BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-064P23.T7 (MSMg01no064_p23.b1) | MSMg01-064P23.TJ (MSMg01no064_p23.g1) |
ACC | AG290312 | AG290313 |
length | 1,186 | 746 |
length of high quality (start - end) | 413 (34 - 446) | 57 (73 - 129) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no064_p23.b1 PHD_FILE: MSMg01no064_p23.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 17:10:22 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no064_p23.g1 PHD_FILE: MSMg01no064_p23.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 17:10:22 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | NTTATGCATTGGGCGCATAGACTCACTAAGGGAGAGGATCCGCGGAATTC
CTACTCACCCCAGTGTGTACATCTTAGGGGACACAAGCCTATATCTTCTT
ATGCATCCAAGTCACAATTGCATCTGCCTGCTTTTGGCTGTTCACATCCC
AACGGAGTGCCACACAGCTGTGGAGATGTTCCACCCACCCACCTGAGCAC
CCCAGTCCTGTGCTTTAACAGTCAGGTCATACTCTGTGTACACATGCACA
TATCAACACCACACTGGTCCAGGCTGAGGGTGTGTGATTCCTGAGATGGG
CATGGTACAGAGAGAATGGCCTTAGGAGTTTTCTAAGGGCAGATAGCCCC
ACTGTCTCCTGGAGTTGGCTGGTTTGATCTGAGTTTTTAGCCGTGCTGTT
AAGTTTACAGTAACAATCTAAACTCACTGGCCATATCTATGGGACCCTGT
CTTCTCCCCCCCCCTTCACCTCCTCGTTCTTGAGAGAAATGCCAAGCTTG
GGCATCTGAGGCCCTTAGTCCATGGTTATCACAGTCATGCTCTGTGGACT
GAGAGTCAGTGTGGTGTTCTCTTTGCTGCTGTTGTTGCTGTTGACTGGTT
ATTCAGGGAATTACCTGGAAGTCCTGCCCCATGTAATGCTGGGTGTTAGA
AATTCCTCATTCCTGCCCCAAGTCACTTGAGCCCTACCAGAATCCAACGC
TGCACCCAGGTTGGGTTGTAGCAAGCTACTCAAGAGGGTCCCACTGTTCC
CTCAAGCCCTGCCCAGCTTGGCTATGGCTGTCTTCCTCCTAGGCTCTGGG
ACCTCGGGTACATGGCAGGGTTCTGGTAGTTTTGCTTCTCCTCTGTACAG
GTTTTCATGACCAGAAAAAAGGTTGTCAGTCCCAGGAAGGACAAACCCCC
CCCTCCAGAGGGCCCTGGAAAAACTTGCAAAAACTTCCTTCTTGGGTAAA
AGGTATTGTTAGCCCCCACGCCCTTTGTGAATAGTTAAGCCTTCCCCCAT
ATTTTTCGGTCGAAACATTGCTCTTTATTTTTTTTCTATTTCTCTTCTCT
CTACTATTTTCTCCTCTTTACCTTCTTCCTCTTCTCTTATATATTCTTTT
CATGCATTTATTTATACTCTCTCATCTTTTTATCTCTTCTCTCTTGTCTA
GTCTCCTCTTCTCTATCCAATCCATCATATTATTCT
| TGATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCAGGCAGCCCAGGGGGGACAGAGAAAC
AAGGCCATGAAAGGTAAAAGGGCAAGGCTAGGGCTGAAGCCGTCCAATGG
TGACAGGAGTGTTCATATGGTAATAGTCAAAACCCAGTGAACGGAGCTGT
GACCATGCATGGAAGGCAAGGCACAATCCTGACTCCAAGATTCTTCACTG
TCCCTACCAGGCACTTTCATGTGCCTTGTCCTGTGTGAAAGATGACAGGT
ACCATGCTACATACTGCATGCTACTTGACAGTCAGGGGACAATAGTCCTC
CACCGAATCCATTTTTTTTCCTTCACACCGAAAAAAACACACTCCTTCTT
TTTAGAGATGTTTCTCCGCCCCCCCCTCTGAAAATTTCCTCTGACCTCTG
CTGCAAAATCTATGGACAGCAAAGGTTGGTGGATCCTTTTAAGACCTTTC
TTGTGTGAGTTTGGATATGTAGGAACACAACTGGCCTCTGCACACTAGAC
ACCAGTGACACCGACAGCCAAAGATAGTCCTGAGACCTGGGAAGGGAGTA
ATAGAGTGCTTACTTAGCATGTGGGAGGTACTGGGTTCCATTCCCAGCCA
CAGGAAAACAAAGTATACCTTATCAAAACCGGACAACCCTCACCCTCCAT
TTTCCAAAATGCCCTCTAGAAACAAAGTGGTCCCTACTAAAAACCC
|
quality values | Open.Hide. 0 3 6 6 6 6 6 7 9 10 8 8 13 14 9 8 8 8 8 9 10 14 16 24 14 12 8 8 8 19 22 26 15 18 18 28 29 33 37 37 37 37 37 37 32 29 32 23 22 12
14 14 25 22 31 31 36 36 50 50 35 35 32 33 33 37 32 34 34 43 43 43 47 47 47 43 50 50 54 54 54 54 54 68 68 68 48 43 42 42 47 50 47 48 48 54 54 47 57 57
57 57 47 57 57 54 57 48 50 47 47 47 51 51 51 57 57 57 57 57 46 36 26 24 15 15 15 15 24 19 32 38 50 50 57 50 57 50 54 50 50 54 57 57 57 68 68 68 57 57
57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 68 68 57 57 50 50 50 50 50 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 57 57 43 43 35 44 44 57 68
68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 52 57 57 57 57 57 57 57 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 62 43 57 57 59 59 68 59 59 39 39 43 57 57 57 57 44 44 35 43 43 59 59 57 57
57 59 59 59 59 57 44 44 33 33 33 44 44 59 57 57 57 57 59 57 57 57 57 52 52 52 52 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 68 44 44 35 35 37 50 50 68 59 59 59 59
59 54 54 54 59 57 57 57 57 57 37 44 44 57 57 57 57 57 54 54 54 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 48 57 57 57 59 59 59 48 48 48 59 47 47 41 41 32 37 37 44
44 48 48 48 57 57 68 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 48 48 48 57 57 57 57 57 57 59 59 59 48 43 43 33 26 21 21 16 21 12 18 11
11 6 8 6 6 6 6 11 13 19 26 19 31 28 24 28 34 34 41 48 48 48 48 48 59 59 59 46 47 47 25 23 11 11 11 12 10 13 10 10 10 11 12 18 25 26 47 39 48 48
48 48 37 37 37 48 43 43 40 43 43 59 48 59 59 59 43 46 39 47 47 48 48 46 59 57 54 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 59 59 59 59 57 57 48 48 48 57 44
43 35 35 35 43 42 57 57 59 59 57 57 57 57 57 68 59 59 47 47 54 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57
57 57 57 54 48 48 57 42 42 42 42 54 57 59 57 57 48 54 54 54 54 46 46 47 48 54 54 57 57 57 46 43 36 36 43 43 48 48 48 47 47 48 59 43 43 40 47 35 35 35
39 39 50 47 48 48 48 48 41 41 40 39 37 37 31 32 32 44 39 44 41 41 41 41 41 41 40 41 43 37 37 31 31 39 41 41 28 28 17 15 15 25 24 37 37 37 39 30 30 30
39 37 47 39 39 37 37 35 31 31 31 34 24 22 30 23 19 10 10 10 15 14 20 20 18 19 15 23 16 19 24 18 25 30 34 34 20 20 23 32 34 39 37 33 18 16 16 14 14 20
27 25 19 13 13 17 11 11 14 16 17 19 22 35 32 18 17 14 14 14 15 30 28 24 24 19 19 17 15 10 10 10 14 23 37 39 35 31 24 25 18 16 16 22 19 28 24 22 24 24
13 11 8 10 8 13 18 11 11 11 13 21 22 18 18 20 19 11 9 12 9 10 10 13 9 8 8 8 10 15 27 27 37 37 20 12 13 8 8 8 12 12 13 14 9 10 11 13 13 16
16 15 19 10 10 9 9 9 15 10 8 8 8 9 9 10 8 9 8 7 6 6 8 6 6 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 11 16 9 9 9 8 8 8 9 10 9 11 11 22 22
8 10 6 6 6 7 9 9 8 8 8 8 8 10 10 12 9 8 9 9 10 10 10 12 12 12 11 11 11 9 9 8 8 8 8 8 8 9 9 8 9 10 9 10 9 10 10 10 15 14
12 12 10 9 9 14 10 10 9 10 12 10 10 10 11 9 8 8 8 8 8 8 10 12 12 15 10 10 9 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 10 8 10 9 9 11 10 10 10
9 9 10 10 10 10 10 10 10 9 9 9 10 10 11 10 10 10 8 8 8 11 11 11 12 9 9 11 10 10 8 8 8 8 7 6 6 8 8 15 10 12 9 9 8 6 6 6 8 8
8 8 7 7 8 8 11 11 10 10 15 16 10 10 10 13 10 10 8 9 9 7 9 9 8 8 8 10 15 15 18 16 16 10 10 8 8 8 6 8 8 8 8 8 8 12 13 18 15 17
9 9 9 7 8 8 8 8 6 6 8 8 11 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 12 12 10 10 8 12 8 8 8 10 9 9 9 7
7 7 8 8 8 8 10 10 10 8 12 12 15 10 8 8 9 8 8 6 7 8 8 6 6 8 8 6 6 8 8 6 6 10 8 6 | Open.Hide. 8 8 8 8 8 15 18 18 15 18 23 15 16 15 19 21 11 21 21 28 34 25 28 25 32 21 23 11 27 23 39 28 34 22 18 18 21 21 28 32 39 29 40 24 21 22 31 22 25 30
37 36 36 23 25 22 34 24 29 29 36 36 26 30 30 14 13 13 21 21 42 42 47 39 39 37 39 37 37 37 37 39 39 39 44 57 44 40 14 14 12 19 10 13 12 15 15 32 32 37
37 37 37 38 38 15 15 12 27 15 16 16 32 38 32 32 20 21 18 38 24 28 28 28 26 30 14 14 14 30 32 24 13 13 13 24 12 24 24 27 43 28 35 35 30 26 12 12 11 15
15 24 34 25 24 22 26 22 19 19 20 35 43 27 27 27 35 26 16 22 22 19 23 23 20 27 22 24 18 20 26 43 43 52 43 43 31 31 31 43 43 43 20 18 15 11 11 12 18 22
26 35 38 26 26 18 18 14 14 12 15 15 15 19 38 27 27 27 41 41 38 27 23 32 34 28 27 38 32 33 38 31 33 28 32 38 38 14 14 14 27 27 37 43 36 18 21 14 16 14
30 30 43 43 43 43 42 36 32 43 24 24 13 15 21 38 36 18 17 17 18 32 32 32 32 24 24 13 24 24 22 22 14 21 21 25 25 30 32 14 14 14 27 27 28 28 28 28 28 20
20 24 19 18 18 18 27 22 32 20 20 15 26 21 22 14 18 14 14 15 21 21 27 17 17 17 26 30 34 32 35 35 35 37 30 34 17 17 17 29 25 28 24 15 13 13 13 24 22 29
19 20 23 28 28 31 28 22 19 12 12 9 11 12 15 14 16 19 21 29 15 10 10 8 15 8 8 8 8 8 8 8 21 30 31 41 28 28 19 25 12 13 18 24 26 28 30 30 30 43
37 28 28 13 13 13 15 15 24 24 37 28 32 19 10 8 8 8 10 11 23 23 34 34 35 35 28 28 20 15 15 26 26 32 37 32 35 32 32 30 32 32 35 39 37 30 30 23 23 20
18 18 13 26 18 19 19 22 21 30 28 28 28 23 25 28 35 35 33 33 30 25 25 28 28 21 26 15 13 13 13 15 15 26 19 32 32 43 34 25 24 11 11 11 23 23 37 37 35 35
24 25 12 13 13 19 19 20 32 32 32 32 18 19 13 15 15 24 21 19 18 13 13 13 21 26 35 31 26 18 17 18 18 32 19 20 28 28 24 19 15 15 15 12 12 15 12 12 12 18
18 23 28 25 20 20 20 28 24 23 23 24 24 24 21 21 24 30 37 30 20 15 15 14 18 15 18 18 12 15 18 18 11 11 11 12 12 19 12 13 18 20 22 28 17 17 18 24 24 20
18 18 12 11 10 10 10 10 14 11 21 15 17 15 18 11 11 11 11 13 14 12 12 18 18 20 20 15 16 13 13 16 12 21 21 13 21 21 17 17 14 22 22 25 22 28 20 14 11 11
11 17 17 21 23 21 15 11 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 6 6 11 8 10 11 12 12 18 17 12 10 10 8 8 10 10 9 9 11 12 10 10 11 13 13 10 11 12 14 13 16
18 18 20 22 22 19 22 22 25 32 21 12 10 10 12 10 9 9 9 8 8 8 9 9 9 9 10 11 11 10 10 10 12 11 13 13 12 10 10 9 10 14 13 14 14 14 |