BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-106N12.T7 (MSMg01no106_n12.b1) | MSMg01-106N12.TJ (MSMg01no106_n12.g1) |
ACC | AG320819 | AG320820 |
length | 1,286 | 1,277 |
length of high quality (start - end) | 336 (133 - 468) | 272 (135 - 406) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no106_n12.b1 PHD_FILE: MSMg01no106_n12.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:07:51 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no106_n12.g1 PHD_FILE: MSMg01no106_n12.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:07:51 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | plural | no hit data |
---|
sequence | NCCCAATCATTTTNNATACACTGCGCGCTATAGACTACTAAGGGAGAGGA
TCCGCGGAATTCTGAGTGTTAAATCCAACCTATAAACTGCTTATAATTTA
CAATGTTGGTTATCTCTGCCTTTAAAATTTATATATTTAGCACATAAATG
TATTTCAACATCTTTTAATTATTCTTTCTTTCCTTCACAATTTGTGTGCC
CTCTCTATTGTAACGTATGTCACACTCAACACATTAGAATGACTCTTTAA
TCAACAGTAAAACAAGGAACCTACTAAAGATAAATTTGTTCTCCTAAAGT
CACTGTAATTTTATTATCAGAGAAGCAATCCTTTCCTATTGAAAAAGTTA
ATTGAAATTTAGGAACCATTAGAAAATGTTAAGTCTTGAAATGTTTCTTC
AGAGAGTATGTTTTTTTTCAAAATTGCAATTATGCTACACATTTGCCTGC
GTCATCCTACAATCTTCTCTGGCAAATTAGTTTTCTTAAAGTTGTTAATT
AACAATGGTGCTTGAAATTGTCTTAATGGCATTGTTGAGTGTTGTTTTCA
ATTATAATAGTACAGTGGAAAGATCTATTGCTTCATAAGACTCATGTGCA
ACCTTCCATCACGCTGTTTATTATGACAGTGCTAAAAGTCTCAAGTTAGA
ATGTAAATTCCATTGTACCATCAAAATTTGCCTTTCAATTTTTTTCTTCA
CCAGTTACTGAGAGAACATCATAGCCTTTGTCTATGGTTACTTCTTCTGT
TTTATTTATGTGAACTACGGTAGGGAAATGGAATATGAATTATTATTCTA
CGAAATAATCTTCAAACAATTATGTTGAAAACAATAATTTCATATAAACC
TCCTAAGTTTAATCTAATAATTTGGTATTTAATTTTATTAAAACTAAACA
TTTCCTTAACATTCCTTTTGCATTTCTTTCCCTATGTATGGTCATTTTAT
AAACTAATATGCTTTTCAGGGAAAAAAAATTAATTTTTCTATTATGGTGC
CTGCTTCAAAATTTTCTCCTAATAATGGTTTTTAAAAATGGCCCTTTTCC
CTATAATATCACATAATGTCATAATTTTTTTGGTGCCCCTGGGAATTTAT
TATAACCCATGTTTGTCTTATTTAAATCGTTACTTATATTTAACTAGTAA
ACATATTATCTTATCTATACCTCGGTTGTTATATTTTTCTGCTATTTCGT
TCTTACATCTTATACTTTATATTACTTATTTNTACAATACTACTTTATGG
TATATATACACATATAATGATCCTTTTTACATCGTT
| CATTTCATTNTTATTCATGTGAGCCGTGGGCGCCGGTXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCCTCTTAAGGGCCCCCACATGGTC
CTGTGCTTTCTTTTTGGCCCCTAGACTTTTAATAACTGCTTTTATTTAAG
TAAGGGTTATGGACTCTTTAGATGGTTTATCTAGTCCTGATTTAACTTTG
GTATCAAAAAGTTATTCATTTCATCCTGATTTTCCAGTTTTGCTAAGTAT
AGTCTTTTATATTAGGATATGTTGACTTTTTAAATTCCTTTGGTTTTTGA
TGTTATATCTCCTTTTTCATTCTTATTTTGTTAATTTGGATACTGTCTTC
ATGCCTTCTGGTTAGTCTGGCTAAGGATTTATCTATCTTGTTGATTTTCT
CAAAGTATTTTCTCCTCCTAGCCTTGGTGATGTCTTGTATAGTTCATTTT
GTTTCTCCGTGGTTGATTTCAGCTCTGATGTTGATTCTTTCCTGCCCTCT
AAGCTTCCTAGGTACATTTGCTCCTTTTTGTTCTAGAGTTTTCAGATGTG
CTGTCTAGCTGCTAGTGTATCCTCTCTATAGTTTTCTTTTTGTACTCACT
CAGATCTACGAGTTTTCCTCTTTATCACCTGCTTTCATTCTGCCCTATTT
TTTTGATTATCTTTGCGCCTCCCTTTTCATTATTTTCTAAAACAGTCTTT
AATCTCTCTTCCATTTTTCTTCCTCACCTATCTTTCTTTACTTTCACTTT
ATTTCTTTTTCCTTGTTTCTTTTGGCTTCTCCATCGATTTCCTTTTTTTT
TTTCTGTTGCATTTTACTTTATATCCACCCTTTATCTATTGTTTTTTCTT
TATGTATTTCTTGTTACTTTTTTTTTATTTTTTTTTCCTCTCGTCGTTTT
CTCCCTTTTCTTAACTTTTTTACTCTTTTCTTTTTTTCTTTTATTACCTT
TCTTTGTTCTTCACTCTCACCTTTCTTTTCTCTTTCTTCATTTTCTCCCT
CTTTCCTCTTACTTATTTCTTTTATAATCCCTATTTACCATCCTTACCTT
CTTTGATTTCTTCCTCTCTCTTCCCTTCTTTATTTTCTTGCTCTTTCTCC
CTATATTCTATCCTTCTTTCTCACATCTCGCGTACTTTTCCACACTTTTC
CCATATTTATTCTCTCTACCTTGTTTTTATCCTCACTATTCTCCTCTCTT
CTCTTACTATTCTTTCCTTTCATTCCCTTGTCAGAATATCCAATTATTAT
TCTATATACCTCTGTCTATTCCTTATC
|
quality values | Open.Hide. 0 3 6 6 8 8 9 9 8 8 10 8 3 0 0 3 9 9 7 6 6 6 6 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 12 9 9 8 8 8 8 8 15 21 28 17 21 18 22 22 22
29 32 39 40 37 37 37 37 34 34 42 37 35 35 35 35 35 35 30 31 31 33 33 42 30 28 10 10 10 12 9 9 9 10 10 9 9 9 8 8 8 8 8 13 25 33 33 33 33 41
36 36 36 36 38 36 36 36 35 31 31 31 30 28 25 24 15 17 11 12 12 14 12 18 20 18 18 19 19 19 19 17 18 21 30 32 42 47 48 48 48 59 57 57 57 57 57 57 50 50
50 68 68 68 68 68 68 50 68 54 54 54 57 47 50 50 68 68 68 50 50 50 50 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 44 38 28 36 27 24 32 38 48 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 57 57 57 57 59 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 44 44 27 27 32 44 50 57 57 57 57 57 50 57 57 57 57
57 57 57 57 57 43 39 39 43 57 57 57 52 52 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 52 52 57 57 57 57 52 52 52 59 59 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 52
52 52 52 52 52 52 54 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 50 43 44 44 47 50 57 48 48 50 57 59 59 59 59 57 57 57 57 48 46 47 43 42 42 42 42 47 47 54 48 57 48
48 54 57 57 57 57 57 57 57 44 39 30 30 42 44 48 54 57 44 44 30 30 30 42 43 48 54 54 54 54 57 54 54 59 59 57 57 59 57 57 57 43 43 43 47 57 57 57 57 57
48 48 48 48 37 39 23 17 10 10 10 11 11 19 19 21 25 27 47 47 48 48 48 48 57 48 48 47 59 43 43 48 59 59 59 59 47 46 46 46 46 57 57 57 48 48 43 46 39 39
32 36 36 46 59 59 57 57 47 47 30 30 14 13 12 12 12 12 23 15 8 8 8 8 10 15 16 19 28 28 43 40 39 43 43 43 47 43 48 48 43 43 48 48 46 34 34 19 18 11
11 11 11 13 18 16 18 12 18 18 34 34 46 43 43 43 37 33 37 37 43 39 43 39 43 33 39 30 32 39 39 39 39 39 39 37 37 30 30 30 30 30 37 44 47 47 47 46 43 37
37 33 40 25 28 21 32 29 20 20 24 28 31 30 30 18 17 17 22 32 36 43 43 37 37 37 57 44 44 32 33 33 42 42 46 34 34 14 14 14 19 19 27 24 28 40 40 39 30 32
28 28 28 37 30 36 36 36 31 37 30 33 28 28 30 37 37 43 46 42 32 28 20 20 20 28 25 25 22 22 22 22 25 33 25 25 29 26 14 18 15 12 9 10 10 22 19 15 11 11
15 15 12 13 13 25 30 28 31 32 36 23 19 11 10 10 15 13 22 32 36 34 19 19 14 14 16 22 28 32 32 33 30 31 33 33 33 28 28 28 33 29 29 31 21 22 13 15 12 14
18 15 12 9 9 9 13 23 23 24 11 11 11 16 17 28 18 19 24 16 14 14 10 9 9 11 15 17 22 25 15 14 8 8 8 11 11 13 15 19 19 17 17 17 18 17 16 13 13 21
16 12 13 8 8 8 17 19 20 17 13 10 8 8 10 13 11 10 10 10 10 11 11 11 11 11 13 10 9 9 9 12 18 15 22 13 12 8 11 8 8 8 8 10 11 11 10 9 8 8
8 8 8 8 10 10 10 10 8 8 8 13 9 9 9 9 9 9 10 8 9 9 12 15 18 10 10 8 8 8 8 8 9 10 10 9 12 12 14 14 15 11 8 8 8 11 8 10 10 10
10 10 16 20 14 9 10 9 9 9 10 10 10 10 10 8 8 8 8 6 7 8 6 10 8 11 9 9 12 12 12 14 10 10 10 16 12 9 9 12 12 10 9 9 9 8 8 8 10 10
8 12 15 8 10 8 13 12 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 12 12 11 11 15 12 10 13 13 10 12 13 9 9 6 6 6 6 8 6 8 8 8 8 12 19 22 16 14 14
19 17 8 8 8 8 10 8 8 8 13 9 11 11 11 9 9 10 10 10 10 10 10 10 10 12 10 10 10 10 10 13 11 11 11 11 12 13 8 8 6 6 8 8 8 9 13 10 9 9
8 8 8 8 8 9 11 11 11 12 12 11 11 11 11 11 11 11 11 11 9 9 8 8 10 11 8 8 9 12 13 11 8 8 8 9 9 9 9 10 11 9 10 10 10 11 8 8 8 8
8 8 8 10 12 10 7 6 8 6 10 8 8 6 6 8 10 8 8 8 8 10 8 11 11 16 12 14 10 11 10 8 8 8 8 9 12 10 11 11 11 11 8 8 8 8 13 6 6 8
8 8 10 10 10 8 8 6 6 8 10 8 9 8 7 8 7 8 8 8 11 11 10 10 8 8 6 6 6 6 8 6 7 10 12 7 6 10 8 11 16 12 9 9 7 7 8 8 15 16
11 10 8 8 12 10 11 16 16 15 12 8 8 10 8 8 8 9 11 11 11 9 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 7 7 8 8 9 10 9 8
8 8 8 6 6 8 6 6 6 8 8 8 6 8 8 8 8 7 9 9 12 13 8 8 8 10 8 10 10 16 3 0 3 8 8 8 8 10 8 8 6 6 6 7 8 8 8 6 6 6
8 8 8 11 10 8 8 6 6 6 6 6 6 10 10 13 13 8 8 6 6 8 8 8 8 13 13 8 8 8 8 8 8 9 9 9 | Open.Hide. 8 8 8 8 8 6 6 6 3 0 3 14 8 9 9 7 6 6 7 6 8 8 15 6 6 6 6 6 7 8 12 15 8 8 8 8 8 13 15 7 9 9 14 14 13 10 15 15 10 12
14 21 23 28 28 28 28 33 26 21 18 19 28 37 36 33 33 33 33 33 37 23 23 9 9 10 12 11 10 8 8 8 10 10 10 10 10 10 10 16 17 15 26 24 31 28 28 24 24 24
28 26 26 35 35 35 35 35 31 31 31 28 31 37 20 19 10 8 7 8 10 10 10 10 10 22 18 19 16 13 10 10 10 20 19 21 28 31 34 44 42 42 47 47 47 47 42 36 36 36
42 43 42 42 43 33 33 32 33 37 44 44 47 48 48 48 43 42 42 42 30 30 42 44 44 37 37 37 37 47 42 38 37 37 37 37 57 46 46 57 37 32 32 25 32 37 44 44 39 37
37 39 43 50 37 37 37 37 43 43 38 38 20 20 38 41 43 52 52 57 57 52 43 43 43 43 52 57 57 59 57 57 43 43 33 33 43 43 57 57 59 52 43 38 38 23 43 43 44 44
32 32 20 27 27 43 44 57 57 52 52 43 43 33 33 33 43 43 39 39 43 43 39 39 43 43 52 57 57 43 57 43 52 43 43 44 43 52 52 44 44 52 52 52 52 57 57 57 57 52
52 52 43 43 43 43 43 37 43 43 52 52 54 59 59 50 50 37 43 44 50 50 54 54 57 54 57 50 47 43 43 36 30 41 19 19 13 14 14 14 30 30 44 36 33 28 28 32 44 30
35 35 47 59 44 47 43 37 39 36 36 20 23 20 31 28 32 24 25 15 18 12 24 18 29 25 37 34 43 43 33 33 37 30 36 42 42 43 40 40 39 39 39 39 43 43 47 48 48 47
47 47 37 24 25 12 15 15 18 12 10 10 12 22 23 32 32 30 23 16 10 10 12 23 22 15 15 14 21 21 23 14 8 8 8 13 13 20 20 21 21 28 22 22 24 37 39 48 43 42
30 23 15 13 21 19 19 14 18 12 12 12 12 24 22 22 17 11 11 9 11 11 18 22 16 16 8 8 6 6 8 8 17 12 14 9 9 10 19 24 30 28 32 18 15 10 10 10 16 17
22 15 17 15 15 22 21 20 23 12 12 10 10 10 11 12 12 25 19 23 14 12 13 12 12 23 27 34 39 37 33 23 19 18 11 11 12 18 23 24 29 19 19 11 11 11 21 18 15 12
12 12 10 13 9 9 8 8 11 13 13 12 16 11 11 11 12 16 22 14 15 15 19 17 11 11 11 13 9 9 10 14 18 17 18 16 30 37 33 22 20 14 12 10 10 10 10 10 10 12
13 11 10 9 10 13 10 9 9 8 8 9 8 14 13 14 14 14 12 24 23 23 19 13 11 11 9 9 15 19 17 19 12 11 11 10 11 12 20 18 15 14 14 14 8 8 7 6 8 8
8 9 13 8 8 8 8 8 8 8 11 11 11 9 9 9 9 10 12 8 8 8 8 10 10 10 10 11 12 12 13 10 10 10 10 10 13 15 15 10 10 10 17 8 8 8 10 10 13 10
9 10 10 8 14 9 9 8 8 7 6 6 6 7 11 15 19 10 10 9 9 10 8 10 8 8 10 6 6 8 8 10 11 11 11 11 11 12 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 10 8
9 9 10 9 9 8 8 10 12 8 9 11 10 9 9 8 10 10 11 12 12 10 7 6 8 8 10 8 9 9 8 8 10 8 8 8 10 10 10 10 10 10 13 17 19 10 12 8 10 8
8 10 10 9 9 10 8 8 6 6 8 8 12 12 12 12 12 19 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 12 9 9 9 10 10 10 10 10 9 9 9 10 10 10 12 7 6 8
8 8 8 8 8 9 8 10 11 10 13 19 12 10 8 8 8 8 8 8 8 12 8 8 8 8 9 8 10 8 8 8 12 12 11 16 19 21 13 8 8 6 6 8 8 8 8 12 8 8
6 7 10 10 8 8 8 13 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 8 6 6 8 8 9 9 8 8 8 8 8 10 12 12 14 12 14 14 14 10 10 8 8 8 8 10 10 10 9 9
10 10 10 9 10 10 8 8 6 6 8 8 10 10 13 10 8 6 6 8 8 8 8 8 6 6 11 8 8 6 6 8 8 10 8 8 8 8 10 8 8 10 8 8 8 9 10 11 9 9
10 9 9 9 9 9 10 9 8 8 8 6 6 8 8 9 12 8 6 6 10 8 8 6 6 8 8 10 10 8 8 8 6 6 8 8 6 7 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 8 10
19 8 8 7 9 9 9 10 8 8 8 7 7 8 10 10 10 8 8 6 6 8 8 10 10 13 11 8 8 8 9 10 10 15 12 10 10 10 9 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8
8 8 8 8 6 6 7 7 9 7 8 8 6 6 8 8 12 15 12 12 11 8 8 8 8 8 8 8 8 10 6 6 6 6 8 8 10 10 10 8 8 7 9 9 9 9 8 8 8 8
8 8 9 10 10 10 10 9 8 8 8 15 13 9 8 8 8 8 8 8 12 10 9 9 10 10 8 8 8 8 8 6 6 8 6 6 8 8 8 10 9 7 8 8 8 8 8 8 22 15
11 11 8 8 8 8 8 8 8 6 6 7 6 8 8 12 10 10 10 6 8 6 6 7 7 12 10 12 8 9 9 9 8 8 8 8 8 8 6 7 6 6 8 8 10 10 8 8 8 8
6 6 8 8 6 6 6 6 6 6 8 7 8 8 8 8 8 11 12 9 9 9 10 8 8 8 6 |