BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-074F02.T7 (MSMg01no074_f02.b1) | MSMg01-074F02.TJ (MSMg01no074_f02.g1) |
ACC | AG297402 | AG297403 |
length | 706 | 686 |
length of high quality (start - end) | 612 (47 - 658) | 528 (56 - 583) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no074_f02.b1 PHD_FILE: MSMg01no074_f02.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 17:22:39 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no074_f02.g1 PHD_FILE: MSMg01no074_f02.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 17:22:39 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | CCTCATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCG
GAATTCTCCTTAACAGGGACGGGTTTTTGTTTTCTCTCTCTCTTGCTTCT
TACACTCCTGCTCCTAAAGATGTAAGCAATAAAGCTTTGCCGCAGAAGAT
TCTGGTTTGTTGCGTCTTTCCTGGCCGGTCGTGAGAACGCGTCTAATAAC
ATAACTCCAACCAAGCAAGTTAAAGACCTATGTGACAAGAACTAGACGTC
TGTGAAGAAGAAATCTGTGATAGTATCAGAACATGGACAGATCTCCCATG
CTCATGAATGGGCAGGATTTACATAGTAAAAATGGCCATTTTTTACCAAA
AGCAATCTACAGATTCAAAAACTTCCCATCAAAATTCCAACAGAGTTCTT
TCCAGATCTTCAAAGAATGACATTTAACTTCATACGGAAAACCAAAAGAG
GCAGGGTAGCTAAAACACTCTTGTTCAAAACGGGAATATCAATAAAGTTA
TTGCCATCTCTGAGTTCAAGCACTACTACAGAAATATGTTAATAATAACC
ACATGGCAATGGCATAAAACAGACAGGCAGATCAATGGAATGTAATCTTT
AATGGAATCAAAGACCCAGAATAAATTTACCCTCCTTTGGACATTTTATT
TTTGACAAAGAAGCCAAAATTATACAATGAAAAAAAAAAGGGTCTTCAAC
AACTGG
| XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXCTTGTGAAACCTTAGGTCCATGCAAATACATAGAAAGTAGGACTA
AACAACTGAAGATATAAGGAAACATTAAAATAAATTAAACTGAAGAGATC
AAATTATTTAAGCACCAAATTATATGCATATATGTACACATACACACACA
CACACACACTCACACACACACATACACACACACACACACACACACATATA
TATGTTTAGTTTAGTTTTAAAATATGTGATTTTTCACTTTTAGTGAATGA
ATAAAATGAGCTAAAATATGGTAGTTTTCTTAGGGTTTTACTGCTGTGAA
CAGACATCATGACCAAGGCAAGTCTTATAAAGGACATCATTATTTGGGGC
TGGCTTACAGGTTCAGAGGTTCACTTCAGTATCATCAAGGCAGGCACAGT
ACAGGAGGAGCTGAGAGTTCTATATCTGCATCTAAAGACTGCTAACAGAA
TACTGACTGTCAGTCAGCTTAGGAATAGGCTTAAAGCCCAAGCCCATAGT
GACACACCTACTCCAACAAGGCCACACCTTCCAATAGTTCCAGTCCCTGT
GTCAAGCATACACAAACCATCACAGTAGTTCATTCATTCACAAATTATTG
ACTGGGAAAAGCAATGTCAAACCATGGGTACAAATG
|
quality values | Open.Hide. 6 8 8 8 8 9 9 19 12 16 21 18 18 17 19 16 15 19 10 9 9 19 19 33 33 37 23 17 19 13 13 8 10 10 8 8 8 9 13 21 22 29 29 31 28 28 30 37 47 47
36 36 33 50 50 42 59 47 39 32 19 6 6 6 6 6 8 18 30 41 40 40 40 48 48 36 35 35 28 28 28 36 57 57 57 57 57 57 57 57 57 53 50 50 68 68 68 68 68 68
51 68 50 50 50 50 68 57 57 57 57 54 57 57 57 48 57 57 48 50 50 50 50 50 50 47 47 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 44 57 47 57 57 38 38 17 35
35 42 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52
52 57 57 57 57 57 57 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 62 62 62 62 62 62 62 52 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 45 45 45 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 45 43 43 43 43 52 62 62 62 62 62 54 52 62 52 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 52 52 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 52 45 45 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 43 43 35 44 44 57 57 57 57 52 52 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59
57 57 57 52 57 57 59 59 57 57 52 52 57 57 57 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 57 52 52 52 59 59 57 57 57 52 52 52 52 52 52 52 52 59
52 52 52 57 52 54 57 57 57 57 57 57 43 43 35 43 43 43 43 43 44 59 57 57 46 41 39 57 57 46 47 43 43 43 48 59 44 59 42 35 35 43 59 59 68 68 68 59 59 59
57 57 57 57 48 48 47 59 48 54 47 59 59 43 43 43 43 43 46 43 48 48 48 48 54 48 43 39 35 35 39 39 43 48 57 48 48 48 48 48 48 48 48 48 48 48 48 41 40 40
39 39 39 40 37 34 39 37 37 35 31 28 36 37 47 59 46 46 46 48 48 43 43 34 34 23 24 19 26 26 28 28 21 28 30 30 28 28 36 37 37 30 33 33 33 33 39 39 39 39
34 31 37 31 31 25 27 26 20 20 20 32 32 30 28 23 28 23 28 24 27 39 32 32 38 37 37 43 44 41 41 44 44 47 47 39 39 37 31 26 29 28 30 39 40 41 40 39 39 39
39 37 37 18 18 9 9 9 14 21 22 18 22 22 16 12 11 8 8 8 8 13 12 21 19 19 19 25 28 30 25 17 17 18 19 37 37 43 30 19 14 11 11 11 18 22 19 23 34 34
39 34 34 28 24 24 | Open.Hide.24 25 30 30 30 33 33 33 37 23 20 8 8 11 8 8 8 12 11 11 11 12 21 19 25 24 24 20 15 15 10 10 12 26 21 36 36 34 29 19 17 11 11 13 13 27 23 42 32 42
42 48 43 48 48 48 48 57 48 50 50 50 48 57 47 47 36 42 36 47 47 36 38 40 40 40 40 48 48 57 57 48 47 47 30 42 30 39 39 38 42 30 30 29 30 37 42 57 57 57
57 47 50 57 57 57 57 57 57 50 54 54 57 57 57 57 57 57 57 57 50 50 50 50 50 50 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 50 50 43 43 37 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 52 62 62 52 52 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 62 62 62 62 52 52 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 43 44 43 52 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 57 57
57 57 57 52 57 57 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 43 37 43 43 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 57 52 57 57 57 52 52 52 52 57 57 57 57 50 43 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 47 44 43 43 46 46 48 47 42 44 33
33 42 42 42 48 48 48 48 48 48 48 44 44 28 28 28 32 32 37 39 39 57 57 57 54 54 54 54 54 54 54 54 48 57 48 54 54 54 57 57 68 68 50 53 48 50 48 47 48 43
43 48 48 43 48 48 39 39 35 39 37 37 28 28 23 24 24 37 25 25 14 14 14 26 26 37 30 37 32 39 23 23 11 11 11 23 28 40 39 37 18 18 16 14 18 23 30 30 37 41
39 43 43 48 48 46 46 46 43 47 43 38 34 31 38 32 30 24 22 20 19 19 18 28 20 23 20 30 34 24 22 22 25 23 24 20 20 12 12 12 12 12 23 21 30 37 37 37 37 37
39 35 35 25 28 17 17 17 20 15 11 11 11 17 27 39 37 37 32 32 37 31 20 19 11 11 12 23 23 34 34 39 39 48 48 39 39 39 31 31 33 28 26 25 33 32 27 31 31 39
39 31 24 18 11 9 8 8 8 8 8 11 24 22 22 15 14 14 11 14 14 14 15 14 12 10 8 8 8 10 13 17 16 21 12 12 |