAGCTGTTTCTTTAGGAAAACCACAGAGAT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGCAGCAGATCTATTTAGAGCTGTTTCTTTAGGAAAACCACAGAGAT  900

seq1  CATAGTGCATAAGGCCACTTCACTGCCCCTTCCTACACACAGTTCCTTTT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAGTGCATAAGGCCACTTCACTGCCCCTTCCTACACACAGTTCCTTTT  950

seq1  AAACTTTCAAGATAAGTCTCAAATCATTGCATCCTGGAAGCACCCTGGCC  1000
      ||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||
seq2  AAACTTTCAAGAT-AGTCTC-AATCATTGCAT-CTG--AGCACCCTGGCC  995

seq1  TCCTGACTCCCCTGGTCATCTGCCCTTTTATTCTCTCCATTTTCTGTTCA  1050
      |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  TCCTGACT-CCCTGGTCATCTGCCCTTTTATTCTCT-CATTTTCTGTTCA  1043

seq1  CTTCATTCTATGTGTTTGCTTTCAAAGGTTTTATTTGGGCAAAGTGAACA  1100
      ||||| |||||||| ||||||||||  | ||||||||||| |||||||| 
seq2  CTTCA-TCTATGTG-TTGCTTTCAA--GATTTATTTGGGCCAAGTGAAC-  1088

seq1  CCTTCGGCTTATGGAATTGCCT  1122
         || |||||| |||||||||
seq2  ---TCCGCTTAT-GAATTGCCT  1106