BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-126J03.T7 (MSMg01no126_j03.b1) | MSMg01-126J03.TJ (MSMg01no126_j03.g1) |
ACC | AG335350 | AG335351 |
length | 698 | 695 |
length of high quality (start - end) | 346 (71 - 416) | 339 (75 - 413) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no126_j03.b1 PHD_FILE: MSMg01no126_j03.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:39:00 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no126_j03.g1 PHD_FILE: MSMg01no126_j03.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:39:01 2005 |
singlet/doublet | doublet | doublet |
---|
BLAST hit | unique | unique |
---|
Map location. | (118,122,040 - 118,122,385) | (117,970,620 - 117,970,958) |
---|
sequence | CTCATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGG
AATTCCTAGAGGTGCCCTAACAATTGCAGCATTAAAAAATAACACAGAAA
ACCTCTTTAAAGGTTTTCTGCATTCCAGAAAATATATACTTATCACAGAT
CATAAATGCAGCCTCGGATAATTTTAAACATATGGTGAGTTTCTTCTTAA
GTACTTATATTTTCGGATCCCTAATTATGCTCTAAATCTTTTTCTCGTCA
CAGAATAATTTCGCCTTGAGAATTTGTGTAGGTAAGACCGCCACTTCTTC
CCTCATAATATTTATGGGTGTTGGATCGGCTTACAATTTGCAATTCATTA
ATTCAGAATATAATTCCCCATAACTAAGAAGTCTCTTGTCTAGTTATTCA
GCTTAGTAGTGCTTCACCACAGTAAACTATGAGCTGCAAAAACAAACAAA
TTATTTCTCAAGCACTTAGCAGTCAGTATGTTATGGAAACAGCCTGGGAA
GGTGTTATCCTTACTCATTGCTATGGAGTGACTTCAGTCTTCACTGCTCA
GTTGTAGTTTTGTGCACTTGAAATGATCTATGCCCCCATTAGGTTCCTTA
TGCCAGTCGAGTATCTTTACGGTCCATTACCATGATAAAAGTAAATCAAT
TAAGGTGTATTGCCCTTTCTGAAGTTCCTTAATGTCTTGTTTTCTGTG
| CGATGAAGTXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTAGACATCAGCTTGCCTCTGCTGGGAT
TAGATAATTTAGCATAGAGAGATTACCCTAAGTCACTGGGTAAAGTTTGC
ACCGGTGTGATCACAAGAGTCCTTAAAAGCAGAAGAGGAGATTTCACTTG
CTATTGACCCAGAAGGTGGAAAAAGATGCAGTGAGCCAAGCACAGGATGC
AGGAGTTACAAATCAAGGATAGGATGCAGGAGTTAGTTAGAAAGCAATGC
TCTGACTATGTGTTTCAATGTTTCACTTTAGTTAACTTAAGTACAAATAT
CTGTGGGCAACTCCTACCTATCATGTTAGACATCCTGGTGGACTCTTACA
GTCCTAGTGGTCATTGCCATGAACAATGAGGGAGATTGTCATTGTTCCTT
TTCATTTCGCAAATAGTCCATTAATAACGATACCCTCGTGCTACATGGAC
CGGAGTGCGCAATTCAGACTGTTTAATACACTGTTGCCACTAGTCTTCAC
CGGAGTTTATTACAGAAACGGGTGGCCCAGGTGGAAACTTCCATAGGCCC
CTGGGGGTTGTTTGTTGGTGAATTCTTGACCTCCCCTTGCATTAAACCTC
TGATGCCCCCTCCGCGCTTTCGACCTAATCGTCTCCCCCATTTGG
|
quality values | Open.Hide. 6 8 8 8 6 6 14 17 20 25 25 23 22 19 17 17 31 39 39 39 40 33 33 33 39 23 19 9 9 9 10 8 8 8 8 7 8 11 17 17 12 13 10 13 13 15 23 25 34 29
33 36 33 33 33 37 27 21 15 11 11 12 11 12 12 16 11 12 8 8 15 15 33 33 44 33 33 33 33 33 36 57 57 57 57 48 48 48 48 48 43 43 42 36 36 36 31 31 28 30
30 40 40 57 57 48 50 48 47 47 47 41 41 37 37 42 42 57 42 42 37 42 44 47 41 41 35 35 41 42 57 57 57 57 57 57 54 54 48 57 57 47 47 47 41 41 37 42 50 50
50 50 57 50 50 50 46 50 37 35 35 35 37 50 43 37 35 35 36 50 50 50 50 50 59 57 57 57 57 57 52 52 50 43 35 35 50 50 50 50 57 57 59 59 59 59 57 57 57 57
52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 43 39 39 57 57 57 62 62 62 62 59 59 57 52 52 57 57
57 57 57 47 57 47 47 47 52 57 57 52 52 52 52 57 47 47 35 35 35 42 42 57 57 52 43 43 33 28 28 33 39 39 43 57 57 57 52 52 52 57 52 52 52 57 57 57 59 59
68 59 59 57 57 57 57 52 52 52 52 43 43 43 43 43 33 33 33 27 27 18 15 13 13 24 32 24 35 35 50 44 44 39 39 37 59 42 42 35 40 44 28 32 35 35 35 35 42 35
42 42 42 32 24 28 20 24 24 25 36 37 39 39 59 47 32 40 28 23 23 22 32 32 46 48 47 39 39 42 42 54 43 48 46 41 40 28 25 28 43 37 40 35 35 39 43 33 33 32
33 33 32 32 19 19 15 27 21 28 33 34 28 28 12 11 11 8 8 6 6 8 8 13 14 30 30 28 37 30 30 18 22 24 25 22 25 28 34 32 29 29 32 37 37 23 26 19 19 22
22 33 33 48 47 47 41 41 39 25 14 9 9 9 14 22 27 30 22 23 28 34 39 43 39 39 24 24 23 18 22 24 28 28 37 30 17 20 20 16 16 16 19 17 19 12 11 15 12 18
17 21 11 11 12 25 24 33 25 17 21 18 18 15 27 17 20 15 23 19 15 13 6 6 6 7 11 16 16 20 19 19 18 18 22 22 19 19 13 12 13 10 10 10 17 15 16 17 16 11
11 11 16 16 15 11 11 15 13 13 10 10 11 11 12 11 11 10 15 10 10 11 15 13 8 8 8 13 13 11 8 9 11 10 17 20 18 15 11 11 10 10 10 17 15 18 15 15 6 8
6 6 8 10 8 13 13 10 10 10 19 15 12 12 10 11 22 15 15 12 8 8 10 13 10 10 11 17 11 11 12 11 8 10 10 8 8 8 10 8 8 8 8 11 8 8 8 10 15 15
22 12 12 10 6 6 6 8 8 8 10 9 8 8 12 8 10 9 11 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 9 10 11 14 13 10 10 10 10 10 11 13 8 8 8 8 10 10 10 | Open.Hide. 9 9 9 15 8 8 8 13 13 8 8 8 8 10 10 27 27 39 48 43 26 26 24 24 24 30 34 34 23 14 9 9 11 9 11 9 10 10 10 16 8 9 9 9 21 26 31 36 36 48
36 36 36 33 28 28 21 27 19 22 30 19 21 16 14 16 22 17 30 21 19 14 12 18 20 19 33 33 34 30 35 28 28 22 39 40 48 57 57 57 57 57 48 48 48 43 34 34 46 41
41 41 54 47 48 47 48 48 42 42 31 37 42 37 39 35 32 27 30 24 37 37 46 57 57 57 57 57 57 48 48 47 47 47 41 41 41 57 43 46 47 47 57 57 57 50 50 50 57 50
48 48 57 57 50 43 41 43 37 50 50 50 50 57 44 44 35 35 43 44 57 57 57 57 54 54 54 54 50 50 35 35 33 33 33 38 43 50 57 57 47 57 57 57 52 52 43 57 57 52
52 57 57 57 57 57 57 57 44 43 35 35 39 43 43 43 43 23 23 26 43 43 52 52 45 45 39 39 39 39 31 31 31 43 39 39 35 35 35 39 35 35 43 62 62 45 43 43 34 33
26 26 26 43 43 62 62 43 39 39 39 43 43 52 45 43 43 43 43 52 52 43 43 35 43 39 43 43 52 52 62 62 62 43 43 31 31 31 39 35 35 35 43 35 35 35 43 43 57 57
57 57 57 57 57 57 57 44 44 29 28 27 27 33 36 43 33 29 28 39 44 57 43 39 39 39 44 38 24 15 12 19 30 43 57 68 57 44 32 23 23 28 44 35 35 35 37 37 50 50
57 59 57 57 57 52 44 43 41 41 43 43 52 52 52 48 46 50 43 37 37 32 28 28 28 28 42 35 32 32 32 32 35 42 44 46 36 37 23 28 28 42 42 57 44 44 26 19 14 15
15 25 32 44 36 30 25 19 16 12 15 12 17 12 15 12 13 13 13 13 23 23 18 15 15 15 14 14 22 30 30 31 25 25 25 32 32 19 20 20 31 23 37 28 39 39 44 35 35 28
18 18 30 32 37 29 26 15 11 8 10 10 12 12 9 11 11 15 18 19 20 16 10 10 10 10 10 16 15 22 16 16 14 12 12 14 16 16 20 21 20 15 15 10 10 12 12 12 11 11
11 12 10 9 9 9 9 9 9 10 10 10 12 23 18 12 10 10 10 9 11 10 8 8 8 8 8 8 8 8 10 9 15 15 12 10 9 9 9 13 14 10 10 9 9 9 11 8 8 8
9 9 11 15 11 14 10 11 12 13 13 13 11 12 12 18 18 19 21 18 12 12 11 10 10 13 15 10 11 10 11 12 10 8 8 8 10 12 19 16 16 22 22 28 24 19 12 13 12 12
16 15 8 8 8 8 9 10 24 24 22 12 12 9 8 8 8 10 8 10 9 6 8 6 6 8 8 10 9 11 11 12 8 8 8 8 8 11 8 8 8 6 6 6 10 8 11 10 8 8
10 12 10 9 9 9 10 17 15 15 15 10 10 10 8 8 10 10 10 8 8 8 8 9 10 8 8 6 6 8 8 8 11 11 11 20 9 12 8 8 8 15 10 8 8 |