| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-124I19.T7 (MSMg01no124_i19.b1) | MSMg01-124I19.TJ (MSMg01no124_i19.g1) |
|---|
| ACC | AG333874 | AG333875 |
|---|
| length | 1,275 | 1,319 |
|---|
length of high quality
(start - end) | 569 (126 - 694) | 276 (125 - 400) |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no124_i19.b1 PHD_FILE: MSMg01no124_i19.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:35:48 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no124_i19.g1 PHD_FILE: MSMg01no124_i19.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:35:48 2005 |
|---|
| singlet/doublet | doublet | doublet |
|---|
| BLAST hit | unique | unique |
|---|
| Map location. | (110,470,934 - 110,471,502) | (110,297,009 - 110,297,284) |
|---|
| sequence | TTCTATTACATTGGGCGCTAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGAA
TTCTAAAAAAATGGAAATAACCCTATAGATTTCTGGAAGTATTTCACAGA
AAGCAGAATTGCCCCTTAAGTGCCCATATATCTCAGTACAAAGACCATGA
GCCTACCCATAAATATTTTTAAAATCATAATAAAAATAAAAAGAAGCATT
CTCTATAGACTGAAAATAAAACTAATTTAAAAGCACCATAAAATGGAGTG
AGCAAATGTAACTTTCCTACTGGCATAAATAGTATCCTCTACAACTTTGG
TGAAGTATTTTACTTCTGCTAAATTGAAATGAAATAGAAGTTATCAATTC
TTTAATATGGTGAAGTCATAGCATGCAAGACATAAATGCGTATCAAGTAA
TGCCACTTATAATCTAATATTGACATAAAGTATAAAATATAGTTAAGAAT
CCTGAGGTACAATAGGTCTTGCACAAGCATTGCAGGGGTGGTGACATGTT
AAAAACCGGTTTGTTTTGTACTTGACATCAAAGATATTGACCTAAAGCAT
ACTTTATGGACATAAAATTTTTTGTTATTGTTATTACTCTTATGTATATC
AGAACCAAAGGAAAAAAATAAAAATACTGACATAGCTATATAACCACATT
TCTAGTTAATGAAATATTAAAATTGTTGCATACACATTTAATAGCTTATC
ACCATATAAACAATAGGCTTATAGCTAAATTACAGTATTTCACCCTACTT
CACAGTTAAAATTTTTTCCCCCTATTTTATTGTGACTATGGATTACCCAG
TGTCCCCATTTCCGAAGTATCCCATTAATGTGGATTGTTATCCTACTCTA
TCCATGAATGCACTGTTATTGACTATCTTATTTAATTCAACTGAACCCCC
TATGGTTCCGAAACAACCCTGTTGAATTTATAGTGGAAAAATACCCGGCT
CTTTAAAGGAACCACACTCCTACTCCCATTCATGTCGAAGGGTTGGGTTC
CCATCCTCCTATTACCTACCGTTTCCGGAAGTGATTTCCCCCCTTTGCCT
CCCCTAACACCCCTGGATAAACTCCGGTCCTTCCCCCCGTCTCGCTTGAA
CTGAATCCCATCTCTCTCCATTCCTTCCCTTGTCTTTCTTCCACCTCATT
ATCTTCTTCCTTTTTCCGTTAAACTCTCTTAATAGGTATCTCTTACGTCC
TTNCAGACACCTCCTTTACAAATTGGTGCTTCTATTGTATATACCTTGCT
TAGTGCATGAACCTTCTTTCTCTAT
| TTTTTTCCATGCGAGGCTGGGGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXCCCCTCTTTGACCCCTACTACATTAGATGCTTTGC
TTTTCATACCTTTAACAAATTCTTCTAAAGTGACCAGGTTCTGGGCACAG
AGGACAAGATTGTAGTGCAAGTGCATCTGACCTCTGATCTCAGCAGCTCA
CACCTTGTGGCCATTTACAAAACAGCAGTTAGGAGACTGCAGATAATGTT
TTGCCTAAGCCAGCCTTCACAAGGAAGGCAAACTGCTTCTCAGCATCCTT
GCAAAGATCAAGCAAGCTTTCCACAAAGAGTGGGTGAGAATATGGAACTC
GGAACATAGAAATTCTCCTCCTCATCTATTGAAGTAACGGGCAAAGATAC
TCATTTTTCAAGACAGAGACTGGATTATAAATTCATATTTAGCTTAATTA
ATTATGAGCTTTTCACATAATATTTTTCTGACAATATTTAGTCATTGATG
ATGTAAAAGTGTTTCAATTAACATGTTTCTACACGGTTCTTCTGTTGCAG
ATATAGCTTCCAGCTTTCTGTTTTTATGTGGCACTGAATTTGTAAATGAG
TCTCTCATTCTTGTGCTTTTTCTTGCACTCTTTTTCTTTCTAGTGCTTTG
TCCTGTCCAACTTTGAATTAATCAGCTTTTGTTTTATCTTATTATAATAT
ATTTTGTTATAATTAAAAATAAATAATGTATTGCTTATCATTGTGGTACT
ATAAAAATACAATTACATTTTTAACCAAACCATTAATTAATTTTCACTGT
AACACTACCAGATGCTCTTCTAATTTTCCTATTGACACCTGAATATTTTC
CACGAAATTTACTTTTCCCTGCCCAATGTTCAATACTTTTTATGCTTTTC
TACCTTTTTTTATTCTTTATGACCCTCTTTTCTAATCCCCATGTTTTATG
GCCTTAAACTTTTTTTTTTATGTATCTTTTTTATTTTTATATTACTCTCC
TAAATTTTTTGCCCTGCCCCCTTTTCATTTTTTTGCATACTAGTTCTGTT
ATTCTCTCTTGGTTATCTTTCGTTTTCCCTGAACCTGTCTGTACACTCTG
TTCCCGGGTGAAATTTCTTTGCCAATATTGCATTTCGGTGTTCCTGTCTT
CCTAATCAAATCATTCTCCTGGTCCTCTTAAACATCGGGTTGAAATCCTT
TTTCTCCTCGCTCCCATTGTATATTACTCATATTTTATAATTCCAATACT
CCCTTTTGCTCCCCACTCTCTTTTTAGCGGTGCGTGTAATACATTCTCTC
TCTCTTTCTCTCCCCTTCT
|
|---|
| quality values | Open.Hide. 7 10 10 8 8 8 8 6 6 6 7 8 8 9 10 14 16 15 19 8 8 8 8 17 19 9 8 8 10 13 18 24 28 36 28 28 28 28 28 29 28 28 28 33 39 37 37 35 36 27
30 32 33 31 33 33 33 50 50 53 41 41 39 37 37 33 23 21 10 10 6 8 6 6 6 6 11 12 9 11 10 10 10 10 10 23 33 41 50 50 50 50 48 48 48 48 42 47 47 53
48 47 59 50 50 50 47 25 25 23 18 17 10 10 10 8 8 8 10 10 10 10 15 13 14 14 21 30 34 47 50 57 57 57 50 47 50 50 50 57 59 59 59 59 48 48 48 48 57 48
48 48 48 57 57 54 47 46 50 48 50 48 54 57 57 57 57 47 47 47 47 47 50 57 57 48 48 48 48 57 57 43 39 36 36 30 30 30 35 42 47 57 57 57 47 47 43 43 39 46
47 47 47 50 50 57 48 48 48 50 50 57 57 57 50 52 57 52 43 43 37 43 43 52 52 52 59 59 57 52 52 52 52 52 52 52 52 52 52 52 52 52 57 57 52 43 37 32 32 43
44 43 52 52 52 52 59 59 59 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 52 52 52 57 57 57 52 52 43 50 50 54 52 57 50 43 37 37 43 50 52 59 59 57 52
52 43 50 43 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 50 50 44 44 44 44 50 50 47 48 48 48 48 47 47 48 42 39 37 37 37 43 44 48 48 57 57 48 48 44 44 44 44
48 44 44 44 44 48 48 44 44 28 30 14 32 23 36 28 25 23 31 28 32 32 39 39 43 43 43 40 40 40 43 43 59 57 43 43 43 37 37 30 33 33 47 47 46 46 43 34 34 31
25 21 19 11 11 11 11 11 11 13 25 28 36 36 39 43 48 43 43 43 43 39 39 39 43 43 40 40 40 43 43 43 43 43 43 43 47 47 48 43 43 43 43 43 43 43 43 43 43 46
48 48 47 47 43 43 43 37 40 30 30 30 40 32 30 15 15 10 20 22 36 28 37 37 42 42 42 43 43 37 38 21 21 21 21 32 33 42 42 43 41 37 37 43 50 44 47 44 44 42
43 35 35 42 50 52 44 43 23 20 20 32 20 23 25 43 43 42 38 38 43 33 35 43 43 52 52 52 52 52 43 52 43 52 52 52 52 57 57 52 52 43 43 27 23 23 33 33 33 43
39 46 57 57 52 52 52 52 43 52 43 43 43 57 45 52 52 52 57 57 52 43 43 33 31 31 39 43 43 41 35 31 27 35 43 43 57 57 57 57 57 57 57 57 39 39 35 36 36 24
15 20 27 32 32 23 23 23 24 32 43 32 35 35 35 32 30 25 25 14 16 18 23 23 31 43 43 44 30 27 14 13 18 18 12 12 21 27 33 43 37 35 16 16 10 10 13 19 21 44
43 35 24 32 24 32 32 42 44 46 46 43 43 37 26 30 30 17 19 20 23 23 20 30 32 32 22 32 16 21 12 19 12 12 11 20 20 36 29 31 25 24 19 16 15 15 21 21 28 23
23 23 20 20 15 26 13 12 12 12 11 11 21 22 20 18 18 24 24 28 33 21 19 17 17 19 21 19 22 24 26 26 12 12 12 13 13 10 10 12 9 9 8 8 8 10 16 21 13 10
9 9 9 13 12 12 12 12 17 27 22 9 9 10 15 15 13 8 8 8 8 8 10 10 15 21 21 21 28 28 23 23 19 19 15 11 10 10 13 8 8 8 10 10 10 10 10 8 9 8
10 10 12 9 9 11 16 11 11 12 12 12 11 11 11 11 12 11 12 10 10 12 10 13 10 10 9 9 9 14 11 15 9 12 8 8 8 10 9 8 11 19 13 12 12 15 15 13 13 11
11 10 10 10 9 9 9 9 9 10 10 10 10 15 11 10 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 14 13 14 14 13 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 10 9 9 9 9 9 15 14 17 13 10 10 10 11 11 10 10 9 9 9 9 10 10 10 10 10 11 11 12 12 11 8 8
8 8 10 10 8 7 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 12 8 8 8 10 8 8 9 10 10 11 11 11 11 8 8 6 6 8 8 10 8 8 8 8 8 10 10 10 10 10 10 10 12
10 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 12 9 9 10 10 10 8 10 10 10 10 16 10 10 7 6 8 8 8 10 10 10 13 8 12 10 10 10 10 11 10 10 10 10
10 8 8 8 8 8 8 7 6 10 10 15 15 9 9 9 11 11 10 9 10 11 11 10 10 9 11 10 10 10 10 12 12 11 12 11 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 6
6 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 6 6 8 8 10 11 11 10 13 12 12 9 8 8 6 6 6 6 6 8 8 8 8 7 6 8 8 9 10 8 8 8 8 8 8 8 9
8 8 12 8 8 6 6 8 8 9 9 9 18 12 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 7 6 12 7 6 8 8 8 8 8 8 13 7 7 8 8 8 6 6 6 6 8 8 6
6 3 0 3 8 6 6 8 8 8 8 6 6 7 6 10 6 6 8 8 8 9 10 10 13 9 9 9 8 8 8 8 10 8 8 8 12 8 10 8 8 6 6 8 10 10 9 9 10 14
8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 10 10 9 9 12 9 9 8 8 8 8 8 9 9 9 | Open.Hide. 9 9 9 9 11 8 9 9 9 9 8 6 8 8 6 6 8 6 6 6 7 8 15 19 15 8 6 6 8 6 6 7 6 10 10 10 10 10 20 20 9 9 9 25 25 36 39 36 30 32
29 30 28 30 30 33 33 41 41 41 25 23 3 0 3 11 11 11 10 11 11 13 10 8 9 8 8 8 8 8 8 9 13 19 30 33 33 39 44 48 36 32 30 24 34 32 35 32 36 31
31 33 33 37 21 17 8 8 8 8 9 9 15 15 12 21 21 23 9 8 8 8 8 13 19 27 31 31 33 48 43 43 43 43 43 43 43 39 47 32 32 28 28 23 28 28 35 35 35 39
32 37 28 32 30 32 32 35 35 41 44 44 44 32 31 31 32 36 37 32 32 32 39 42 57 57 57 57 57 44 44 28 25 25 36 32 57 48 47 37 37 37 35 32 42 35 36 39 42 39
43 37 44 57 50 57 54 54 43 44 33 33 42 43 57 43 43 35 50 35 43 43 52 52 52 52 43 43 52 52 52 52 52 52 52 52 44 44 43 32 27 23 27 43 38 43 33 33 38 44
57 57 52 52 43 44 43 31 31 29 38 34 42 35 39 43 43 43 37 37 37 43 43 43 43 35 33 29 29 27 20 25 25 24 26 32 43 52 52 43 43 33 32 27 38 43 43 52 50 44
43 35 32 32 32 32 37 43 43 42 43 42 42 37 37 42 43 57 57 57 57 39 39 39 31 31 18 18 15 24 18 13 13 15 24 20 23 22 22 32 33 42 42 37 37 37 37 37 30 36
26 36 25 30 30 30 32 31 31 30 23 21 28 28 28 30 30 33 37 37 39 37 35 35 39 42 46 48 47 59 39 39 30 30 30 39 32 32 32 28 28 28 28 28 28 24 24 10 10 6
6 6 6 10 18 15 18 15 12 11 12 15 24 23 28 28 25 25 25 36 33 30 30 39 40 43 48 43 43 43 43 33 42 30 30 30 43 43 47 40 30 28 28 28 44 37 39 41 41 35
30 30 31 31 27 24 13 12 12 19 21 21 34 18 23 23 36 28 32 32 37 39 47 46 57 46 46 43 46 37 37 23 23 23 31 31 39 31 29 19 19 20 23 28 29 39 39 48 48 48
48 39 39 35 35 31 32 28 30 30 32 30 25 25 34 28 28 25 31 28 32 30 22 28 26 28 28 39 34 30 24 17 17 18 21 14 14 14 28 28 37 35 41 35 37 28 24 16 11 13
16 25 25 29 19 19 20 23 23 32 21 19 10 10 10 14 22 42 42 48 48 48 42 42 42 37 37 29 30 23 23 17 16 16 28 31 28 35 28 32 28 20 18 22 20 20 18 23 12 10
10 10 16 24 31 28 32 32 15 15 8 8 8 13 19 26 28 15 11 11 14 17 22 28 18 16 11 11 11 21 21 28 37 39 34 34 34 33 33 26 26 18 16 19 11 13 15 17 15 14
9 9 13 12 8 8 8 8 8 13 16 27 30 15 15 11 11 11 18 23 30 11 12 8 8 8 15 19 22 29 22 22 29 21 21 28 20 26 18 18 15 14 12 12 10 8 8 8 8 10
13 20 19 18 18 13 12 12 13 18 10 10 10 17 11 11 15 15 12 15 19 12 10 10 10 10 8 10 10 12 12 15 10 10 10 10 8 10 8 8 8 8 10 12 12 8 8 6 6 8
8 9 9 9 8 10 7 7 8 6 10 10 12 18 12 10 10 10 19 23 26 12 9 9 9 10 8 8 8 8 12 12 19 20 15 10 11 12 11 10 16 15 10 10 8 9 9 9 9 9
12 9 8 8 6 6 10 8 8 8 8 8 8 8 7 6 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 8 8 8 8 8 10 8 9 9 10 9 10 10 9 9 12 13 14 15 16 9 8
8 8 8 8 9 10 10 16 17 15 10 10 10 10 10 12 10 16 13 12 15 10 10 8 8 8 8 10 12 10 10 11 18 13 19 19 19 15 16 23 19 15 15 14 14 14 24 14 13 8
8 8 8 9 10 10 13 19 19 16 9 9 9 9 10 10 11 10 11 9 9 9 9 9 9 10 10 10 10 8 8 6 6 8 8 7 8 9 10 10 10 10 10 10 10 10 10 9 9 11
11 11 15 21 22 12 11 11 11 11 11 11 17 15 19 12 8 10 8 8 6 6 8 8 8 10 8 10 12 9 10 8 8 8 10 8 11 8 8 8 8 8 10 8 8 11 10 8 8 8
8 10 8 8 10 10 9 9 11 9 9 9 13 15 12 11 10 13 15 10 10 10 10 10 6 6 6 6 8 10 14 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 7 6 12
8 10 11 10 11 8 15 10 13 10 7 7 8 8 8 8 8 9 15 15 10 11 11 16 13 13 16 12 12 11 8 8 6 8 8 6 8 6 6 6 6 8 8 10 9 8 8 8 8 6
7 7 7 10 6 6 8 8 10 8 8 8 8 9 9 13 8 10 10 8 6 8 6 6 8 8 7 8 8 8 9 9 9 15 11 12 8 10 6 6 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10
10 8 8 8 8 7 7 7 7 9 9 12 8 8 8 12 12 10 10 11 10 10 10 10 8 8 7 7 6 6 6 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 11 8 8 8 9 8
8 8 8 8 11 8 9 9 11 9 9 9 10 10 6 6 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 9 10 8 8 8 8 8 10 15 11 11 8 8 8 8 8 13 10 8 8 8 8 10 10
10 7 9 9 9 11 9 9 9 9 11 8 8 8 8 8 8 15 15 10 10 14 15 17 8 8 8 8 8 8 13 10 6 8 6 6 6 6 6 6 6 7 10 12 6 6 8 8 10 8
10 8 8 8 10 8 7 6 8 6 11 8 8 8 9 9 8 8 8 |
|---|
