BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-078G21.T7 (MSMg01no078_g21.b1) | MSMg01-078G21.TJ (MSMg01no078_g21.g1) |
ACC | AG299768 | AG299769 |
length | 712 | 720 |
length of high quality (start - end) | 362 (36 - 397) | 554 (74 - 627) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no078_g21.b1 PHD_FILE: MSMg01no078_g21.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 17:26:45 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no078_g21.g1 PHD_FILE: MSMg01no078_g21.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 17:26:45 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXATCCGCGGAATTCAAA
AGAGAATACTTATTTGATCCTTTGATAATTTGTTTTAAAGTACGGTTTCA
AACTATGTAAACATATTCATGATTTTATAGTTCCCTAGACTCTTTCTTTC
CTGTGTTTCAGAGAAGAACAACTTTATGCTGTATAATATTTTGAAAACCA
TCACTGCAGGTGCTAAACTCTAGCATCAGGAGGCAATTTCCTTAACAATT
TCTCTTAAGTTCTATTTCAACTGGCAAGTGGTCTACCTTCCAAGATAATA
CCCAAGAAGGATGCCTCAGTACAGCATATTTCAATACAAGTGAAACACAT
GTTGTGATGCCCATTTTATATGAATTCAAGCACGAATTCTTTCCACAAGT
CCACATGCAATTTTCACTTCCCCATTGTTTAATAATTGTCAAATTATTAA
ACTCTCATGTATTGGGACCCACTCGACCGGCAAGAAAGACGCACCAAACC
GGACTCTTCCATGGTACAAGCTTCATTGCTCACTTCTTCAGGCAGACCCT
GAACCAGGAAAATGGTGCCTCTTTTGTAGTCCTCAGCGTGACGTTTCAGC
CCCTGATATGGCGTGCCTGATCCTGATTTGTTGCTCGCCCATCACCCTAA
TATTACACCCTGACAATGCCAGCGATTTCCAGTGATTTTTTTTTCCTACT
TGCGATCAAGGC
| CAATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTCACCTGAGGAATACCGAATGGCAGAG
AAGCACCTGAAAAAATGTTCAACATCCTTAATCATCAGGGAAATGCAAAT
CAAAACAACCCTAAGATTCCACCTCACACCAGTCAGAATGTCTAAGATCA
AAAATTCAGGTGACAGCAGATGCTGGCGAGGATGTGGAGAAAGAGGAACA
CTCCTCCATTGTTGGTGGGATTGCAGGCTTGTACAACCACTCTGGAAATC
CGTCTGGCGGTTCCTCAGAAAATTGGACATAGTACTACCGGAGGATCCAG
CAATACCTCTCCTGGGCATATATCCAGAAGATGCCCCAACTGGTAAGAAG
GACACATGCTCCACTATGTTCATAGCAGCCTTATTTATAATAGCCAGAAG
CTGGAAAAAACCCAGATGCCCCTCAACAGAGGAATGGATACAGAAAATGT
GGTACATCTACACAATGGAGTACTACTCAGCTATTACAAAGAATGAATTT
ATGAAATTCCTAGCCAAATGGATGGACCTGGAGGGCATCATCCTGAGTGA
GGTAACACATTCACAAAGGAACTCACACAATATGCACTCACTGATAAGTG
GATATTAGCCCAAAACCTAGGATACCCAAGATATAAGATACAATTTGCTA
AACACATGAAACTCAAGAAA
|
quality values | Open.Hide.10 10 14 14 19 17 15 12 12 18 23 17 15 8 8 8 19 19 22 21 9 10 10 22 19 19 9 9 9 9 9 9 10 10 10 12 19 21 37 37 37 36 36 36 35 31 29 28 22 28
29 31 30 27 14 15 8 8 8 8 8 13 23 30 30 33 33 33 41 41 47 53 53 53 50 53 57 57 37 37 40 40 40 40 50 57 50 37 37 36 36 36 42 48 50 50 42 47 47 50
48 48 57 57 57 57 57 57 68 50 50 50 50 47 50 42 42 35 35 35 37 42 57 57 57 57 57 50 50 47 47 47 57 57 57 57 48 48 47 57 57 68 68 68 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 50 50 50 35 35 35 43 43 43 43 52 57 57 57 57 57 57 57 50 50 50 50 50 57 47 47 50 57 57 57 47 47 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 59 52 52 52 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 52 52 57 57 59 59 59 50 50 52 52 52 57 57
57 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 50 48 47 50 50 44 42 43 35 42 42 42 42 41 42 42 47 47 54 54 57 57 57 47 47 47 47 47 57 48 57 57 57
57 59 57 44 43 43 43 57 46 54 48 46 54 47 42 37 28 23 23 23 28 23 23 28 28 30 32 43 59 54 50 48 57 57 43 47 39 35 35 39 37 39 39 39 40 40 43 43 48 48
48 46 47 47 35 35 17 15 6 6 8 19 21 41 41 41 41 48 48 48 43 47 41 39 28 28 14 8 8 6 6 8 12 19 30 30 30 37 37 40 43 36 33 33 31 31 13 16 10 11
11 20 12 15 15 19 23 11 11 11 19 28 37 37 41 41 37 39 37 39 36 31 31 24 19 16 13 13 15 15 15 18 15 15 12 21 21 21 21 13 13 21 13 19 11 12 11 11 11 11
18 15 11 12 12 18 16 12 9 9 9 12 11 12 11 11 11 11 14 10 10 10 10 20 20 12 11 11 17 10 16 11 12 18 11 10 11 12 12 11 10 13 10 13 13 12 11 11 11 11
17 13 9 9 9 9 10 24 28 32 39 19 19 8 8 8 8 8 12 9 8 8 8 8 8 10 12 10 10 10 10 10 13 27 30 28 24 21 18 13 12 9 9 8 13 8 8 8 8 8
8 10 12 21 16 12 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 19 17 10 9 8 8 8 8 11 10 9 8 8 8 8 10 8 9 11 11 13 16 16 16 11 9 8
8 8 10 8 11 9 13 13 10 9 9 8 8 11 6 6 8 6 6 8 8 8 8 8 8 6 7 10 15 10 10 8 8 8 9 10 9 19 14 11 10 10 15 13 13 16 10 10 10 11
11 19 20 19 8 8 8 8 8 8 10 13 8 8 8 13 12 9 7 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 9 10 9 11 10 10 10 9 10 10 10 10 8 8
9 9 10 8 6 6 8 6 10 10 10 10 | Open.Hide. 9 9 11 9 8 8 8 15 15 18 10 10 10 19 18 24 24 30 41 41 25 23 21 19 19 32 44 47 33 27 10 9 9 10 10 9 13 11 16 14 18 19 19 22 29 29 36 36 36 38
50 50 50 50 50 53 53 53 42 37 37 20 22 10 13 13 11 11 23 26 48 50 48 48 48 48 43 50 57 57 57 57 50 50 43 47 40 46 57 68 57 57 57 47 47 47 47 47 47 57
44 43 43 43 57 57 57 57 57 54 54 54 57 50 42 42 38 38 38 42 50 50 50 50 50 50 68 57 57 57 50 50 50 50 50 50 50 50 50 54 50 46 46 46 46 46 50 50 50 50
50 50 54 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 62 68 62 62 62 62 62 62 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 44 43 35 35 43 43 43 43 43 35 35 35 43 43 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 44 43
31 31 43 44 62 62 62 62 62 62 62 62 62 59 59 52 52 52 52 57 57 57 59 59 57 57 52 52 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 52 57 43 47 32 32 17 32 32 43 43 52
52 52 52 52 52 52 52 57 57 59 57 52 52 59 59 59 59 54 54 54 57 57 57 57 52 52 43 59 43 52 52 59 59 68 57 57 57 54 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 48
48 50 59 59 57 57 57 57 43 43 43 42 39 35 42 42 57 57 57 57 59 59 57 44 42 42 37 42 42 46 46 48 48 48 46 41 39 39 42 42 32 39 39 46 47 47 42 39 33 33
43 28 28 33 33 36 43 43 37 42 32 39 39 39 39 39 39 39 43 47 46 48 48 48 43 39 32 28 23 28 28 37 34 25 22 11 11 11 21 25 39 40 39 39 40 40 40 43 43 43
59 39 39 35 36 39 39 39 39 37 37 35 25 25 12 12 12 25 25 32 32 41 41 39 39 30 30 25 25 22 24 28 37 37 39 35 35 39 34 37 35 39 39 37 37 43 48 47 47 35
35 32 37 28 28 23 25 24 34 28 25 18 18 19 24 24 33 33 34 29 24 24 18 13 13 22 22 28 24 24 24 21 21 12 12 12 23 20 20 20 20 20 30 24 30 29 30 30 30 25
28 34 37 29 23 22 11 11 18 22 19 28 11 15 10 9 9 13 19 13 13 18 17 13 11 9 9 9 13 16 15 13 10 9 12 9 10 13 22 20 11 11 11 20 30 47 32 32 20 24
17 23 10 10 10 13 15 28 37 34 30 28 24 19 17 20 26 22 26 26 |