BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-123F04.T7 (MSMg01no123_f04.b1) | MSMg01-123F04.TJ (MSMg01no123_f04.g1) |
ACC | AG332954 | AG332955 |
length | 1,803 | 1,275 |
length of high quality (start - end) | --- | 132 (271 - 402) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no123_f04.b1 PHD_FILE: MSMg01no123_f04.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:32:54 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no123_f04.g1 PHD_FILE: MSMg01no123_f04.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:32:54 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | NATATTCCTCCNNNNNNGGGTTAATTGTGCCCGCGCATATCACNTCACGT
GATAGTGGAGAGAGATCCCGCGCGCAATTCTCTTGGTATCTTAGATAGCC
CTGACCTTTCTAGCTTCCACTTNTACTAATATGCTACCACTTATTATTAC
TGCTACTCCTCTTCTACAAGCCTGCCCCGGATTAGTCTTGGGCTCGCCTT
TCCACGCCTTCCTGACTCTATTTTTTATACACCTGGCTGACCTATGACTC
ATCCCCCGTCACCATGTCGCTCCCTCGCCTTCACCTATTGCGAGAACCCA
TTATTGCGGTATAGTTCCTCCCGGACGACCAACTAGACTTGGCTGCCCCC
CCCCATTCATTCTGTTCCAACTTTTCTTGACCACCCCTTTCCAATTCGAT
TTACCCCAGTCGCCCCCAACCACCTTCGCAATCCCCGTTCCCACTCGCCA
GAACCTGCTCCTCTTTTCTCCCATACCCTCCCCCTTGCCCACCTCTCGCC
CCTCCTGAGACCCCGATCCCTTTTTTTATTTCTGCACCCGCCTCTGACCC
ATCTCACTCCCCCACGCCACTGGCTTCACGACCTCCGTATTTTTTGTCTT
TCTCCCCCCCCACACCACACCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCAAAAAA
AAAAAGGGGGGGGTGTCTCCTCATTCCCCACCTCCCTCGCTACCCACCCT
GCCTCCCTCTCACCCCCCCTCGTCCCTCCCCCTCTCCTTTCCCACTACCC
CGCTCTCCCCTCGCCCTTCCTCCCCGTACTCCTCTCCCACCCTTTCCCCC
CCTCGCGTCCTTCCCTCCTCCCTCCCCTCTTCCCACCCTCTCCCCCCCTC
CCCCACCCCCCTCCCCCCCCGTCCATCCCCCTCCCTCACCCTCCTCCTTC
CCCCCCTCTCCACCTCTCTCTCCCTCCCGTCCTGCCATCCTCCCCCCTCT
TCCCCCTCACCCCCCCTCCTCCCTCCTCTATCTCCCCCTACGCTCACCTT
TCTCACCCCTCCCTCCTCCTCCCTCCTTTCTCCTCCACTCTCCCCCTCCC
CTCTCCTCTCCTACTCTCCTTCTTCACTCCTCCTCCCCTCCCCCTCACCT
CTTTCTCTCTCCTCTTCCTTCCTACTCTTACCCACTTCCTTCCCTCCCCC
CTCTATCCCCCTCTCTACTCCCTACCTCTTCTATCTCACTCCCCTCCCTC
CCTTCCCCTTCTCCCCTCTCCCCTCTCCTCTCTCCCCCTCCCTACCCCCA
CTCCCTCCCCTCTCCCCTCTCCACCCTCACCCCCTCCTCCCTCCTCCTTC
CTCTCCTCCCCCTCCCCCTCCTCCACTTTCTCACTTTTTAACTCTCCCCT
CACTCCTACCTCCTTGTCCCCCCTCCTCTTTCCCTCTTCCCGCTCCCCCT
CCCACTCCTTCTCATCTCCCCTTTCCTCATCATCCCTCCCCTCCTCTCTC
CTCCTCTCCACATCCTCCCTCCTCCTCCCCTCTCCCCTCTCCCTCCCCTN
CCTACCCCTCCCNCCTCCTCTCATTCCCTCACCATCCTCCCTTCCTCCTT
CCTCCCCTCTCCTCTTCTCCTCTCTCCTCTCCTTCTCCATCCCCCTCATT
CACTCTCCCCTTCTTCTCCCCTCTCTCGTCACTCCCCATCCACTCCCGTC
CTCCACTCCTCCCTCCCTCCCTCTCTCGTACTCTCCCCTCGCCGCCCTCG
ATCACACCTCCTCCTCTCCCCTATCTTCTTGCACCTCNCTCCCTGCTTCC
CAACCTCCGCGCTCACCGACTCCACTTCTCTCTCTCCTCACTCTTCTCCA
CTA
| TCCCCTCTATGACCGAGCTGGGGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXCCCTTAAAACCCCAAAAGGGGAGAAANAGNTTA
GCTTTGCCCCTTTAAATCCCCTTCTTTGTATCCTGGTCCATTAAGACCCA
AGCAAGCTGCTACCTAATGAACTTGTCACATATAATGGGCAATATCCTCT
CAACACTGAGACAAAAAATAAAAAAAAAAAGCAAAAATAACCTACCAACC
CAATAAACAAATAAAAACCAAAAGCTTCTTTAATTTGTTCCTTGACAGGA
TTTTATTTATTTTTATTACCACAGCAAGGAGTAAAGTCACTCAGGTGTAC
TGTAAGTTTGGCAGGTAATATCAAGCAAGTGAACCCATTATACTCTGGGA
AAATGTTACATTTTATTGCCAGAATACAATACCGTGCTTATGCATGTTAC
ATATATAGAAATACACATACTGATAGTGAAAAATAAAATAAGAATATTCA
AAATACATGCCACCTTTGTCCTTTCAGTAAAATAGCGAGAATTTTCTCTT
TCCTATATAGTAAGATAACTGTCCATCATAGAGTCTCCAAGGTCATGTAC
ATAGCATAATACAACAATATATAATAAGTACCCATGTGTTTTGTTTTCTA
CTCCAACAAGCCATTACCTATCCTATAATAAAATATATCTGATGGACAAT
GTACGATTTCTCTCTTCCCCCGCACACTAGTGGCTAAATAAAAAGCTAAC
TTCCCCAAGGAATTTGAAAGTCAAGGATAAATTCCACTATGAAAAGTAAA
AATGCTTCTCCAGGTCTCCCTTTCTACTGTCCCTTCAAAATGAATTTTGC
TCCCGGCACAAACATGTCCTTTAAACCATGCCCTGATTCCAAAAAACTCA
TTAAAACCCCCACTTAGGATTATAATCTGATCCTGCCGCTTTACCCTAAA
ATAGCCCCCTCTAAACTCCCCAACTTGTTTTGGTGCCCTAAAGCCTACGG
TCCCCCTTATTTTTGGTAAACCCCTTTCGGGAAACAACTTATCTCAGCAC
TTTTTCTTGTCTTGTCCCTCTTTTTGCTCTCAAATTCTCCCCTTGACACC
CCCACATTTCTCTGCTGGAAACTCCTTCCCGGGAAAAAATACACCCCTTG
TTTGTTTTAGATTAAAACTTGTTTCTTGGCAAGAATAAACACCGCTTGCG
GGCCTCTTCTTTCATACCTTATCTCCCCTCAATGGGCCGGTTTCCTATCT
CACAACAATAACTTCTTTATCGTCC
|
quality values | Open.Hide. 0 3 6 8 8 8 9 9 9 10 3 0 0 0 0 0 0 3 9 12 12 9 9 8 8 8 8 6 6 8 8 7 7 6 6 8 8 8 8 6 8 6 3 0 3 13 13 9 6 6
6 6 13 13 8 8 8 17 19 19 17 8 8 8 17 13 8 8 8 8 8 8 11 11 11 11 18 18 22 22 17 17 13 8 9 8 7 8 6 8 8 10 6 6 6 12 10 15 12 10
8 8 8 8 9 9 10 16 10 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 3 0 3 10 10 10 13 6 6 6 8 8 8 8 10 11 15 8 6 6 6 6 10 10 15 15 11 8 8
8 6 8 8 8 8 8 8 10 9 9 7 6 6 6 6 6 6 10 10 12 6 6 6 6 10 10 15 10 10 10 8 6 8 8 13 20 12 8 8 8 8 8 8 8 8 13 17 19 22
12 19 11 10 6 6 8 8 11 18 22 19 15 10 6 6 8 6 8 10 11 9 10 8 13 8 8 6 6 8 6 6 6 6 10 8 10 13 8 8 8 8 11 9 9 10 8 8 6 6
10 8 10 10 10 10 8 8 8 10 15 16 17 15 9 9 9 8 8 8 9 13 13 9 9 9 8 21 8 8 6 6 6 8 10 13 14 13 12 9 9 10 10 9 9 12 12 14 9 7
10 8 6 8 14 10 10 10 8 8 12 8 8 6 6 7 7 9 9 9 9 9 14 10 8 7 7 8 8 9 8 8 6 6 8 6 8 8 8 9 9 9 8 8 6 7 8 8 11 11
11 8 8 6 6 8 6 7 8 8 10 10 13 8 8 8 8 8 8 8 17 8 8 8 16 8 8 6 7 10 10 10 9 7 10 8 6 6 10 13 16 14 19 8 8 6 6 8 8 9
9 9 9 9 8 10 10 8 8 10 9 8 10 10 12 12 8 8 6 6 8 8 9 17 8 8 6 6 8 8 10 11 11 8 6 8 6 6 8 8 15 10 8 8 10 10 7 7 8 8
12 12 8 8 8 6 8 8 10 8 7 10 7 6 8 8 10 10 10 8 8 7 6 10 10 10 8 11 6 6 8 8 15 8 8 6 6 8 10 11 10 8 9 8 10 7 9 10 10 10
12 17 17 15 8 9 10 10 10 10 10 9 9 9 9 10 9 9 9 10 18 15 14 12 13 13 9 9 9 9 8 8 10 6 6 6 6 8 8 8 8 6 6 6 6 8 10 10 8 6
6 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 10 10 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 8 6 6 6 6 7 8 8 9 10 10 9 9 13 11 13 16 15 16 13 3 3 3 10 6 7
7 7 7 8 13 15 19 19 21 11 8 8 8 10 8 8 8 8 7 7 9 12 17 17 17 18 16 19 21 20 30 16 15 13 13 19 19 37 39 37 30 24 16 13 13 13 13 15 18 22
32 18 8 8 8 8 8 8 11 13 10 9 10 10 10 16 10 10 10 8 8 12 13 13 10 8 8 8 12 8 8 8 6 8 8 10 7 7 10 8 11 11 11 11 9 9 6 10 7 7
8 10 10 8 6 6 6 6 8 8 6 6 6 8 8 16 19 11 8 8 6 8 8 8 8 8 9 9 9 9 11 16 13 12 9 9 9 9 9 14 15 12 8 8 6 6 6 6 8 8
11 8 8 8 8 8 8 13 8 8 6 6 6 6 13 7 7 7 6 8 6 6 8 10 10 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 7 6 6 6 8 10 7 7 10 10 8 8 8 10 10
24 13 10 9 8 8 6 6 10 8 8 8 8 10 9 12 12 14 13 17 19 11 11 11 12 11 6 10 7 6 6 6 18 9 9 6 8 6 6 8 8 9 10 10 14 16 10 8 7 7
8 8 8 8 10 11 11 11 11 7 11 9 9 10 8 10 10 10 17 8 8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 9 10 8 6 6 8 8 10 12 15 10 13 8 8 6 6 6 6
15 13 13 23 14 12 12 17 10 8 8 8 8 8 8 6 7 6 6 8 8 10 8 10 14 7 7 9 9 9 12 8 8 8 8 8 8 11 10 18 22 19 16 10 11 8 7 8 8 10
11 15 15 11 9 7 7 8 6 6 7 11 24 11 8 8 8 8 8 8 10 10 15 10 10 9 8 10 9 12 10 8 8 8 8 9 15 20 10 10 9 6 6 6 6 6 8 6 7 8
8 8 10 8 8 8 9 10 10 10 10 15 9 9 8 15 10 8 8 10 11 19 14 12 9 9 9 9 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 12 8 8 11 22 19 24 18 18 18
8 8 8 8 12 10 6 6 8 8 8 8 6 6 8 8 9 8 8 6 6 6 7 10 11 6 6 6 9 11 8 8 8 10 15 13 12 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10
12 9 6 6 6 6 11 6 8 8 8 8 8 8 8 8 13 9 9 6 11 6 6 6 6 6 6 10 8 13 8 8 8 8 7 7 8 8 8 8 7 6 10 7 7 8 8 13 8 8
9 7 8 8 8 10 10 8 8 8 8 12 8 8 8 6 6 6 7 10 10 10 9 9 6 8 6 6 8 6 11 10 10 8 10 9 8 12 12 9 9 12 13 14 16 12 15 6 6 6
10 8 8 10 8 10 12 11 10 8 8 6 6 10 10 9 9 10 10 20 13 13 13 14 14 14 12 12 9 9 9 9 8 8 12 9 10 16 15 10 10 10 8 8 9 14 13 10 8 8
8 8 11 10 10 9 9 11 11 11 11 10 11 11 18 17 8 8 6 6 8 6 9 9 10 10 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 7 7 12 12 10 15 10 9 9 12 15 16 12 10
11 6 8 6 6 8 8 11 15 12 12 8 8 8 8 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 11 9 8 7 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 11 11 17 17 13 8
8 8 8 7 7 7 11 8 8 10 9 8 7 7 8 8 6 8 8 12 12 12 15 13 13 7 6 8 12 10 8 8 12 7 9 8 8 12 10 15 9 6 6 6 6 11 15 10 9 12
9 7 6 6 7 10 10 11 10 8 8 6 6 6 10 8 9 10 15 9 9 9 9 9 12 10 10 9 6 11 6 6 6 10 15 10 10 10 10 10 11 10 8 10 9 8 8 8 8 8
6 8 8 8 13 15 15 11 10 9 9 9 8 11 7 9 8 13 9 10 9 8 8 8 8 8 9 8 8 6 8 10 10 14 13 13 8 8 8 8 8 8 10 13 13 17 15 13 3 0
3 8 8 8 8 8 8 8 8 9 11 3 0 3 6 6 6 8 15 8 8 8 8 8 8 10 13 6 6 6 7 6 6 7 8 10 10 10 10 11 8 8 7 7 6 6 8 8 8 8
8 11 13 10 10 11 8 8 6 6 8 10 10 9 7 12 6 9 8 13 10 8 8 8 8 11 8 8 8 8 8 10 18 16 14 12 6 11 7 6 8 7 14 21 15 13 8 8 8 8
8 8 6 7 13 15 15 15 13 8 8 8 8 8 8 6 8 8 8 8 8 10 9 9 11 8 8 6 6 6 6 10 10 17 17 6 6 6 6 8 6 6 6 6 8 8 6 6 6 8
6 9 8 8 6 6 6 11 10 6 6 8 6 9 8 8 7 6 10 10 19 10 8 10 10 9 9 10 6 10 6 9 9 9 12 14 14 10 10 8 9 10 9 9 6 10 6 6 6 6
9 10 10 10 10 10 10 12 10 8 9 13 13 8 10 19 22 13 9 9 9 9 12 12 19 9 9 9 10 9 9 11 10 8 8 8 3 0 3 10 8 8 8 6 6 6 6 6 6 10
6 6 6 6 8 8 10 9 9 6 6 6 6 8 6 6 8 8 6 8 11 13 8 8 8 8 10 10 9 8 8 8 8 8 11 19 17 15 10 9 7 14 7 9 9 9 11 11 14 11
8 6 6 | Open.Hide. 6 8 8 6 8 8 9 10 9 7 7 7 7 7 8 10 8 8 6 6 8 8 13 17 19 22 11 7 7 6 6 8 8 10 12 12 19 13 13 15 8 10 10 21 19 16 13 20 17 14
17 10 12 21 21 23 30 37 22 22 12 11 11 22 22 9 12 9 9 8 6 8 8 8 8 15 9 15 12 10 10 10 18 23 34 41 40 37 37 37 23 23 3 0 3 3 0 3 18 17
19 17 17 26 19 18 9 9 11 13 10 10 10 15 16 16 12 11 11 11 11 11 11 18 22 19 26 23 28 28 33 36 36 42 36 36 22 22 22 21 33 30 25 21 12 13 13 13 17 18
18 20 21 28 20 20 15 28 10 12 12 27 25 47 47 42 42 32 39 37 42 42 32 36 22 22 19 24 19 28 28 28 33 33 32 32 41 28 28 27 28 24 24 24 21 21 25 24 19 24
19 20 22 36 22 22 19 26 18 19 18 19 18 18 22 19 23 8 8 8 19 23 42 42 35 35 35 37 37 30 26 24 17 17 12 23 12 9 9 11 16 18 22 12 13 13 15 12 12 12
12 12 24 25 22 13 15 11 11 13 7 7 8 15 20 30 15 15 13 18 21 28 28 26 28 28 33 39 39 39 47 47 47 47 59 59 59 59 34 34 28 28 28 24 32 32 43 43 43 43
48 40 44 32 35 35 44 39 35 37 35 42 42 47 43 43 43 39 42 37 33 32 30 26 26 30 43 36 37 28 24 32 27 28 28 27 27 33 36 26 32 15 12 12 15 18 20 32 26 32
27 18 15 21 15 20 20 32 32 35 32 24 20 19 20 22 31 33 41 43 43 42 31 28 23 23 23 28 28 32 28 29 29 39 36 36 36 36 37 28 28 28 33 37 37 37 37 23 18 15
16 15 15 12 10 10 10 10 10 15 25 32 31 35 39 37 39 32 34 32 37 43 36 32 24 26 23 23 37 34 39 39 33 28 23 20 20 20 23 23 30 23 19 12 12 13 19 15 18 17
19 19 15 13 12 20 12 12 12 24 24 21 24 12 12 12 18 18 30 34 37 39 32 37 37 43 25 25 15 13 14 15 15 14 14 12 19 12 12 15 11 11 12 22 21 30 28 28 25 25
34 40 48 47 47 41 41 35 23 23 14 14 14 24 24 24 25 23 31 28 31 31 32 26 25 12 12 12 12 11 12 16 16 14 16 18 15 15 23 23 30 23 21 25 16 18 13 13 15 21
21 28 28 30 20 16 11 11 11 24 23 21 16 11 12 15 24 23 19 19 13 13 12 10 10 10 11 10 10 14 24 21 21 18 15 12 9 9 9 10 13 15 18 12 21 15 10 8 8 8
8 12 10 18 21 24 33 32 21 11 8 8 8 8 9 13 15 18 22 21 12 12 12 18 19 18 15 18 18 26 27 37 36 36 36 36 36 36 31 22 24 28 19 19 13 11 10 20 20 20
22 21 18 15 13 14 20 17 17 11 17 17 23 18 17 18 9 9 9 15 15 11 14 14 30 26 19 13 9 9 11 9 11 10 12 12 12 12 13 10 10 8 8 8 8 9 10 11 17 21
19 15 10 10 10 10 21 15 20 17 17 17 17 17 23 20 18 13 10 10 10 10 10 10 8 11 8 8 10 10 11 11 12 11 12 15 15 14 14 14 17 14 15 8 8 8 8 11 8 9
9 13 16 10 11 10 9 9 9 12 13 10 11 11 13 13 20 13 10 9 9 9 9 11 9 11 11 18 15 10 10 9 8 8 8 8 9 9 10 15 10 9 9 8 8 8 9 12 15 16
22 24 24 14 9 9 8 10 8 10 10 13 16 15 10 10 10 9 15 16 18 10 10 7 6 8 8 10 10 10 8 8 8 8 8 8 10 12 22 24 21 12 10 10 14 17 19 18 13 11
9 8 8 8 6 6 6 6 8 8 9 12 9 10 10 10 8 8 10 10 10 13 12 16 15 15 11 11 9 9 8 8 7 6 10 10 15 13 10 10 10 9 9 10 10 13 10 10 8 8
10 10 10 10 8 8 10 10 13 11 10 10 6 6 6 6 10 11 11 11 11 11 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 11 12 10 12 16 12 11 8 8 8 8 6 6 8 8 8
8 8 9 7 9 11 9 9 9 9 9 9 11 6 8 6 6 8 8 11 6 8 6 6 6 8 7 6 8 8 10 10 10 10 10 8 10 8 8 8 8 9 9 8 10 8 10 10 11 12
11 12 15 18 19 18 18 11 11 11 15 10 15 10 8 8 8 8 8 8 15 15 19 18 10 10 9 9 9 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 9 9 10 13
19 19 13 15 10 9 9 11 12 12 11 8 8 8 8 8 8 15 12 11 12 10 19 17 10 8 8 8 8 10 10 10 10 16 10 10 10 13 13 12 17 9 10 10 10 11 11 14 15 23
19 9 8 8 8 8 10 12 8 6 6 8 8 8 6 6 8 8 10 10 10 10 10 11 12 13 10 10 12 11 11 11 12 12 12 11 8 8 6 6 8 7 7 10 10 8 6 6 8 8
12 15 12 11 11 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 11 10 7 6 6 6 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 8 6 6 7
7 10 10 9 9 7 7 8 7 6 12 10 11 7 6 6 6 8 10 6 6 8 6 8 8 10 10 9 9 9 10 8 8 8 8 8 9 9 9 9 8 6 6 6 8 8 8 6 6 8
8 8 8 10 6 6 8 8 8 8 9 6 6 6 6 6 10 7 7 10 8 6 6 8 6 |