BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-161F10.T7 (MSMg01no161_f10.b1) | MSMg01-161F10.TJ (MSMg01no161_f10.g1) |
ACC | AG360767 | AG360768 |
length | 1,235 | 1,246 |
length of high quality (start - end) | 369 (27 - 395) | 381 (71 - 451) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no161_f10.b1 PHD_FILE: MSMg01no161_f10.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:27:50 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no161_f10.g1 PHD_FILE: MSMg01no161_f10.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:27:50 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | plural |
---|
sequence | NNTTGTATGCGCGCTAAGACTCACTAAGGGAGAGGATCCGCGGAATTCTC
TGCTATAGTCTGACCAATTCCAAGTGAGTGGTAAAATTGTTGGTCCAGTG
CCTGGAAGAGCTTTTGAGCTACTCCTTGAGACCTTTGAGACTAGTGGATA
AAACTTATACATTCCCATAAAAGGTATCACAAAAAAGAAGCATGGACTCT
TATCCTCCCCTAGCAGGCCACATCACTGAAGTCAGTTTCTCACAATTGAC
CATAGTTTGGCCCCTCATATGTGCCCACTTCTGGGATAAGTGTCTGTCTT
TACATTTATTTTACTATAAACCTGACATATTGCTTAGATAAGTTGGGCCA
GGCTGTCATGTCTAGTTATAACATCTTCTTTCCTTTTTCTGGGTTTTTTT
TATAGNATACTGGACTCCGGTCTGGTACCCTGGTGAAAGTTACTTTTTTT
ATTCCCCCCCCCCCCANNGGGNAGCCTGCCCCTAAAAAAAAAGAGGGGNC
CACCANNCNNNNGGNNCNCCNACCCNNGGGANANNNNNANANNCCCNANG
NCCCCNGGGNNANACNANGGANNCNGAGGCAGCAGCGAGCCACANNANGN
CACCAGAAGGNCAGNAGGCCCCACGGGNCNNNGGGCCAANNNNGGGGCAG
CCAAGNCAANNCCCGGGNGACCCCCGGCCCCAAGGGCGCCNCAAAGCCGA
CGCCCNAAGCACCGAAACCAAGAAACCCCCAGAGGAAGGCAAAGAGCCCC
CAGGAGAGCCCAGAACCCCCCCNAAANNNNAAAGCNCNNCCCGCCAGCAG
AGAGGAGCCCCCCCCCCGGAAAGACCAGAACANCCCCAAGGGCAGGACCA
AAGGCAAAGAGACACCCCCGAAAAGAGAAAACGGGACNCCCCCAACCCCA
AAAAAAAGGGCCAAAAAGCCCGGGGCCCAAACCACCCCCGCGGCAAANCC
GGCAGAAACCCCCGGGGCCCAGAAACCAACGGAAAAAGAAGGGGGACCCA
ACCCAGGCCCCCAGGGCCCCAAAGGCCCGACCCCGCCCCCCAAACGAAAC
AAACCCGCGCGAGGGGGGGGAAAACAAACAGAACCCCACCACAACAACCG
CACACNCCCCGCCCAACACACCCCCCCCACCCCACACCCACCCAAAGCAA
CACCCACAAAACACACANCGACGGCCGCAAAACAAACCCCACCCAAGCCA
CGCAAAAGACACACCAACCCGCCCCAGCAACGCCC
| NNNGGCTGAAGTGAGGCTGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXATTTCCAGACCTCCTGCTGTGTCCCTACTG
GAATTGAGTTCCCCCTGGATGGTTCACGACAGAAGCTCACAGGTTACAAG
CGATTTCCCCACTGCTTTCACACAGCAAGGCTAGTGCTAGTAATGTCAGC
CCAGGTCTGTCCTTTTTAAGGTATTATTTTATGTGTATAGATATTGTGCC
CTCATGTATGTGTGTGAACCACGTGTGTGCAGTGCCGTCAGGGGCTAGAA
CAAGGCAACAAGTGATTGTGAGCTGTCATGTGGGTGCAGGGAGTGGATGG
AGCTCGAATCCTCTGGAAGAGCAGCCAAGTGCACTTAACCACTGAGCCAT
CTCTCTAGCTCCACTGTCCTCCTTAAGATGGAATACTAGAAACGAAAGAT
TTTTTTTCCCCCCCCCCACTCTTGTAGAAAATATTGAAAAAAAAAAAGAG
GGTACCTGGATGTTGTGTTTTACCAAGCAGTCATCCCCCCCCCCAAAAAA
AAAGAGAGAATTTTTCAGCTACCCAAAGGTAGTGCCTTGTAAAAAGAAGC
TGATTTCTTCAATTAAATGAGCAGACATTCTCTGAGGAAACATTGGATTG
CTACAGATCTTGGAAGAACCCAGAACAATTAACAAGGTGATGTTATTCCT
GGAATGTGGAGAGCCGTGCCGTGAGCAATCGCCATTATAAAATGGCACTG
GCTTCCACTGCGCCTAACTAGTAAACAAGCCTTATGCGCAAGAGCAAGAG
TGAATTCCCGCCCAGTCACTGCCCATCTCGTGGCGTAATAATGGGGTGAA
GGGCGAACAACGAATTATGAGCTGTCACGCCCCATCAGGTGCTGAAACGT
CCCACTGTGCGCTTATTCATCAGCCGCCTTTTTCGGGTTCCGGTCCTTCC
TTATGTTTAAACAAAAAAACCTTTTCCTTTAAAACACCCCCGTTTCCTAA
TAACACCCTGCTCCCACAAATATAATTGTGTTCTAAATATTGCTTCTTAA
CATCTCCCTTTTTTTCTTCTTCCTCCCTTCTTTTCTATAATCCTCCCCTT
TTCCTCTTGTGTTCTAATTATTTTTCATATTTTTTATCTTTTCTCCTTCC
ATAACCTCTTGTTTTTTTCCCATTAATTCTTCTTTTAGTTCTAACCCTCT
CTGCTTTAGCTTTCTCTGTTCTTCCTCTTTATTCATTTTCTTCTTN
|
quality values | Open.Hide. 0 0 3 6 6 6 7 13 6 8 9 14 13 10 8 8 8 8 15 15 28 21 15 15 10 10 10 22 26 36 33 33 33 33 33 33 33 33 33 30 37 37 37 31 32 37 44 41 41 41
40 33 33 33 36 36 36 38 42 48 28 23 14 14 10 15 15 39 42 42 37 36 36 36 48 48 48 54 48 42 48 48 48 43 42 46 42 39 35 35 29 37 32 29 29 31 31 28 42 42
43 48 48 48 46 46 43 43 43 57 57 57 47 47 48 48 37 33 33 30 30 16 16 11 11 11 18 25 30 37 46 46 48 48 48 48 59 59 57 42 47 37 37 32 32 36 43 43 57 59
59 59 48 54 54 54 54 54 54 54 54 54 57 50 50 50 50 50 50 50 54 57 57 57 57 42 44 39 47 47 57 57 59 59 59 54 54 54 59 59 59 43 43 44 59 57 54 54 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 50 50 54 57 59 57 57 57 57 52 52 52 52 57 52 57 57 68 68 68 57 57 52 59 52 54 54 57 57 57 57 52 52 57 57 57
57 68 68 68 57 57 52 57 52 57 57 57 57 57 57 52 57 57 57 57 54 57 57 59 59 57 57 57 57 57 54 52 52 57 57 57 57 57 57 52 52 52 52 52 57 52 59 59 57 57
57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 40 44 33 28 27 23 23 28 44 42 54 54 59 47 57 43 47 47 59 59 59 59 48 48 48 57 57 57 57 59
59 48 48 48 48 43 43 43 43 48 57 48 57 57 47 48 48 59 59 59 59 59 57 57 57 48 48 48 59 48 48 48 59 59 59 59 47 47 46 28 28 13 12 10 13 15 18 20 18 8
8 8 8 8 3 0 3 27 27 41 41 40 40 40 48 48 48 37 34 32 23 23 34 38 43 43 43 47 47 48 28 25 18 11 11 25 29 37 40 32 34 28 28 30 9 9 9 7 7 6
9 9 9 9 9 9 8 8 9 16 7 9 7 6 6 3 0 0 3 9 3 0 3 6 6 8 8 9 9 22 10 8 8 8 8 9 13 22 20 9 7 6 6 6 6 7 6 3 0 3
18 27 29 27 3 0 0 3 0 0 0 0 3 3 0 0 3 0 3 3 0 3 27 29 3 0 0 3 7 7 3 0 3 0 0 0 0 0 3 0 3 0 0 3 29 3 0 3 0 3
0 3 27 18 3 0 3 7 3 0 0 3 0 3 3 0 3 0 3 27 3 0 0 3 0 3 27 25 41 41 46 59 27 25 9 9 9 15 7 9 9 7 15 3 0 0 3 0 3 0
3 23 23 41 41 27 16 7 7 3 0 3 25 3 0 3 23 15 11 11 11 11 18 9 7 7 3 0 3 0 0 0 3 22 22 40 23 23 3 0 0 0 0 3 7 7 15 36 37 32
29 35 17 17 3 0 3 22 3 0 0 3 14 7 7 7 3 0 3 19 17 8 6 6 6 6 7 15 10 10 10 14 15 21 21 9 9 9 9 3 0 3 6 6 15 9 9 9 9 9
9 9 11 11 3 0 3 23 23 18 7 6 6 6 8 8 18 26 15 15 14 24 17 12 15 9 9 9 9 9 9 9 11 23 22 37 37 37 32 27 25 25 30 19 15 6 6 6 6 7
11 15 32 22 23 23 21 14 8 8 8 8 10 10 9 13 8 8 6 6 6 3 0 3 6 3 0 0 0 0 3 9 7 7 3 0 3 0 0 3 7 8 11 13 17 10 10 9 10 10
9 9 10 15 15 13 8 6 6 7 6 6 9 6 6 6 7 7 9 9 10 16 22 12 12 12 21 21 18 17 20 3 0 3 9 9 9 6 6 6 9 10 8 8 8 8 8 8 7 9
9 17 12 18 22 16 10 10 8 8 8 8 8 7 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 10 10 11 13 7 7 8 6 7 8 12 3 0 3 7 8 7 7 7 7 7 10 8 9 9
11 9 8 8 7 6 6 6 6 6 8 10 10 10 10 10 10 10 8 8 9 13 13 12 9 9 9 12 9 10 10 9 10 10 10 10 10 10 9 9 9 6 7 10 8 6 3 0 3 15
10 7 8 7 6 12 8 10 10 10 10 9 12 11 10 8 8 8 8 7 9 9 13 11 14 13 8 8 8 6 8 8 6 8 8 9 9 9 9 9 8 10 8 8 6 6 7 8 9 9
9 8 8 6 6 8 12 19 11 10 10 9 9 8 8 9 9 14 16 14 9 9 9 11 11 8 10 6 6 8 8 8 8 12 12 12 19 12 12 12 11 11 10 9 9 9 8 10 7 7
8 8 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 12 15 23 20 19 18 12 9 9 11 12 12 11 10 10 9 9 9 11 9 11 13 11 11 9 9 9 11 8 10 12 10 10 9 12 10 6 6
6 7 8 6 3 0 3 11 11 8 8 8 10 15 8 8 8 8 8 8 8 10 15 15 15 10 10 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 10 6 6 8 6 6 6 8 8 9 10 13 9
10 10 10 15 11 8 6 8 8 8 6 6 8 10 7 7 3 0 3 10 9 8 8 8 8 8 8 9 9 10 8 10 10 12 8 8 10 14 8 8 8 8 10 8 10 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 6 6 8 6 6 8 6 6 12 10 20 16 15 8 8 6 8 8 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 | Open.Hide. 0 0 0 3 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 6 6 6 8 8 9 13 8 8 9 8 11 12 21 19 15 10 10 10 21 19 29 22 28 24 32 34 36 36 37 37 37 47
47 47 47 42 57 48 57 57 57 57 57 48 48 48 57 48 48 42 50 47 47 47 50 50 48 47 47 47 47 57 57 57 50 42 41 41 36 36 35 38 35 35 35 40 42 48 41 38 38 35
38 42 57 57 47 47 41 47 47 47 47 57 50 50 50 50 35 36 37 44 44 57 38 19 8 8 8 8 10 10 32 32 52 57 52 37 52 52 57 57 57 57 50 50 50 50 57 57 57 57
52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 45 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 43 43 35 35 35 44 43 57 52 43 43 43 43 39 57 57 57 57 57
57 57 62 62 52 52 52 62 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 62 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 39 43 43 62 62
62 62 52 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 39 39 43 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 57 57 57 57 39 39 39 57 57 57 57 52 57 57 57 57 52 52 52 45 52 52 57
57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 52 52 52 59 57 57 57 52 52 52 52 52 57 57 57 52 52 52 52 44 59 57 57 43 52 57 59 57 47 47 47 50 50 37 43 43 57 52 54
54 54 54 54 57 57 57 54 54 50 57 50 50 50 50 43 43 32 32 32 44 44 57 59 59 59 59 47 47 47 47 57 48 48 57 57 57 57 57 57 57 48 46 44 30 21 12 12 12 11
12 12 19 19 28 27 44 42 54 54 59 59 46 37 37 30 41 41 47 47 54 57 48 59 47 43 43 39 47 43 57 57 57 57 57 57 48 48 48 48 48 48 50 41 39 25 21 11 12 15
13 24 24 23 16 14 11 14 14 14 22 17 18 18 17 16 10 11 9 20 20 30 30 33 41 37 28 18 18 12 12 16 16 20 28 20 15 13 10 10 11 17 27 30 22 20 22 19 18 16
27 23 40 43 43 43 37 39 39 47 47 47 57 59 48 48 48 47 59 48 48 48 57 59 59 59 59 59 59 43 43 39 43 43 47 59 59 59 59 59 57 57 54 59 59 59 59 59 59 59
44 44 30 30 28 44 32 43 43 44 44 57 57 54 43 42 42 31 28 42 44 44 57 54 54 54 57 59 43 42 37 35 35 35 42 42 46 46 43 57 57 57 59 59 48 43 43 47 36 36
37 40 43 46 46 43 43 33 42 42 36 39 43 43 43 40 40 37 40 33 40 37 32 32 32 39 33 33 37 37 39 39 31 34 31 43 43 37 36 35 30 30 34 34 31 31 39 34 34 32
35 28 32 20 28 25 32 34 37 34 34 25 25 28 19 19 17 20 25 28 28 20 14 14 18 21 27 29 37 37 37 37 40 43 39 43 43 33 28 32 32 30 30 39 41 34 37 30 22 22
14 8 10 19 20 20 20 21 24 16 16 16 27 19 16 12 12 12 19 17 10 10 10 16 18 28 33 37 30 19 17 15 16 15 28 32 28 28 34 36 41 37 32 20 16 14 14 15 21 21
18 20 18 20 24 24 24 22 30 32 37 39 34 34 30 24 13 18 16 13 12 12 24 30 28 29 25 19 11 10 10 11 12 12 13 19 13 17 12 19 19 24 14 14 17 30 18 18 15 18
12 12 15 15 13 22 8 9 9 13 13 22 20 23 22 22 22 22 28 29 29 30 30 23 23 14 14 10 15 7 7 7 13 15 16 18 11 12 12 20 9 8 8 8 8 8 15 13 8 8
8 8 9 9 12 9 11 13 10 9 11 9 9 11 11 9 9 9 9 12 10 9 8 8 8 8 8 10 15 12 10 10 8 8 6 8 8 11 15 10 10 10 10 10 10 13 10 8 8 8
8 8 8 8 9 11 10 10 10 10 8 8 8 6 6 8 6 6 6 8 8 10 8 8 8 6 8 8 11 11 19 8 8 8 8 8 15 11 8 8 8 8 8 10 8 8 12 10 10 9
8 8 8 8 8 11 13 19 19 10 10 10 8 8 8 10 15 12 7 6 8 8 10 14 13 15 12 8 8 8 8 8 8 10 15 12 12 12 12 12 9 9 8 8 6 6 6 8 10 10
8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 9 7 10 10 10 10 7 6 8 8 12 12 10 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 6
6 6 6 6 6 8 8 11 11 11 11 15 9 13 8 8 8 6 6 8 6 6 6 6 8 8 6 6 7 9 8 8 8 7 6 8 10 8 8 9 9 8 8 6 6 8 8 10 10 10
8 10 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 11 8 8 6 6 8 8 8 8 12 11 8 8 8 8 8 10 10 15 10 9 9 6 8 6 7 12 10 8 8 8 8 8 8 13 8 8
10 6 6 8 8 8 8 8 8 8 12 11 16 15 17 17 17 19 19 15 10 10 9 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 10 8 12 11 11 11 8 10 8 8 8 8 8 8 8 7 6
8 8 8 9 9 10 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 6 6 6 7 7 12 12 14 7 7 8 8 17 15 11 10 8 8 8 8 8 8 7 9 10 8 8 8 3 0 |