BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-053E09.T7 (MSMg01no053_e09.b1) | MSMg01-053E09.TJ (MSMg01no053_e09.g1) |
ACC | AG281532 | AG281533 |
length | 702 | 1,337 |
length of high quality (start - end) | 238 (77 - 314) | --- |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no053_e09.b1 PHD_FILE: MSMg01no053_e09.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 16:54:08 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no053_e09.g1 PHD_FILE: MSMg01no053_e09.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 16:54:08 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | TCATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTCCCGAGTAGCGCGGA
ATTCCAGGAGTGTTCCCAGACCATAAGGCCAATGCTAATTAATGGGAATT
ACCTAGAACCCCCAAATTAACCCCCTATGATTGAGATAAGGAAAAGAAAA
TATTACCAGGATGGGTATTTATGCTGATTTCAAACCTTCTTCATGCTATT
TCAAAGGTCAGGGAAAATGATCAATCACCCTCCCTTCCTACGGAACGAGC
CAGTCTGTGGTGAGCTTGGTTTCAGGGGATCTTTATGAAGGGTGTCTGGT
GCATCATGTGGCAATGCCTTGCTTCTTCATACCGAGAATACACTGCACAA
GTTTAAGCTTTTTTCTCCCCCCCCACTTTCATTAAATAAATTTATTTGTT
AAAATAATTTAACTCCAAATACAACTGTTGAATTTGCACTGAGTTCTAAT
GACAATTCATGCTTCAATTGAAATGTCTGGTTTCTCTCGACTCTGTTACT
ATACATATTGCCGTTGCTCACTTTTCTATGCTCCGCTGCACTAAAGTCCC
AAATTTTACTGTGAACTGGATTTCTTGGGCAACCTCTTACTCAACTTCTT
TTCCGGCTTTAAACTCCTATGAAACTCATCCTATAACCTTTGATCCCCTC
TTAATAACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCATTATACCCCCCTTGTCCTCAT
AG
| NCCCCTCTCTTTTNNNNNNTTCTCTCTCTCTTCTTTNNNNCNCNCCACTT
TNNCCNCCTCCATACANNNAAGGNGAAAGANNGNGNNNNNNNNNNNNTTN
TANATNNTNNTTTTTACAGNANATAAAGAGNAGGTGTGTAAGTCAACTAC
AATACGAAATATTNNTNATTCTTTTATCTTCTTCNCATATATCTCTCTAT
CATCTCCTTTCTCTTCCTTTTACTGTCTTCTATCTTATATACCATTATCT
AGACACGAACTATACTTCCCCCTATTACCTTATATACACTCTCTATCTCC
CTTTTTTTNTTCTTTATCTTNCTTATCTCATCTGTCTCTCGCCGCACTCC
CNACTCCTCNCCTCCACATCATCTCCTCCTTTCTTACCTACAATCGNCTC
ATACCTACCTNNNCCTTCCCATCTCTCTCAACCTCCNTATTTNCNTTCNT
CTNACTCTTTCACATCGCTCTCTTCTACTATATATTACCACGCATGATCA
GCGGATCGACTATTCGCGCGTATTTTGCGCTGCTGTATATTGTACTGTAC
TTTCACTGAGAGTAACGTAGTACNGGCGATAATAGCAACGCGGTGTTCGT
TCGTATATTATGCTTGCGCTATCGGCACACTAACGCAGTCTCGTAACCGT
AGATTAGCGTAGTCTACGTAGCTTCTATGATTCGCCGCTACTGTCGCCTC
TCTCTACTCATATCCGCTGTATTCGCTTCATTCCTGCTTATTAAACTCCG
GCCTTTCCGANGCCTATCGNCTATTCTTCCCATCTTTTATTTATCATTAT
CAATTGATGATCATACATGCTTTATATAATAATACTCGCCCGACAATCTA
TACTACCGATCCCTCGACCAATACACACACACAGCACAATACATAAACAA
CACGTATGCAAACCATGAAGAAAGAATGACGTGTGGATAGACAATATTGC
GGCTATAGTAGATACCGCAGAGTTACGGTATATCTCGATACACGTAGCTT
GTCATCATGTGGAGAGCGACAATTAGGACGGAGCAGAGGATGCACNACCG
GTGTCGTAGATATGCTGTATACGCGCGACGCACGCGATGTGTCTGTAGTG
TGGTAGCACGACGCGCGATGTACATCCGCACGACCGGTTATCTGANTGAC
NTATGAGTGACCGTCACATACATAGCATGTGAGTTGATTGCGTGCCCGAT
AGTGAAACGCGCAGCAGATATATGATATTGTGATATGGATATCATTACGC
GATCACCCGCTGCCGACACCGCGACATATATATCGACCGATTACGNGGCG
ATTGTCTCAGGANGATAGTAGTTCGGCGCGCGCCGAT
|
quality values | Open.Hide. 8 10 8 8 8 8 15 25 29 30 20 19 17 13 13 28 23 23 16 13 13 25 25 48 27 20 20 18 18 19 21 9 6 6 6 6 6 6 7 7 8 6 6 6 6 11 15 17 27 27
33 33 29 28 24 24 20 23 21 21 7 6 6 8 6 6 6 6 6 6 8 9 14 23 19 18 21 23 27 31 31 29 35 47 50 50 57 57 57 57 42 42 47 47 37 37 43 48 48 48
48 57 44 43 39 35 35 39 47 57 50 36 36 33 33 30 34 34 28 19 17 10 10 11 13 17 28 37 37 33 33 33 33 36 33 39 39 43 43 46 59 59 59 57 48 48 48 48 48 48
42 42 42 50 48 48 42 42 36 28 28 29 28 21 31 40 57 57 57 50 57 57 57 57 50 50 50 50 47 51 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57
57 47 48 48 48 57 50 50 50 57 57 43 43 37 36 36 50 50 50 50 57 57 57 57 50 47 47 50 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 59 42 35 35 37 37 37 42 44 32 30 15
12 10 10 9 10 10 13 16 24 24 35 35 42 39 46 42 42 35 35 39 47 44 37 28 28 23 20 20 29 31 42 48 59 48 48 43 43 41 32 32 30 32 37 39 43 43 37 30 19 17
17 26 29 33 47 30 34 25 23 23 23 23 23 21 16 11 9 9 9 7 9 7 7 6 6 6 9 9 10 10 10 8 8 8 8 10 27 32 47 47 40 30 30 26 20 23 28 28 32 35
39 39 39 30 27 15 10 10 13 10 13 19 15 9 8 8 10 11 14 13 19 16 14 19 13 11 12 12 13 24 22 21 22 18 17 15 17 17 19 13 19 15 26 15 16 12 10 10 10 10
19 19 20 20 20 23 23 23 27 27 15 15 11 16 16 12 12 16 12 11 18 13 13 14 15 19 28 22 25 24 24 16 16 16 16 15 8 8 6 6 10 8 10 14 16 15 11 10 8 8
8 10 10 13 11 15 16 10 10 8 8 8 8 10 8 11 11 12 11 10 8 8 8 8 8 8 10 9 8 12 10 10 10 9 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 15 12 10 10
8 8 8 12 6 6 8 8 9 9 10 10 10 9 9 10 8 10 8 8 8 10 14 11 16 10 10 8 8 10 10 8 8 8 8 8 10 15 16 15 12 10 8 8 8 6 6 7 6 8
8 8 8 10 10 9 9 9 9 9 17 12 14 12 11 11 11 11 11 11 11 14 13 14 13 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 9 9 8 8 8 8 8 10 10
16 17 13 10 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 12 12 15 12 14 10 8 8 6 6 8 13 8 8 8 8 10 8 8 8 8 9 9 17 13 18 22 24 25 16 14 10
8 7 6 8 8 8 8 9 8 8 8 8 15 13 14 15 19 20 20 11 11 11 17 12 9 9 9 10 9 8 8 10 8 8 9 12 9 11 10 10 8 9 9 9 9 8 8 8 8 8
6 6 | Open.Hide. 0 3 8 11 9 8 8 8 8 8 8 8 3 0 0 0 0 0 0 3 17 13 6 6 6 6 6 8 11 8 8 8 8 10 13 3 0 0 0 0 3 0 3 0 3 7 6 8 6 7
3 0 0 3 3 0 3 8 9 9 7 7 7 7 7 3 0 0 0 3 6 6 3 0 3 6 6 6 6 3 0 0 3 0 3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3 3 0
3 3 0 3 3 0 0 3 0 0 3 8 8 6 6 6 6 6 3 0 3 0 3 6 6 7 7 7 6 3 0 3 7 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 6 8 8 8 8 8
8 8 6 6 6 6 10 8 6 6 8 8 3 0 0 3 0 3 6 8 6 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 3 0 3 12 9 11 12 10 10 6 6 6 6 10 10 11 10
9 9 9 7 6 6 6 6 6 6 8 9 8 6 6 6 6 6 8 6 9 6 6 6 6 6 6 9 7 10 8 6 6 6 6 8 6 6 6 6 11 7 6 6 6 7 6 6 6 8
8 6 6 6 6 6 6 8 8 6 6 8 10 6 6 6 6 8 10 11 12 9 8 8 6 6 6 6 7 7 6 6 6 10 6 8 8 8 10 9 11 9 8 8 8 8 8 6 10 6
6 6 7 8 9 7 7 3 0 3 6 6 6 7 7 7 10 6 9 3 0 3 6 6 6 6 8 6 6 10 6 9 9 9 9 10 8 8 10 8 10 9 11 13 11 11 11 9 8 8
3 0 3 6 8 6 8 10 3 0 3 8 8 8 8 8 10 8 10 8 6 6 8 6 6 6 6 8 8 12 10 10 10 10 8 11 8 7 7 8 8 13 11 9 11 3 0 3 11 9
6 6 6 6 6 8 8 8 8 3 0 0 0 3 9 9 10 9 9 9 7 8 8 6 6 6 8 10 9 9 10 7 6 6 6 3 0 3 10 9 9 3 0 3 0 3 9 3 0 3
7 3 0 3 9 9 6 6 6 6 6 8 8 8 7 8 6 6 8 8 10 9 9 9 7 7 8 8 6 6 6 6 9 9 9 14 13 12 7 8 7 9 8 8 8 8 8 8 8 10
8 7 6 8 8 6 6 6 6 6 6 6 8 6 8 8 8 8 8 10 10 9 8 8 8 8 8 8 6 8 6 6 8 12 15 12 10 14 8 8 8 8 8 8 10 8 8 6 6 6
8 8 8 8 8 8 8 6 8 8 8 8 8 8 9 10 8 8 6 6 6 6 3 0 3 6 8 6 6 6 8 8 8 8 10 8 10 9 6 8 6 6 8 8 10 11 10 8 8 8
8 8 9 10 8 6 6 6 7 8 8 7 7 7 8 8 10 10 10 6 6 8 6 10 10 12 10 10 21 15 12 9 9 9 9 8 8 8 9 9 9 8 8 6 6 6 6 7 8 8
7 6 8 8 8 8 6 6 7 7 8 8 8 6 6 8 6 6 6 6 8 8 10 6 6 6 6 8 8 8 8 8 7 9 9 10 10 10 10 10 6 6 6 6 6 6 8 13 13 15
15 11 8 10 8 8 8 10 10 10 7 7 7 7 6 10 8 8 8 9 8 8 8 9 9 9 13 13 10 12 8 8 6 7 6 6 6 8 15 10 12 9 9 9 10 10 10 8 7 6
8 8 13 8 8 8 6 6 8 3 0 3 6 8 8 8 8 6 3 0 3 8 6 6 6 6 11 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 13 8 10 8 8 8 8 8 8 9 9 13 9
8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 10 10 10 6 6 6 6 6 6 10 10 6 8 6 6 8 6 6 6 6 8 10 8 12 7 6 6 6 6 8 6 6 8 8 8 8 10
10 11 6 8 6 6 8 6 6 6 6 8 8 8 6 6 6 8 8 10 10 11 11 10 10 19 15 15 11 11 8 10 8 8 6 6 8 8 8 8 10 8 9 9 6 6 6 6 8 10
8 8 8 8 8 6 6 6 8 8 8 6 6 8 6 9 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 10 13 11 10 9 8 10 11 9 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8
6 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 9 7 7 6 6 6 6 6 6 8 6 8 8 8 7 7 8 10 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 10 12 19 8 8 6 6 8 6 8 8
7 8 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 7 7 12 8 8 6 8 6 6 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 3 0 3 6 6 6
8 6 9 9 7 8 8 8 8 8 10 6 6 6 6 8 10 10 7 7 11 11 15 10 10 9 6 8 6 6 8 8 12 8 6 6 8 8 10 10 11 9 6 10 8 12 10 10 10 10
10 11 11 11 10 10 8 8 6 6 8 6 7 10 8 11 6 6 6 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 10 6 6 6 6 6 8 8 8 8 3 0 3 9 10 3
0 3 6 6 6 6 6 6 8 8 13 12 11 10 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 6 9 9 9 10 6 8 6 6 6 6 8 10 9 8 8 6 6 6 7 10 8 8 6 6
6 6 8 6 6 8 6 6 6 6 6 8 6 6 6 6 8 8 8 8 6 6 6 6 7 6 8 8 10 8 8 8 8 6 8 6 6 8 8 9 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6
6 6 6 8 6 6 6 6 9 9 10 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 7 8 8 10 8 8 9 3 0 3 11 8 10
8 8 8 10 9 6 8 8 6 6 8 3 0 3 6 8 8 6 6 6 6 6 7 6 8 8 6 6 6 7 6 6 8 8 10 8 8 |